Synthetic RNA Controls

High-throughput sequencing of cDNA (RNA-seq) is a widely used method that allows for transcriptome profiling and annotation. However, questions about the accuracy and performance of different protocols and platforms remain. To address this issues, synthetic RNA controls can be used as spike-in controls. Jiang et al. in 2011 reported the use of a pool of 96 synthetic RNAs with various lengths, and GC content covering a 2²⁰ concentration range as synthetic RNA spike-in controls to measure sensitivity, accuracy, and biases in RNA-sequencing experiments. The standard curves for quantifying the abundance of transcripts were also derived. The linearity between read density and RNA input over the entire detection range was observed as well as excellent agreement between replicates. However, the researchers observed a significantly larger imprecision than expected under pure Poisson sampling errors.

In summary, synthetic RNA controls are very useful to allow the evaluation of reproducibilities of RNA-based assay protocols. Ussing synthetic RNA controls allows to determine biases due to GC content, transcript length, and heterogeneities in coverage across transcripts. In addition, synthetic RNA controls can help establishing the limits for RNA-sequencing discovery experiments. Furthermore, synthetic RNA controls, when used externally, allow evaluation of the sensitivity and accuracy of RNA-sequencing based transcriptome analysis.  {Jiang et al., 2011; Genomic Research 21:1543-1551}

The following is a list of synthetic constructs used for the experiment derived from the genbank.

Results of BLASTN 2.2.23+ Query for the constructs:

Query=  ERCC-00002_genbank |92111308|gb|DQ459430.1|

Synthetic construct microarray control MC28 mRNA, complete sequence

Length=1134, Subject=  ERCC-00002, Length=1061
Score = 1919 bits (1039),  Expect = 0.0
Identities = 1055/1062 (99%), Gaps = 3/1062 (0%)
Strand=Plus/Plus

Query  69    TCCAGATTACTTCCATTTCCGCCCAAGCTGCTCACAGTATACGGGCGTCGGCATCCAGAC  128
             ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  1     TCCAGATTACTTCCATTTCCGCCCAAGCTGCTCACAGTATACGGGCGTCGGCATCCAGAC  60

Query  129   CGTCGGCTGATCGTAGTTTTACTAGGCTAGACTAGCGTACGAGCACTATGGTCAGTAATT  188
             |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  61    CGTCGGCTGATCGTGGTTTTACTAGGCTAGACTAGCGTACGAGCACTATGGTCAGTAATT  120

Query  189   CCTGGAGGAATAGGTACCAAGaaaaaaaCGAACCTTTGGGTTCCAGAGCTGTACGGTCGC  248
             ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  121   CCTGGAGGAATAGGTACCAAGAAAAAAACGAACCTTTGGGTTCCAGAGCTGTACGGTCGC  180

Query  249   ACTGAACTCGGATAGGTCTCAGAAAAACGAAATATAGGCTTACGGTAGGTCCGAATGGCA  308
             ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  181   ACTGAACTCGGATAGGTCTCAGAAAAACGAAATATAGGCTTACGGTAGGTCCGAATGGCA  240

Query  309   CAAAGCTTGTTCCGTTAGCTGGCATAAGATTCCATGCCTAGATGTGATACACGTTTCTGG  368
             ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  241   CAAAGCTTGTTCCGTTAGCTGGCATAAGATTCCATGCCTAGATGTGATACACGTTTCTGG  300

Query  369   AAACTGCCTCGTCATGCGACTGTTCCCCGGGGTCAGGGCCGCTGGTATTTGCTGTAAAGA  428
             ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  301   AAACTGCCTCGTCATGCGACTGTTCCCCGGGGTCAGGGCCGCTGGTATTTGCTGTAAAGA  360

Query  429   GGGGCGTTGAGTCCGTCCGACTTCACTGCCCCCTTTCAGCCTTTTGGGTCCTGTATCCCA  488
             ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  361   GGGGCGTTGAGTCCGTCCGACTTCACTGCCCCCTTTCAGCCTTTTGGGTCCTGTATCCCA  420

Query  489   ATTCTCAGAGGTCCCGCCGTACGCTGAGGACCACCTGAAACGGGCATCGTCGCTCTTCGT  548
             ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  421   ATTCTCAGAGGTCCCGCCGTACGCTGAGGACCACCTGAAACGGGCATCGTCGCTCTTCGT  480

Query  549   TGTTCGTCGACTTCTAGTGTGGAGACGAATTGCCAGAATTATTAACTGCGCAGTTAGGGC  608
             ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  481   TGTTCGTCGACTTCTAGTGTGGAGACGAATTGCCAGAATTATTAACTGCGCAGTTAGGGC  540

Query  609   AGCGTCTGCGGAAGTTTGCTGCGGTTTCCGCCTTGACCGCGGGAAGGAGACATAACGATA  668
             |||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  541   AGCGTCTGAGGAAGTTTGCTGCGGTTTC-GCCTTGACCGCGGGAAGGAGACATAACGATA  599

Query  669   GCGACTCTGTCTCAGCGGATCTGCATATGTTTGCAGCATACTTTAG-TGGGCCTTGGCTT  727
             ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||
Sbjct  600   GCGACTCTGTCTCAGGGGATCTGCATATGTTTGCAGCATACTTTAGGTGGGCCTTGGCTT  659

Query  728   CCTTCCGCAGTCAAAACCGCGCAATTATCCCCGTCCTGATTTACTGGACTCGCAACGTGG  787
             ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  660   CCTTCCGCAGTCAAAACCGCGCAATTATCCCCGTCCTGATTTACTGGACTCGCAACGTGG  719

Query  788   GTCCATCAGTTGTCCGTATACCAAGACGTCTAAGGGCGGTGTACACCCTTTTGAGCAATG  847
             ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  720   GTCCATCAGTTGTCCGTATACCAAGACGTCTAAGGGCGGTGTACACCCTTTTGAGCAATG  779

Query  848   ATTGCACAACCTGCGATCACCTTATACAGAATTATCAATCAAGCTCCCCGAGGAGCGGAC  907
             ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  780   ATTGCACAACCTGCGATCACCTTATACAGAATTATCAATCAAGCTCCCCGAGGAGCGGAC  839

Query  908   TTGTAAGGACCGCTGCTTTCGCTCGGGTCTGCGGGTTATAGCTTTTCAGTC-CGACGGGC  966
             ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||
Sbjct  840   TTGTAAGGACCGCCGCTTTCGCTCGGGTCTGCGGGTTATAGCTTTTCAGTCTCGACGGGC  899

Query  967   TAGCACACATCTGGTTGACTAGGCGCATAGTCGCCATTCACAGATTTGCTCGGCAATCAG  1026
             ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  900   TAGCACACATCTGGTTGACTAGGCGCATAGTCGCCATTCACAGATTTGCTCGGCAATCAG  959

Query  1027  TACTGGTAGGCGTTAGACCCCGTGACTCGTGGCTGAACGGCCGTACAACTCGACAGCCGG  1086
             ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  960   TACTGGTAGGCGTTAGACCCCGTGACTCGTGGCTGAACGGCCGTACAACTCGACAGCCGG  1019

Query  1087  TGCTTGCGTTTTACCCTTaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaa  1128
             ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  1020  TGCTTGCGTTTTACCCTTAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAA  1061

Query=  ERCC-00003_genbank |103488731|gb|DQ516784.1|
Methanocaldococcus jannaschii spike-in control MJ-1000-67 genomic sequence
Length=1000 Subject=  ERCC-00003 Length=1023
Score = 1840 bits (996),  Expect = 0.0
Identities = 999/1000 (99%), Gaps = 1/1000 (0%)
Strand=Plus/Plus

Query  1    CAGCAGCGATTAAGGCAGAGGCGTTTGTATCTGCCATTATAAAGAAGTTTCCTCCAGCAA  60
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  1    CAGCAGCGATTAAGGCAGAGGCGTTTGTATCTGCCATTATAAAGAAGTTTCCTCCAGCAA  60

Query  61   CTCCTTTCTTAATTCCAAACTTAGCTTCAGTTATAAATTCCCCTCCCATGATTGGGATTT  120
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  61   CTCCTTTCTTAATTCCAAACTTAGCTTCAGTTATAAATTCCCCTCCCATGATTGGGATTT  120

Query  121  TATAAACTTTTCTTCCATATAATTCATCTTTCTTCTCATAACCGTCTCCGAAAAACTTCA  180
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  121  TATAAACTTTTCTTCCATATAATTCATCTTTCTTCTCATAACCGTCTCCGAAAAACTTCA  180

Query  181  ACTTAAATCCAACCTTTAACTGCTCATCAGCCATGTCTCCCATAGCATCAAAAATAGCAG  240
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  181  ACTTAAATCCAACCTTTAACTGCTCATCAGCCATGTCTCCCATAGCATCAAAAATAGCAG  240

Query  241  TTGTTGGACATGTTAAGACACACTGCCCCAATCTCTCTAACATTTGATGCTCTAACTCTG  300
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  241  TTGTTGGACATGTTAAGACACACTGCCCCAATCTCTCTAACATTTGATGCTCTAACTCTG  300

Query  301  ACTTTTTAGGGTGGCATATCTGTATTATAAATCCTGGTCTTCCATCTGGTGTTTTTGATG  360
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  301  ACTTTTTAGGGTGGCATATCTGTATTATAAATCCTGGTCTTCCATCTGGTGTTTTTGATG  360

Query  361  GAGGGACATATTTCTCAATTCCTGCTTCTGCTGGACACATTATAACTGAACAACCAAAAC  420
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  361  GAGGGACATATTTCTCAATTCCTGCTTCTGCTGGACACATTATAACTGAACAACCAAAAC  420

Query  421  CTGTTGCCTCTGTAGCTGCAATCTTAGCCCACTTCTTTGTAGCTGCTGTTATTAAAACTC  480
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  421  CTGTTGCCTCTGTAGCTGCAATCTTAGCCCACTTCTTTGTAGCTGCTGTTATTAAAACTC  480

Query  481  TTGAAACCCATATTGGGAATGCTTCTGCAAATGTATCTTCAATATATACTCCATTTATTT  540
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  481  TTGAAACCCATATTGGGAATGCTTCTGCAAATGTATCTTCAATATATACTCCATTTATTT  540

Query  541  CCATAGTTTCCCTCCATTAAGATTTTAACAATTATAGTTTATCTTAGGGGCTATTAATAT  600
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  541  CCATAGTTTCCCTCCATTAAGATTTTAACAATTATAGTTTATCTTAGGGGCTATTAATAT  600

Query  601  CTTATCATTTGGtttttaatattcgataaatccataaataaaaatatatcaacaataatt  660
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  601  CTTATCATTTGGTTTTTAATATTCGATAAATCCATAAATAAAAATATATCAACAATAATT  660

Query  661  ttaaataatctaagtataggtaatataacaattaaaaaGATTTAGAGGGATAGAATTGAA  720
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  661  TTAAATAATCTAAGTATAGGTAATATAACAATTAAAAAGATTTAGAGGGATAGAATTGAA  720

Query  721  CGGCATTAGGAGAATTGTTTTAGATATATTGAAGCCGCATGAGCCAAAAATAACAGATAT  780
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  721  CGGCATTAGGAGAATTGTTTTAGATATATTGAAGCCGCATGAGCCAAAAATAACAGATAT  780

Query  781  GGCATTAAAATTAACATCATTATCAAACATTGATGGGGTTAATATTACAGTCTATGAAAT  840
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  781  GGCATTAAAATTAACATCATTATCAAACATTGATGGGGTTAATATTACAGTCTATGAAAT  840

Query  841  AGATAAAGAGACTGAGAATGTTAAAGTTACAATTGAAGGGAATAATTTAGATTTTGATGA  900
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  841  AGATAAAGAGACTGAGAATGTTAAAGTTACAATTGAAGGGAATAATTTAGATTTTGATGA  900

Query  901  GATTCAGGAAATTATTGAAAGTTTGGGAGGGACTATTCACAGTATAGATGAGGTTGTTGC  960
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  901  GATTCAGGAAATTATTGAAAGTTTGGGAGGGACTATTCACAGTATAGATGAGGTTGTTGC  960

Query  961  AGGTAAAAAGATTATTGAAGAAGTTAGAACACCACAAGAT  1000
            ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||
Sbjct  961  AGGTAAAAAGATTATTGAAGA-GTTAGAACACCACAAGAT  999

 

Query=  ERCC-00004_genbank |103488699|gb|DQ516752.1| Methanocaldococcus
jannaschii spike-in control MJ-500-35 genomic sequence
Length=500

Subject=  ERCC-00004
Length=523

Score =  917 bits (496),  Expect = 0.0
Identities = 499/500 (99%), Gaps = 1/500 (0%)
Strand=Plus/Plus

Query  1    TCTTGCTTCAACAATAACGTCTCTTTCAGAAGGCATTGGTATCTTTTCCCCACTTCCAAG  60
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  1    TCTTGCTTCAACAATAACGTCTCTTTCAGAAGGCATTGGTATCTTTTCCCCACTTCCAAG  60

Query  61   CATTTTTTCAACTAATCTTATGTTATTAACCATTTCCTTAAATTCTTCTGGGTCTGCTGA  120
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  61   CATTTTTTCAACTAATCTTATGTTATTAACCATTTCCTTAAATTCTTCTGGGTCTGCTGA  120

Query  121  CAAAGCATGATCAGGACCTTCCATATTTTTATCTAAGGTAAAGTGCTTCTCAATAACATC  180
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  121  CAAAGCATGATCAGGACCTTCCATATTTTTATCTAAGGTAAAGTGCTTCTCAATAACATC  180

Query  181  CGCTCCTAAGGCAACAGAAACTACTGGGGCGAGTATTCCCAATGTATGGTCAGAATATCC  240
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  181  CGCTCCTAAGGCAACAGAAACTACTGGGGCGAGTATTCCCAATGTATGGTCAGAATATCC  240

Query  241  CACAGGGATATTGAATATACTTTTCAAGGTTTTAATAGCGTTTAAATTGACATCTTCATA  300
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  241  CACAGGGATATTGAATATACTTTTCAAGGTTTTAATAGCGTTTAAATTGACATCTTCATA  300

Query  301  AGGGGTTGGGTAAGATGAAATACAATGCAATAAAATAATATCCCTGCATCCATTATTTTC  360
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  301  AGGGGTTGGGTAAGATGAAATACAATGCAATAAAATAATATCCCTGCATCCATTATTTTC  360

Query  361  TAAAACTTTAACTGCTTCCCAAATTTCCCCAATATCAGACATTCCTGTAGATAAAATCAC  420
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  361  TAAAACTTTAACTGCTTCCCAAATTTCCCCAATATCAGACATTCCTGTAGATAAAATCAC  420

Query  421  CGGCTTGCCTGTTTTTGCCACTTTTTCTAATAAGGGATAAAAGGTTAAATCACCAGAGGC  480
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  421  CGGCTTGCCTGTTTTTGCCACTTTTTCTAATAAGGGATAAAAGGTTAAATCACCAGAGGC  480

Query  481  AATTTTAAATGCAGGCACAT  500
            |||||||||| |||||||||
Sbjct  481  AATTTTAAAT-CAGGCACAT  499

 

Query=  ERCC-00007_genbank |116733904|gb|EF011068.1| Synthetic construct
spike-in microarray control hypothetical protein (ysdC) gene,
complete cds
Length=1121

 

Score = 2052 bits (1111),  Expect = 0.0
Identities = 1111/1111 (100%), Gaps = 0/1111 (0%)
Strand=Plus/Plus

Query  10    TTTATTGGTACGTAATTTCGTCAACCGTTTTTCGGTCTAACTTCTTAATGACTTCTGTAA  69
             ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  1     TTTATTGGTACGTAATTTCGTCAACCGTTTTTCGGTCTAACTTCTTAATGACTTCTGTAA  60

Query  70    TTAACTTTACCGCGTTTTCATAATCATCACGATGCAGCATGGCCGCGTGCGTATGAATGT  129
             ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  61    TTAACTTTACCGCGTTTTCATAATCATCACGATGCAGCATGGCCGCGTGCGTATGAATGT  120

Query  130   AGCGGGTTGCAATGGTAATGGACAGCGCAGGAACGCCATTTGCCGTCAAATGGATGGCAC  189
             ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  121   AGCGGGTTGCAATGGTAATGGACAGCGCAGGAACGCCATTTGCCGTCAAATGGATGGCAC  180

Query  190   CCGAATCAGTTCCGCCGCCGGCAATGGCATCAAATTGGTACGGAATGCCGGCTTCCTCCG  249
             ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  181   CCGAATCAGTTCCGCCGCCGGCAATGGCATCAAATTGGTACGGAATGCCGGCTTCCTCCG  240

Query  250   CAGTGGCTACAACTGCATCGCGCAAACCTTTGTGAGAGACCATGGATGCATCGTAAACGA  309
             ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  241   CAGTGGCTACAACTGCATCGCGCAAACCTTTGTGAGAGACCATGGATGCATCGTAAACGA  300

Query  310   TAATCTGCGGGCCTTTGCCCATTTTGCTCTGCGCTTCCTTCTCGGAAATGCCAGGCGTGT  369
             ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  301   TAATCTGCGGGCCTTTGCCCATTTTGCTCTGCGCTTCCTTCTCGGAAATGCCAGGCGTGT  360

Query  370   CTCCTGCTATCCCTACATCAACACCAAACGCAATATCAGGCTGAATGGTGTGTGCAGCCG  429
             ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  361   CTCCTGCTATCCCTACATCAACACCAAACGCAATATCAGGCTGAATGGTGTGTGCAGCCG  420

Query  430   TTTTCGCTCCCCTCAGCCCGACTTCCTCCTGCACGGTTCCGACGCCATACACTATATTTG  489
             ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  421   TTTTCGCTCCCCTCAGCCCGACTTCCTCCTGCACGGTTCCGACGCCATACACTATATTTG  480

Query  490   GATGATCTGTGTTTTGTAAGTTTCTTAACACATCAATAGCAATCGCACAGCCGATGCGGT  549
             ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  481   GATGATCTGTGTTTTGTAAGTTTCTTAACACATCAATAGCAATCGCACAGCCGATGCGGT  540

Query  550   TGTCCCAGGCCTTTGCGAGTAGGAATTTTTCATTGTTCATGACCGTAAATTCAAAATGCG  609
             ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  541   TGTCCCAGGCCTTTGCGAGTAGGAATTTTTCATTGTTCATGACCGTAAATTCAAAATGCG  600

Query  610   GAACGATCATATCTCCCGGAAGTACACCCCACTCCAAGGCTTCTTCCCGGCTTGAAGCTC  669
             ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  601   GAACGATCATATCTCCCGGAAGTACACCCCACTCCAAGGCTTCTTCCCGGCTTGAAGCTC  660

Query  670   CAATATCAATAAACATGTCTTTTATTTCCACTGAtttttttCTTGCTTCAGGAGACAAAA  729
             ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  661   CAATATCAATAAACATGTCTTTTATTTCCACTGATTTTTTTCTTGCTTCAGGAGACAAAA  720

Query  730   TATGAGGCGGCTTAGATCCGATAACCCCTGTGATTTCTCCtttttttGTGACAATGGTGA  789
             ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  721   TATGAGGCGGCTTAGATCCGATAACCCCTGTGATTTCTCCTTTTTTTGTGACAATGGTGA  780

Query  790   CGCGCTGAGCAAGCATAACCTGAGCCCACCAGCCGCCAACGGTTTGAAAACGGATAAAGC  849
             ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  781   CGCGCTGAGCAAGCATAACCTGAGCCCACCAGCCGCCAACGGTTTGAAAACGGATAAAGC  840

Query  850   CTTTATCTGTGATTTGTGTCACCATAAAGCCGACTTCATCCAAATGTCCGGCGATCATAA  909
             ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  841   CTTTATCTGTGATTTGTGTCACCATAAAGCCGACTTCATCCAAATGTCCGGCGATCATAA  900

Query  910   TTTTCGGGCCGTTTTCTGCACCAGttttttttGCAATTAAACTGCCCAGGCGATCTGTTG  969
             ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  901   TTTTCGGGCCGTTTTCTGCACCAGTTTTTTTTGCAATTAAACTGCCCAGGCGATCTGTTG  960

Query  970   TCACCTCATCAGCAAATGGTTCTATGTATGATTTCATCACTTGCCTTACTTCTCTTTCAT  1029
             ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  961   TCACCTCATCAGCAAATGGTTCTATGTATGATTTCATCACTTGCCTTACTTCTCTTTCAT  1020

Query  1030  TGCCCGGTATGCCTTTTGCATCTGTTAAATCTTTCAGCATGGTCAATGTTTCATCTAATT  1089
             ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  1021  TGCCCGGTATGCCTTTTGCATCTGTTAAATCTTTCAGCATGGTCAATGTTTCATCTAATT  1080

Query  1090  TTGCCATGTTCCAAACCCTCCTTGAGCTCGG  1120
             |||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  1081  TTGCCATGTTCCAAACCCTCCTTGAGCTCGG  1111

 

Query=  ERCC-00009_genbank |110339337|gb|DQ668364.1| Synthetic construct
clone TagJ microarray control
Length=960

Subject=  ERCC-00009
Length=984

Score = 1773 bits (960),  Expect = 0.0
Identities = 960/960 (100%), Gaps = 0/960 (0%)
Strand=Plus/Minus

Query  1    CAATGATAGGCTAGTCTCGCGCAGTACATGGTAGTTCAGCCAATAGATGCCTAGTACGCT  60
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  984  CAATGATAGGCTAGTCTCGCGCAGTACATGGTAGTTCAGCCAATAGATGCCTAGTACGCT  925

Query  61   GACGGCATTCAGAGTACGCTGATCGGCTTATGACGTATGTGACGCAGCTCTTAGCGCAAT  120
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  924  GACGGCATTCAGAGTACGCTGATCGGCTTATGACGTATGTGACGCAGCTCTTAGCGCAAT  865

Query  121  GTATGTGCTGTTATCGAAGCCTATGGCTGAGTATGTAACGCTATGGCGTGCTAGTCGTCT  180
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  864  GTATGTGCTGTTATCGAAGCCTATGGCTGAGTATGTAACGCTATGGCGTGCTAGTCGTCT  805

Query  181  CATATACGTCTGATGACCTCGTATCATGTTATAGGGCTGCGAACTGTCGATGATGGTCAC  240
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  804  CATATACGTCTGATGACCTCGTATCATGTTATAGGGCTGCGAACTGTCGATGATGGTCAC  745

Query  241  GACTCTGTCGATAGCTGTGTGACTCATTCAGAAGGTGTGCAGCCTATATGATACGCAGTC  300
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  744  GACTCTGTCGATAGCTGTGTGACTCATTCAGAAGGTGTGCAGCCTATATGATACGCAGTC  685

Query  301  GCATCCTATCTTACGTGTCAGTACTATGTGTGAGTGCTCCGCCCTAGTGCTGATGTATGC  360
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  684  GCATCCTATCTTACGTGTCAGTACTATGTGTGAGTGCTCCGCCCTAGTGCTGATGTATGC  625

Query  361  CCCATAGTGCTCAGTGGAGTCTCTCTTAGCATAGTGTCCGCTCATACATTAGATGGACGG  420
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  624  CCCATAGTGCTCAGTGGAGTCTCTCTTAGCATAGTGTCCGCTCATACATTAGATGGACGG  565

Query  421  CTCATTAGTATCATCGTCGGCTGATATAGGTCGTGGCTCCCTGTATATCGAGGTGAGTCT  480
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  564  CTCATTAGTATCATCGTCGGCTGATATAGGTCGTGGCTCCCTGTATATCGAGGTGAGTCT  505

Query  481  ATCTGGATCAACGTCGCACTATGATGTGCAAAGTGTCGTCCATGTATAGACAGTGCGCGT  540
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  504  ATCTGGATCAACGTCGCACTATGATGTGCAAAGTGTCGTCCATGTATAGACAGTGCGCGT  445

Query  541  ATCATATAGGATGCGGCGATCTCATACAGCGTTACGGTCGCTGCGTACTGTATAAGGATG  600
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  444  ATCATATAGGATGCGGCGATCTCATACAGCGTTACGGTCGCTGCGTACTGTATAAGGATG  385

Query  601  CTCTGTGAACTGTCATCGGTCCGATCAATTAGTCTAGTGTGCGTTATTCAGATCGAGTGA  660
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  384  CTCTGTGAACTGTCATCGGTCCGATCAATTAGTCTAGTGTGCGTTATTCAGATCGAGTGA  325

Query  661  GTACATGATTCGTCAGTGTGGATCAATTACAGTTAGGCCGCTGACACATTAGTAACGTCG  720
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  324  GTACATGATTCGTCAGTGTGGATCAATTACAGTTAGGCCGCTGACACATTAGTAACGTCG  265

Query  721  GCAAGCACTTAGTCGTGTCGTAAGCCAGTGTGTCGTGTCTTAGACGACTGTGTGTGATTC  780
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  264  GCAAGCACTTAGTCGTGTCGTAAGCCAGTGTGTCGTGTCTTAGACGACTGTGTGTGATTC  205

Query  781  TCGAGCGATTTATACATCCGTGACAGCGTTTATAGTGTGCTGACAGACTGGTTGGTTATC  840
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  204  TCGAGCGATTTATACATCCGTGACAGCGTTTATAGTGTGCTGACAGACTGGTTGGTTATC  145

Query  841  CAATGATCGACCTGGAGTCTAATATCTGACCACGCCTTGTAATCGTATGACACGCGCTTG  900
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  144  CAATGATCGACCTGGAGTCTAATATCTGACCACGCCTTGTAATCGTATGACACGCGCTTG  85

Query  901  ACACGACTGAATCCAGCTTAAGAGCCCTGCAACGCGATATACAGGCGCTGCTACCGATAT  960
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  84   ACACGACTGAATCCAGCTTAAGAGCCCTGCAACGCGATATACAGGCGCTGCTACCGATAT  25

 

Query=  ERCC-00012_genbank |114976952|gb|DQ883670.2| Synthetic construct
clone NISTag29 external RNA control sequence
Length=1000

Subject=  ERCC-00012
Length=994

Score = 1836 bits (994),  Expect = 0.0
Identities = 994/994 (100%), Gaps = 0/994 (0%)
Strand=Plus/Plus

Query  1    CGAGAGATGTTTGTAGGTGCGGAATGTGTGCGGTCTACCTTAGCTGTAGTGTGCGATGAA  60
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  1    CGAGAGATGTTTGTAGGTGCGGAATGTGTGCGGTCTACCTTAGCTGTAGTGTGCGATGAA  60

Query  61   CCTACACACAACGTGGTATAGTGGCCGATCTTAGAGTGATCCTATCACTCCTTACGCACC  120
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  61   CCTACACACAACGTGGTATAGTGGCCGATCTTAGAGTGATCCTATCACTCCTTACGCACC  120

Query  121  AGAAGGGATCTGCATACCAGGCGGAGAACTTGGAAGGCGGCTAGATCACTGAATTGCGGG  180
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  121  AGAAGGGATCTGCATACCAGGCGGAGAACTTGGAAGGCGGCTAGATCACTGAATTGCGGG  180

Query  181  AATCGGCATTTCGCATTCTTAGGATCTAAACCTTAGACCTCCGCGTGCGATTGCACCTGC  240
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  181  AATCGGCATTTCGCATTCTTAGGATCTAAACCTTAGACCTCCGCGTGCGATTGCACCTGC  240

Query  241  TTGGTACAGAGTTACAAGCCCCCCGCACTTTCTTTGCGGTCGTTAAGAGGGAAATCGCCC  300
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  241  TTGGTACAGAGTTACAAGCCCCCCGCACTTTCTTTGCGGTCGTTAAGAGGGAAATCGCCC  300

Query  301  AATTAGCAGAGTGTCAGGTGTTACGCGCGATTGAGCCGTCAGAAGAATCGATAGAGCCGC  360
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  301  AATTAGCAGAGTGTCAGGTGTTACGCGCGATTGAGCCGTCAGAAGAATCGATAGAGCCGC  360

Query  361  GTCGGGACCTTGATGGTATCTCTGCCTCAGCTAACCTGCTAGGTCCGTCCCCTGGGGATG  420
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  361  GTCGGGACCTTGATGGTATCTCTGCCTCAGCTAACCTGCTAGGTCCGTCCCCTGGGGATG  420

Query  421  ATCAGGACTGCGGATAGTAAATTGCGGGTTTGAAGCCGGACTTGCCGCCTAGGCAAAGCA  480
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  421  ATCAGGACTGCGGATAGTAAATTGCGGGTTTGAAGCCGGACTTGCCGCCTAGGCAAAGCA  480

Query  481  CAAAAACATCGGACATGTAGAAGTCTCATCGAACTCCTTTCCCGTTCATGCAGATACTTC  540
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  481  CAAAAACATCGGACATGTAGAAGTCTCATCGAACTCCTTTCCCGTTCATGCAGATACTTC  540

Query  541  AACTGTGACTAGTGGGGTTCGGGAGCACCCGCACTACTTCATTCTTGGCGGTGGGCCACT  600
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  541  AACTGTGACTAGTGGGGTTCGGGAGCACCCGCACTACTTCATTCTTGGCGGTGGGCCACT  600

Query  601  TTATGTGACTGTACATGGGACTTCTACTCATACCAATGTAAAGTATAGTTAACGCCCTGT  660
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  601  TTATGTGACTGTACATGGGACTTCTACTCATACCAATGTAAAGTATAGTTAACGCCCTGT  660

Query  661  CCACTCTACTCAGGCGTAATCATCGCGGAAGGCTATCCACAGCCCATCAGCGGTCTACAT  720
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  661  CCACTCTACTCAGGCGTAATCATCGCGGAAGGCTATCCACAGCCCATCAGCGGTCTACAT  720

Query  721  GTCCCAGCAGATTCACCTGTCCTGCGGGTCCGCGTCACAGCCTATTCTGAGGCTCTAAAG  780
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  721  GTCCCAGCAGATTCACCTGTCCTGCGGGTCCGCGTCACAGCCTATTCTGAGGCTCTAAAG  780

Query  781  ACTATGCGAACCAGGTGTCCCAGTCGATCAGACGACGAAGTCGGGAAGGAAGCATGGATA  840
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  781  ACTATGCGAACCAGGTGTCCCAGTCGATCAGACGACGAAGTCGGGAAGGAAGCATGGATA  840

Query  841  CCAAAAAGGCTTTATATACTGGGTTATCCTAGGGGATGTTTTTACCGGACTGGTCAGCCT  900
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  841  CCAAAAAGGCTTTATATACTGGGTTATCCTAGGGGATGTTTTTACCGGACTGGTCAGCCT  900

Query  901  CGGTGCGCTCGGCCTAGGCGCTTACTGCATGGGGGCTGTGGGCAATTTGGTATTTCTCAG  960
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  901  CGGTGCGCTCGGCCTAGGCGCTTACTGCATGGGGGCTGTGGGCAATTTGGTATTTCTCAG  960

Query  961  GACTATGGACaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaa  994
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  961  GACTATGGACAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAA  994

 

Query=  ERCC-00013_genbank |116733893|gb|EF011062.1| Synthetic construct
spike-in microarray control methionine aminopeptidase (map) gene,
partial cds
Length=794

Subject=  ERCC-00013
Length=808

Score = 1437 bits (778),  Expect = 0.0
Identities = 783/785 (99%), Gaps = 1/785 (0%)
Strand=Plus/Plus

Query  1    ACCGAGCTCAGATGTGAAGGATCTTCTTGGAGGATTaaaaaaaTGATTATCTGTAAAACC  60
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  1    ACCGAGCTCAGATGTGAAGGATCTTCTTGGAGGATTAAAAAAATGATTATCTGTAAAACC  60

Query  61   CCACGTGAACTTGGTATCATGCGGGAAGCAGGGCGAATCGTGGCTTTAACTCATGAAGAG  120
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  61   CCACGTGAACTTGGTATCATGCGGGAAGCAGGGCGAATCGTGGCTTTAACTCATGAAGAG  120

Query  121  TTAAAAAAGCACATTAAACCAGGAATCTCGACAAAAGAATTGGATCAAATTGCCGAACGT  180
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  121  TTAAAAAAGCACATTAAACCAGGAATCTCGACAAAAGAATTGGATCAAATTGCCGAACGT  180

Query  181  TTTATTAAGAAGCAGGGTGCAATCCCATCTTTTAAGGGGTATAATGGGTTTCGCGGGAGC  240
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  181  TTTATTAAGAAGCAGGGTGCAATCCCATCTTTTAAGGGGTATAATGGGTTTCGCGGGAGC  240

Query  241  ATTTGCGTATCAGTTAATGAAGAACTCGTTCACGGCATACCTGGCAGCAGGGTGCTGAAG  300
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  241  ATTTGCGTATCAGTTAATGAAGAACTCGTTCACGGCATACCTGGCAGCAGGGTGCTGAAG  300

Query  301  GACGGTGACATCATCAGTATTGATATCGGTGCTAAATTAAATGGTTATCATGGTGACTCT  360
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  301  GACGGTGACATCATCAGTATTGATATCGGTGCTAAATTAAATGGTTATCATGGTGACTCT  360

Query  361  GCATGGACATATCCGGTAGGAAACATCAGCGATGATGACAAAAAACTTCTGGAAGTGACA  420
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  361  GCATGGACATATCCGGTAGGAAACATCAGCGATGATGACAAAAAACTTCTGGAAGTGACA  420

Query  421  GAGGAGTCTTTATATAAAGGCTTGCAGGAAGCAAAACCAGGTGAACGTTTGTCGAATATT  480
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  421  GAGGAGTCTTTATATAAAGGCTTGCAGGAAGCAAAACCAGGTGAACGTTTGTCGAATATT  480

Query  481  TCCCACGCAATACAAACGTATGTCGAAAATGAGCAGTTTTCAGTTGTTAGGGAGTATGTC  540
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  481  TCCCACGCAATACAAACGTATGTCGAAAATGAGCAGTTTTCAGTTGTTAGGGAGTATGTC  540

Query  541  GGACATGGTGTTGGTCAAGACTTGCATGAGGACCCGCAAATTCCTCATTACGGTCCGCCC  600
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  541  GGACATGGTGTTGGTCAAGACTTGCATGAGGACCCGCAAATTCCTCATTACGGTCCGCCC  600

Query  601  AACAAAGGACCACGGCTTAAACCTGGCATGGTTCTCGCTATTGAACCTATGGTGAACGCT  660
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  601  AACAAAGGACCACGGCTTAAACCTGGCATGGTTCTCGCTATTGAACCTATGGTGAACGCT  660

Query  661  GGCAGCCGCTACGTGAAAACATTGGCTGATAACTGGACGGTTGTAACGGTAGATGGGAAA  720
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  661  GGCAGCCGCTACGTGAAAACATTGGCTGATAACTGGACGGTTGTAACGGTAGATGGGAAA  720

Query  721  AAGTGTGCTCATTTTGAACATACGATTGCGATTACGGAAACGGTTTTTGATATACTGACG  780
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||
Sbjct  721  AAGTGTGCTCATTTTGAACATACGATTGCGATTACGGAAACGGGTTTTGAT-TACTGACG  779

Query  781  AGAGT  785
            |||||
Sbjct  780  AGAGT  784

 

Query=  ERCC-00014_genbank |112819960|gb|DQ875385.1| Synthetic construct
microarray control DAP gene, complete sequence
Length=1937

Subject=  ERCC-00014
Length=1957

Score = 3567 bits (1931),  Expect = 0.0
Identities = 1936/1938 (99%), Gaps = 1/1938 (0%)
Strand=Plus/Minus

Query  1     AAAAGAAGAAGGAAAGTAGAGGAGATCAAGATGTCAAACGAAACAATTAAATTAGTCATT  60
             ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  1957  AAAAGAAGAAGGAAAGTAGAGGAGATCAAGATGTCAAACGAAACAATTAAATTAGTCATT  1898

Query  61    GCGGGACCGCGTGGAAGAATGGGGCAGGAAGCTGTTAAATTGGCAGAACGAACACCACAT  120
             ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  1897  GCGGGACCGCGTGGAAGAATGGGGCAGGAAGCTGTTAAATTGGCAGAACGAACACCACAT  1838

Query  121   TTTGACCTTGTAGGGGCCATAGACCATACATACGATCAGCAAAAATTATCTGATGTGATG  180
             ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  1837  TTTGACCTTGTAGGGGCCATAGACCATACATACGATCAGCAAAAATTATCTGATGTGATG  1778

Query  181   CCTGTTGAGTCAGATGCTTTCATTTACACAGATATCCATGCCTGTTTTACAGAAACACAA  240
             ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  1777  CCTGTTGAGTCAGATGCTTTCATTTACACAGATATCCATGCCTGTTTTACAGAAACACAA  1718

Query  241   CCGGATGTCTTGATTGATTTAACAACGCCCGAAATCGGAAAAGTACATACAAAAATTGCA  300
             ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  1717  CCGGATGTCTTGATTGATTTAACAACGCCCGAAATCGGAAAAGTACATACAAAAATTGCA  1658

Query  301   TTAGAGCACGGAGTCCGTCCAGTTGTCGGAACAACCGGTTTCTCAGAAGCTGATTTAAAA  360
             ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  1657  TTAGAGCACGGAGTCCGTCCAGTTGTCGGAACAACCGGTTTCTCAGAAGCTGATTTAAAA  1598

Query  361   GAGCTCACATCTTTAACAGAAGAAAAAGGGATCGGAGCCATCATCGCGCCAAATTTTGCG  420
             ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  1597  GAGCTCACATCTTTAACAGAAGAAAAAGGGATCGGAGCCATCATCGCGCCAAATTTTGCG  1538

Query  421   CTCGGTGCGATACTGATGATGAAATTTTCAAAAATGGCTGCCAACTATTTTGAGGATGTT  480
             ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  1537  CTCGGTGCGATACTGATGATGAAATTTTCAAAAATGGCTGCCAACTATTTTGAGGATGTT  1478

Query  481   GAGATTATTGAGCTTCATCATGACCAGAAGCTTGACGCACCAAGCGGAACTGCGCTTAAA  540
             ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  1477  GAGATTATTGAGCTTCATCATGACCAGAAGCTTGACGCACCAAGCGGAACTGCGCTTAAA  1418

Query  541   ACAGCGGAAATGATTTCAGAAGTCCGTAAAGAAAAGCAGCAAGGACATCCGGATGAAAAA  600
             ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  1417  ACAGCGGAAATGATTTCAGAAGTCCGTAAAGAAAAGCAGCAAGGACATCCGGATGAAAAA  1358

Query  601   GAAATTCTCCCAGGAGCAAGAGGAGCGGAGCAAAACGGTATTCGCTTGCACAGCGTCCGT  660
             ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  1357  GAAATTCTCCCAGGAGCAAGAGGAGCGGAGCAAAACGGTATTCGCTTGCACAGCGTCCGT  1298

Query  661   CTTCCGGGACTGATCGCGCATCAGGAGGTCATGTTCGGCATGGATGGCCAAACGCTTCAG  720
             ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  1297  CTTCCGGGACTGATCGCGCATCAGGAGGTCATGTTCGGCATGGATGGCCAAACGCTTCAG  1238

Query  721   ATACGCCATGATTCTTATAACCGTGCTTCTTTCATGTCAGGCGTTAAACTGTCAGTCGAA  780
             ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  1237  ATACGCCATGATTCTTATAACCGTGCTTCTTTCATGTCAGGCGTTAAACTGTCAGTCGAA  1178

Query  781   CAAGTCATGAAGATTGATCAGCTTGTGTATGGTTTAGAAAATATCATTGATTAGACGGGG  840
             ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  1177  CAAGTCATGAAGATTGATCAGCTTGTGTATGGTTTAGAAAATATCATTGATTAGACGGGG  1118

Query  841   GGATAAACAATGAAAATTGCTTTGATCGCGCATGACAAGAAAAAACAGGATATGGTTCAA  900
             ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  1117  GGATAAACAATGAAAATTGCTTTGATCGCGCATGACAAGAAAAAACAGGATATGGTTCAA  1058

Query  901   TTTACGACTGCCTATCGGGATATTTTAAAGAATCATGATCTATACGCAACCGGAACCACA  960
             ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  1057  TTTACGACTGCCTATCGGGATATTTTAAAGAATCATGATCTATACGCAACCGGAACCACA  998

Query  961   GGGTTGAAAATTCATGAGGCGACAGGTCTTCAAATTGAACGTTTTCAATCCGGCCCTTTA  1020
             ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  997   GGGTTGAAAATTCATGAGGCGACAGGTCTTCAAATTGAACGTTTTCAATCCGGCCCTTTA  938

Query  1021  GGGGGAGACCAGCAAATCGGTGCACTGATCGCTGCCAATGCACTCGATCTTGTCAttttt  1080
             ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  937   GGGGGAGACCAGCAAATCGGTGCACTGATCGCTGCCAATGCACTCGATCTTGTCATTTTT  878

Query  1081  ttGCGCGACCCGCTGACCGCGCAGCCGCATGAACCGGATGTCTCGGCATTAATCCGTTTA  1140
             ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  877   TTGCGCGACCCGCTGACCGCGCAGCCGCATGAACCGGATGTCTCGGCATTAATCCGTTTA  818

Query  1141  TGTGATGTGTATTCCATTCCGCTCGCCACAAATATGGGTACTGCGGAAATTCTTGTGCGC  1200
             ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  817   TGTGATGTGTATTCCATTCCGCTCGCCACAAATATGGGTACTGCGGAAATTCTTGTGCGC  758

Query  1201  ACACTTGATGAAGGTGTTTTCGAATTCCGTGACCTTCTTCGGGGAGAAGAGCCGAATGTA  1260
             ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  757   ACACTTGATGAAGGTGTTTTCGAATTCCGTGACCTTCTTCGGGGAGAAGAGCCGAATGTA  698

Query  1261  TAATGCTGACGTTCTTGCTTTTGGCGCCCACAGTGATGATGTCGAGATCGGAATGGGCGG  1320
             ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  697   TAATGCTGACGTTCTTGCTTTTGGCGCCCACAGTGATGATGTCGAGATCGGAATGGGCGG  638

Query  1321  CACAATAGCGAAGTTTGTCAAACAGGaaaaaaaaGTAATGATATGCGATTTGACAGAAGC  1380
             ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  637   CACAATAGCGAAGTTTGTCAAACAGGAAAAAAAAGTAATGATATGCGATTTGACAGAAGC  578

Query  1381  GGAACTCTCTTCTAACGGTACGGTCAGTTTGCGTAAAGAAGAAGCAGCTGAAGCAGCCCG  1440
             ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  577   GGAACTCTCTTCTAACGGTACGGTCAGTTTGCGTAAAGAAGAAGCAGCTGAAGCAGCCCG  518

Query  1441  CATATTAGGCGCAGATAAAAGAATTCAGCTAACGCTTCCAGACCGCGGCCTAATAATGAG  1500
             ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  517   CATATTAGGCGCAGATAAAAGAATTCAGCTAACGCTTCCAGACCGCGGCCTAATAATGAG  458

Query  1501  TGATCAGGCAATTCGGTCAATTGTCACTGTCATCAGAATCTGTCGGCCAAAAGCGGTTTT  1560
             ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  457   TGATCAGGCAATTCGGTCAATTGTCACTGTCATCAGAATCTGTCGGCCAAAAGCGGTTTT  398

Query  1561  TATGCCGTATAAAAAGGATCGCCATCCGGATCACGGCAATGCGGCTGCACTGGTGGAAGA  1620
             ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  397   TATGCCGTATAAAAAGGATCGCCATCCGGATCACGGCAATGCGGCTGCACTGGTGGAAGA  338

Query  1621  AGCGATCTTTTCCGCCGGAATCCATAAATATAAAGACGAAAAAAGCCTTCCGGCGCATAA  1680
             ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  337   AGCGATCTTTTCCGCCGGAATCCATAAATATAAAGACGAAAAAAGCCTTCCGGCGCATAA  278

Query  1681  AGTCAGCAAGGTTTACTATTATATGATAAATGGTTTTCATCAGCCGGATTTTGTTATTGA  1740
             ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  277   AGTCAGCAAGGTTTACTATTATATGATAAATGGTTTTCATCAGCCGGATTTTGTTATTGA  218

Query  1741  TATCTCGGATACAATAGAGGCAAAGAAACAAAGCCTCAACGCCTACAAAAGCCAGTTTAT  1800
             ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  217   TATCTCGGATACAATAGAGGCAAAGAAACAAAGCCTCAACGCCTACAAAAGCCAGTTTAT  158

Query  1801  CCCGTCAAAGGATTCCGTTTCTACTCCTCTGACGAATGGGTATATTGAAATCGTTGAAGC  1860
             ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  157   CCCGTCAAAGGATTCCGTTTCTACTCCTCTGACGAATGGGTATATTGAAATCGTTGAAGC  98

Query  1861  GAGAGAAAAGCTTTACGGTAAAGAAGCGGGCGTGGAGTATGCCGAAG-TTTCTTTTCCAA  1919
             ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||
Sbjct  97    GAGAGAAAAGCTTTACGGTAAAGAAGCGGGCGTGGAGTATGCCGAAGGTTTCTTTTCCAA  38

Query  1920  ACGGATGCTGATGCTTGA  1937
             ||||||||||| ||||||
Sbjct  37    ACGGATGCTGAAGCTTGA  20

Query=  ERCC-00016_genbank |114976930|gb|DQ883664.2| Synthetic construct
clone NISTag23 external RNA control sequence
Length=850

Subject=  ERCC-00016
Length=844

Score = 1559 bits (844),  Expect = 0.0
Identities = 844/844 (100%), Gaps = 0/844 (0%)
Strand=Plus/Plus

Query  1    GTTGTAACGAATGTTAATTTAGGAGGCAAGAGTTTGTGGGCGCGGACTTGCAGCTCGTAA  60
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  1    GTTGTAACGAATGTTAATTTAGGAGGCAAGAGTTTGTGGGCGCGGACTTGCAGCTCGTAA  60

Query  61   CGCTCTAAAAGGGTTATGCCGCTGAGGCGGGACCATAGTCAGGAAGTTTGTCCGATCCGC  120
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  61   CGCTCTAAAAGGGTTATGCCGCTGAGGCGGGACCATAGTCAGGAAGTTTGTCCGATCCGC  120

Query  121  TCCAGTTGTCAAGAGTAGAGGATTTCGTGTTCGCCGATACTGCCGAAAACGTCATACCGA  180
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  121  TCCAGTTGTCAAGAGTAGAGGATTTCGTGTTCGCCGATACTGCCGAAAACGTCATACCGA  180

Query  181  AGCAATTCTGTCGTCACTCTGTATGTCCGTGCCCCACCTTCGAGTATGAGTTTTAAAGTT  240
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  181  AGCAATTCTGTCGTCACTCTGTATGTCCGTGCCCCACCTTCGAGTATGAGTTTTAAAGTT  240

Query  241  CGTGCAGAGACATAGCTCGCGCACTCCCTGTGTGATGCCGGTCGGCCGACACATGCTTCA  300
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  241  CGTGCAGAGACATAGCTCGCGCACTCCCTGTGTGATGCCGGTCGGCCGACACATGCTTCA  300

Query  301  ATGTGCCTTGAACTTGCATTCGAAAGAATGTCCTTATCTTGATCGGCCATTGTAATGCAA  360
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  301  ATGTGCCTTGAACTTGCATTCGAAAGAATGTCCTTATCTTGATCGGCCATTGTAATGCAA  360

Query  361  CGCTCTCCTTTCATTGACACGAGGTTCGTAGATGGCTGTTACTCGCGGACGTTAAATAAA  420
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  361  CGCTCTCCTTTCATTGACACGAGGTTCGTAGATGGCTGTTACTCGCGGACGTTAAATAAA  420

Query  421  ACTATCAGCGTCAGCGGATTAGGAGGCTTACGGGGGAACCTACAATTGTTCGCCGCATGG  480
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  421  ACTATCAGCGTCAGCGGATTAGGAGGCTTACGGGGGAACCTACAATTGTTCGCCGCATGG  480

Query  481  TCCGAAGGCGCCATGTCCCTCAGCGGAGCGACAACAATTACTACTGGAGCTATTGTAAAT  540
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  481  TCCGAAGGCGCCATGTCCCTCAGCGGAGCGACAACAATTACTACTGGAGCTATTGTAAAT  540

Query  541  ACGCAGCAACAAGCGTCCAGACATTTGCCGCTGACCTCCAGTCGCATGGACGGGGGAGAA  600
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  541  ACGCAGCAACAAGCGTCCAGACATTTGCCGCTGACCTCCAGTCGCATGGACGGGGGAGAA  600

Query  601  CAGCTGGAGCAATGCATCATTCGCTGAGGGACATCCAATCACGGAATCAAGGAAGAATTA  660
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  601  CAGCTGGAGCAATGCATCATTCGCTGAGGGACATCCAATCACGGAATCAAGGAAGAATTA  660

Query  661  CCAATTTTACCTGTAACGAAACCAATTTATTACTGACGCAGAGTGAATCACATCTATAGC  720
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  661  CCAATTTTACCTGTAACGAAACCAATTTATTACTGACGCAGAGTGAATCACATCTATAGC  720

Query  721  GGTTACGACCCTCCAGAGTGATCCGACGGCGATGTGTCTTTGACCCCCGTGTGACTGGTG  780
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  721  GGTTACGACCCTCCAGAGTGATCCGACGGCGATGTGTCTTTGACCCCCGTGTGACTGGTG  780

Query  781  TTCCTGTCGTATCCGCAACATGTTTACTCATCACTACGTTaaaaaaaaaaaaaaaaaaaa  840
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  781  TTCCTGTCGTATCCGCAACATGTTTACTCATCACTACGTTAAAAAAAAAAAAAAAAAAAA  840

Query  841  aaaa  844
            ||||
Sbjct  841  AAAA  844

 

Query=  ERCC-00017_genbank |92111298|gb|DQ459420.1| Synthetic construct
microarray control MC09 mRNA, complete sequence
Length=1143

Subject=  ERCC-00017
Length=1136

Score = 2071 bits (1121),  Expect = 0.0
Identities = 1133/1138 (99%), Gaps = 4/1138 (0%)
Strand=Plus/Plus

Query  1     GAGAACTGAAAGTGAGTCCCAACGAGAGAGGTGCATCTGTCCAGTGAGAGCTGACTGTCT  60
             ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  1     GAGAACTGAAAGTGAGTCCCAACGAGAGAGGTGCATCTGTCCAGTGAGAGCTGACTGTCT  60

Query  61    GCGACAACACTAGTCGGTCCAGGCATGGATTTCGCGACCTCACAACTTAAGGAGGCGGTA  120
             ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  61    GCGACAACACTAGTCGGTCCAGGCATGGATTTCGCGACCTCACAACTTAAGGAGGCGGTA  120

Query  121   AATCAGATGACAGCGCGACCCTGTAATGGGTGACCTGCTAGTGGAGGTGGCGCGGTGTCC  180
             ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  121   AATCAGATGACAGCGCGACCCTGTAATGGGTGACCTGCTAGTGGAGGTGGCGCGGTGTCC  180

Query  181   CAGATACAAGGATCTCGATGTAGTACCCTCACATAACTTTGCTCCCTGAAATAACATTCG  240
             ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  181   CAGATACAAGGATCTCGATGTAGTACCCTCACATAACTTTGCTCCCTGAAATAACATTCG  240

Query  241   ATCACTCTAATGAATCCCTTAAGCCAGGAGCGTTAGTGTCAAACGCAACGCCCCGGGTTC  300
             ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  241   ATCACTCTAATGAATCCCTTAAGCCAGGAGCGTTAGTGTCAAACGCAACGCCCCGGGTTC  300

Query  301   ATGATCCTGGATGGCTGGTCGAACCAGGGAGATGTCACTCTAATAGGTGCCAAATGTACC  360
             ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  301   ATGATCCTGGATGGCTGGTCGAACCAGGGAGATGTCACTCTAATAGGTGCCAAATGTACC  360

Query  361   GCAGAACCTCGTAGGCGTTCGCCCAATTGGACCCGAGGTCATAATGTAGACGGGCACGCT  420
             ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||
Sbjct  361   GCAGAACCTCGTAGGCGTTCGCCCAATTGGACCCGAGGT-ATAATGTAGACGGGCACGCT  419

Query  421   GACTGGGCAAAAGATTACAATCCCAGTTACCATACAGTC-CCC-GTCAGGATCGGGGCAT  478
             ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||
Sbjct  420   GACTGGGCAAAAGATTACAATCCCAGTTACCATACAGTCGCCCGGTCAGGATCGGGGCAT  479

Query  479   GAAGGCAATATGTTGGCGCATCCCAGTCTTTCCGTAGAAACAGTGGCTAACGACGGAGAT  538
             ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  480   GAAGGCAATATGTTGGCGCATCCCAGTCTTTCCGTAGAAACAGTGGCTAACGACGGAGAT  539

Query  539   ACTGCCGGGCAAGAAACCTTGACCAAGTATGCGCGCCTTGTGAGTCTCCATGGACTTGCT  598
             ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  540   ACTGCCGGGCAAGAAACCTTGACCAAGTATGCGCGCCTTGTGAGTCTCCATGGACTTGCT  599

Query  599   GCACCTACAAATCCGGAAGGGCGCTTATAGTGCTTGCTAGCACTCCCTGGAATATCTTAA  658
             ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  600   GCACCTACAAATCCGGAAGGGCGCTTATAGTGCTTGCTAGCACTCCCTGGAATATCTTAA  659

Query  659   TCCCGCCAGCTCATGGGACGGGAGGAATGTGTTAGACCATAAACAGAGGGCTGGCCAACA  718
             ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  660   TCCCGCCAGCTCATGGGACGGGAGGAATGTGTTAGACCATAAACAGAGGGCTGGCCAACA  719

Query  719   ATCAGAGGGAAGTAAGCCCCGCAAAAGGATTCTGCGGGAACCGAATTACACAACGTAAGG  778
             ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  720   ATCAGAGGGAAGTAAGCCCCGCAAAAGGATTCTGCGGGAACCGAATTACACAACGTAAGG  779

Query  779   ACGTACCTGCTCCTACCCCCGAACCACTGTCAATACGATAATGCGCCCAAAACGAGGGAT  838
             ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  780   ACGTACCTGCTCCTACCCCCGAACCACTGTCAATACGATAATGCGCCCAAAACGAGGGAT  839

Query  839   CGAGACGGTCGGAGTGGCAGTCCAGCTTAAACAGGTGCTCGCCGAAACTAGCTGGCCAGG  898
             ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  840   CGAGACGGTCGGAGTGGCAGTCCAGCTTAAACAGGTGCTCGCCGAAACTAGCTGGCCAGG  899

Query  899   GTGAGGCATGGATTCAAAGCCCAACGACCGAAGAAAGTTCCGACATACAATTACTCGGCT  958
             ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  900   GTGAGGCATGGATTCAAAGCC-AACGACCGAAGAAAGTTCCGACATACAATTACTCGGCT  958

Query  959   TTTGGCAATACCCAGGCGAGAGGTAAGCCCAAGCCATACCGGGAATGACCTGAGATCCAC  1018
             ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  959   TTTGGCAATACCCAGGCGAGAGGTAAGCCCAAGCCATACCGGGAATGACCTGAGATCCAC  1018

Query  1019  TTAGTAAGTCTTACGAGATGATCCCGACCCAGGACTGGAGCTAGGCGGTTGTGCAAGTAA  1078
             ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||
Sbjct  1019  TTAGTAAGTCTTACGAGATGATCCCGACCCAGGACTGGAGCTAGGCGGTTGCGCAAGTAA  1078

Query  1079  CTTCATCATGTATCGCTGGGGAATAATGTTCCTGGaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaa  1136
             ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  1079  CTTCATCATGTATCGCTGGGGAATAATGTTCCTGGAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAA  1136

Query=  ERCC-00018_genbank |116733899|gb|EF011065.1| Synthetic construct
spike-in microarray control hypothetical protein (yurP) gene,
complete cds
Length=1013

Subject=  ERCC-00018
Length=1032

Score = 1860 bits (1007),  Expect = 0.0
Identities = 1009/1010 (99%), Gaps = 0/1010 (0%)
Strand=Plus/Plus

Query  4     GAGCTCAGTGAAGGATTTGAGTCAGGCCACAGCAAAAGTAAATCGTGAGGTTCAAGCTTT  63
             ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  1     GAGCTCAGTGAAGGATTTGAGTCAGGCCACAGCAAAAGTAAATCGTGAGGTTCAAGCTTT  60

Query  64    CTTGCAGGATTTGAAAGGGAAAACCATTGATCATGTATTCTTTGTCGCATGCGGAGGGTC  123
             ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  61    CTTGCAGGATTTGAAAGGGAAAACCATTGATCATGTATTCTTTGTCGCATGCGGAGGGTC  120

Query  124   TTCTGCCATTATGTATCCGAGTAAGTATGTGTTTGACAGAGAGTCAAAATCAATAAACTC  183
             ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  121   TTCTGCCATTATGTATCCGAGTAAGTATGTGTTTGACAGAGAGTCAAAATCAATAAACTC  180

Query  184   CGATCTCTACAGCGCCAACGAATTTATTCAGCGCAACCCTGTTCAGCTTGGTGAAAAGTC  243
             ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  181   CGATCTCTACAGCGCCAACGAATTTATTCAGCGCAACCCTGTTCAGCTTGGTGAAAAGTC  240

Query  244   TCTTGTTATTTTGTGCTCGCATTCGGGAAATACCCCGGAGACAGTCAAAGCTGCTGCGTT  303
             ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  241   TCTTGTTATTTTGTGCTCGCATTCGGGAAATACCCCGGAGACAGTCAAAGCTGCTGCGTT  300

Query  304   TGCAAGGGGCAAGGGCGCACTTACGATTGCGATGACGTTTAAACCGGAGTCTCCTTTAGC  363
             ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  301   TGCAAGGGGCAAGGGCGCACTTACGATTGCGATGACGTTTAAACCGGAGTCTCCTTTAGC  360

Query  364   GCAGGAAGCGCAATATGTTGCCCAGTACGATTGGGGTGATGAGGCGCTTGCGATCAATAC  423
             ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  361   GCAGGAAGCGCAATATGTTGCCCAGTACGATTGGGGTGATGAGGCGCTTGCGATCAATAC  420

Query  424   AAACTATGGCGTTTTGTATCAAATCGTTTTTGGAACCCTGCAAGTATTAGAAAACAATAC  483
             ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  421   AAACTATGGCGTTTTGTATCAAATCGTTTTTGGAACCCTGCAAGTATTAGAAAACAATAC  480

Query  484   GAAATTTGAGCAAGCAATTGAAGGCTTAGATCAATTGCAGGCTGTATATGAAAAAGCCCT  543
             ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  481   GAAATTTGAGCAAGCAATTGAAGGCTTAGATCAATTGCAGGCTGTATATGAAAAAGCCCT  540

Query  544   TAAGCAGGAAGCTGACAACGCCAAGCAATTTGCAAAAGCCCATGAAAAAGAAAGCATTAT  603
             ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  541   TAAGCAGGAAGCTGACAACGCCAAGCAATTTGCAAAAGCCCATGAAAAAGAAAGCATTAT  600

Query  604   TTATACCATGGCAAGCGGTGCAAACTACGGTGTCGCTTACTCCTACAGCATCTGCATTCT  663
             ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  601   TTATACCATGGCAAGCGGTGCAAACTACGGTGTCGCTTACTCCTACAGCATCTGCATTCT  660

Query  664   CATGGAAATGCAATGGATTCATTCCCACGCCATTCATGCCGGAGAATATTTTCACGGACC  723
             ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  661   CATGGAAATGCAATGGATTCATTCCCACGCCATTCATGCCGGAGAATATTTTCACGGACC  720

Query  724   GTTTGAAATTATTGATGAATCCGTGCCGTTTATCATCCTGCTCGGTTTAGATGAAACAAG  783
             ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  721   GTTTGAAATTATTGATGAATCCGTGCCGTTTATCATCCTGCTCGGTTTAGATGAAACAAG  780

Query  784   ACCTCTTGAAGAGCGGGCGCTTACCTTCTCGAAAAAGTATGGCAAAAAGCTCACTGTGCT  843
             ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  781   ACCTCTTGAAGAGCGGGCGCTTACCTTCTCGAAAAAGTATGGCAAAAAGCTCACTGTGCT  840

Query  844   TGATGCTGCATCTTACGACTTCACTGCAATTGACGATTCAGTTAAAGGCTATCTTGCTCC  903
             ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  841   TGATGCTGCATCTTACGACTTCACTGCAATTGACGATTCAGTTAAAGGCTATCTTGCTCC  900

Query  904   GCTCGTTCTCAATCGTGTGCTGAGAAGCTATGCAGACGAGCTGGCAGAGGAGAGAAATCA  963
             ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  901   GCTCGTTCTCAATCGTGTGCTGAGAAGCTATGCAGACGAGCTGGCAGAGGAGAGAAATCA  960

Query  964   TCCTTTATCTCATATAAGATACATGTGGAAAGTTGAGTATTGAATTCTGG  1013
             |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  961   TCCTTTATCTCATAGAAGATACATGTGGAAAGTTGAGTATTGAATTCTGG  1010

Query=  ERCC-00019_genbank |114975628|gb|DQ883651.2| Synthetic construct
clone NISTag10 external RNA control sequence
Length=650

Subject=  ERCC-00019
Length=644

Score = 1190 bits (644),  Expect = 0.0
Identities = 644/644 (100%), Gaps = 0/644 (0%)
Strand=Plus/Plus

Query  1    CTTTAATGGTTGTACATACTTGACGGATTGCAGTGAGTGTATTCCCGTCCCATCGTATGG  60
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  1    CTTTAATGGTTGTACATACTTGACGGATTGCAGTGAGTGTATTCCCGTCCCATCGTATGG  60

Query  61   GTAACCCATAGGGGCGTGTCATTCAGCACTTCGGATAGTGTTTGACCGCGTCGCTCCCAT  120
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  61   GTAACCCATAGGGGCGTGTCATTCAGCACTTCGGATAGTGTTTGACCGCGTCGCTCCCAT  120

Query  121  GTCGCCTTTCAGGAGAAATAGTACAGGCTGCTGGCTCATGTTTCCTTCTACGCTGCACTT  180
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  121  GTCGCCTTTCAGGAGAAATAGTACAGGCTGCTGGCTCATGTTTCCTTCTACGCTGCACTT  180

Query  181  GCGGGCATAGAGGTCGGTTGCGATCTATATTCGGAGATAACTATTCACCCAGCGCCACTC  240
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  181  GCGGGCATAGAGGTCGGTTGCGATCTATATTCGGAGATAACTATTCACCCAGCGCCACTC  240

Query  241  GAATATCCCCTCTTCTGAGCAAGAGGCCAATAAATGCTCAAAAACGAGCGATTGTCCAAC  300
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  241  GAATATCCCCTCTTCTGAGCAAGAGGCCAATAAATGCTCAAAAACGAGCGATTGTCCAAC  300

Query  301  GACATAAAGGGAGACTGTAAGGTCCTAGCGCTCTGTCTGTTAGTGAGAGCCCTAGGTAAA  360
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  301  GACATAAAGGGAGACTGTAAGGTCCTAGCGCTCTGTCTGTTAGTGAGAGCCCTAGGTAAA  360

Query  361  CACGGTCGTTATCCCCTAGAGCGTGAAGCGGCTGTAGATATCTCTGAATCTTCGACCTTG  420
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  361  CACGGTCGTTATCCCCTAGAGCGTGAAGCGGCTGTAGATATCTCTGAATCTTCGACCTTG  420

Query  421  GTGTAGATGGGGCTAGGTCAAAAAGCGGTAGCGATTAGCACTTGTATACACTCTCCCCCT  480
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  421  GTGTAGATGGGGCTAGGTCAAAAAGCGGTAGCGATTAGCACTTGTATACACTCTCCCCCT  480

Query  481  ACTAAGTATGTAAGGCCTGACCGGAGATTTGTCCATGCTCACCAGGACCGATAGTTGGGC  540
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  481  ACTAAGTATGTAAGGCCTGACCGGAGATTTGTCCATGCTCACCAGGACCGATAGTTGGGC  540

Query  541  CCCGGTAATCTTGCCGCCGTAGGGAGTACGAGCAGTGCACCGTTGAAACAAGCACAGGAG  600
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  541  CCCGGTAATCTTGCCGCCGTAGGGAGTACGAGCAGTGCACCGTTGAAACAAGCACAGGAG  600

Query  601  GTATGAAGCATCAGACCTGaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaa  644
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  601  GTATGAAGCATCAGACCTGAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAA  644

Query=  ERCC-00022_genbank |116662509|gb|DQ855004.2| Synthetic construct
clone AG019.0111 external RNA control sequence
Length=727

Subject=  ERCC-00022
Length=751

Score = 1343 bits (727),  Expect = 0.0
Identities = 727/727 (100%), Gaps = 0/727 (0%)
Strand=Plus/Plus

Query  1    CCCGGGCCAATTGCCTCTATAACTAGAGCTGAGCCCACCATTAAAGCGATTTTTTCGCAC  60
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  1    CCCGGGCCAATTGCCTCTATAACTAGAGCTGAGCCCACCATTAAAGCGATTTTTTCGCAC  60

Query  61   TTAGCCGTAATAAATATAATGATCCCGCGGTGTAGTAATTCTACGGAATGCACGGAATGT  120
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  61   TTAGCCGTAATAAATATAATGATCCCGCGGTGTAGTAATTCTACGGAATGCACGGAATGT  120

Query  121  CATAAGCAGAAGGACGTGATGTGCAACCTACTCCCCTTTCCCAAGTAAATGTACGGGAAT  180
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  121  CATAAGCAGAAGGACGTGATGTGCAACCTACTCCCCTTTCCCAAGTAAATGTACGGGAAT  180

Query  181  TATCGTTTCGTTACCGACAACCATGGGGCCACGTGGCCAGTTTGCCCCTATTAGGTGGAT  240
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  181  TATCGTTTCGTTACCGACAACCATGGGGCCACGTGGCCAGTTTGCCCCTATTAGGTGGAT  240

Query  241  AGGCACTGAGTACAGAATATATAAAGCGTGACGGATGAAAACGCACCCATTGTCACCGAT  300
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  241  AGGCACTGAGTACAGAATATATAAAGCGTGACGGATGAAAACGCACCCATTGTCACCGAT  300

Query  301  TGTGACTAGTTGACCCTATCACCCCTACTGTGTTCAGACGTCGTTCTACTAAAGGCCCGT  360
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  301  TGTGACTAGTTGACCCTATCACCCCTACTGTGTTCAGACGTCGTTCTACTAAAGGCCCGT  360

Query  361  GCCGCCGGAAGCTCATTTAAAAAGAACTCGTAAGTAAGCCGGCGACATATCTAGCAAAAC  420
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  361  GCCGCCGGAAGCTCATTTAAAAAGAACTCGTAAGTAAGCCGGCGACATATCTAGCAAAAC  420

Query  421  ATAGTCCCCCTTCTGCTCAGAGGTTATCCATAAGTGACTTACCAGATGGAGTGCCAAGGT  480
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  421  ATAGTCCCCCTTCTGCTCAGAGGTTATCCATAAGTGACTTACCAGATGGAGTGCCAAGGT  480

Query  481  ACAGACCTCCCTCCCAACTGGTTCCTGCAGGACGTTGCTATATCACTTCTGGCCGTCCTT  540
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  481  ACAGACCTCCCTCCCAACTGGTTCCTGCAGGACGTTGCTATATCACTTCTGGCCGTCCTT  540

Query  541  ATGGGTTACCCCTCGCGAGTGCCATCGCATCGACTGACACACCTGCATTCTATTTTATGC  600
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  541  ATGGGTTACCCCTCGCGAGTGCCATCGCATCGACTGACACACCTGCATTCTATTTTATGC  600

Query  601  TCTACTGACGGCGACGAGTTTTTTGTAGCGTCGATCGCGGAGTTAAGGTCATTGGGGAAT  660
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  601  TCTACTGACGGCGACGAGTTTTTTGTAGCGTCGATCGCGGAGTTAAGGTCATTGGGGAAT  660

Query  661  AGAACCATAGCGCTTGGGTTTGTGACTTTCTCCCTAGATACGCGTTTGCTGACTGCGCTA  720
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  661  AGAACCATAGCGCTTGGGTTTGTGACTTTCTCCCTAGATACGCGTTTGCTGACTGCGCTA  720

Query  721  CATGGAT  727
            |||||||
Sbjct  721  CATGGAT  727

Query=  ERCC-00023_genbank |103488691|gb|DQ516744.1| Methanocaldococcus
jannaschii spike-in control MJ-250-27 genomic sequence
Length=250

Subject=  ERCC-00023
Length=273

Score =  462 bits (250),  Expect = 3e-135
Identities = 250/250 (100%), Gaps = 0/250 (0%)
Strand=Plus/Plus

Query  1    TGCCTTCAAGTATTACGATGAATTGGCTGAGTTTTGTAAAAGGCATAACATCCCATTTCT  60
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  1    TGCCTTCAAGTATTACGATGAATTGGCTGAGTTTTGTAAAAGGCATAACATCCCATTTCT  60

Query  61   CCCTCTACCAACAATCTCAGAAATTCATCCAGATTTAGAGAAGGATAGGACAGTAGATGA  120
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  61   CCCTCTACCAACAATCTCAGAAATTCATCCAGATTTAGAGAAGGATAGGACAGTAGATGA  120

Query  121  TGACGTAAAGAATAAAGTTGTCAAATATTTGGGATATGAAGGGGTTTATAATTACAAAAA  180
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  121  TGACGTAAAGAATAAAGTTGTCAAATATTTGGGATATGAAGGGGTTTATAATTACAAAAA  180

Query  181  TCTTCTTTTATATTTGGCAAATAGGTTTGGAAATTTAAATGTTGAGTATGAAGAACCAAG  240
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  181  TCTTCTTTTATATTTGGCAAATAGGTTTGGAAATTTAAATGTTGAGTATGAAGAACCAAG  240

Query  241  ACCAATGCCA  250
            ||||||||||
Sbjct  241  ACCAATGCCA  250

Query=  ERCC-00024_genbank |116662503|gb|DQ854993.2| Synthetic construct
clone AG005.0110 external RNA control sequence
Length=512

Subject=  ERCC-00024
Length=536

Score =  946 bits (512),  Expect = 0.0
Identities = 512/512 (100%), Gaps = 0/512 (0%)
Strand=Plus/Plus

Query  1    ACGGAGGAGCTTTGGCATACTAGGCTAGCGAATCTGCAACTAACGCAAGTTACATCCTAG  60
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  1    ACGGAGGAGCTTTGGCATACTAGGCTAGCGAATCTGCAACTAACGCAAGTTACATCCTAG  60

Query  61   CTAGCGAAGGGCGTCCCAATTTTCGCTAACCCGACGCGACGCATAAAAAGCGAGAATAAC  120
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  61   CTAGCGAAGGGCGTCCCAATTTTCGCTAACCCGACGCGACGCATAAAAAGCGAGAATAAC  120

Query  121  GCCTAAGGGATGTACAATGGATGTTGATTATGCCTTCGGGAATGAGGGATGATTTGCGAA  180
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  121  GCCTAAGGGATGTACAATGGATGTTGATTATGCCTTCGGGAATGAGGGATGATTTGCGAA  180

Query  181  AAACAAGTCAATACCTAACCAAATCCGCTAATGGACACCCGTAATCGTGCCCAAGTTTAA  240
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  181  AAACAAGTCAATACCTAACCAAATCCGCTAATGGACACCCGTAATCGTGCCCAAGTTTAA  240

Query  241  CTGGTCGGTAGGTGGCAGGCAAAGCGCTAGTATCCCTAGGCGCGACACTATAAGTTTACA  300
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  241  CTGGTCGGTAGGTGGCAGGCAAAGCGCTAGTATCCCTAGGCGCGACACTATAAGTTTACA  300

Query  301  ACTGCGAGAATTGACACTATGAGCGCGCATACTGGGGCCAGAATAGGCAATACCATGTGC  360
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  301  ACTGCGAGAATTGACACTATGAGCGCGCATACTGGGGCCAGAATAGGCAATACCATGTGC  360

Query  361  GTCCCTGTGTGAACAGCTCGCGGCCATCAGAAGTTGGGATTGACGCATGATCTTGATCGA  420
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  361  GTCCCTGTGTGAACAGCTCGCGGCCATCAGAAGTTGGGATTGACGCATGATCTTGATCGA  420

Query  421  GCATACGGCTTCCACCAACCCATAGTACTTGGTAACTATAGCAATCAAGCACGCGTGAGC  480
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  421  GCATACGGCTTCCACCAACCCATAGTACTTGGTAACTATAGCAATCAAGCACGCGTGAGC  480

Query  481  ACAACGCTATCCAAATTACTACATTAACTGGA  512
            ||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  481  ACAACGCTATCCAAATTACTACATTAACTGGA  512

Query=  ERCC-00025_genbank |114977058|gb|DQ883689.2| Synthetic construct
clone NISTag48 external RNA control sequence
Length=2000

Subject=  ERCC-00025
Length=1994

Score = 3677 bits (1991),  Expect = 0.0
Identities = 1993/1994 (99%), Gaps = 0/1994 (0%)
Strand=Plus/Plus

Query  1     GGGGTCCATTATAGTGCAGGCGTGGTAAAGTAGCATTAGAACCCTACTACTTAGCCCGCG  60
             ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  1     GGGGTCCATTATAGTGCAGGCGTGGTAAAGTAGCATTAGAACCCTACTACTTAGCCCGCG  60

Query  61    CAACTCGTCCTATTAAAAGTCGGAAGGATTAGGGAAGTTAACCTCCGTTAGGGCCTCATT  120
             ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  61    CAACTCGTCCTATTAAAAGTCGGAAGGATTAGGGAAGTTAACCTCCGTTAGGGCCTCATT  120

Query  121   GGCGCGCCTCCACGTATCTGTATTCCCGTGTCCCGACTGGCTAATAAGAGATATGGTGCA  180
             ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  121   GGCGCGCCTCCACGTATCTGTATTCCCGTGTCCCGACTGGCTAATAAGAGATATGGTGCA  180

Query  181   GCGTGAACGCGGACCGAACTCCGGTGTGCGCCGGTTCATGTTACTCGAAAAATAGACCCT  240
             ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  181   GCGTGAACGCGGACCGAACTCCGGTGTGCGCCGGTTCATGTTACTCGAAAAATAGACCCT  240

Query  241   ACTTGCGCCATGTCATCTTTCACTACGGGGTAGTCTCTCGGCCAGGCTTTGAATCGCCTC  300
             ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  241   ACTTGCGCCATGTCATCTTTCACTACGGGGTAGTCTCTCGGCCAGGCTTTGAATCGCCTC  300

Query  301   ATCCGCTTCTCAATGGTTCTGTCCTGACCTCTGGAGTTAATCTTCGTCTCATAGAGTAAC  360
             ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  301   ATCCGCTTCTCAATGGTTCTGTCCTGACCTCTGGAGTTAATCTTCGTCTCATAGAGTAAC  360

Query  361   CAGGCGACGCACCACGCCTAGTTGGTACCACCACTAGAAGCCCGGTTCGCTGGCTCAGTG  420
             ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  361   CAGGCGACGCACCACGCCTAGTTGGTACCACCACTAGAAGCCCGGTTCGCTGGCTCAGTG  420

Query  421   CTAATATTCTGGAGGTCAGCCGACAGGTCACATGAGCCTACTCGTCTCGTCAAACACCCG  480
             ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  421   CTAATATTCTGGAGGTCAGCCGACAGGTCACATGAGCCTACTCGTCTCGTCAAACACCCG  480

Query  481   CCTAGCCATGATTAACAAATACAGTGATTAAGTGTGTTTTGACCCTAGTGTTAGGTCGCT  540
             ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  481   CCTAGCCATGATTAACAAATACAGTGATTAAGTGTGTTTTGACCCTAGTGTTAGGTCGCT  540

Query  541   GGTACTTAGCAAGGGGAGTTGCATATGTGGTCTCTGTTTCGGGTTATATCTATCATTTAC  600
             ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  541   GGTACTTAGCAAGGGGAGTTGCATATGTGGTCTCTGTTTCGGGTTATATCTATCATTTAC  600

Query  601   TTGACACCCTATTGGTTTATCACAGTCCTTCCACACGACCATACGCGTTGTAAGAATACC  660
             ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  601   TTGACACCCTATTGGTTTATCACAGTCCTTCCACACGACCATACGCGTTGTAAGAATACC  660

Query  661   CTCTAGCGTTGGAGAGAATAAGTTCGATGTTCAATTCACAAAACCGAGCAAAGGCTTGTC  720
             ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  661   CTCTAGCGTTGGAGAGAATAAGTTCGATGTTCAATTCACAAAACCGAGCAAAGGCTTGTC  720

Query  721   GACAGCTTCTACTAGTATTCACTACCAAAACGCGTACCGACTTTAGGGCGGTAGAGAGAT  780
             |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  721   GACAGCTTCTACTAGTATTCACTACCAAAACGCGTACCGACTTTAGGGCGGTAGAGAGAA  780

Query  781   TTGCCATTGCCACGAGGTTCCCCAGAATACAGGGTCCAGGCGGCCCCCAGCATCGGAGTG  840
             ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  781   TTGCCATTGCCACGAGGTTCCCCAGAATACAGGGTCCAGGCGGCCCCCAGCATCGGAGTG  840

Query  841   CCTGAACTGGCGGGGATGCCCAAGATTGTAGAGGGCCTAACGAGTTTGATACGCCCGGGA  900
             ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  841   CCTGAACTGGCGGGGATGCCCAAGATTGTAGAGGGCCTAACGAGTTTGATACGCCCGGGA  900

Query  901   CTACGGGGCATTGTCTGCCGCGTCTGTTTCAGGTAAACGATCAACCGGAGACCAGGTTAT  960
             ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  901   CTACGGGGCATTGTCTGCCGCGTCTGTTTCAGGTAAACGATCAACCGGAGACCAGGTTAT  960

Query  961   TCCCATGTCGGTCCCCAGGCTTATACTGCGGAGATAGGCTGATGATGGTAGGTGCCTTGC  1020
             ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  961   TCCCATGTCGGTCCCCAGGCTTATACTGCGGAGATAGGCTGATGATGGTAGGTGCCTTGC  1020

Query  1021  TCTAGCAAAAACGCGCACAGCTTATGAGCATAGCGGCTGGGCGTAGGTCAGAGAGGGTAT  1080
             ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  1021  TCTAGCAAAAACGCGCACAGCTTATGAGCATAGCGGCTGGGCGTAGGTCAGAGAGGGTAT  1080

Query  1081  GTAAGATCTCTCCTCTATCGGTGTGCGTCTACTCTGCCCCCTTCGACACAAATGTACATC  1140
             ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  1081  GTAAGATCTCTCCTCTATCGGTGTGCGTCTACTCTGCCCCCTTCGACACAAATGTACATC  1140

Query  1141  GCGGGAAACGGATACGCCTTACGCCCCAAGGTTTAGCGTATCAAAAAATGCAACGATTCC  1200
             ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  1141  GCGGGAAACGGATACGCCTTACGCCCCAAGGTTTAGCGTATCAAAAAATGCAACGATTCC  1200

Query  1201  GATGTCGAACCTTGGATAGGAGCGACCGATTACGTGTTAATTGGCCCTGTACCTTTCTGG  1260
             ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  1201  GATGTCGAACCTTGGATAGGAGCGACCGATTACGTGTTAATTGGCCCTGTACCTTTCTGG  1260

Query  1261  TCCGTTGATTATCACTCATCCCCAGGTTGTTATGGTCTACCGTGGAAGCCTCGTCAATGA  1320
             ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  1261  TCCGTTGATTATCACTCATCCCCAGGTTGTTATGGTCTACCGTGGAAGCCTCGTCAATGA  1320

Query  1321  ATACTTTGAGCGCGATTGAAGTGTTCCGCTACATCGCGGCTATCATTAAAAATTCCCCTT  1380
             ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  1321  ATACTTTGAGCGCGATTGAAGTGTTCCGCTACATCGCGGCTATCATTAAAAATTCCCCTT  1380

Query  1381  TAACAAAGGTTGTGGACGTCAACGGCCCTGCAGTAGCGTTCCTTGGACCCGGTTCGAGTA  1440
             ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  1381  TAACAAAGGTTGTGGACGTCAACGGCCCTGCAGTAGCGTTCCTTGGACCCGGTTCGAGTA  1440

Query  1441  CCCAGAGCAGACTACGTATATATCCAAGTGGTTATGTCCGACGGCATTTTGCCAGGTTAG  1500
             ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  1441  CCCAGAGCAGACTACGTATATATCCAAGTGGTTATGTCCGACGGCATTTTGCCAGGTTAG  1500

Query  1501  TATCTTCGGCAATGAGTTGCGTCTACGGCTAATCGAGAGCACTTGTCAGTACGCGCAATT  1560
             ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  1501  TATCTTCGGCAATGAGTTGCGTCTACGGCTAATCGAGAGCACTTGTCAGTACGCGCAATT  1560

Query  1561  ACTACATGGAGTGTATTCGTTTTGAGCGCTGATACAGTTCTCCTATCAAGGTCGCAAAAG  1620
             ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  1561  ACTACATGGAGTGTATTCGTTTTGAGCGCTGATACAGTTCTCCTATCAAGGTCGCAAAAG  1620

Query  1621  GTTGTCTAGAAAAGGGCCGTGCGCGCAGTCTACTGCTACCGGCGACTTTACGACGAAGTT  1680
             ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  1621  GTTGTCTAGAAAAGGGCCGTGCGCGCAGTCTACTGCTACCGGCGACTTTACGACGAAGTT  1680

Query  1681  AGGCATCAGACGACCACATGACGGAGAATTACGTACGCCACTTCAGACGTTCTGCCTGCG  1740
             ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  1681  AGGCATCAGACGACCACATGACGGAGAATTACGTACGCCACTTCAGACGTTCTGCCTGCG  1740

Query  1741  TGCTCTGCAATATAGGCGTAGCAACGAAGCTCGGTCGTGAACTGCTATAGGAATAGCCTG  1800
             ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  1741  TGCTCTGCAATATAGGCGTAGCAACGAAGCTCGGTCGTGAACTGCTATAGGAATAGCCTG  1800

Query  1801  ATACGAGCGCACAACAAGAACGAACCAGCGAAACTACCCAGATAACATCGCTCCCCGGCA  1860
             ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  1801  ATACGAGCGCACAACAAGAACGAACCAGCGAAACTACCCAGATAACATCGCTCCCCGGCA  1860

Query  1861  TTACTCTGACGGGGGTTGTCACTAGGCTGGTGGGTCCTTTCGCCTCTCATGTCAATTCCC  1920
             ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  1861  TTACTCTGACGGGGGTTGTCACTAGGCTGGTGGGTCCTTTCGCCTCTCATGTCAATTCCC  1920

Query  1921  TTTGTTGGGCTGCTTGGAAGTACTGATACTAGAGTAGCCTAGTAATACCTaaaaaaaaaa  1980
             ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  1921  TTTGTTGGGCTGCTTGGAAGTACTGATACTAGAGTAGCCTAGTAATACCTAAAAAAAAAA  1980

Query  1981  aaaaaaaaaaaaaa  1994
             ||||||||||||||
Sbjct  1981  AAAAAAAAAAAAAA  1994

Query=  ERCC-00028_genbank |92111297|gb|DQ459419.1| Synthetic construct
microarray control MC08 mRNA, complete sequence
Length=1147

Subject=  ERCC-00028
Length=1130

Score = 2037 bits (1103),  Expect = 0.0
Identities = 1126/1135 (99%), Gaps = 9/1135 (0%)
Strand=Plus/Plus

Query  6     AAGTATTCCATTCCGGCTCATGGTCCCGGCTAGACCTGCAAGATCGAAGGTACTCAATGA  65
             ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  5     AAGTATTCCATTCCGGCTCATGGTCCCGGCTAGACCTGCAAGATCGAAGGTACTCAATGA  64

Query  66    CACCAGTGACTGAGCGGTCAGCCCGGAAATAGCCAGAAATGTTACCATCCCCGCATGTTA  125
             ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  65    CACCAGTGACTGAGCGGTCAGCCCGGAAATAGCCAGAAATGTTACCATCCCCGCATGTTA  124

Query  126   CACAAACGTCGGGCTGACGAAACCCATGAGAACCTATGGTGAATAGACAGTAAACGAGCG  185
             ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  125   CACAAACGTCGGGCTGACGAAACCCATGAGAACCTATGGTGAATAGACAGTAAACGAGCG  184

Query  186   CAAAGGCGTGCTGCCAAGGGCTCCCCACCGAATGTAGAACTGATCTGATCTTCCGTGACA  245
             |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||
Sbjct  185   CAAAGGCGTGCTGCCAAGGGCT-CCCACCGAATGTAGAACTGATCTGAT-TTCCGTGACA  242

Query  246   GGGAAACGCAATGCGAGGTTCCGCAAGTCCACCTATAATCTGTGACCGCTCGTAGAACAT  305
             ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  243   GGGAAACGCAATGCGAGGTTCCGCAAGTCCACCTATAATCTGTGACCGCTCGTAGAACAT  302

Query  306   GGTTAGGGGCCTGATTCAGTTAAATCAAGCCACCTCTGACAGAACGACGAGTCAGTGGAA  365
             ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  303   GGTTA-GGGCCTGATTCAGTTAAATCAAGCCACCTCTGACAGAACGACGAGTCAGTGGAA  361

Query  366   TCGACTTCACACACCTCAGAGTCCACTCACGTGCTGTAAGTCAAAACCCAGTGAACTTCT  425
             |||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  362   TCGACTT--CACACCTCAGAGTCCACTCACGTGCTGTAAGTCAAAACCCAGTGAACTTCT  419

Query  426   CAACCGTGTAGCGCTCCTAGAACATTCAGGCGCCACTGAGGGGCATATGGATGAAGCGTG  485
             ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  420   CAACCGTGTAGCGCTCCTAGAACATTCAGGCGCCACTGAGGGGCATATGGATGAAGCGTG  479

Query  486   ATACGAATTACCTCCAACGAATGCCAGCTGGGAGGAGGATAGGGACTATGTCTTCGTCAA  545
             ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  480   ATACGAATTACCTCCAACGAATGCCAGCTGGGAGGAGGATAGGGACTATGTCTTCGTCAA  539

Query  546   TGCTCCCGTCAAATGCCTTTCTAAATACCTTTTCGACCTCTCTGTGTGGAATGGGGTCTA  605
             ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  540   TGCTCCCGTCAAATGCCTTTCTAAATACCTTTTCGACCTCTCTGTGTGGAATGGGGTCTA  599

Query  606   GAACCAAGGACTAAAGCGGTGCACGAGGCCCTTTGGATATGTCCTTCTTGGGAGGGCCCA  665
             ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  600   GAACCAAGGACTAAAGCGGTGCACGAGGCCCTTTGGATATGTCCTTCTTGGGAGGGCCCA  659

Query  666   CAGCCAAAGCCACCCATCACAGCTGGAATCTAATCTTGTGACCCAGTATTAACCGTGAGA  725
             ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  660   CAGCCAAAGCCACCCATCACAGCTGGAATCTAATCTTGTGACCCAGTATTAACCGTGAGA  719

Query  726   TCTACACAACCGACAAGCGCTAGCTTCCTCCCCGGTCAAGTAGTAATGCCGGGATGACTT  785
             ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  720   TCTACACAACCGACAAGCGCTAGCTTCCTCCCCGGTCAAGTAGTAATGCCGGGATGACTT  779

Query  786   TGCGTGTCCTATAGCGATCGAGCCCTCGAATTCACGTCGTCAAAGTGGAATGATCAGATT  845
             ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  780   TGCGTGTCCTATAGCGATCGAGCCCTCGAATTCACGTCGTCAAAGTGGAATGATCAGATT  839

Query  846   AAAGGGCTGTCGGGAGGGATGTGTAGGCCACTAACACCCCTCTGCACGAACTATAGATAC  905
             ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  840   AAAGGGCTGTCGGGAGGGATGTGTAGGCCACTAACACCCCTCTGCACGAACTATAGATAC  899

Query  906   GTCTTTCATCGGTACGCTCGAAAGCGCAGGTGGCTCCCAAATCGTGGGGAGTTAATCGAG  965
             ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  900   GTCTTTCATCGGTACGCTCGAAAGCGCAGGTGGCTCCCAAATCGTGGGGAGTTAATCGAG  959

Query  966   CTGCGGATTGGTCCCCACGCCTTACGGCAGCGAACATAATCCCGCTGATGTGAAGTCGAT  1025
             ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  960   CTGCGGATTGGTCCCCACGCCTTACGGCAGCGAACATAATCCCGCTGATGTGAAGTCGAT  1019

Query  1026  CTACAAGGTAAACAACGGGGAATATAATTCAGTTGAACCGGTGTGGAGCCTGCACTTGGA  1085
             ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  1020  CTACAAGGTAAACAACGGGGAATATAATTCAGTTGAACCGGTGTGGAGCCTGCACTTGGA  1079

Query  1086  ACGACTGCATAAGGGACCCAACAGCCCCTCATaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaa  1140
             ||| ||||||||||||||||||||||||  | |||||||||||||||||||||||
Sbjct  1080  ACG-CTGCATAAGGGACCCAACAGCCCC--A-AAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAA  1130

Query=  ERCC-00031_genbank |92111309|gb|DQ459431.1| Synthetic construct
microarray control MC30 mRNA, complete sequence
Length=1140

Subject=  ERCC-00031
Length=1138

Score = 2026 bits (1097),  Expect = 0.0
Identities = 1128/1141 (98%), Gaps = 9/1141 (0%)
Strand=Plus/Plus

Query  1     GGGAGAAAAGCTTCTTGCCTAGTTACAGCACGAAGATTGGGACCCATCGATCAGCGCCTC  60
             ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  1     GGGAGAAAAGCTTCTTGCCTAGTTACAGCACGAAGATTGGGACCCATCGATCAGCGCCTC  60

Query  61    CGTGCAATGGCGCCTTGGTGACACTCTCTAAAATGCAGTCGGTAGCGGGGCATGTAGTTA  120
             ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  61    CGTGCAATGGCGCCTTGGT-ACACTCTCTAAAATGCAGTCGGTAGCGGGGCATGTAGTTA  119

Query  121   CTGCGGTGATATTAAGCTAGTGAGTAACCTT-TATCGAACTGTCTACCAAATTGATGTAT  179
             ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  120   CTGCGGTGATATTAAGCTAGTGAGTAACCTTATATCGAACTGTCTACCAAATTGATGTAT  179

Query  180   CTACATTAGCCGTACGATGAGACAATGAACCGTGTCTACGCTCGGGAGCATTACCCCTAT  239
             |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  180   CTACATTAGCCGTACGATGAGACAATGAACCGTGTCTACGCTCGGGAGCATTACCCCTA-  238

Query  240   TCATGAGCCTACAAGCACCTGACTAGACCAGGAGACAACTTGAGCGAGACACTAGCGAGA  299
             ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  239   TCATGAGCCTACAAGCACCTGACTAGACCAGGAGACAACTTGAGCGAGACACTAGCGAGA  298

Query  300   GGTGCCGATATAAGGTACA-TGTTGCGGATGCTCAACATCGCATTTTTATCCCCTGGCGG  358
             ||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  299   GGTGCCGATATAAGGTACATTGTTGCGGATG-TCAACATCGCATTTTTATCCCCTGGCGG  357

Query  359   GATGCAACTAACACCAGTAATGTCGTTCTCCACGACCCCCTACCCGAAAACTTACTCGTA  418
             ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  358   GATGCAACTAACACCAGTAATGTCGTTCTCCACGACCCCCTACCCGAAAACTTACTCGTA  417

Query  419   TGAGTACTTTCGCGACGACTCGGCTGTGTAGTTTCCAAGCAGGCCCCTGGCTAGACCCAT  478
             ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  418   TGAGTACTTTCGCGACGACTCGGCTGTGTAGTTTCCAAGCAGGCCCCTGGCTAGACCCAT  477

Query  479   TTGTACCACGCGGAGGATCATC-GAATCCATAATCGGCCACAAACTAGCCGGCTGGAAAC  537
             |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  478   TTGTACCACGCGGAGGATCATCGGAATCCATAATCGGCCACAAACTAGCCGGCTGGAAAC  537

Query  538   CTTGTGATATCATGAACGAGGAGTAAGAGCTGGTTAGTGAATCACCTTGAGGGCGAGGAA  597
             ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  538   CTTGTGATATCATGAACGAGGAGTAAGAGCTGGTTAGTGAATCACCTTGAGGGCGAGGAA  597

Query  598   CACAACAATTCTGCGGGTTAGCAGGAAGGTTAGGGAACTCGCTCATAGCATATTAGTACC  657
             ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  598   CACAACAATTCTGCGGGTTAGCAGGAAGGTTAGGGAACTCGCTCATAGCATATTAGTACC  657

Query  658   GCTATCTCCTTTCCTTGGCGCGATATCTCCCAAAGTTAGGCT-ATTCTGCCGCCTGTGAT  716
             ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||
Sbjct  658   GCTATCTCCTTTCCTTGGCGCGACATCTCCCAAAGTTAGGCTGATTCTGCCGCCTGTGAT  717

Query  717   CGCTATCCTTATTTGTGGCAGAATATGTCGATGCAAAAAACCTTAATTCGTGCTTCATAC  776
             ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  718   CGCTATCCTTATTTGTGGCAGAATATGTCGATGCAAAAAACCTTAATTCGTGCTTCATAC  777

Query  777   ATCATCCCCGAGAACTCCACGGCTCCACTACCGCTTATCACGCGTGGGTGCTAAATGATA  836
             ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  778   ATCATCCCCGAGAACTCCACGGCTCCACTCCCGCTTATCACGCGTGGGTGCTAAATGATA  837

Query  837   CGAAGTGTGGCAGTCTATGTTAACTTGGAGCATCA-ATTTATTTCTGTTCACGGATTAAG  895
             ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||
Sbjct  838   CGAAGTGTGGCAGTCTATGTTAACTTGGAGCATCATATTTATTTCTGTTCACGGATGAAG  897

Query  896   GCCTATATCAATGATCATTAAAGACATTCCGTCATCGGCTACATGCAAAGAGGCTTTTCC  955
             ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  898   GCCTATATCAATGATCATTAAAGACATTCCGTCATCGGCTACATGCAAAGAGGCTTTTCC  957

Query  956   ACCCTGTTTCGGTGATTCAGGTGTCGAGCGACCATTATCTGTCGGCTCATCATCGAACCG  1015
             |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||
Sbjct  958   ACCCTGTTTCGGTGATTCAGGTGTCGAGCGACCATTATCTGTCGGCTCATCACCGAACCG  1017

Query  1016  GCCGT-ATAGAGTCTTCGCATCAGGTTACACCATGTCGACTGATAGTAACTGTGGTTCGA  1074
             ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  1018  GCCGTGATAGAGTCTTCGCATCAGGTTACACCATGTCGACTGATAGTAACTGTGGTTCGA  1077

Query  1075  GTTATGCGTGTTGACACACCGTTGAGGCGCCCTATTTaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaa  1134
             ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  1078  GTTATGCGTGTTGACACACCGTTGAGGCGCCCTATTTAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAA  1137

Query  1135  a  1135
             |
Sbjct  1138  A  1138

Query=  ERCC-00033_genbank |103488743|gb|DQ516796.1| Methanocaldococcus
jannaschii spike-in control MJ-2000-79 genomic sequence
Length=2000

Subject=  ERCC-00033
Length=2022

Score = 3694 bits (2000),  Expect = 0.0
Identities = 2000/2000 (100%), Gaps = 0/2000 (0%)
Strand=Plus/Plus

Query  1     GCACGCCCTATTTAACTGGAAACCTTCCAAGATTCGGAGAGCATATAAGTTGGGCCGAAA  60
             ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  1     GCACGCCCTATTTAACTGGAAACCTTCCAAGATTCGGAGAGCATATAAGTTGGGCCGAAA  60

Query  61    GCTCAGCTGTGAGCTTTGCAAACTCTGTCTTAGGAGCTAAGACAAATAGAGAAGGTGGGC  120
             ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  61    GCTCAGCTGTGAGCTTTGCAAACTCTGTCTTAGGAGCTAAGACAAATAGAGAAGGTGGGC  120

Query  121   CATCAGCATTAGCAGCTGCAATTATTGGAAAAACACCATATTATGGATATCACTTAGATG  180
             ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  121   CATCAGCATTAGCAGCTGCAATTATTGGAAAAACACCATATTATGGATATCACTTAGATG  180

Query  181   AAAATAGAAAGACAACACATATCATTGAGTTAGATGGACAATTAATCTCTAACTTTAAAT  240
             ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  181   AAAATAGAAAGACAACACATATCATTGAGTTAGATGGACAATTAATCTCTAACTTTAAAT  240

Query  241   ATGGAGAGAGTTTTTATGGAGCTTTAGGTTACTTAGTTGGGAAGATTGTTAAGAATGGCA  300
             ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  241   ATGGAGAGAGTTTTTATGGAGCTTTAGGTTACTTAGTTGGGAAGATTGTTAAGAATGGCA  300

Query  301   TTCCATATTTTGAAAATCTATATAAATTAAATCCAAATAACGATAATTTAAAATCCTTGG  360
             ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  301   TTCCATATTTTGAAAATCTATATAAATTAAATCCAAATAACGATAATTTAAAATCCTTGG  360

Query  361   GAGCTGCAATGGCTGCAAGTGGTGGTATCGCCTTATATCACGCAAAAAACTTGACAGCTG  420
             ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  361   GAGCTGCAATGGCTGCAAGTGGTGGTATCGCCTTATATCACGCAAAAAACTTGACAGCTG  420

Query  421   AATGCAGAGTTAAAGAAGTTGTTAATGATAAAATTGAAAAGATATCTATTGGAGTTGAGG  480
             ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  421   AATGCAGAGTTAAAGAAGTTGTTAATGATAAAATTGAAAAGATATCTATTGGAGTTGAGG  480

Query  481   AGATAAAGGAAGCTTATGAAAAATTAAATACAACAAATGAAGAGCCAGATTTAATTTGTA  540
             ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  481   AGATAAAGGAAGCTTATGAAAAATTAAATACAACAAATGAAGAGCCAGATTTAATTTGTA  540

Query  541   TTGGTTGCCCTCACTGCAGTTTAATGGaaattaaaaaaattgctgaacttttaaaaaata  600
             ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  541   TTGGTTGCCCTCACTGCAGTTTAATGGAAATTAAAAAAATTGCTGAACTTTTAAAAAATA  600

Query  601   aaaaatTGAATGCTGATTTATGGGTTTGCTGCTCTCTTCATATTAAAGCAATAGCAGATA  660
             ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  601   AAAAATTGAATGCTGATTTATGGGTTTGCTGCTCTCTTCATATTAAAGCAATAGCAGATA  660

Query  661   GAATGGGATATACAAAGATTATTGAAAAAGCTGGTGGAAAGGTAGTTAAAGACACCTGTA  720
             ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  661   GAATGGGATATACAAAGATTATTGAAAAAGCTGGTGGAAAGGTAGTTAAAGACACCTGTA  720

Query  721   TGGTTGTTTCTCCAATTGAGGATTTAGGTTATAAAAGAGTTGCAACAAACTCTGGAAAAG  780
             ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  721   TGGTTGTTTCTCCAATTGAGGATTTAGGTTATAAAAGAGTTGCAACAAACTCTGGAAAAG  780

Query  781   CTGCTGTTTATCTACCAAGCTTTTGTAAGAGTGAAGTAATTTTTGGAGATATTGAGGAAT  840
             ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  781   CTGCTGTTTATCTACCAAGCTTTTGTAAGAGTGAAGTAATTTTTGGAGATATTGAGGAAT  840

Query  841   TGTTAAAAGGGAGATAATGCTGAATCCAATAATCTTATTTTTGGCTATTATTTTTGATAG  900
             ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  841   TGTTAAAAGGGAGATAATGCTGAATCCAATAATCTTATTTTTGGCTATTATTTTTGATAG  900

Query  901   AATCATTGGGGAGTTGCCAGAGAGTATTCATCCAACGGTTTGGATAGGGAAGTTGATAGC  960
             ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  901   AATCATTGGGGAGTTGCCAGAGAGTATTCATCCAACGGTTTGGATAGGGAAGTTGATAGC  960

Query  961   TTTTTTAGAGAACATATTTAAATCTACAAATTGCAAAAATAAATATAGAGATTTTTTGTT  1020
             ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  961   TTTTTTAGAGAACATATTTAAATCTACAAATTGCAAAAATAAATATAGAGATTTTTTGTT  1020

Query  1021  TGGCTCACTAACAACATTTATTACTCTATTAGTTGTGGGAGTTATAGCtttttttGTTGA  1080
             ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  1021  TGGCTCACTAACAACATTTATTACTCTATTAGTTGTGGGAGTTATAGCTTTTTTTGTTGA  1080

Query  1081  TAAATGCATAATGCTGTTACCATTTCCTTTAAACTATATTATCTATGGTTTTTTGTTATC  1140
             ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  1081  TAAATGCATAATGCTGTTACCATTTCCTTTAAACTATATTATCTATGGTTTTTTGTTATC  1140

Query  1141  AACAACTATTGGCTACAAATCATTATTCGAATTCTGCAAAAAGCCGATTGAATATATAAA  1200
             ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  1141  AACAACTATTGGCTACAAATCATTATTCGAATTCTGCAAAAAGCCGATTGAATATATAAA  1200

Query  1201  AAATGGTGATTTAGAGGGAGCAAGGAAAGCTGTTCAGCATATAGTTAGCAGAGATGCCTC  1260
             ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  1201  AAATGGTGATTTAGAGGGAGCAAGGAAAGCTGTTCAGCATATAGTTAGCAGAGATGCCTC  1260

Query  1261  AAAGTTGGATAAAGAGCATGTATTATCGGCTGCAGTAGAGAGCTTATCCGAGAACATAAC  1320
             ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  1261  AAAGTTGGATAAAGAGCATGTATTATCGGCTGCAGTAGAGAGCTTATCCGAGAACATAAC  1320

Query  1321  AGACAGTATAATTGGAGCTTTATTCTATGCTATATTTTTTGGTTTGCCTGGAGCCTTTGT  1380
             ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  1321  AGACAGTATAATTGGAGCTTTATTCTATGCTATATTTTTTGGTTTGCCTGGAGCCTTTGT  1380

Query  1381  TTATAGGGCGATAAATACATTAGATGCAATGATTGGTTATAAAAATGAGAAATATCTATG  1440
             ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  1381  TTATAGGGCGATAAATACATTAGATGCAATGATTGGTTATAAAAATGAGAAATATCTATG  1440

Query  1441  GTATGGGAAGTTAGCAGCAAGGTTGGATGATATTGCCAATTTTATTCCTTCAAGAATAGC  1500
             ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  1441  GTATGGGAAGTTAGCAGCAAGGTTGGATGATATTGCCAATTTTATTCCTTCAAGAATAGC  1500

Query  1501  AGGGATTTTGCTAATAATTACTGCCCCATTTTATAAAGGAGATGTTAAAAAGGCAATATA  1560
             ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  1501  AGGGATTTTGCTAATAATTACTGCCCCATTTTATAAAGGAGATGTTAAAAAGGCAATATA  1560

Query  1561  TGGGTTTTTAAAAGAAGCTAATAAGGTTCCATCACCAAACTCTGGTTATACAATGGCTAC  1620
             ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  1561  TGGGTTTTTAAAAGAAGCTAATAAGGTTCCATCACCAAACTCTGGTTATACAATGGCTAC  1620

Query  1621  ATTGGCAAATGCATTAAATATAACTTTGGAGAAGATAGGATATTATAAACTTGGTAGTGG  1680
             ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  1621  ATTGGCAAATGCATTAAATATAACTTTGGAGAAGATAGGATATTATAAACTTGGTAGTGG  1680

Query  1681  GAAAATAGATGTTGAAAAATCTTTAAACGCTTTTAAGGCAGTTGATTATACAGTCGTTGT  1740
             ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  1681  GAAAATAGATGTTGAAAAATCTTTAAACGCTTTTAAGGCAGTTGATTATACAGTCGTTGT  1740

Query  1741  GTTTTTAATTATTTATACTTTAATTTGGTGGATAACATGATAAGTAAAGCTTATTACACT  1800
             ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  1741  GTTTTTAATTATTTATACTTTAATTTGGTGGATAACATGATAAGTAAAGCTTATTACACT  1800

Query  1801  ACAGAGATTCCAGAGGATAGATTTGAAGCTCTGAGTTGTATTAAAGATAGTCAAAAACCT  1860
             ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  1801  ACAGAGATTCCAGAGGATAGATTTGAAGCTCTGAGTTGTATTAAAGATAGTCAAAAACCT  1860

Query  1861  CTTAAAATTATATTACTTGGAGGAGTTGATAGTGGTAAAACAACATTAGCTACTTTTTTG  1920
             ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  1861  CTTAAAATTATATTACTTGGAGGAGTTGATAGTGGTAAAACAACATTAGCTACTTTTTTG  1920

Query  1921  GCAAATGAGCTTTTAAACTTAGGATTTAAAGTTGCTATAGTCGATAGTGATGTAGGGCAG  1980
             ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  1921  GCAAATGAGCTTTTAAACTTAGGATTTAAAGTTGCTATAGTCGATAGTGATGTAGGGCAG  1980

Query  1981  AAGAGCATTTTACCTCCAGC  2000
             ||||||||||||||||||||
Sbjct  1981  AAGAGCATTTTACCTCCAGC  2000

Query=  ERCC-00034_genbank |110586147|gb|DQ855001.1| Synthetic construct
clone AG012.1111 external RNA control sequence
Length=996

Subject=  ERCC-00034
Length=1019

Score = 1805 bits (977),  Expect = 0.0
Identities = 990/996 (99%), Gaps = 1/996 (0%)
Strand=Plus/Plus

Query  1    GGTATTACCCAGCACTCGTATGGCGCCCCATCGTTGTATCAGCAGGAGCATATGTTGCTC  60
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  1    GGTATTACCCAGCACTCGTATGGCGCCCCATCGTTGTATCAGCAGGAGCATATGTTGCTC  60

Query  61   TTGATTGTATCACTTCGCGAGAAAGACCCCTTGAATACACGAGCTGCCGTCCGGATAACG  120
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  61   TTGATTGTATCACTTCGCGAGAAAGACCCCTTGAATACACGAGCTGCCGTCCGGATAACG  120

Query  121  ATGTAATAGCCTATGGAGGGGAAGTAGTCATGTCTGCGGACTATTGGTAAGAGCACCGCC  180
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  121  ATGTAATAGCCTATGGAGGGGAAGTAGTCATGTCTGCGGACTATTGGTAAGAGCACCGCC  180

Query  181  TCGTCGTACGTGGACACGAAGCTGTTCGGCCGCACGCAAGTACCTCCCACTTAGAAAGCG  240
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  181  TCGTCGTACGTGGACACGAAGCTGTTCGGCCGCACGCAAGTACCTCCCACTTAGAAAGCG  240

Query  241  AATAACCCAACGACCGTGTTCAACCCTGGCCGTCTCTCAACCAGGTATGCAATCAACGAC  300
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  241  AATAACCCAACGACCGTGTTCAACCCTGGCCGTCTCTCAACCAGGTATGCAATCAACGAC  300

Query  301  ATTGGCCCAGATGTAGGGCCGTCTTGGTGGATTGAAACTCGGATCGATCACGTATGGTCT  360
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  301  ATTGGCCCAGATGTAGGGCCGTCTTGGTGGATTGAAACTCGGATCGATCACGTATGGTCT  360

Query  361  AGACCTTATACAACACCTGTGCGTGCGTCTGCGTCTGGCGATGGTGGGTAGCGGTCCGGA  420
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  361  AGACCTTATACAACACCTGTGCGTGCGTCTGCGTCTGGCGATGGTGGGTAGCGGTCCGGA  420

Query  421  CCACGATCGTACTGTAGGCGGCCCAAATGCGGATCTTTAGGTTGACCGATTGTACATCTC  480
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  421  CCACGATCGTACTGTAGGCGGCCCAAATGCGGATCTTTAGGTTGACCGATTGTACATCTC  480

Query  481  GCCATAGCCCTTTTCGTCACAACCTTTATAAAAGGGGTCAGGCCACTGTGTGAATCAGAT  540
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  481  GCCATAGCCCTTTTCGTCACAACCTTTATAAAAGGGGTCAGGCCACTGTGTGAATCAGAT  540

Query  541  GGCAAGCCCGTATCCGTATAGAAACATACGTTTCTCTGGCCACGACCAATAATTATGCAC  600
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  541  GGCAAGCCCGTATCCGTATAGAAACATACGTTTCTCTGGCCACGACCAATAATTATGCAC  600

Query  601  TGTTGGCTccccccccGGGTCTACGGAGAACATTAGATATCGACCTAATATCCTGATAGC  660
            |||||||||     | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  601  TGTTGGCTCGGAAGC-GGGTCTACGGAGAACATTAGATATCGACCTAATATCCTGATAGC  659

Query  661  TAGCTTTCCCGAGGATAGGCGAGGATGGGCGTGCTAGACACAGGAGCATTGCATCACATG  720
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  660  TAGCTTTCCCGAGGATAGGCGAGGATGGGCGTGCTAGACACAGGAGCATTGCATCACATG  719

Query  721  AATAAAGGGCTACGTACGCAGCGGCGTTAAGACAGACTTAGACTGATCACTATGAAATGA  780
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  720  AATAAAGGGCTACGTACGCAGCGGCGTTAAGACAGACTTAGACTGATCACTATGAAATGA  779

Query  781  TAGACACCATGTCGCAATTTGCTCCCTCACTCATATCGTTGTATCATAAAGTTGATCCTA  840
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  780  TAGACACCATGTCGCAATTTGCTCCCTCACTCATATCGTTGTATCATAAAGTTGATCCTA  839

Query  841  ATCACAAACCGAGTAACGAGCCAGACTAATCCGGAACATTCGTAAGCGATAGTGGTTGGC  900
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  840  ATCACAAACCGAGTAACGAGCCAGACTAATCCGGAACATTCGTAAGCGATAGTGGTTGGC  899

Query  901  TCCTCCCGGTCGCCGAACTGATATCATAGCTAAGTATGCTGGCCTCGGTTAACCGCGAAG  960
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  900  TCCTCCCGGTCGCCGAACTGATATCATAGCTAAGTATGCTGGCCTCGGTTAACCGCGAAG  959

Query  961  GCATATACAATGGATTCGCTGTCCGCGTAGCAATAT  996
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  960  GCATATACAATGGATTCGCTGTCCGCGTAGCAATAT  995

Query=  ERCC-00035_genbank |92111291|gb|DQ459413.1| Synthetic construct
microarray control MC02 mRNA, complete sequence
Length=1136

Subject=  ERCC-00035
Length=1130

Score = 2065 bits (1118),  Expect = 0.0
Identities = 1127/1131 (99%), Gaps = 2/1131 (0%)
Strand=Plus/Plus

Query  1     GGGAGAGGTATCGTAAAGGTGAATCCTGTGGCTGTAGGAAGCAGTTCATATGACCAACGG  60
             ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  1     GGGAGAGGTATCGTAAAGGTGAATCCTGTGGCTGTAGGAAGCAGTTCATATGACCAACGG  60

Query  61    GCGCCCTAGGGTATACTCCAGAATCGAATGTTACCAGAAAATAGGGGAACTGGTCGCTCC  120
             ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  61    GCGCCCTAGGGTATACTCCAGAATCGAATGTTACCAGAAAATAGGGGAACTGGTCGCTCC  120

Query  121   TAGGTAAGGTTGCCTGTCCCCGCACTGTACGAAGGTCCGGTCAACGGAAGCAGGCACACG  180
             ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  121   TAGGTAAGGTTGCCTGTCCCCGCACTGTACGAAGGTCCGGTCAACGGAAGCAGGCACACG  180

Query  181   CGCTATCTGAGTCCAAATACTTGATCCGGCCGGAAAATTAGAGGTGACGGCTTCCCACTA  240
             ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  181   CGCTATCTGAGTCCAAATACTTGATCCGGCCGGAAAATTAGAGGTGACGGCTTCCCACTA  240

Query  241   CTGATCTCACTGACGTGCAATCATCCTGTGTCCGGAGCAATGACAGTGTCCAGTCTGTTA  300
             ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  241   CTGATCTCACTGACGTGCAATCATCCTGTGTCCGGAGCAATGACAGTGTCCAGTCTGTTA  300

Query  301   TGGACGAGCTGGACGATTCACAGATAAGGACAGTCGCCCGGATACCGCAAACTAAATCTT  360
             ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  301   TGGACGAGCTGGACGATTCACAGATAAGGACAGTCGCCCGGATACCGCAAACTAAATCTT  360

Query  361   GCCTGCCTCCGAGGGTGTGTGAAGGATAACTGTCGCCCTTAAGTAAAGATCTACCATTCG  420
             ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  361   GCCTGCCTCCGAGGGTGTGTGAAGGATAACTGTCGCCCTTAAGTAAAGATCTACCATTCG  420

Query  421   CCGGGGCAACGCGGCTCTCTGATGCTACGACCAAAGTGGTTGACATTACGCCAGTAATGG  480
             ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  421   CCGGGGCAACGCGGCTCTCTGATGCTACGACCAAAGTGGTTGACATTACGCCAGTAATGG  480

Query  481   ACTAAGGTTGAATTTGAGCGGATGGGCTCAACTGCGTCGTAACCGGTAGATACAGGGCAT  540
             ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  481   ACTAAGGTTGAATTTGAGCGGATGGGCTCAACTGCGTCGTAACCGGTAGATACAGGGCAT  540

Query  541   ACGAGCCTCCCTATTTAACGGCATCATCCCGCGTAGTGCTGGTCAACCCGACTGTCTATT  600
             |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||
Sbjct  541   ACGAGCCTCCCTATTTAACGGCATCATCCCGCGTAGTGCTGGTCAACC-GACTGTCTATT  599

Query  601   GAAGTCAGGTTTCGGCTACATCAGCTGGAACGTTCCCGTAGCTACTATAATCAGGCAATC  660
             ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  600   GAAGTCAGGTTTCGGCTACATCAGCTGGAACGTTCCCGTAGCTACTATAATCAGGCAATC  659

Query  661   TGTCCCGAAGAGCCCACACCCTGACTTGGCCGTAAGGGAGCCCTAAATCAGTTAAATACG  720
             ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  660   TGTCCCGAAGAGCCCACACCCTGACTTGGCCGTAAGGGAGCCCTAAATCAGTTAAATACG  719

Query  721   GGGAAGGAGTCTCGCCCTCCGGGTGATCCATCTTATTTACCAAAGAACATGTC-ACGCCT  779
             ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||
Sbjct  720   GGGAAGGAGTCTCGCCCTCCGGGTGATCCATCTTATTTACCAAAGAACATGTCCACGCCT  779

Query  780   GTGGGCTCTGAAGATGGGCGACACATGTCTACCCTGGCATAACGCCCAGCTTGATAAGAG  839
             ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  780   GTGGGCTCTGAAGATGGGCGACACATGTCTACCCTGGCATAACGCCCAGCTTGATAAGAG  839

Query  840   TGAAACGACCCATCTGACACAGGCCGGCATAGAAGACCAGCGCAATGCGAGGGCCACACA  899
             ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  840   TGAAACGACCCATCTGACACAGGCCGGCATAGAAGACCAGCGCAATGCGAGGGCCACACA  899

Query  900   TAGGAGTGTGAAAATCTACATCAACATACTTCGGCCGTGGCTGAACCAGGGAGTGCTTGT  959
             |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||
Sbjct  900   TAGGAGTGTGAAAATCTACATCAACATACTTCGGCCGTGGCTGAACGAGGGAGTGCTTGT  959

Query  960   ACAATCCCGTTGTTTGGTGTGGCAGATTCCGGGAAATGAGCAAACGCTTCTCCCATGAAC  1019
             ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  960   ACAATCCCGTTGTTTGGTGTGGCAGATTCCGGGAAATGAGCAAACGCTTCTCCCATGAAC  1019

Query  1020  ACACTCACAGCCATAAGTCCTACCTTGCTAACATCGCCCCGAATGCAGAGCCACCTACTG  1079
             ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  1020  ACACTCACAGCCATAAGTCCTACCTTGCTAACATCGCCCCGAATGCAGAGCCACCTACTG  1079

Query  1080  GGGTTGTCTGAGAATACTCCATGGGTCaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaa  1130
             |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  1080  GGGTTGTCTGAGAACACTCCATGGGTCAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAA  1130

Query=  ERCC-00039_genbank |114975660|gb|DQ883656.2| Synthetic construct
clone NISTag15 external RNA control sequence
Length=750

Subject=  ERCC-00039
Length=740

Score = 1367 bits (740),  Expect = 0.0
Identities = 740/740 (100%), Gaps = 0/740 (0%)
Strand=Plus/Plus

Query  1    GAGCATGGCCTAACTGAATGCGCCTGCAGTATCTTTCTTAGTATATCAAGATCCGTAATA  60
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  1    GAGCATGGCCTAACTGAATGCGCCTGCAGTATCTTTCTTAGTATATCAAGATCCGTAATA  60

Query  61   TAACGGTTTGCGCGACTACGGTTACCGTCTTTATAAGTGAACAAAACCGGCTACCAGCAT  120
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  61   TAACGGTTTGCGCGACTACGGTTACCGTCTTTATAAGTGAACAAAACCGGCTACCAGCAT  120

Query  121  GTCGTATTTCGCCACCCATATAAACCCCACTTCGTCCTCAAGGAATCCAAAAGTCGGACG  180
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  121  GTCGTATTTCGCCACCCATATAAACCCCACTTCGTCCTCAAGGAATCCAAAAGTCGGACG  180

Query  181  GCGTGGCTTGTCATCTTCGTCAGAAGGTTCGAAACCAGTAAAAAGACGCGATAGATAGGC  240
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  181  GCGTGGCTTGTCATCTTCGTCAGAAGGTTCGAAACCAGTAAAAAGACGCGATAGATAGGC  240

Query  241  CTAAGTGGGCCTCCCCTTTGCCAAAATCACGACGAAGTGACTAGTGCAGGCGTCGTATAC  300
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  241  CTAAGTGGGCCTCCCCTTTGCCAAAATCACGACGAAGTGACTAGTGCAGGCGTCGTATAC  300

Query  301  TTACTCCTCATGTTCAGCCCACGCTGCATTGGTAGGCTGTTAGAAGCCGTGACCGAACAG  360
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  301  TTACTCCTCATGTTCAGCCCACGCTGCATTGGTAGGCTGTTAGAAGCCGTGACCGAACAG  360

Query  361  GGTATGATGACCTCGCCATGGGCACCCTTGTATTCTCGGGGGCGGATGTAGAAATCAAAG  420
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  361  GGTATGATGACCTCGCCATGGGCACCCTTGTATTCTCGGGGGCGGATGTAGAAATCAAAG  420

Query  421  CTGTTTACTAACCATGTACTGTCCTAAGAGATTGGCTGTGACCGGTCCCGGACACTGCGT  480
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  421  CTGTTTACTAACCATGTACTGTCCTAAGAGATTGGCTGTGACCGGTCCCGGACACTGCGT  480

Query  481  CAACGCAGGTCGCTCACGATCGGCGTGCGCATTTTCGTGAATCATGTATAGTGGTTCTCG  540
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  481  CAACGCAGGTCGCTCACGATCGGCGTGCGCATTTTCGTGAATCATGTATAGTGGTTCTCG  540

Query  541  TTAGATACACATGTAAGCTGAATGGGGCCCTACCCAACCGGTTGGGTCTATAAGGCAGAT  600
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  541  TTAGATACACATGTAAGCTGAATGGGGCCCTACCCAACCGGTTGGGTCTATAAGGCAGAT  600

Query  601  GTGCGACGCACCTATTGGTAGGCCAATCTTATGGTTTGCCTCTTGTACTGAGGGTACCGC  660
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  601  GTGCGACGCACCTATTGGTAGGCCAATCTTATGGTTTGCCTCTTGTACTGAGGGTACCGC  660

Query  661  AGAGGTCCACTGGTTAGCTCACACTATGATCTAGGAGCAGTTGGGCGGTAAACGGCaaaa  720
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  661  AGAGGTCCACTGGTTAGCTCACACTATGATCTAGGAGCAGTTGGGCGGTAAACGGCAAAA  720

Query  721  aaaaaaaaaaaaaaaaaaaa  740
            ||||||||||||||||||||
Sbjct  721  AAAAAAAAAAAAAAAAAAAA  740

Query=  ERCC-00040_genbank |114976678|gb|DQ883661.2| Synthetic construct
clone NISTag20 external RNA control sequence
Length=750

Subject=  ERCC-00040
Length=744

Score = 1369 bits (741),  Expect = 0.0
Identities = 743/744 (99%), Gaps = 0/744 (0%)
Strand=Plus/Plus

Query  1    AACTACGATCCCATGAGAACACCTGTAGATACTCAGGTCTCCGCGGACCTACGCCGCGGA  60
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  1    AACTACGATCCCATGAGAACACCTGTAGATACTCAGGTCTCCGCGGACCTACGCCGCGGA  60

Query  61   CGATGATAAAGTCCGAGAAACCACCGGATTGCCCCAACAGACGGCCTAGCCCATCGAACT  120
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  61   CGATGATAAAGTCCGAGAAACCACCGGATTGCCCCAACAGACGGCCTAGCCCATCGAACT  120

Query  121  AGGGAAATGAACTATATCGTAACCAAGCCGGGTAGCTGCGGTGGTGCTAGACTAGATGTT  180
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  121  AGGGAAATGAACTATATCGTAACCAAGCCGGGTAGCTGCGGTGGTGCTAGACTAGATGTT  180

Query  181  AGCGTTCAGTCGAGCTGTTACGTGTAACGCCATTGAGACCCTTACCCTTTACCGGTCGGC  240
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  181  AGCGTTCAGTCGAGCTGTTACGTGTAACGCCATTGAGACCCTTACCCTTTACCGGTCGGC  240

Query  241  GGATACGTCCAGCTTCGTCACTGCGTTCGAGCCTTCTACACGATCCAAGTTACCAGCGCA  300
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  241  GGATACGTCCAGCTTCGTCACTGCGTTCGAGCCTTCTACACGATCCAAGTTACCAGCGCA  300

Query  301  GTTTAAGGTACGTCGCTTCGACCAGAACGAGAGTTCGCAGCAAGGGGGAGGAGTTGGATT  360
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  301  GTTTAAGGTACGTCGCTTCGACCAGAACGAGAGTTCGCAGCAAGGGGGAGGAGTTGGATT  360

Query  361  CTTAGGGAATGAGGCTGAACCTAACTCCTCGCTACATTCCTATTGTTTTCCCGATCGGCT  420
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  361  CTTAGGGAATGAGGCTGAACCTAACTCCTCGCTACATTCCTATTGTTTTCCCGATCGGCT  420

Query  421  TCATCGGGACGCCGGAGACCGCACCTTTGCCCGTTTAAGCTCGGACGGGATGCCACGGTT  480
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  421  TCATCGGGACGCCGGAGACCGCACCTTTGCCCGTTTAAGCTCGGACGGGATGCCACGGTT  480

Query  481  CTGTTCCACAACCCGGTCGGAGCACACCCTCACTATGCTGCGTCTATGCCTTCCGGGTGG  540
            ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  481  CTGTTCCACAACCCGGTCGGAGCACACCCTCTCTATGCTGCGTCTATGCCTTCCGGGTGG  540

Query  541  TTGAGGTGAGCCATGTGGTCTTAGAATCCGGTTGTATTAGACAGTATTGTGCTTGACGTC  600
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  541  TTGAGGTGAGCCATGTGGTCTTAGAATCCGGTTGTATTAGACAGTATTGTGCTTGACGTC  600

Query  601  GTGGTATCGGGTGGTTGTGAAGGATACAGATATTCTATGGGCAGCGATGGGGCTTCCTCA  660
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  601  GTGGTATCGGGTGGTTGTGAAGGATACAGATATTCTATGGGCAGCGATGGGGCTTCCTCA  660

Query  661  GTCCGTCTACGGCCCACCAGACAAACAACTCGGGATACAAATTGAGCACCCGCGGACCGG  720
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  661  GTCCGTCTACGGCCCACCAGACAAACAACTCGGGATACAAATTGAGCACCCGCGGACCGG  720

Query  721  aaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaa  744
            ||||||||||||||||||||||||
Sbjct  721  AAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAA  744

Query=  ERCC-00041_genbank |116733906|gb|EF011069.1| Synthetic construct
spike-in microarray control O-sialoglycoprotein endopeptidase (gcp)
gene, complete cds
Length=1101

Subject=  ERCC-00041
Length=1122

Score = 2032 bits (1100),  Expect = 0.0
Identities = 1100/1100 (100%), Gaps = 0/1100 (0%)
Strand=Plus/Plus

Query  2     CCGAGCTCAAGATGCGTTAATTATGTGGGTGACGATAAATGAGTGAGCAAAAAGACATGT  61
             ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  1     CCGAGCTCAAGATGCGTTAATTATGTGGGTGACGATAAATGAGTGAGCAAAAAGACATGT  60

Query  62    ACGTATTAGGAATTGAAACAAGCTGTGATGAGACTGCTGCAGCTATTGTGAAAAACGGGA  121
             ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  61    ACGTATTAGGAATTGAAACAAGCTGTGATGAGACTGCTGCAGCTATTGTGAAAAACGGGA  120

Query  122   AAGAGATCATTTCAAACGTAGTAGCCTCTCAAATTGAAAGCCATAAGCGCTTCGGAGGCG  181
             ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  121   AAGAGATCATTTCAAACGTAGTAGCCTCTCAAATTGAAAGCCATAAGCGCTTCGGAGGCG  180

Query  182   TTGTTCCGGAAATTGCTTCAAGACATCATGTTGAACAAATCACTTTGGTTATAGAAGAGG  241
             ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  181   TTGTTCCGGAAATTGCTTCAAGACATCATGTTGAACAAATCACTTTGGTTATAGAAGAGG  240

Query  242   CGTTTCGCAAAGCTGGCATGACGTATAGTGATATTGATGCGATTGCAGTAACAGAAGGTC  301
             ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  241   CGTTTCGCAAAGCTGGCATGACGTATAGTGATATTGATGCGATTGCAGTAACAGAAGGTC  300

Query  302   CGGGACTGGTGGGAGCGCTTCTTATCGGAGTGAATGCCGCTAAAGCATTGAGCTTTGCAT  361
             ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  301   CGGGACTGGTGGGAGCGCTTCTTATCGGAGTGAATGCCGCTAAAGCATTGAGCTTTGCAT  360

Query  362   ATAACATTCCGTTAGTAGGCGTTCATCATATAGCCGGTCATATATACGCGAACCGTCTTG  421
             ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  361   ATAACATTCCGTTAGTAGGCGTTCATCATATAGCCGGTCATATATACGCGAACCGTCTTG  420

Query  422   TAGAAGACATCGTGTTCCCGGCACTGGCATTGGTCGTTTCAGGAGGCCATACAGAACTGG  481
             ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  421   TAGAAGACATCGTGTTCCCGGCACTGGCATTGGTCGTTTCAGGAGGCCATACAGAACTGG  480

Query  482   TTTATATGAAGGAACATGGATCATTTGAAGTCATTGGGGAAACCCTTGATGATGCGGCAG  541
             ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  481   TTTATATGAAGGAACATGGATCATTTGAAGTCATTGGGGAAACCCTTGATGATGCGGCAG  540

Query  542   GAGAAGCCTACGACAAAGTGGCGCGGACGATGGGATTGCCATATCCGGGTGGACCGCAAA  601
             ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  541   GAGAAGCCTACGACAAAGTGGCGCGGACGATGGGATTGCCATATCCGGGTGGACCGCAAA  600

Query  602   TTGACAAGCTAGCTGAAAAAGGGAATGACAATATTCCGCTTCCTCGCGCATGGCTTGAAG  661
             ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  601   TTGACAAGCTAGCTGAAAAAGGGAATGACAATATTCCGCTTCCTCGCGCATGGCTTGAAG  660

Query  662   AAGGCTCTTACAACTTCAGCTTTAGCGGATTGAAGTCTGCGGTGATCAATACGCTTCATA  721
             ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  661   AAGGCTCTTACAACTTCAGCTTTAGCGGATTGAAGTCTGCGGTGATCAATACGCTTCATA  720

Query  722   ATGCATCCCAAAAAGGGCAAGAGATTGCTCCGGAAGATTTGTCTGCCAGTTTCCAAAATA  781
             ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  721   ATGCATCCCAAAAAGGGCAAGAGATTGCTCCGGAAGATTTGTCTGCCAGTTTCCAAAATA  780

Query  782   GTGTGATCGATGTCTTGGTAACCAAAACGGCGCGCGCGGCAAAGGAATATGATGTCAAAC  841
             ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  781   GTGTGATCGATGTCTTGGTAACCAAAACGGCGCGCGCGGCAAAGGAATATGATGTCAAAC  840

Query  842   AGGTCCTTTTAGCCGGAGGAGTAGCTGCAAACAGAGGCCTCAGAGCTGCATTAGAAAAGG  901
             ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  841   AGGTCCTTTTAGCCGGAGGAGTAGCTGCAAACAGAGGCCTCAGAGCTGCATTAGAAAAGG  900

Query  902   AATTTGCCCAGCATGAAGGGATTACGCTTGTCATTCCTCCATTAGCTTTATGCACGGATA  961
             ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  901   AATTTGCCCAGCATGAAGGGATTACGCTTGTCATTCCTCCATTAGCTTTATGCACGGATA  960

Query  962   ATGCTGCGATGATTGCTGCTGCTGGTACAATTGCTTTTGAAAAAGGAATTCGCGGTGCAT  1021
             ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  961   ATGCTGCGATGATTGCTGCTGCTGGTACAATTGCTTTTGAAAAAGGAATTCGCGGTGCAT  1020

Query  1022  ATGATATGAATGGCCAGCCCGGCCTTGAATTGACTTCTTATCAAAGTCTCACGAGATAAT  1081
             ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  1021  ATGATATGAATGGCCAGCCCGGCCTTGAATTGACTTCTTATCAAAGTCTCACGAGATAAT  1080

Query  1082  AGCGTGAGACTCCCGGGTAC  1101
             ||||||||||||||||||||
Sbjct  1081  AGCGTGAGACTCCCGGGTAC  1100

Query=  ERCC-00042_genbank |103488730|gb|DQ516783.1| Methanocaldococcus
jannaschii spike-in control MJ-1000-66 genomic sequence
Length=1000

Subject=  ERCC-00042
Length=1023

Score = 1840 bits (996),  Expect = 0.0
Identities = 999/1000 (99%), Gaps = 1/1000 (0%)
Strand=Plus/Plus

Query  1    ACCAACTCTGGCCTTTGTGTTGCTATTCCCCAAGCACACAATCCAGTATAACATCTTCCA  60
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  1    ACCAACTCTGGCCTTTGTGTTGCTATTCCCCAAGCACACAATCCAGTATAACATCTTCCA  60

Query  61   CAAACTCTACAGCCAAGAGCAACCATTGCAGCAGTTCCAATATAGACAGCATCTGCTCCT  120
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  61   CAAACTCTACAGCCAAGAGCAACCATTGCAGCAGTTCCAATATAGACAGCATCTGCTCCT  120

Query  121  AAAGCTATAGCCTTAAATACATCTGCTGAACATCTGATTCCTCCACTTGCTATGATGCTA  180
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  121  AAAGCTATAGCCTTAAATACATCTGCTGAACATCTGATTCCTCCACTTGCTATGATGCTA  180

Query  181  ATTTCATTTCTCAAACCTTCCTCTCTCAATCTTTGATCTACTGCGGCAATAGCCATTTCT  240
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  181  ATTTCATTTCTCAAACCTTCCTCTCTCAATCTTTGATCTACTGCGGCAATAGCCATTTCT  240

Query  241  ATTGGGATTCCAACATGGTCTCTGAATACCTTTGGTGCTGCCCCTGTCCCTCCTTTATAT  300
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  241  ATTGGGATTCCAACATGGTCTCTGAATACCTTTGGTGCTGCCCCTGTCCCTCCTTTATAT  300

Query  301  CCATCTATAACAACTGCGTCAGCATCACTTGTTGCTATTCCAACAGCAATAGCTGGAGCA  360
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  301  CCATCTATAACAACTGCGTCAGCATCACTTGTTGCTATTCCAACAGCAATAGCTGGAGCA  360

Query  361  TTATGGACAGCTGCAATTTTAACAAACACTGGCTTTTTCCATCTTGTTGCTTCTTTCAAA  420
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  361  TTATGGACAGCTGCAATTTTAACAAACACTGGCTTTTTCCATCTTGTTGCTTCTTTCAAA  420

Query  421  CTTCTAACTAATTGAGCTAAATCCTCAATTGAGTAAATGTCATGGTGAGGAGCTGGTGAG  480
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  421  CTTCTAACTAATTGAGCTAAATCCTCAATTGAGTAAATGTCATGGTGAGGAGCTGGTGAG  480

Query  481  ATAGCATCACTTCCCTCAGGAATCATTCTTGTTGCTGAAATTTCTGCTGTAACCTTCTCT  540
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  481  ATAGCATCACTTCCCTCAGGAATCATTCTTGTTGCTGAAATTTCTGCTGTAACCTTCTCT  540

Query  541  CCAGGTAAGTGCCCTCCAATTCCAGGCTTAGCTCCCTGCCCTATTTTAATCTCTATTGCA  600
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  541  CCAGGTAAGTGCCCTCCAATTCCAGGCTTAGCTCCCTGCCCTATTTTAATCTCTATTGCA  600

Query  601  GAACCTTTCATAAGATACTCTTCATTAACTCCAAATCTTCCACTTGCAACTTGGGTAATT  660
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  601  GAACCTTTCATAAGATACTCTTCATTAACTCCAAATCTTCCACTTGCAACTTGGGTAATT  660

Query  661  ATGTGGTCTGCATAAGGGTAGAGAGCTTTTGGCAATCCTCCTTCACCAGTTCCCATGAAT  720
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  661  ATGTGGTCTGCATAAGGGTAGAGAGCTTTTGGCAATCCTCCTTCACCAGTTCCCATGAAT  720

Query  721  GTTCCACATTCTTTAACTGCCTTAGCAAATGATAGGTGAGCGTTTAAAGACAAAGCTCCA  780
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  721  GTTCCACATTCTTTAACTGCCTTAGCAAATGATAGGTGAGCGTTTAAAGACAAAGCTCCA  780

Query  781  TAAGACATATGGGCAATCATTATTGGGGTATCTAACTTTAAGTTTGGAGCTAtttttgtt  840
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  781  TAAGACATATGGGCAATCATTATTGGGGTATCTAACTTTAAGTTTGGAGCTATTTTTGTT  840

Query  841  tttaacttagcttttttAATCTTCTTGCCATCAATCTCTTCTTCAACAAATTCAAACTCT  900
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  841  TTTAACTTAGCTTTTTTAATCTTCTTGCCATCAATCTCTTCTTCAACAAATTCAAACTCT  900

Query  901  AACTGCTTTGGTTTTTTACCAATGTAAGTTCTTAATTCCATTGGCTCTCTCAATGGGTCG  960
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  901  AACTGCTTTGGTTTTTTACCAATGTAAGTTCTTAATTCCATTGGCTCTCTCAATGGGTCG  960

Query  961  ATGGATGGGTTTGTAACTTGGCATGCATCTAAAACAATCT  1000
            ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||
Sbjct  961  ATGGATGGGTTTGTAACTTGG-ATGCATCTAAAACAATCT  999

Query=  ERCC-00043_genbank |103488734|gb|DQ516787.1| Methanocaldococcus
jannaschii spike-in control MJ-1000-70 genomic sequence
Length=1000

Subject=  ERCC-00043
Length=1023

Score = 1840 bits (996),  Expect = 0.0
Identities = 999/1000 (99%), Gaps = 1/1000 (0%)
Strand=Plus/Plus

Query  1    AATACCTTTACAAATGCTTTAACAAGAGGAAATTGTGTTTTTGCCAATTTAAGACCTAAT  60
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  1    AATACCTTTACAAATGCTTTAACAAGAGGAAATTGTGTTTTTGCCAATTTAAGACCTAAT  60

Query  61   TTAATAGTTAAACCATTAACCTTAGTTGTTCCAAGGCATAATATAGAGAGTGAGATACAG  120
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  61   TTAATAGTTAAACCATTAACCTTAGTTGTTCCAAGGCATAATATAGAGAGTGAGATACAG  120

Query  121  GATGAGCTATTTCAGGGAGTTATTCAGTATGCAGTTGCCAAGGCAGTTGCTGATTTAGAT  180
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  121  GATGAGCTATTTCAGGGAGTTATTCAGTATGCAGTTGCCAAGGCAGTTGCTGATTTAGAT  180

Query  181  TTAGATGAAGATTTAAAGGTTGTTGTCTCTGTTAATGTCCCAGAGGTTCCAATAACCAAT  240
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  181  TTAGATGAAGATTTAAAGGTTGTTGTCTCTGTTAATGTCCCAGAGGTTCCAATAACCAAT  240

Query  241  TTAAATAAAAGAAAACTCTTCCAATACTTCTATGCCTCAGCAAAGTTAGCTATAAACAGA  300
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  241  TTAAATAAAAGAAAACTCTTCCAATACTTCTATGCCTCAGCAAAGTTAGCTATAAACAGA  300

Query  301  GCTTTAAATGAATATCCTTCAAAAGAGAAGGTAAAGAAAGAGAAATATAGAGCTTTGCAT  360
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  301  GCTTTAAATGAATATCCTTCAAAAGAGAAGGTAAAGAAAGAGAAATATAGAGCTTTGCAT  360

Query  361  CCATTAGTTGGATTTAGGGATGTTAGATTGGAGTATCCTCCATATCTACAAATTGCTTTG  420
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  361  CCATTAGTTGGATTTAGGGATGTTAGATTGGAGTATCCTCCATATCTACAAATTGCTTTG  420

Query  421  GATGTCCCAACTATGGAGAATTTGGAATTTTTGTTACAAACAATTCCAAATAGCGACCAC  480
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  421  GATGTCCCAACTATGGAGAATTTGGAATTTTTGTTACAAACAATTCCAAATAGCGACCAC  480

Query  481  ATCATCTTAGAGGCTGGAACACCACTAATTAAAAAGTTTGGTTTAGAGGTTATTGAAATA  540
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  481  ATCATCTTAGAGGCTGGAACACCACTAATTAAAAAGTTTGGTTTAGAGGTTATTGAAATA  540

Query  541  ATGAGAGAATATTTTGATGGCTTTATTGTTGCTGATTTAAAAACCTTAGACACTGGAAGG  600
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  541  ATGAGAGAATATTTTGATGGCTTTATTGTTGCTGATTTAAAAACCTTAGACACTGGAAGG  600

Query  601  GTTGAGGTAAGATTGGCATTTGAAGCAACAGCTAATGCAGTGGCAATAAGTGGAGTAGCA  660
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  601  GTTGAGGTAAGATTGGCATTTGAAGCAACAGCTAATGCAGTGGCAATAAGTGGAGTAGCA  660

Query  661  CCAAAATCAACAATAATTAAAGCTATCCACGAATGTCAAAAATGTGGTTTAATCAGCTAT  720
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  661  CCAAAATCAACAATAATTAAAGCTATCCACGAATGTCAAAAATGTGGTTTAATCAGCTAT  720

Query  721  TTGGATATGATGAACGTCTCTGAACCTCAAAAATTATATGATTCATTAAAATTAAAGCCA  780
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  721  TTGGATATGATGAACGTCTCTGAACCTCAAAAATTATATGATTCATTAAAATTAAAGCCA  780

Query  781  GATGTTGTTATCTTGCATAGAGGGATTGATGAGGAGACATTTGGAATTAAAAAGGAATGG  840
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  781  GATGTTGTTATCTTGCATAGAGGGATTGATGAGGAGACATTTGGAATTAAAAAGGAATGG  840

Query  841  AAATTTAAGGAAAACTGCTTATTAGCAATTGCTGGAGGAGTTGGTGTGGAGAATGTTGAA  900
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  841  AAATTTAAGGAAAACTGCTTATTAGCAATTGCTGGAGGAGTTGGTGTGGAGAATGTTGAA  900

Query  901  GAGCTTTTAAAAGAATATCAAATATTAATCGTTGGTAGAGCAATTACAAAATCAAAAGAC  960
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  901  GAGCTTTTAAAAGAATATCAAATATTAATCGTTGGTAGAGCAATTACAAAATCAAAAGAC  960

Query  961  CCAGGAAGAGTAATTAGGATGTTTATAAACAAGATGGGTT  1000
            |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||
Sbjct  961  CCAGGAAGAGTAATTAGGAT-TTTATAAACAAGATGGGTT  999

Query=  ERCC-00044_genbank |92111302|gb|DQ459424.1| Synthetic construct
microarray control MC19 mRNA, complete sequence
Length=1140

Subject=  ERCC-00044
Length=1156

Score = 2008 bits (1087),  Expect = 0.0
Identities = 1106/1114 (99%), Gaps = 6/1114 (0%)
Strand=Plus/Plus

Query  4     AGATAGTGACTAGGGTAAATGCCAAGCCGTCTTATAAAAGCGGTAGCGAGAGATCTTAGA  63
             ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  1     AGATAGTGACTAGGGTAAATGCCAAGCCGTCTTATAAAAGCGGTAGCGAGAGATCTTAGA  60

Query  64    ACTCCCGGGCGAACGCCCCAACTTATGCGATGTCCAGCCCCAAACGGTTGATTAGATCGG  123
             |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  61    ACTCCCGG-CGAACGCCCCAACTTATGCGATGTCCAGCCCCAAACGGTTGATTAGATCGG  119

Query  124   TAGCTCCCGAACTAAGAGACCCTAAACGCTATCCGTGGACTGTGTAGGTAGGCCGTCGTC  183
             ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  120   TAGCTCCCGAACTAAGAGACCCTAAACGCTATCCGTGGACTGTGTAGGTAGGCCGTCGTC  179

Query  184   CTAAGTGGCCTCGTGAACTAACGCCTGCTGCTATGTCCCAATGAAGGGTACATGCCCTCT  243
             ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  180   CTAAGTGGCCTCGTGAACTAACGCCTGCTGCTATGTCCCAATGAAGGGTACATGCCCTCT  239

Query  244   TCCCGTACTACGCCGATACAAAGTCCCGAACGAGCTTACGAAATATAGCGCTTAACCATG  303
             ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  240   TCCCGTACTACGCCGATACAAAGTCCCGAACGAGCTTACGAAATATAGCGCTTAACCATG  299

Query  304   GG-CCACCATAGGTGCCTGGTACAGACGTGTCAGACGAGCCCTCGGCTAGCTCATAATTG  362
             || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  300   GGGCCACCATAGGTGCCTGGTACAGACGTGTCAGACGAGCCCTCGGCTAGCTCATAATTG  359

Query  363   CGGCCGTTCATATAAACCTCAGCGTCTGGTCATGTCTGTTACCACAACGCTCCCGGTTCT  422
             ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||
Sbjct  360   CGGCCGTTCATATAAACCTCAGCGTCTGGTCATGTCTGT-ACCACAACGCTCCCGGTTCT  418

Query  423   TCGACGCTCAGTTCGGTACCCAAGATAGCGGACTCTCAAAGAACGATTCAGTAGTCGC-G  481
             |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
Sbjct  419   TCGACGCTCAGTTCGGTACCCAAGATAGCGGACTCTCAAAGAACGATTCAGTAGTCGCCG  478

Query  482   TACCCATGTAGGCCTTAAGAGGTCTAATTAGCTCTAGGAAACACAACGCCGGGATTTGGG  541
             ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||
Sbjct  479   TACCCATGTAGGCCTTAAGAGGTCTAATTAGCTCTAGGAAACACAACCCCGGGATTTGGG  538

Query  542   ATACGCCACCAACACGATATCCAGCCGCATCGCACGCGTCGAAGTCCTCCGTGCTTGTGT  601
             ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  539   ATACGCCACCAACACGA-ATCCAGCCGCATCGCACGCGTCGAAGTCCTCCGTGCTTGTGT  597

Query  602   GAGTCGACACATAGGATCGGGCACGGAGAGATCGGCGGTTGAAGTATGGAGCGTAGGTCT  661
             ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  598   GAGTCGACACATAGGATCGGGCACGGAGAGATCGGCGGTTGAAGTATGGAGCGTAGGTCT  657

Query  662   CGATCTCGTACAAAACGACTATGACCATTGGGCGTTGTACTCATTATCGTTACGATTTTA  721
             ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  658   CGATCTCGTACAAAACGACTATGACCATTGGGCGTTGTACTCATTATCGTTACGATTTTA  717

Query  722   CGGTGGCAAACGAAGCTACCAAGTAGATGCCGACGTCGAGTGGATCCACGCAGTCCGAGA  781
             ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  718   CGGTGGCAAACGAAGCTACCAAGTAGATGCCGACGTCGAGTGGATCCACGCAGTCCGAGA  777

Query  782   CAGCGCCACACTCGCTGTAGAGGGTTTCAATCCGACTAAGACGGCGGGATCTACTACTTC  841
             |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  778   CAGCGC-ACACTCGCTGTAGAGGGTTTCAATCCGACTAAGACGGCGGGATCTACTACTTC  836

Query  842   TGCGAGTTTAGATTAACTGTATCTCCCGAATGCGCGTTCTAAAACCCTGACGTGATGGGA  901
             ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  837   TGCGAGTTTAGATTAACTGTATCTCCCGAATGCGCGTTCTAAAACCCTGACGTGATGGGA  896

Query  902   CGGGTGAAGCACCAGGTTTTCGCCGGTTAGGTAAGGTAAAAATATGACCTTACCCTACGT  961
             ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  897   CGGGTGAAGCACCGGGTTTTCGCCGGTTAGGTAAGGTAAAAATATGACCTTACCCTACGT  956

Query  962   TGATTGTGGTCATTACAGCAAGAGGTGGGTTATAACGCAATCTATGTTCGCATGCTATGT  1021
             ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  957   TGATTGTGGTCATTACAGCAAGAGGTGGGTTATAACGCAATCTATGTTCGCATGCTATGT  1016

Query  1022  TATTTGACCCCTGCGGTAAGATTATTCACTCGTCATGGATAACCGGATAATCCCGTATAA  1081
             ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  1017  TATTTGACCCCTGCGGTAAGATTATTCACTCGTCATGGATAACCGGATAATCCCGTATAA  1076

Query  1082  CCTGTGGGTATTATAGGCGACAATTCGaaaaaaa  1115
             ||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  1077  CCTGTGGGTATTATAGGCGACAATTCGAAAAAAA  1110

Query=  ERCC-00046_genbank |103488695|gb|DQ516748.1| Methanocaldococcus
jannaschii spike-in control MJ-500-31 genomic sequence
Length=500

Subject=  ERCC-00046
Length=522

Score =  911 bits (493),  Expect = 0.0
Identities = 498/500 (99%), Gaps = 2/500 (0%)
Strand=Plus/Plus

Query  1    ATCTCCTCTAACTTTGGAGAGGTAGGAATGGGAGTATTTGCACTTGTGGTAACGGTATTT  60
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  1    ATCTCCTCTAACTTTGGAGAGGTAGGAATGGGAGTATTTGCACTTGTGGTAACGGTATTT  60

Query  61   GCATTATTGATGGTTTTTACTATGTTGGGTATGCTGTTCGATTTCTTAAAGGACTGAATA  120
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  61   GCATTATTGATGGTTTTTACTATGTTGGGTATGCTGTTCGATTTCTTAAAGGACTGAATA  120

Query  121  TTCGGTGGCAGTATGGGATTTCTAAAAATAATGTTAAGAATTTTTTGCTGGTTTTTTGCG  180
            |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||
Sbjct  121  TTCGGTGGCAGTATGGGATTTCTAAAAATAATGTTAAGAA-TTTTTGCTGGTTTTTTGCG  179

Query  181  ACGTTGGTGTTGTATTCTATAGCTCCATTATGGCCGTTATATGGAATCATTGGAGTGCCA  240
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  180  ACGTTGGTGTTGTATTCTATAGCTCCATTATGGCCGTTATATGGAATCATTGGAGTGCCA  239

Query  241  GTAATTCTACCACGCCTTATATTTAAAGACAAAAAGAAGTGTCTAACAACAACATCCACA  300
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  240  GTAATTCTACCACGCCTTATATTTAAAGACAAAAAGAAGTGTCTAACAACAACATCCACA  299

Query  301  CTACTACTCCTTGTCATATTTCTTCCTGAATTGCTGATTCTTATTGGATTTCTGATATTT  360
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  300  CTACTACTCCTTGTCATATTTCTTCCTGAATTGCTGATTCTTATTGGATTTCTGATATTT  359

Query  361  CCTATTGTTATGGGCTATTACATCTCTAAGGAATTGGTGAAGTAAAATGGTGAAGCTTAT  420
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  360  CCTATTGTTATGGGCTATTACATCTCTAAGGAATTGGTGAAGTAAAATGGTGAAGCTTAT  419

Query  421  GAATTTGTGGAGTGAGAGGATTAAAGATAGGGAAGTTGTTGAAGTTATTGGCTGTGAGAG  480
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  420  GAATTTGTGGAGTGAGAGGATTAAAGATAGGGAAGTTGTTGAAGTTATTGGCTGTGAGAG  479

Query  481  AGTGCCATTGAATGAAACGT  500
            ||||||||||||| ||||||
Sbjct  480  AGTGCCATTGAAT-AAACGT  498

Query=  ERCC-00048_genbank |114976955|gb|DQ883671.2| Synthetic construct
clone NISTag30 external RNA control sequence
Length=1000

Subject=  ERCC-00048
Length=992

Score = 1832 bits (992),  Expect = 0.0
Identities = 992/992 (100%), Gaps = 0/992 (0%)
Strand=Plus/Plus

Query  1    TCTGTAAATCCCGTAAACGAGTAGTACGAATCCGGACTTGAATACACGCGTCAATCCCTT  60
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  1    TCTGTAAATCCCGTAAACGAGTAGTACGAATCCGGACTTGAATACACGCGTCAATCCCTT  60

Query  61   TTATATCCTAGAATGGACCGTGTGGACGGCAACTCAGAGATAACGCATATCTATGTGCTC  120
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  61   TTATATCCTAGAATGGACCGTGTGGACGGCAACTCAGAGATAACGCATATCTATGTGCTC  120

Query  121  GCTTGCCCATCAAAGAAGAGACGGCGACCAAACGGACGACATATAGTGACATGGTCAACC  180
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  121  GCTTGCCCATCAAAGAAGAGACGGCGACCAAACGGACGACATATAGTGACATGGTCAACC  180

Query  181  CGTACGCCTGCTTCGTAAGCCGACGGTCCTTTGAAGAGGCTGGCGAATCATGTCGTTTGT  240
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  181  CGTACGCCTGCTTCGTAAGCCGACGGTCCTTTGAAGAGGCTGGCGAATCATGTCGTTTGT  240

Query  241  GCTTACTATTACATGCTAGCTTGGTTGGGGCATCTCGGGACAACGTCTATGTACAATAAA  300
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  241  GCTTACTATTACATGCTAGCTTGGTTGGGGCATCTCGGGACAACGTCTATGTACAATAAA  300

Query  301  CACAAAGCCGCGTAGTTATCTTCCGCGAGTTCCGCCCAATACATTGGCGGTGACTTGAGA  360
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  301  CACAAAGCCGCGTAGTTATCTTCCGCGAGTTCCGCCCAATACATTGGCGGTGACTTGAGA  360

Query  361  CCGCTAAAATGCACATAGAAGCCTCAAACATGGTAAGACTATAGATAAGCGGCGCGAAAA  420
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  361  CCGCTAAAATGCACATAGAAGCCTCAAACATGGTAAGACTATAGATAAGCGGCGCGAAAA  420

Query  421  CACGGCATTTGGAATGATGTGTACTGGGAATAAGACGACGTCGCTATGGCCTCTCCGGAA  480
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  421  CACGGCATTTGGAATGATGTGTACTGGGAATAAGACGACGTCGCTATGGCCTCTCCGGAA  480

Query  481  GGCGGTGTATGTGCCAAGCGATGTTTCATTAATGTAACGGACAGGTCGCTGAGGTGGCTT  540
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  481  GGCGGTGTATGTGCCAAGCGATGTTTCATTAATGTAACGGACAGGTCGCTGAGGTGGCTT  540

Query  541  TCGTTGGGGGCGCCGTCTTTGGGGGAGATTGCGTCAATTTTGACTGTCAGATCAGCGACT  600
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  541  TCGTTGGGGGCGCCGTCTTTGGGGGAGATTGCGTCAATTTTGACTGTCAGATCAGCGACT  600

Query  601  AGATTTTAGGCAGATTAGTGTGCCACCTGAATCAATAGAACAATATCAGTTATGGCGGTG  660
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  601  AGATTTTAGGCAGATTAGTGTGCCACCTGAATCAATAGAACAATATCAGTTATGGCGGTG  660

Query  661  CAGTATACTATACAATGGGTTGGGCGCATCTGCATGTCTCATGCTGTCATGGCAATCGAC  720
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  661  CAGTATACTATACAATGGGTTGGGCGCATCTGCATGTCTCATGCTGTCATGGCAATCGAC  720

Query  721  CTCTAGTCTGGGGTGATCCGAGGCGCTTCTCTTATTAGGAATAGTGCAGGACCCGAAACC  780
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  721  CTCTAGTCTGGGGTGATCCGAGGCGCTTCTCTTATTAGGAATAGTGCAGGACCCGAAACC  780

Query  781  GCCATAGGGAAAGGGTGAGCGAGGTAGCAGCGTAATAATTCGCGGTGGGCAGGAAATGCT  840
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  781  GCCATAGGGAAAGGGTGAGCGAGGTAGCAGCGTAATAATTCGCGGTGGGCAGGAAATGCT  840

Query  841  TAGTGTTCTGTCTCAAGACCTAAGCGACAGCGTGACCTTGTTTCACTTACCTCTGAAGCT  900
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  841  TAGTGTTCTGTCTCAAGACCTAAGCGACAGCGTGACCTTGTTTCACTTACCTCTGAAGCT  900

Query  901  CTTCGACGTTATAGATATTGGCATCCCTAAACAACGAGTACCTTGTGCTACGACAGAAAA  960
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  901  CTTCGACGTTATAGATATTGGCATCCCTAAACAACGAGTACCTTGTGCTACGACAGAAAA  960

Query  961  GTGACCTGaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaa  992
            ||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  961  GTGACCTGAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAA  992

Query=  ERCC-00051_genbank |103488687|gb|DQ516740.1| Methanocaldococcus
jannaschii spike-in control MJ-250-23 genomic sequence
Length=250

Subject=  ERCC-00051
Length=274

Score =  462 bits (250),  Expect = 3e-135
Identities = 250/250 (100%), Gaps = 0/250 (0%)
Strand=Plus/Plus

Query  1    TTACAATAGATGCGTTTAGAGTAGCTGGGGGAATTTTGCTCTTTAAAATAGCTTGGGACA  60
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  1    TTACAATAGATGCGTTTAGAGTAGCTGGGGGAATTTTGCTCTTTAAAATAGCTTGGGACA  60

Query  61   TGCTTCACGCAGAAATTCCAAAAACAAAGCACAAACCAGATGAAAGATTAGACCTTGAAG  120
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  61   TGCTTCACGCAGAAATTCCAAAAACAAAGCACAAACCAGATGAAAGATTAGACCTTGAAG  120

Query  121  ATATTGATAGTATAGTTTATGTCCCATTGGCTATTCCTTTAATCTCTGGCCCTGGAGCTA  180
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  121  ATATTGATAGTATAGTTTATGTCCCATTGGCTATTCCTTTAATCTCTGGCCCTGGAGCTA  180

Query  181  TAACAACAACCATGATTTTGATTAGCAAAACCCAGAGTATCTTAGAGAAAGGGGTTGTTG  240
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  181  TAACAACAACCATGATTTTGATTAGCAAAACCCAGAGTATCTTAGAGAAAGGGGTTGTTG  240

Query  241  TTCTCTCTAT  250
            ||||||||||
Sbjct  241  TTCTCTCTAT  250

Query=  ERCC-00053_genbank |103488732|gb|DQ516785.1| Methanocaldococcus
jannaschii spike-in control MJ-1000-68 genomic sequence
Length=1000

Subject=  ERCC-00053
Length=1023

Score = 1840 bits (996),  Expect = 0.0
Identities = 999/1000 (99%), Gaps = 1/1000 (0%)
Strand=Plus/Plus

Query  1    ACATCTGTATAAAAAACACTACAGGGTGGTAACATGGTTCTATATAAAATTAGAAGATCA  60
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  1    ACATCTGTATAAAAAACACTACAGGGTGGTAACATGGTTCTATATAAAATTAGAAGATCA  60

Query  61   AAAAACGATCCCTGTCCATCAATACCTTCAGCGGTAATTATAGGATATTCTGTTGGATTA  120
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  61   AAAAACGATCCCTGTCCATCAATACCTTCAGCGGTAATTATAGGATATTCTGTTGGATTA  120

Query  121  AAATTAATTACTGGACATGGAGCTCAGAGCTTAAGCAATATGGCTGGTTCTTATGCTGGA  180
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  121  AAATTAATTACTGGACATGGAGCTCAGAGCTTAAGCAATATGGCTGGTTCTTATGCTGGA  180

Query  181  AAGGAATTGGGAATTTACGCAATGAATAATGGTTATGAATTTAAGGATATTAAAGATATT  240
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  181  AAGGAATTGGGAATTTACGCAATGAATAATGGTTATGAATTTAAGGATATTAAAGATATT  240

Query  241  GAAAGATTTCTTAACCAGTTAGATTTTGCAAAGATAGAGATGAATGAGGAAGAGGATGAA  300
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  241  GAAAGATTTCTTAACCAGTTAGATTTTGCAAAGATAGAGATGAATGAGGAAGAGGATGAA  300

Query  301  ATTATAGTAAAGATATCAAAATGCAATCTCTGCCCAAAGAGAATTTGTGGCTATGAATTT  360
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  301  ATTATAGTAAAGATATCAAAATGCAATCTCTGCCCAAAGAGAATTTGTGGCTATGAATTT  360

Query  361  GAAGGAACAGCATGCCCTTGGGGAGGATTGTTAATTGGATTTATAAGTGAAACTTTAAAG  420
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  361  GAAGGAACAGCATGCCCTTGGGGAGGATTGTTAATTGGATTTATAAGTGAAACTTTAAAG  420

Query  421  TATAATTTAGGCTACCAAATGAATTTAAAGCCAGCTGAAACATGTATTATTAAATTAAAG  480
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  421  TATAATTTAGGCTACCAAATGAATTTAAAGCCAGCTGAAACATGTATTATTAAATTAAAG  480

Query  481  AAGAAATAAAACTTATCTAATATTAAAAAACTCCAAAATCTCATAAGGATGCTTTAATAC  540
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  481  AAGAAATAAAACTTATCTAATATTAAAAAACTCCAAAATCTCATAAGGATGCTTTAATAC  540

Query  541  AATAACATCCTCCAACTCCATCAATTTTCTTGTATTTTCAGCATCTATCTTTCTAACCCT  600
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  541  AATAACATCCTCCAACTCCATCAATTTTCTTGTATTTTCAGCATCTATCTTTCTAACCCT  600

Query  601  CATCTTAATCTCTTTTCCCTCAATTATTGCATTATAAGGGCAAACTTTTTTACAATTTCC  660
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  601  CATCTTAATCTCTTTTCCCTCAATTATTGCATTATAAGGGCAAACTTTTTTACAATTTCC  660

Query  661  ACATCCTAAGCATTTAGATAATAATATCTCAACAAAATTATCCCTCTTAACTATAGCTCC  720
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  661  ACATCCTAAGCATTTAGATAATAATATCTCAACAAAATTATCCCTCTTAACTATAGCTCC  720

Query  721  ATTTGGACAGACGTTTATACATTTTAAACAGAGTTTGCATTTCTTTTTATCAATTGCATA  780
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  721  ATTTGGACAGACGTTTATACATTTTAAACAGAGTTTGCATTTCTTTTTATCAATTGCATA  780

Query  781  AGGAAGTTTTGTTGTTACAATCCCAGCTTTATAATCAACTGGAACTATTAAAGATTTAAC  840
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  781  AGGAAGTTTTGTTGTTACAATCCCAGCTTTATAATCAACTGGAACTATTAAAGATTTAAC  840

Query  841  AAATCCTTTCCCTGCCTGAGCTATAGCATTTGTTACTAAGCTATCTGCAATGCCATTAAC  900
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  841  AAATCCTTTCCCTGCCTGAGCTATAGCATTTGTTACTAAGCTATCTGCAATGCCATTAAC  900

Query  901  AACCTTAGCAACGGTATTTCCAGTAGCTGGTGAGCAAATTAAATAATCATACTTTCCTAA  960
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  901  AACCTTAGCAACGGTATTTCCAGTAGCTGGTGAGCAAATTAAATAATCATACTTTCCTAA  960

Query  961  GCTCAATCTTCCAGTGATTGGTGATGAGTAAGGATGTTCT  1000
            |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||
Sbjct  961  GCTCAATCTTCCAGTGATTG-TGATGAGTAAGGATGTTCT  999

Query=  ERCC-00054_genbank |103488678|gb|DQ516731.1| Methanocaldococcus
jannaschii spike-in control MJ-250-14 genomic sequence
Length=250

Subject=  ERCC-00054
Length=274

Score =  462 bits (250),  Expect = 3e-135
Identities = 250/250 (100%), Gaps = 0/250 (0%)
Strand=Plus/Plus

Query  1    GATAAAATTGGTTTTGTCTTTCAGCAATTCAACTTAATTCCTTTATTAACTGCCTTAGAA  60
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  1    GATAAAATTGGTTTTGTCTTTCAGCAATTCAACTTAATTCCTTTATTAACTGCCTTAGAA  60

Query  61   AATGTTGAACTTCCACTGATTTTTAAATATAGGGGAGCAATgagcggagaagagaggagg  120
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  61   AATGTTGAACTTCCACTGATTTTTAAATATAGGGGAGCAATGAGCGGAGAAGAGAGGAGG  120

Query  121  aagagagctttagaatgcttaaagatggcagagttggaggagagaTTTGCCAATCACAAA  180
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  121  AAGAGAGCTTTAGAATGCTTAAAGATGGCAGAGTTGGAGGAGAGATTTGCCAATCACAAA  180

Query  181  CCAAATCAGTTGAGTGGAGGGCAACAACAGAGAGTTGCTATAGCGAGGGCTTTGGCAAAC  240
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  181  CCAAATCAGTTGAGTGGAGGGCAACAACAGAGAGTTGCTATAGCGAGGGCTTTGGCAAAC  240

Query  241  AACCCACCAA  250
            ||||||||||
Sbjct  241  AACCCACCAA  250

Query=  ERCC-00057_genbank |110339339|gb|DQ668366.1| Synthetic construct
clone TagQ microarray control
Length=1000

Subject=  ERCC-00057
Length=1021

Score = 1847 bits (1000),  Expect = 0.0
Identities = 1000/1000 (100%), Gaps = 0/1000 (0%)
Strand=Plus/Minus

Query  1     CTAGTGCATCCTCGTGGCATCATGCGTCTCCTCAGTAGGTCTGCGACTGATCCTAGTGCA  60
             ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  1021  CTAGTGCATCCTCGTGGCATCATGCGTCTCCTCAGTAGGTCTGCGACTGATCCTAGTGCA  962

Query  61    ATGCGTCTGAGCCTGAGCTACAGCGATATAGCCTGGATTGTGAGCGTATTTGCTGTCAGA  120
             ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  961   ATGCGTCTGAGCCTGAGCTACAGCGATATAGCCTGGATTGTGAGCGTATTTGCTGTCAGA  902

Query  121   ACCTCAGCTCATCATGTATGATGCTGTACCATCCTGCGATACTGAAGATGCACCGCTATA  180
             ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  901   ACCTCAGCTCATCATGTATGATGCTGTACCATCCTGCGATACTGAAGATGCACCGCTATA  842

Query  181   ATGCGAGGCTCTCCGCTAAAGTGGAAGCTGCTCGTTCTCAATGCGAGCGAGTCGAATCCA  240
             ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  841   ATGCGAGGCTCTCCGCTAAAGTGGAAGCTGCTCGTTCTCAATGCGAGCGAGTCGAATCCA  782

Query  241   ATGCCGTAGCTGCGATAACGATGCCGCTGACTCTACGGTAATGCACGATCCTCTACATTG  300
             ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  781   ATGCCGTAGCTGCGATAACGATGCCGCTGACTCTACGGTAATGCACGATCCTCTACATTG  722

Query  301   ATAGCAGATAGTCTAACGGGATAGCATAGGTGCAAGGCTCCTAGCATGTAGTCACAGGTG  360
             ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  721   ATAGCAGATAGTCTAACGGGATAGCATAGGTGCAAGGCTCCTAGCATGTAGTCACAGGTG  662

Query  361   CTCAGATATAGTCATCGCTGCAATCAGCTAGTCATCTTGTCAGGATGCTACTCACTGCGT  420
             ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  661   CTCAGATATAGTCATCGCTGCAATCAGCTAGTCATCTTGTCAGGATGCTACTCACTGCGT  602

Query  421   GCAGAAGATTCGCACGACTTCAGAGGATGGCACTCGTCATTAGAGTGATGTTCTCGGATC  480
             ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  601   GCAGAAGATTCGCACGACTTCAGAGGATGGCACTCGTCATTAGAGTGATGTTCTCGGATC  542

Query  481   GACACTGCTGGTCTGCGAATGACTCGCATTCACTAACATGGAGCATCGTTATCTAAAGGG  540
             ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  541   GACACTGCTGGTCTGCGAATGACTCGCATTCACTAACATGGAGCATCGTTATCTAAAGGG  482

Query  541   GATGCACGTTATCGTCGAGTGGCCGTCATGTCTATGCAGTGCGGCCTATGTCTCATTAGC  600
             ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  481   GATGCACGTTATCGTCGAGTGGCCGTCATGTCTATGCAGTGCGGCCTATGTCTCATTAGC  422

Query  601   GAGTCGTATGTATCATGTCGGGCTCGAATGTTGCACACGTCTGCGTAATGGTGACCGCTA  660
             ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  421   GAGTCGTATGTATCATGTCGGGCTCGAATGTTGCACACGTCTGCGTAATGGTGACCGCTA  362

Query  661   GTCCCACATGGTGCTTCGTAGCCACAAATGTCGTTAGGTAGACCGACGTTATCGCGCTAT  720
             ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  361   GTCCCACATGGTGCTTCGTAGCCACAAATGTCGTTAGGTAGACCGACGTTATCGCGCTAT  302

Query  721   ACCCGATGTCAACGCGAGTTAGACCGTATCGTCCCCAGTGCCCTAAGATGGTCAAGCGTG  780
             ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  301   ACCCGATGTCAACGCGAGTTAGACCGTATCGTCCCCAGTGCCCTAAGATGGTCAAGCGTG  242

Query  781   CTCCTACGTTAGTATCAGTTTCCCTATTGGTACGTCTGGCGTACTTCTGAAACGTGATGG  840
             ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  241   CTCCTACGTTAGTATCAGTTTCCCTATTGGTACGTCTGGCGTACTTCTGAAACGTGATGG  182

Query  841   GCGGCTGGTTACCCGTATATGGGCTCGGTTGACCTCTATTGGGCGTTGTTGACCCGAATT  900
             ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  181   GCGGCTGGTTACCCGTATATGGGCTCGGTTGACCTCTATTGGGCGTTGTTGACCCGAATT  122

Query  901   CGGTATCCTCGTCGTTAAATGGCGAACGTCGTCTGCTATAGGCAAACGTCTGTCGGTCAT  960
             ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  121   CGGTATCCTCGTCGTTAAATGGCGAACGTCGTCTGCTATAGGCAAACGTCTGTCGGTCAT  62

Query  961   GGCAAATGTTACTCGTGTGTGCAAGAAATTACTCGCTGTC  1000
             ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  61    GGCAAATGTTACTCGTGTGTGCAAGAAATTACTCGCTGTC  22

Query=  ERCC-00058_genbank |92111296|gb|DQ459418.1| Synthetic construct
microarray control MC07 mRNA, complete sequence
Length=1140

Subject=  ERCC-00058
Length=1136

Score = 2041 bits (1105),  Expect = 0.0
Identities = 1130/1140 (99%), Gaps = 9/1140 (0%)
Strand=Plus/Plus

Query  1     GGGAGAGTAGGGCCCACTTGTCGATTCGTTTGACTAAACATGGAGAAAGCATCCGAGGGT  60
             ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  1     GGGAGAGTAGGGCCCACTTGTCGATTCGTTTGACTAAACATGGAGAAAGCATCCGAGGGT  60

Query  61    GGGCAGATCCGCCTAAGCAAGGTACCATTTAATCCCGGTCCCACGAAAGAGTTAACCTAT  120
             ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  61    GGGCAGATCCGCCTAAGCAAGGTACCATTTAATCCCGGTCCCACGAAAGAGTTAACCTAT  120

Query  121   ACGCTCAGATGGCGCCATGGTGCGTTCGGAGCCAC-TTCTGCGAATTGTCCACCACTGCC  179
             ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||
Sbjct  121   ACGCTCAGATGGCGCCATGGTGCGTTCGGAGCCACTTTCTGCGAATTGTCCACCACTGCC  180

Query  180   CTCTCGTGTGATGATCAACATACTATCTTCTGCGGATGACCACCACTCACG-GTGTAGGT  238
             |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||
Sbjct  181   CTCTCGTGTGATGATCAACATACTATCTTCTGCGGA-GACCACCACTCACGTGTGTAGGT  239

Query  239   GAGCCATGTTGAATCCATCAGGCACCCGTCCCGGCGTATGAGCGTCTGGAGGCTCACCAA  298
             ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  240   GAGCCATGTTGAATCCATCAGGCACCCGTCCCGGCGTATGAGCGTCTGGAGGCTCACCAA  299

Query  299   CAAAACTTACATAAGACCGGAACTCGAGAGTCTGGCATCATCGTGAACAGGGGCACGAGA  358
             |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||
Sbjct  300   CAAAACTTACATAAGACCGGAACTCGAGAGTCTGGCATCATCGTGAACAGAGGCACGAGA  359

Query  359   GTGAGTCTGTGAGTCCTGACTGAGCATGTCTCGAAAACTGTGATAGATTAAGCCATGGAC  418
             ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  360   GTGAG-CTGTGAGTCCTGACTGAGCATGTCTCGAAAACTGTGATAGATTAAGCCATGGAC  418

Query  419   CAAGGACCAAGAGATCGACGGGCTTGGATATTGCCGCAAGGCTGAAGGTAACACCTTCAG  478
             ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  419   CAAGGACCAAGAGATCGACGGGCTTGGATATTGCCGCAAGGCTGAAGGTAACACCTTCAG  478

Query  479   CTTCAAAATGCTTGAATACTCAGCCGTCCATCACTTCGACCGGGGTTAAGCTAAGATCTG  538
             ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  479   CTTCAAAATGCTTGAATACTCAGCCGTCCATCACTTCGACCGGGGTTAAGCTAAGATCTG  538

Query  539   GTGAGCGGTAGCCCGTCAAACGAATTGGCATCGGACAAGACAAATCAACCAAAGAATCTA  598
             ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  539   GTG-GCGGTAGCCCGTCAAACGAATTGGCATCGGACAAGACAAATCAACCAAAGAATCTA  597

Query  599   CGGTTGCCATGCCATGGTCTGCGTAACGACACCCGAGGTCCTTTTTATGGCGCCAGGCAT  658
             ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  598   CGGTTGCCATGCCATGGTCTGCGTAACGACACCCGAGGTCCTTTTTATGGCGCCAGGCAT  657

Query  659   CGACGCTGTAAAACCCTTCCGTTGTCCTGAGCAGGTTATAACGACATCAAGCGACAGCGA  718
             ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  658   CGACGCTGTAAAACCCTTCCGTTGTCCTGAGCAGGTTATAACGACATCAAGCGACAGCGA  717

Query  719   CAAAGAAGGCGGGAAAACTGTGGACTCCCGGCTATGTCAAATACGCTGAGTCACCCAACA  778
             ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  718   CAAAGAAGGCGGGAAAACTGTGGACTCCCGGCTATGTCAAATACGCTGAGTCACCCAACA  777

Query  779   GAAACGTTATCCGCTTGG-AAACGAATACATGGAAAGTGGGGCCGGTCGGATCACCAAGA  837
             |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  778   GAAACGTTATCCGCTTGGCAAACGAATACATGGAAAGTGGGGCCGGTCGGATCACCAAGA  837

Query  838   TAAGTGGTGTCACGAATAGCCCTCGCTTGCTCTAATCATGGGATGGTACATCGTCATTGC  897
             ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  838   TAAGTGGTGTCACGAATAGCCCTCGCTTGCTCTAATCATGGGATGGTACATCGTCATTGC  897

Query  898   TATTGGATGCAAGACGAATCCTG-CAACAGCCCTCCGGACTCAGTAGGTCCATGGATTTA  956
             ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  898   TATTGGATGCAAGACGAATCCTGGCAACAGCCCTCCGGACTCAGTAGGTCCATGGATTTA  957

Query  957   ACTACAACAGGAAGCCGGTCAACTGTGGAAGACTACCAGTATTCGAGCTGGAATAAAGAG  1016
             |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||
Sbjct  958   ACTACAACAGGAAGCCGGTCAACTGTGGAAGACTACCAGTATTCGAGCTGGA-TAAAGAG  1016

Query  1017  GCTCGGCACCATGGTATAGATGTAATAGGAACCATGAAACTCCC-TGTCGCAAGCACTAA  1075
             |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||
Sbjct  1017  GCTCGGCACCATGGTATAGATGTAATAGGAACCATGAAACTCCCATGTCGCAAGCACTAA  1076

Query  1076  CAGAGCTGTAACCTCCCTCCATTAGCGGTAATCGGGaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaa  1135
             ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  1077  CAGAGCTGTAACCTCCCTCCATTAGCGGTAATCGGGAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAA  1136

Query=  ERCC-00059_genbank |110339329|gb|DQ668356.1| Synthetic construct
clone TagA microarray control
Length=501

Subject=  ERCC-00059
Length=525

Score =  926 bits (501),  Expect = 0.0
Identities = 501/501 (100%), Gaps = 0/501 (0%)
Strand=Plus/Minus

Query  1    ATTTGATCGTAACTCGGGTGACCAATGACCATATACGGCGTATTAAGGTTGTACCCTCGG  60
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  525  ATTTGATCGTAACTCGGGTGACCAATGACCATATACGGCGTATTAAGGTTGTACCCTCGG  466

Query  61   TCTCAACTTGTCGTATGGGACTTTCAAGTACCTTAGCTCGTCGGACGCTTTAGATGACTT  120
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  465  TCTCAACTTGTCGTATGGGACTTTCAAGTACCTTAGCTCGTCGGACGCTTTAGATGACTT  406

Query  121  ATCCATAGTCCTAAGTCCGGCGCCGGTTAAGCCGCTATTAGCGTGTGTGGACTCTCTCTA  180
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  405  ATCCATAGTCCTAAGTCCGGCGCCGGTTAAGCCGCTATTAGCGTGTGTGGACTCTCTCTA  346

Query  181  GGAGCGGCTTCGCACAAATTACTGCTCAATCCTAGATACGTTGCGCTCTTTGGTAAACGG  240
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  345  GGAGCGGCTTCGCACAAATTACTGCTCAATCCTAGATACGTTGCGCTCTTTGGTAAACGG  286

Query  241  CTCAGATCTTAGCACTCGTGCAGTTCTACGATGGCAAGTCGTGCCTCGTTCTCGTGTAGA  300
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  285  CTCAGATCTTAGCACTCGTGCAGTTCTACGATGGCAAGTCGTGCCTCGTTCTCGTGTAGA  226

Query  301  ATATCAGCTAATAGGGTCGGCTCAACAGTGTATCCGGTGGACAAGCACTGACACGCGATG  360
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  225  ATATCAGCTAATAGGGTCGGCTCAACAGTGTATCCGGTGGACAAGCACTGACACGCGATG  166

Query  361  ACGTTCGTCAAGAGTCGCATAATCTCAGAATCCGTACAGCCGCATCGGGTTCACGGCTAT  420
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  165  ACGTTCGTCAAGAGTCGCATAATCTCAGAATCCGTACAGCCGCATCGGGTTCACGGCTAT  106

Query  421  AAAACAGCGTCATCAGCGTAGGGTATCGCTTCGCGTGTCATGACTTGGGCCACGTCTCTC  480
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  105  AAAACAGCGTCATCAGCGTAGGGTATCGCTTCGCGTGTCATGACTTGGGCCACGTCTCTC  46

Query  481  TCTCGCACATTAGGCTAGATT  501
            |||||||||||||||||||||
Sbjct  45   TCTCGCACATTAGGCTAGATT  25

Query=  ERCC-00060_genbank |103488710|gb|DQ516763.1| Methanocaldococcus
jannaschii spike-in control MJ-500-46 genomic sequence
Length=500

Subject=  ERCC-00060
Length=523

Score =  917 bits (496),  Expect = 0.0
Identities = 499/500 (99%), Gaps = 1/500 (0%)
Strand=Plus/Plus

Query  1    ATCGACAATAAACAAAGAAATAGAACTTTTAACACCAGAAGGAAAAATATTTTTGAAGAA  60
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  1    ATCGACAATAAACAAAGAAATAGAACTTTTAACACCAGAAGGAAAAATATTTTTGAAGAA  60

Query  61   AATTGGTTATGTTGATTACTATGAGGCAGGTAGTTTAAAATTAGCTGAAGAAACAGCAAA  120
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  61   AATTGGTTATGTTGATTACTATGAGGCAGGTAGTTTAAAATTAGCTGAAGAAACAGCAAA  120

Query  121  AAGAGATGAGGACGTTATTATATTAAAAAATCATGGAGTAGTTTGTTTAGGTAAAGATTT  180
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  121  AAGAGATGAGGACGTTATTATATTAAAAAATCATGGAGTAGTTTGTTTAGGTAAAGATTT  180

Query  181  GATAGATGCATATATAAAAGTGGAGGTTTTAGAAGAACAAGCTAAACTTACACTTTTAAA  240
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  181  GATAGATGCATATATAAAAGTGGAGGTTTTAGAAGAACAAGCTAAACTTACACTTTTAAA  240

Query  241  CCTTCTTGTAAAGAAATAGTGGGGATTTTTAAATTTATTTAACTCTTTCTAATTCACTAA  300
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  241  CCTTCTTGTAAAGAAATAGTGGGGATTTTTAAATTTATTTAACTCTTTCTAATTCACTAA  300

Query  301  CAATACTCCAAATTTGTGTTCTTGTGTGAAGTGGCATGTTTGGGTCGTTGCTAATCTCAT  360
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  301  CAATACTCCAAATTTGTGTTCTTGTGTGAAGTGGCATGTTTGGGTCGTTGCTAATCTCAT  360

Query  361  CTAAGATGTGGATTGCTGTTGCACTTCTAACGATTGGCTCCTCCCCCTCTTTTAAAACAG  420
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  361  CTAAGATGTGGATTGCTGTTGCACTTCTAACGATTGGCTCCTCCCCCTCTTTTAAAACAG  420

Query  421  CTTCTTTAGCCTTTTCAGCAGCAGCTCTAATGTTTCTTGGAACGGTTGTATCGTTAATTA  480
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  421  CTTCTTTAGCCTTTTCAGCAGCAGCTCTAATGTTTCTTGGAACGGTTGTATCGTTAATTA  480

Query  481  TCTCATCCAACATCAAAGCA  500
            |||||||||| |||||||||
Sbjct  481  TCTCATCCAA-ATCAAAGCA  499

Query=  ERCC-00061_genbank |92111304|gb|DQ459426.1| Synthetic construct
microarray control MC22 mRNA, complete sequence
Length=1147

Subject=  ERCC-00061
Length=1136

Score = 2034 bits (1101),  Expect = 0.0
Identities = 1131/1143 (98%), Gaps = 12/1143 (1%)
Strand=Plus/Plus

Query  1     GGAG-AGCTTGGCAAACACTACCGGGCATAGAT--A-A-GCGGGGCCAAGCATGCCGACA  55
             |||| ||||||||||||||||||||||||||||  | | |||||||||||||||||||||
Sbjct  1     GGAGAAGCTTGGCAAACACTACCGGGCATAGATAAAGACGCGGGGCCAAGCATGCCGACA  60

Query  56    TTGGGATACTTCCATGTTACGAGGGGGCATGGAGGCGCAGCTATCCCACCCTCGTGCGCA  115
             ||||||||||||||||||||   |||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  61    TTGGGATACTTCCATGTTAC---GGGGCATGGAGGCGCAGCTATCCCACCCTCGTGCGCA  117

Query  116   AGATGGACAACCGAGCGCGGTAGTAATCGCGAACTGCCAGGCACTTATTGTAGAGGTGAA  175
             ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  118   AGATGGACAACCGAGCGCGGTAGTAATCGCGAACTGCCAGGCACTTATTGTAGAGGTGAA  177

Query  176   TCGCTAACTAACTCGGTGTAAGTTTCCGTCGATGAACAGGCATCGGAGAGGGCTCTACGG  235
             ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  178   TCGCTAACTAACTCGGTGTAAGTTTCCGTCGATGAACAGGCATCGGAGAGGGCTCTACGG  237

Query  236   GCCACCCAGTAGTGACGTCAGGAGTGCATAAGGAAGCAGATTGACCGTGGCGCAGACTCG  295
             ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  238   GCCACCCAGTAGTGACGTCAGGAGTGCATAAGGAAGCAGATTGACCGTGGCGCAGACTCG  297

Query  296   CGATATGAATAAGACTCTAGGGGGTGTACAATTGATCGTTGCGTACTGGAATCGTGCGAC  355
             |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||
Sbjct  298   CGATATGAATAAGACTCTAGGGGGTGTACAATTGATCGTTGCGTAC-GGAATCGTGCGAC  356

Query  356   CTCAAAAGTTAAGCGCGAGGGTCACCTTGCTCCGCGCGAGCAGCCTTTGTCCAGGCCTAG  415
             ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  357   CTCAAAAGTTAAGCGCGAGGGTCACCTTGCTCCGCGCGAGCAGCCTTTGTCCAGGCCTAG  416

Query  416   TCCTTGCATTCGACCTATCGCACCGAGCGTCTCACCCAGCTAGTACGAAATTAACTGATA  475
             ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  417   TCCTTGCATTCGACCTATCGCACCGAGCGTCTCACCCAGCTAGTACGAAATTAACTGATA  476

Query  476   GAGATGGTTAACCCCCTCAGAGCGACTGGTTTAAGTCTAGGACCGGACAAACGGTACGAT  535
             ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  477   GAGATGGTTAACCCCCTCAGAGCGACTGGTTTAAGTCTAGGACCGGACAAACGGTACGAT  536

Query  536   TACGTCTTAGCATCAAGTGGTGCCTGATCTCGTGATAGACAACGTGAGAGTATTTGGATG  595
             ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  537   TACGTCTTAGCATCAAGTGGTGCCTGATCTCGTGATAGACAACGTGAGAGTATTTGGATG  596

Query  596   TATGGCTAGTTACGCAGAGCATGTGGCATTATTCTCATGTTTTGCGGCGGAGCGACTCAA  655
             ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  597   TATGGCTAGTTACGCAGAGCATGTGGCATTATTCTCATGTTTTGCGGCGGAGCGACTCAA  656

Query  656   TTTATCCGAACCATGGGAGATCGTCATTCTTGTGGTGCaaaaaaaTCACGGGCCCTGATA  715
             ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  657   TTTATCCGAACCATGGGAGATCGTCATTCTTGTGGTGCAAAAAAATCACGGGCCCTGATA  716

Query  716   CTGGTCGAAGTTGCGCCCTATGCTTACACGGCGCACGCCGCGGTGGAGCGATCGAGACCT  775
             ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  717   CTGGTCGAAGTTGCGCCCTATGCTTACACGGCGCACGCCGCGGTGGAGCGATCGAGACCT  776

Query  776   CTCGGATCTGAAATAAACCCGCAACGTGAGGTAGTGTTACGCATACATTCGCCCACGCTA  835
             ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  777   CTCGGATCTGAAATAAACCCGCAACGTGAGGTAGTGTTACGCATACATTCGCCCACGCTA  836

Query  836   GTCACTGATGCGTTGTATTTCTCGGAGTCTTTACCATGAGAATTGGCATATGGAAATCCT  895
                |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  837   ---ACTGATGCGTTGTATTTCTCGGAGTCTTTACCATGAGAATTGGCATATGGAAATCCT  893

Query  896   GTCATACCACGGGTCGATACTTGTTCTCCGTCTGAAGCGAACAACGAAGCATGTTGACCG  955
             ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  894   GTCATACCACGGGTCGATACTTGTTCTCCGTCTGAAGCGAACAACGAAGCATGTTGACCG  953

Query  956   TCTAAGATGATTTTTCCGACAGAGTGACGCATATAACACCTCTGGTCTTACAATGATTCG  1015
             ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  954   TCTAAGATGATTTTTCCGACAGAGTGACGCATATAACACCTCTGGTCTTACAATGATTCG  1013

Query  1016  AAGACACGTGAGACGCACTAGAGGCTTAACCTGGCAGATTGTGATCTCCGATGGTAATGA  1075
             ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  1014  AAGACACGTGAGACGCACTAGAGGCTTAACCTGGCAGATTGTGATCTCCGATGGTAATGA  1073

Query  1076  AGTCGCCGTACTATCTCTTACTTGCATGACGCGACTACCaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaa  1135
             ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  1074  AGTCGCCGTACTATCTCTTACTTGCATGACGCGACTACCAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAA  1133

Query  1136  aaa  1138
             |||
Sbjct  1134  AAA  1136

Query=  ERCC-00062_genbank |103488733|gb|DQ516786.1| Methanocaldococcus
jannaschii spike-in control MJ-1000-69 genomic sequence
Length=1000

Subject=  ERCC-00062
Length=1023

Score = 1840 bits (996),  Expect = 0.0
Identities = 999/1000 (99%), Gaps = 1/1000 (0%)
Strand=Plus/Plus

Query  1    ACTATTGGAGAGAAAGATATCAGCCAGACCTATTTAGTAGCTCCACAGGCGCTAATAAAA  60
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  1    ACTATTGGAGAGAAAGATATCAGCCAGACCTATTTAGTAGCTCCACAGGCGCTAATAAAA  60

Query  61   GAGGCAGTATCATTAATTGGAAAGAGTGCTGTTGAGGGGATGATTAGAAGAAGTTCAAAT  120
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  61   GAGGCAGTATCATTAATTGGAAAGAGTGCTGTTGAGGGGATGATTAGAAGAAGTTCAAAT  120

Query  121  AAATTATTCAAATAATCATAATAAAGTAATACTTATACTGAATATTCGAAATTATTATTT  180
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  121  AAATTATTCAAATAATCATAATAAAGTAATACTTATACTGAATATTCGAAATTATTATTT  180

Query  181  TGGAATTTTACAATATAGGTGATATTATGGCATTAAAATTCACCATTGAAGAGTTATCAA  240
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  181  TGGAATTTTACAATATAGGTGATATTATGGCATTAAAATTCACCATTGAAGAGTTATCAA  240

Query  241  ATCAAAAAAGAGATACATTAGGAAGAAATATTGACGTAACTGTTTTTAGATTAATAAGAT  300
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  241  ATCAAAAAAGAGATACATTAGGAAGAAATATTGACGTAACTGTTTTTAGATTAATAAGAT  300

Query  301  TTATGGATTTGGAAAGATATTTAGGAAGAGGGGCTCATGGAGTTATTTACGAATGTGGAA  360
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  301  TTATGGATTTGGAAAGATATTTAGGAAGAGGGGCTCATGGAGTTATTTACGAATGTGGAA  360

Query  361  GAGAGCTTGGACTGGCATTAAATCCAAAAACTGTTGAAGATGTAGTTAAGTTTTGTGAGG  420
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  361  GAGAGCTTGGACTGGCATTAAATCCAAAAACTGTTGAAGATGTAGTTAAGTTTTGTGAGG  420

Query  421  AATATAAAATTGGAAAGGTGGAGATAGTTAATAAAGAGCCATTGTAAATTAGGGTTTATG  480
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  421  AATATAAAATTGGAAAGGTGGAGATAGTTAATAAAGAGCCATTGTAAATTAGGGTTTATG  480

Query  481  AATGTATCTCTTGTTCTGGACTTCCTGAGGTTGGAGAGACATTATGTTGGTTTGAAGGAG  540
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  481  AATGTATCTCTTGTTCTGGACTTCCTGAGGTTGGAGAGACATTATGTTGGTTTGAAGGAG  540

Query  541  GCTTTATTGCTGGATGCTTAGAAAAAATATTAAACAAGAGAGTTAGAGTGAAAGAAACTC  600
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  541  GCTTTATTGCTGGATGCTTAGAAAAAATATTAAACAAGAGAGTTAGAGTGAAAGAAACTC  600

Query  601  ACTGTGCAGGTTTGGGGCATGATTTCTGTCAGTTTGAGGTAAAAGTCCTTTAATGATATT  660
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  601  ACTGTGCAGGTTTGGGGCATGATTTCTGTCAGTTTGAGGTAAAAGTCCTTTAATGATATT  660

Query  661  TTTTCATCTCATTTATTATATATTCTAAAGCTTCAAAACCCTCTTTTCTATGTCTTGCAA  720
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  661  TTTTCATCTCATTTATTATATATTCTAAAGCTTCAAAACCCTCTTTTCTATGTCTTGCAA  720

Query  721  AAACGGCTATTGAAGCAATCCTCTCCCCAATACTTAAAAATCCAGTGTTGTGGTAAAATA  780
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  721  AAACGGCTATTGAAGCAATCCTCTCCCCAATACTTAAAAATCCAGTGTTGTGGTAAAATA  780

Query  781  AGATATCAATAACATCAAACTTATTTTTTGCCTCCTCAATAACTAACTTCAACTTTTCTA  840
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  781  AGATATCAATAACATCAAACTTATTTTTTGCCTCCTCAATAACTAACTTCAACTTTTCTA  840

Query  841  AGATGTCTTCATCTATCTTCATTCCTTTTGATGGAACTTTTTCTCCATCTTTTAAATCAT  900
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  841  AGATGTCTTCATCTATCTTCATTCCTTTTGATGGAACTTTTTCTCCATCTTTTAAATCAT  900

Query  901  ACTCCCTAACAAATCCATTGAAAGTTACAATACATCCAAATTTCCCTTTGTATTTTTCAA  960
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  901  ACTCCCTAACAAATCCATTGAAAGTTACAATACATCCAAATTTCCCTTTGTATTTTTCAA  960

Query  961  TACATTCATCCATCTTTTTGCAAAACTCTTCATACTCGTT  1000
            |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||
Sbjct  961  TACATTCATCCATCTTTTTG-AAAACTCTTCATACTCGTT  999

Query=  ERCC-00067_genbank |114975645|gb|DQ883653.2| Synthetic construct
clone NISTag12 external RNA control sequence
Length=650

Subject=  ERCC-00067
Length=644

Score = 1190 bits (644),  Expect = 0.0
Identities = 644/644 (100%), Gaps = 0/644 (0%)
Strand=Plus/Plus

Query  1    GCCGTACTTACACCCTACGTTGCTGATCTCGGCGCTCGTACATTTACACTTGTAGTTGAA  60
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  1    GCCGTACTTACACCCTACGTTGCTGATCTCGGCGCTCGTACATTTACACTTGTAGTTGAA  60

Query  61   GGTCGGGCGATGAGGCGTTCGTTTGGCCAACCTCGTTACATTGCACAAATGCCGGATTTG  120
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  61   GGTCGGGCGATGAGGCGTTCGTTTGGCCAACCTCGTTACATTGCACAAATGCCGGATTTG  120

Query  121  GCTACTATATATACTCCCTGATCAAGGGTCGAGTTGTCTGTGCATTAGCTCGGAGCTAAT  180
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  121  GCTACTATATATACTCCCTGATCAAGGGTCGAGTTGTCTGTGCATTAGCTCGGAGCTAAT  180

Query  181  GAGCACGTCGGTCACGGACACTGCGAAGCACGACGAAATGGCTCTCATTGCGATTGTGGC  240
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  181  GAGCACGTCGGTCACGGACACTGCGAAGCACGACGAAATGGCTCTCATTGCGATTGTGGC  240

Query  241  CCTTGTTGCAGACAATTGTCAGGCGGGACGGGCCAGGAATGACAATAGAACATTAATCTA  300
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  241  CCTTGTTGCAGACAATTGTCAGGCGGGACGGGCCAGGAATGACAATAGAACATTAATCTA  300

Query  301  ATTTACAATTTGACGCCATGACGTATTAAACATTCGGGCATGCAAATCACCGATTTTAAG  360
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  301  ATTTACAATTTGACGCCATGACGTATTAAACATTCGGGCATGCAAATCACCGATTTTAAG  360

Query  361  ATCCCCTGTACGGCTGCGTCCACACTAGCATGATGTAAATCGATTTGGCGGTGACCGCTG  420
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  361  ATCCCCTGTACGGCTGCGTCCACACTAGCATGATGTAAATCGATTTGGCGGTGACCGCTG  420

Query  421  ATCCTTAACAAAAGGGGGTGGTTCAAATGTAAAACAAGTAGGTGCGAGCAAACGTCTGGT  480
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  421  ATCCTTAACAAAAGGGGGTGGTTCAAATGTAAAACAAGTAGGTGCGAGCAAACGTCTGGT  480

Query  481  GCTCTAATGGCAAACATCTGCAATCAGCGAACCTCGCGGTATGGCAACTCACTAATTGTC  540
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  481  GCTCTAATGGCAAACATCTGCAATCAGCGAACCTCGCGGTATGGCAACTCACTAATTGTC  540

Query  541  CGTGCGACGACAAATTACCGAGGGAGGCACTTATGAGTTATCTTCGCTGTGATATCTCCT  600
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  541  CGTGCGACGACAAATTACCGAGGGAGGCACTTATGAGTTATCTTCGCTGTGATATCTCCT  600

Query  601  TCGACTAGCGCGGTCAGTCCaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaa  644
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  601  TCGACTAGCGCGGTCAGTCCAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAA  644

Query=  ERCC-00069_genbank |92111299|gb|DQ459421.1| Synthetic construct
microarray control MC10 mRNA, complete sequence
Length=1139

Subject=  ERCC-00069
Length=1137

Score = 2002 bits (1084),  Expect = 0.0
Identities = 1125/1142 (98%), Gaps = 14/1142 (1%)
Strand=Plus/Plus

Query  1     GGGAGAAGTACCAAGATCAGACTCCCGAGACATAAGGGGTGTGCACGGCATGGATGTGTC  60
             |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  1     GGGAGAAGTACCAATATCAGACTCCCGAGACATAAGGGGTGTGCACGGCATGGATGTGTC  60

Query  61    GCTAACCTCCTGGTCCTATAAAGGCAACACTCATGGCACCGTGTGCTGAAGGCTCCAAAC  120
             |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  61    GCTAACCTCCTGGTCCTATAAA-GCAACACTCATGGCACCGTGTGCTGAAGGCTCCAAAC  119

Query  121   GGGTCGATACCAGAAGGGTCGATTC-TTCTTCCAATACATTGTCGGTGTCAATGCTGGAG  179
             ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  120   GGGTCGATACCAGAAGGGTCGATTCTTTCTTCCAATACATTGTCGGTGTCAATGCTGGAG  179

Query  180   GCCCAGGAGGACGAAATCCTCGGTCAGGTTGTTACTTGAAGGGTTCAACACGAGCTCAAA  239
             |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  180   GCCCAGGA-GACGAAATCCTCGGTCAGGTTGTTACTTGAAGGGTTCAACACGAGCTCAAA  238

Query  240   TTTGTCCAGGGGTGGTCACCAGCGGGTCTCGAACAGAGGTGAAACGGGATAAATACCCGA  299
             ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  239   TTTGTCCAGGGGTGGTCACCAGCGGGTCTCGAACAGAGGTGAAACGGGATAAATACCCGA  298

Query  300   AACATTCATAACCCTGCCAGTCATTATAAGCAAGCCGCTGACTTGGACACCACAACGTGT  359
             ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  299   AACATTCATAACCCTGCCAGTCATTATAAGCAAGCCGCTGACTTGGACACCACAACGTGT  358

Query  360   GGAACCTCAGGTAAGCTGGTCCGGGAATCTTGGTCGCGAAGCGACCCCATTGAGTAGGCA  419
             ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  359   GGAACCTCAGGTAAGCTGGTCCGGGAATCTTGGTCGCGAAGCGACCCCATTGAGTAGGCA  418

Query  420   ATCCAAACCCTGCAAACAATAGGTGGCCATCCGGTCAAATAATGTGGGAGATGCGCACAT  479
             ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  419   ATCCAAACCCTGCAAACAATAGGTGGCCATCCGGTCAAATAATGTGGGAGATGCGCACAT  478

Query  480   CATGAGAGCGACGTATTGAACTCAAGGGACGGTGGTCCCCAGGAGAGGGATTACCACATG  539
             ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||
Sbjct  479   CATGAGAGCGACGTATTGAACTCAAGGGACGGTGGTCCC-AGGAGAGGGATTACCACATG  537

Query  540   TTGAAGCTCTTTCAAATCGATTATCCCAATCGGCGCACTGTAAGGTAACCAACCGCAACT  599
             ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |
Sbjct  538   TTGAAGCTCTTTCAAATCGATTATCCCAATCTGCGCACTGTAAGGTAACCAACCGCAA-T  596

Query  600   AATCCCCAGAACACTGCCCTGGTATCCATCGATTTGGAAGTC-AGACTCTAGTGATGCCG  658
             |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||
Sbjct  597   AATCCCCAGAACACTGCCCTGGTATCCATCGATTTGGAAGTCCAGACTCTAGTGATGCCG  656

Query  659   GCTGGTCGCGACAAGAAAACATAATTCGCAAAGGGCCCCTGTCTCATTTGGCGTCTTGTA  718
             ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  657   GCTGGTCGCGACAAGAAAACATAATTCGCAAAGGGCCCCTGTCTCATTTGGCGTCTTGTA  716

Query  719   CCCAAACATCATACTTGGGAGGGTGTTGCGGCCGCATATCAACGACTAGAGGCCGTCAGA  778
             ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  717   CCCAAACATCATACTTGGGAGGGTGTTGCGGCCGCATATCAACGACTAGAGGCCGTCAGA  776

Query  779   ATGAGTCTTCAACACATATCGCTGAAGAAATGTCACTCCCCTGGTGGCTGATATAGAAAC  838
             |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||
Sbjct  777   ATGAGTCTTCAACACATATCGCTGAAGAAATGTCACTCCCATGGTGGCTGATATAGAAAC  836

Query  839   ATATCCTCGCGGACTTCATCGCCGGGCACAAGGCTACAAGATGGACCTGGAACGCCGTGT  898
             |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||
Sbjct  837   ATATCCTCGCGGACTTCATCGCCGGGCACAAGGCTACAAGATGGAC-TGGAACGCCGTGT  895

Query  899   CAACCTCGTAACAACTCCCCATGCAATTCACTCACCGAGTAGCCTATAATGGGGAATGTA  958
             ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  896   CAACCTCGTAACAACTCCCCATGCAATTCACTCACCGAGTAGCCTATAATGGGGAATGTA  955

Query  959   GACGGGGCCCTATCTCAAATGTGTGCACCTCTATCCCCACCAAGTATAGTCGACTTAAGG  1018
             ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  956   GACGGGGCCCTATCTCAAATGTGTGCACCTCTATCCCCACCAAGTATAGTCGACTTAAGG  1015

Query  1019  GCGGATCAAATGGCGCGCTGCCATACAAATCCGGTTCCAA---TGACTCAT----AGTAC  1071
             ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||   ||||||||    |||||
Sbjct  1016  GCGGATCAAATGGCGCGCTGCCATACAAATCCGGTTCCAAGCATGACTCATGGGCAGTAC  1075

Query  1072  GCCGGTTAGTGGGAAATACGGCTGTCAAACGCTGGTCCaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaa  1131
             ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  1076  GCCGGTTAGTGGGAAATACGGCTGTCAAACGCTGGTCCAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAA  1135

Query  1132  aa  1133
             ||
Sbjct  1136  AA  1137

Query=  ERCC-00071_genbank |114975649|gb|DQ883654.2| Synthetic construct
clone NISTag13 external RNA control sequence
Length=650

Subject=  ERCC-00071
Length=642

Score = 1186 bits (642),  Expect = 0.0
Identities = 642/642 (100%), Gaps = 0/642 (0%)
Strand=Plus/Plus

Query  1    CATGCGAGAGGCCTTGAGCCGTTGGCCGATCGCATACAGAGACTATTGCATCAAGGTAAC  60
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  1    CATGCGAGAGGCCTTGAGCCGTTGGCCGATCGCATACAGAGACTATTGCATCAAGGTAAC  60

Query  61   ACTTATTAATCCCCATCGTCATAATCGCTAGATTCTAGGTATTTCGGATCTTCCTAGTTA  120
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  61   ACTTATTAATCCCCATCGTCATAATCGCTAGATTCTAGGTATTTCGGATCTTCCTAGTTA  120

Query  121  TCAGAAACATGTTAATTGGGCTCGGGCGTCTGCGCCAGGCCTTCGTAGTCCATACCACGA  180
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  121  TCAGAAACATGTTAATTGGGCTCGGGCGTCTGCGCCAGGCCTTCGTAGTCCATACCACGA  180

Query  181  TCTGTATTTTGCACCTTTCGCTATGCTGAGGTTGTTGACATAAGGATTAACTGCTGTGGT  240
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  181  TCTGTATTTTGCACCTTTCGCTATGCTGAGGTTGTTGACATAAGGATTAACTGCTGTGGT  240

Query  241  GTGTCATACTCGGCTACCTCCTGGTTTGGCGTCAAACAACTTCCAAGATTATCTCATACT  300
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  241  GTGTCATACTCGGCTACCTCCTGGTTTGGCGTCAAACAACTTCCAAGATTATCTCATACT  300

Query  301  ATAAAAAGACGACATGCACCGCCGTCCTTAAGTGCTTACGACAGAGGGTCGTTATCTCTC  360
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  301  ATAAAAAGACGACATGCACCGCCGTCCTTAAGTGCTTACGACAGAGGGTCGTTATCTCTC  360

Query  361  TCGGTCTCGGTGCGCCTCTTCACGGAGCAGCATGACCTGCTAACCTGCATCAGCCAATGT  420
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  361  TCGGTCTCGGTGCGCCTCTTCACGGAGCAGCATGACCTGCTAACCTGCATCAGCCAATGT  420

Query  421  CCCGTCTCGAGCTGGCCTACGGATGCGTGAGCAAAGGTGCTAACTCTTTTCATAACCCGG  480
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  421  CCCGTCTCGAGCTGGCCTACGGATGCGTGAGCAAAGGTGCTAACTCTTTTCATAACCCGG  480

Query  481  AGATGAACTACCACGCTTCCTGCGTGGGTCCCGCGAAAACGAAGCAAGGAGATTCTTCGC  540
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  481  AGATGAACTACCACGCTTCCTGCGTGGGTCCCGCGAAAACGAAGCAAGGAGATTCTTCGC  540

Query  541  GACCTGGCCCATTCACTACATAACAGAGTTAAGACTTAGATCAGCGAGCAGGTGTACGCC  600
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  541  GACCTGGCCCATTCACTACATAACAGAGTTAAGACTTAGATCAGCGAGCAGGTGTACGCC  600

Query  601  CCGGACCTTGGGCTACTTaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaa  642
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  601  CCGGACCTTGGGCTACTTAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAA  642

Query=  ERCC-00073_genbank |110339331|gb|DQ668358.1| Synthetic construct
clone TagC microarray control
Length=579

Subject=  ERCC-00073
Length=603

Score = 1070 bits (579),  Expect = 0.0
Identities = 579/579 (100%), Gaps = 0/579 (0%)
Strand=Plus/Plus

Query  1    TGTGATAATTTCGACGAGGCGTTACATATTCTGAGAGGGGTGATTAAGTCTGCTTCGGCC  60
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  1    TGTGATAATTTCGACGAGGCGTTACATATTCTGAGAGGGGTGATTAAGTCTGCTTCGGCC  60

Query  61   TGGGATGGTCTGTCTACGTGTGCGTAGTTCTGTCATAGCGTCGAGGATTCTGAACCTGTC  120
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  61   TGGGATGGTCTGTCTACGTGTGCGTAGTTCTGTCATAGCGTCGAGGATTCTGAACCTGTC  120

Query  121  CATAGTATCCTGTAAGCGTCCAATGTACCTATATCGTGGACCCAAAGTCGATACGTCCGA  180
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  121  CATAGTATCCTGTAAGCGTCCAATGTACCTATATCGTGGACCCAAAGTCGATACGTCCGA  180

Query  181  TTAAGCGACGTTGGTCTAGGTAACGAATTATACCCTCGGGTTACGAATTATGGCTGTGCC  240
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  181  TTAAGCGACGTTGGTCTAGGTAACGAATTATACCCTCGGGTTACGAATTATGGCTGTGCC  240

Query  241  TAACGAATCTGGGACGTGCCTAAGTAATCTGGTCCGCGACTAAGATGTACGGTGATCGTG  300
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  241  TAACGAATCTGGGACGTGCCTAAGTAATCTGGTCCGCGACTAAGATGTACGGTGATCGTG  300

Query  301  GACGCTTGACCGGACTTATGCGTCGCCTTCCGAGTTATTGGATGGCGTTCCGTCCTATTG  360
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  301  GACGCTTGACCGGACTTATGCGTCGCCTTCCGAGTTATTGGATGGCGTTCCGTCCTATTG  360

Query  361  GATACTATTCCGTGCGTGTGCGACACGTTCCGAGCATATGCTAACAGTTCCGTCACTATG  420
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  361  GATACTATTCCGTGCGTGTGCGACACGTTCCGAGCATATGCTAACAGTTCCGTCACTATG  420

Query  421  TAACGCTTGACGTAGATTGCTATCAGGTTACGATGACTGCTAAGCCATTACGCGACATTC  480
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  421  TAACGCTTGACGTAGATTGCTATCAGGTTACGATGACTGCTAAGCCATTACGCGACATTC  480

Query  481  TGCAAAGTTACGTCGCATTCTCTCACGTTACGGCTGATTCTCTAGGCTTACGCGCATGAG  540
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  481  TGCAAAGTTACGTCGCATTCTCTCACGTTACGGCTGATTCTCTAGGCTTACGCGCATGAG  540

Query  541  CTCTAGGTTCCGGGTACTATCGAACGTGTCATTGGTACT  579
            |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  541  CTCTAGGTTCCGGGTACTATCGAACGTGTCATTGGTACT  579

Query=  ERCC-00074_genbank |103488701|gb|DQ516754.1| Methanocaldococcus
jannaschii spike-in control MJ-500-37 genomic sequence
Length=500

Subject=  ERCC-00074
Length=522

Score =  917 bits (496),  Expect = 0.0
Identities = 499/500 (99%), Gaps = 1/500 (0%)
Strand=Plus/Plus

Query  1    TGGACATTAATTAGGGCTGAAAGCCCTAACTTAATGGACGGGAGGTATCCCAATAGGAGG  60
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  1    TGGACATTAATTAGGGCTGAAAGCCCTAACTTAATGGACGGGAGGTATCCCAATAGGAGG  60

Query  61   TTTCCTCCTATGGTTTTCAAAACAATCACCATCATGCTATTAATGATATTAAAATCCCAA  120
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  61   TTTCCTCCTATGGTTTTCAAAACAATCACCATCATGCTATTAATGATATTAAAATCCCAA  120

Query  121  CTATACCAAAGAATATCCCAATTATCCATAAAACTGTAACTAAGTGAGGCTCTCTCATTG  180
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  121  CTATACCAAAGAATATCCCAATTATCCATAAAACTGTAACTAAGTGAGGCTCTCTCATTG  180

Query  181  GTTTATACTTCAATATAAGCCTTGGTAGGGATAGATAGCCACCTATATAGTATAGCTTCC  240
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  181  GTTTATACTTCAATATAAGCCTTGGTAGGGATAGATAGCCACCTATATAGTATAGCTTCC  240

Query  241  CATCTTCTTTGAGAGTTGTTGGTTTATGCTCATCCCTACTCATAACCCCAGCACTTAGAT  300
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  241  CATCTTCTTTGAGAGTTGTTGGTTTATGCTCATCCCTACTCATAACCCCAGCACTTAGAT  300

Query  301  ATTTTAAAGAGGCATCTATCACATAAGGCATCATTATAACTAAAAATGGGATATATTCCT  360
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  301  ATTTTAAAGAGGCATCTATCACATAAGGCATCATTATAACTAAAAATGGGATATATTCCT  360

Query  361  TATAAACTACTGCTAAGACAGCTAAGAAAGCTCCAATTGGTAGAGTTCCAACATCTCCTG  420
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  361  TATAAACTACTGCTAAGACAGCTAAGAAAGCTCCAATTGGTAGAGTTCCAACATCTCCTG  420

Query  421  GAAAAACCTTTGCTGGATATTTGTTAAATATCAATAGCCCTAAATAGGATGCAGAGAATA  480
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  421  GAAAAACCTTTGCTGGATATTTGTTAAATATCAATAGCCCTAAATAGGATGCAGAGAATA  480

Query  481  TCAAAGCGGATAAAAATCCA  500
            |||||||||| |||||||||
Sbjct  481  TCAAAGCGGA-AAAAATCCA  499

Query=  ERCC-00075_genbank |103488725|gb|DQ516778.1| Methanocaldococcus
jannaschii spike-in control MJ-1000-61 genomic sequence
Length=1000

Subject=  ERCC-00075
Length=1023

Score = 1840 bits (996),  Expect = 0.0
Identities = 999/1000 (99%), Gaps = 1/1000 (0%)
Strand=Plus/Plus

Query  1    TCCTACACGTTCCCTCATCTGAAACCATACAACTACCAACTGGATTTAATGGAGTGCAAA  60
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  1    TCCTACACGTTCCCTCATCTGAAACCATACAACTACCAACTGGATTTAATGGAGTGCAAA  60

Query  61   CCGTTCCAAACAATGGGCAGTCAGTTGGCAGTTTCTCTCCTCTCAAAATCTTATCACATA  120
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  61   CCGTTCCAAACAATGGGCAGTCAGTTGGCAGTTTCTCTCCTCTCAAAATCTTATCACATA  120

Query  121  TACAACCTTTAGGAATTTTCTCTTTAATCTCTGGAATATCCTCATGCTCATAGATGTCAA  180
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  121  TACAACCTTTAGGAATTTTCTCTTTAATCTCTGGAATATCCTCATGCTCATAGATGTCAA  180

Query  181  ATTTCTTATACTTCTCCCTCAATCCAAAACCACCATTTTTAACAACTGGGAAACCTCTCC  240
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  181  ATTTCTTATACTTCTCCCTCAATCCAAAACCACCATTTTTAACAACTGGGAAACCTCTCC  240

Query  241  AAGGAACATCTATGCTTTCAAAAACTTCATTTATTATTTTTTGAGCTAAAACATTACCTT  300
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  241  AAGGAACATCTATGCTTTCAAAAACTTCATTTATTATTTTTTGAGCTAAAACATTACCTT  300

Query  301  CTGGCTTAACTGCTCTAATATATTCATTTTCAACCTTTGCCTCTCCACTGATGACTTGCT  360
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  301  CTGGCTTAACTGCTCTAATATATTCATTTTCAACCTTTGCCTCTCCACTGATGACTTGCT  360

Query  361  TTAAAATCATTATTATAGCCATTAACACATCTATTGGCTCAAAGCCAGCAACAACCATTG  420
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  361  TTAAAATCATTATTATAGCCATTAACACATCTATTGGCTCAAAGCCAGCAACAACCATTG  420

Query  421  GAGCTTTGTATTTTTCACACAACCCATAATAAGGCTTTAATCCGGTGATTGTTGAAACAT  480
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  421  GAGCTTTGTATTTTTCACACAACCCATAATAAGGCTTTAATCCGGTGATTGTTGAAACAT  480

Query  481  GTCCTGGGCATATAAATGCATCTAAATAAACTCCCTCATTTAACAAGAACTCCATAACTG  540
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  481  GTCCTGGGCATATAAATGCATCTAAATAAACTCCCTCATTTAACAAGAACTCCATAACTG  540

Query  541  GAGGAGTCTGCCTGTGGCAATTTAGGATAAAGAAGTTATTAACATCTTTATTTTTTAAAC  600
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  541  GAGGAGTCTGCCTGTGGCAATTTAGGATAAAGAAGTTATTAACATCTTTATTTTTTAAAC  600

Query  601  TTATTAGTTCAGCCCCAGTAGTTGGAGCAGTGGTTTCAAAACCTATTGCCACAAAAACAA  660
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  601  TTATTAGTTCAGCCCCAGTAGTTGGAGCAGTGGTTTCAAAACCTATTGCCACAAAAACAA  660

Query  661  ACTTCTTATCTCTCTCCTTCTTAGCCATCTTTACTGCTTCACTTATACTATAGACAATTC  720
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  661  ACTTCTTATCTCTCTCCTTCTTAGCCATCTTTACTGCTTCACTTATACTATAGACAATTC  720

Query  721  TAACATCACAACCCTCAGATTGCTTTTCCATCAAAGATTTTTCACTTCCCGGCACTCTAT  780
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  721  TAACATCACAACCCTCAGATTGCTTTTCCATCAAAGATTTTTCACTTCCCGGCACTCTAT  780

Query  781  ACATATCTCCAAGAGTGGTTATTACATATCCATTGTCAGCTAAATATATGGCTGTATCTA  840
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  781  ACATATCTCCAAGAGTGGTTATTACATATCCATTGTCAGCTAAATATATGGCTGTATCTA  840

Query  841  TCTCTTTTTGAGTTGTTACACAAACTGGACAACCCGGCCCTGGAACAACGGTTATATTCT  900
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  841  TCTCTTTTTGAGTTGTTACACAAACTGGACAACCCGGCCCTGGAACAACGGTTATATTCT  900

Query  901  CTGGCAGAACATCCCTAATCCCATACTTACAGATTGTGTGCTCATGACTTCCACAGACGT  960
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  901  CTGGCAGAACATCCCTAATCCCATACTTACAGATTGTGTGCTCATGACTTCCACAGACGT  960

Query  961  GCATAATCTTTAATTTATCTATCTTCTCAGCAAGTTTGTT  1000
            |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||
Sbjct  961  GCATAATCTTTAATTTATCT-TCTTCTCAGCAAGTTTGTT  999

 

Query=  ERCC-00076_genbank |114975623|gb|DQ883650.2| Synthetic construct
clone NISTag9 external RNA control sequence
Length=650

Subject=  ERCC-00076
Length=642

Score = 1181 bits (639),  Expect = 0.0
Identities = 642/643 (99%), Gaps = 1/643 (0%)
Strand=Plus/Plus

Query  1    CTCCTCATGTGAGCGGATCACTATCTACAGCTGGTAATACTCTCAGAATTTCTAACTACC  60
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  1    CTCCTCATGTGAGCGGATCACTATCTACAGCTGGTAATACTCTCAGAATTTCTAACTACC  60

Query  61   AGTCGTAAAGTAGGCGAGCGTTGGTTGGTTCCTCTTGAAGCGAGAGAACCAAGGTGCTGG  120
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  61   AGTCGTAAAGTAGGCGAGCGTTGGTTGGTTCCTCTTGAAGCGAGAGAACCAAGGTGCTGG  120

Query  121  CTATTGTCCGCCCCGTCTACGGCTAACGCGGGGTTCTGCCATCCCGGTTTAGCGCAGAAT  180
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  121  CTATTGTCCGCCCCGTCTACGGCTAACGCGGGGTTCTGCCATCCCGGTTTAGCGCAGAAT  180

Query  181  AGTATTAGTCGGTCAGTGGACCCCCTCCTGAATATCTATACTTAGCGGCGGATTACCCGG  240
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  181  AGTATTAGTCGGTCAGTGGACCCCCTCCTGAATATCTATACTTAGCGGCGGATTACCCGG  240

Query  241  CCCTCTTCATTGTCGAAAGATTGGGAACCGCCCTCTGGCTGTCACGCCCCCAGGCCCTAG  300
            |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  241  CCCTCTTCATTGTCGAAAGATTGGGAACCG-CCTCTGGCTGTCACGCCCCCAGGCCCTAG  299

Query  301  GTGAGGTACTATGTGAGGTATTTTTTCAATGTTAGATCATCTATGTAGTGGATCTGAGAG  360
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  300  GTGAGGTACTATGTGAGGTATTTTTTCAATGTTAGATCATCTATGTAGTGGATCTGAGAG  359

Query  361  ATCACGTGGACCAAAGCTGATTGATTACGGGACTGGCCGTAAGTGCTGCCCGCGAGTAGA  420
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  360  ATCACGTGGACCAAAGCTGATTGATTACGGGACTGGCCGTAAGTGCTGCCCGCGAGTAGA  419

Query  421  TCGTCTAGATCCGGCTAAAATTCCCTGCGGTGCCTTAGCCACCACTCCTACGACGGGCCG  480
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  420  TCGTCTAGATCCGGCTAAAATTCCCTGCGGTGCCTTAGCCACCACTCCTACGACGGGCCG  479

Query  481  CATCTTGGTTATTCTCGCTAGACACGGTTCGGGAAGTGGAGCATCGTTAGCTGCCAAGAT  540
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  480  CATCTTGGTTATTCTCGCTAGACACGGTTCGGGAAGTGGAGCATCGTTAGCTGCCAAGAT  539

Query  541  GTGTATGTTGTCGCCACTCTCGCACCGTTTTTATAGTCGTTCTATTAGAGATGGTTGCAC  600
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  540  GTGTATGTTGTCGCCACTCTCGCACCGTTTTTATAGTCGTTCTATTAGAGATGGTTGCAC  599

Query  601  ATGGGCGTTTCTCATCGGTaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaa  643
            |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  600  ATGGGCGTTTCTCATCGGTAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAA  642

Query=  ERCC-00077_genbank |103488689|gb|DQ516742.1| Methanocaldococcus
jannaschii spike-in control MJ-250-25 genomic sequence
Length=250

Subject=  ERCC-00077
Length=273

Score =  462 bits (250),  Expect = 3e-135
Identities = 250/250 (100%), Gaps = 0/250 (0%)
Strand=Plus/Plus

Query  1    AGTTTTTTCACCTTATGACTTCTCATTCCATACGAAAGACAGATGGTTTGCTCCCAATGA  60
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  1    AGTTTTTTCACCTTATGACTTCTCATTCCATACGAAAGACAGATGGTTTGCTCCCAATGA  60

Query  61   ACCCAGAGGGAGTTAAGGTTGATGATTCCCAAGTCCAACATGGAGTTATGCCTATAACGT  120
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  61   ACCCAGAGGGAGTTAAGGTTGATGATTCCCAAGTCCAACATGGAGTTATGCCTATAACGT  120

Query  121  CATGTTGGACAGACCCCTGTATTGAGCAGACTTAACTTATACTGATATACAGCTAAAATT  180
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  121  CATGTTGGACAGACCCCTGTATTGAGCAGACTTAACTTATACTGATATACAGCTAAAATT  180

Query  181  TGAACAACAAATCTCTTAAATTTATTGTTGAGAATAAAAAGGATACTATCTTATCCAATA  240
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  181  TGAACAACAAATCTCTTAAATTTATTGTTGAGAATAAAAAGGATACTATCTTATCCAATA  240

Query  241  TTGTATTTCC  250
            ||||||||||
Sbjct  241  TTGTATTTCC  250

Query=  ERCC-00078_genbank |114976964|gb|DQ883673.2| Synthetic construct
clone NISTag32 external RNA control sequence
Length=1000

Subject=  ERCC-00078
Length=993

Score = 1834 bits (993),  Expect = 0.0
Identities = 993/993 (100%), Gaps = 0/993 (0%)
Strand=Plus/Plus

Query  1    GGGGAATTGGATTTGCAGAGCATATTAGCAAGTTAACGCCGATCACTCTCCGGCAGTTGC  60
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  1    GGGGAATTGGATTTGCAGAGCATATTAGCAAGTTAACGCCGATCACTCTCCGGCAGTTGC  60

Query  61   TCCATTAAATACGGGCCTTCGCAATCGCGTGTTGTTACACATAATGCCGGTATCCATCTA  120
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  61   TCCATTAAATACGGGCCTTCGCAATCGCGTGTTGTTACACATAATGCCGGTATCCATCTA  120

Query  121  CTATCGCCGCCAGGTGCAAGAAATGCATATCCCGGCCTACCCCCTTAGCAATCGACATTT  180
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  121  CTATCGCCGCCAGGTGCAAGAAATGCATATCCCGGCCTACCCCCTTAGCAATCGACATTT  180

Query  181  GTCTTTGCTGGACGCGCATGATTGAGTTATACGGAACTTCGCAAAAGTATTCCCTTTGTG  240
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  181  GTCTTTGCTGGACGCGCATGATTGAGTTATACGGAACTTCGCAAAAGTATTCCCTTTGTG  240

Query  241  GTCCGTGCGCCATGCTCCTCTGGGCGTAGCTTACAAGGACTAGGCCGTAGCCTGTAATTA  300
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  241  GTCCGTGCGCCATGCTCCTCTGGGCGTAGCTTACAAGGACTAGGCCGTAGCCTGTAATTA  300

Query  301  GGGAACCGAGCACCAGAGAATCAGGGTCACAGTGTGTGGTAGACGAAATGATCGTGGGCT  360
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  301  GGGAACCGAGCACCAGAGAATCAGGGTCACAGTGTGTGGTAGACGAAATGATCGTGGGCT  360

Query  361  GAGGGAATTAGGAGGCGCCGGTCCAATAGTCGATAACACCTGACGGAAGTACGGCTGCAG  420
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  361  GAGGGAATTAGGAGGCGCCGGTCCAATAGTCGATAACACCTGACGGAAGTACGGCTGCAG  420

Query  421  GATCTAATCATATAGTTCAGAATTGCACGCGCGTCTAAGAACGGACCAGTGTAGACACAA  480
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  421  GATCTAATCATATAGTTCAGAATTGCACGCGCGTCTAAGAACGGACCAGTGTAGACACAA  480

Query  481  TACAACTTAAGCGCAGATCTGAGAGAGGGGTGCACAATCCAGGCAAAGTCCGTTAGAAGG  540
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  481  TACAACTTAAGCGCAGATCTGAGAGAGGGGTGCACAATCCAGGCAAAGTCCGTTAGAAGG  540

Query  541  TCAACCTTGTGGGTGCAGCGCTTTGCTCCTAAAGATTCGCTCCTCGGGAGCGACGCGACT  600
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  541  TCAACCTTGTGGGTGCAGCGCTTTGCTCCTAAAGATTCGCTCCTCGGGAGCGACGCGACT  600

Query  601  GCTAGGGACTGGTAAAACGTTGGGCGCTGTCCAAGGTACCCTCAGTCTGTATTTCATGCC  660
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  601  GCTAGGGACTGGTAAAACGTTGGGCGCTGTCCAAGGTACCCTCAGTCTGTATTTCATGCC  660

Query  661  CTCAAATATGCAATCCCGACCCGGAGCCGGCTTTAGATTTATAGCAGAGGGTCTCCGAGG  720
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  661  CTCAAATATGCAATCCCGACCCGGAGCCGGCTTTAGATTTATAGCAGAGGGTCTCCGAGG  720

Query  721  ACTGTAATGTCTTTTGCGAGACAGGAAAGGTTGGGCGGTGTACGTCACCTCTACGGTCGA  780
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  721  ACTGTAATGTCTTTTGCGAGACAGGAAAGGTTGGGCGGTGTACGTCACCTCTACGGTCGA  780

Query  781  GGCTTGGGTGTATCATGGAGTAATCTATATTCCTTACACGCTTGCTTGCTCCTACCATAC  840
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  781  GGCTTGGGTGTATCATGGAGTAATCTATATTCCTTACACGCTTGCTTGCTCCTACCATAC  840

Query  841  AACCACGCAGTCATTACGCGTACATATACCAGCAATTCTTCTACGGACCGTTAGGAAGAA  900
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  841  AACCACGCAGTCATTACGCGTACATATACCAGCAATTCTTCTACGGACCGTTAGGAAGAA  900

Query  901  AATGAACGGAGTGGCTGGCCCATAATTTCGCACCCGAAGCTACTGGTCGGACCCATCAGC  960
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  901  AATGAACGGAGTGGCTGGCCCATAATTTCGCACCCGAAGCTACTGGTCGGACCCATCAGC  960

Query  961  GCGTGTCGTaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaa  993
            |||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  961  GCGTGTCGTAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAA  993

Query=  ERCC-00079_genbank |114975640|gb|DQ883652.2| Synthetic construct
clone NISTag11 external RNA control sequence
Length=650

Subject=  ERCC-00079
Length=644

Score = 1190 bits (644),  Expect = 0.0
Identities = 644/644 (100%), Gaps = 0/644 (0%)
Strand=Plus/Plus

Query  1    GATGTTGGAGTTAACGGAGACCCGCCATCGTTTACGAAACAGGTCGCAGATAAATGTGGA  60
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  1    GATGTTGGAGTTAACGGAGACCCGCCATCGTTTACGAAACAGGTCGCAGATAAATGTGGA  60

Query  61   GCAGATTTACGTTGAGGGCCTTCTGGGGACCCAAAGGATGAACGGGGTGTTGTTTCAGAG  120
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  61   GCAGATTTACGTTGAGGGCCTTCTGGGGACCCAAAGGATGAACGGGGTGTTGTTTCAGAG  120

Query  121  CGAATAGAGCGATCACCAACGCGCACGTCTCTTTTTAAGATTGAGCGGCTAGGTGTTTCC  180
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  121  CGAATAGAGCGATCACCAACGCGCACGTCTCTTTTTAAGATTGAGCGGCTAGGTGTTTCC  180

Query  181  TACAGTAACTCAATTAGCGTGAGCCAAAGGGCGGAGCCACGGGCCAGTAAGCTATTTAGG  240
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  181  TACAGTAACTCAATTAGCGTGAGCCAAAGGGCGGAGCCACGGGCCAGTAAGCTATTTAGG  240

Query  241  GTTTACATGGCTCGATACCGAAACGTGACCGGTACGACGTTCATTTCCTCTGCTTTGGAG  300
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  241  GTTTACATGGCTCGATACCGAAACGTGACCGGTACGACGTTCATTTCCTCTGCTTTGGAG  300

Query  301  TTATCAATTCGTGACCCCGATCATCCAGTCCAGAAGTCGCGGCCCGAAGATCAAAGACGC  360
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  301  TTATCAATTCGTGACCCCGATCATCCAGTCCAGAAGTCGCGGCCCGAAGATCAAAGACGC  360

Query  361  TACTGACTTGGACTGGTACGAGAGCCCGAGAGTTTAGTGTGCGCACCCCACGTATTTTTT  420
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  361  TACTGACTTGGACTGGTACGAGAGCCCGAGAGTTTAGTGTGCGCACCCCACGTATTTTTT  420

Query  421  CGCGTCGATCATGCTTAGATTTTAACAACCCGCGGGCCGAAGTTTGATAAGCGTGTTCTA  480
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  421  CGCGTCGATCATGCTTAGATTTTAACAACCCGCGGGCCGAAGTTTGATAAGCGTGTTCTA  480

Query  481  GATTGGAACTTACCACTGTTAAATACACGACGCCCATCTCCAAATCGCACGCAACAGGGG  540
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  481  GATTGGAACTTACCACTGTTAAATACACGACGCCCATCTCCAAATCGCACGCAACAGGGG  540

Query  541  GCTTCCACCAGATACTCCCCAGGACAGGTGGAGATACCAACCACGAAGGAGGTCTCGTGC  600
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  541  GCTTCCACCAGATACTCCCCAGGACAGGTGGAGATACCAACCACGAAGGAGGTCTCGTGC  600

Query  601  TGAGCCTTCGTCGATATACCaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaa  644
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  601  TGAGCCTTCGTCGATATACCAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAA  644

Query=  ERCC-00081_genbank |110586078|gb|DQ854991.1| Synthetic construct
clone AG002.0011 external RNA control sequence
Length=509

Subject=  ERCC-00081
Length=534

Score =  929 bits (503),  Expect = 0.0
Identities = 508/510 (99%), Gaps = 1/510 (0%)
Strand=Plus/Plus

Query  1    TTTATGCGGGGTGTTGTTGATAAGACTTCCTAGGCACGCGGACCAAGCACGTTAAAGGGA  60
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  1    TTTATGCGGGGTGTTGTTGATAAGACTTCCTAGGCACGCGGACCAAGCACGTTAAAGGGA  60

Query  61   GGTTCGCTCGATCAAGAGATCCATACAGCAGGCTCCTATCAGTCTATCTGACGCCAGTTG  120
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  61   GGTTCGCTCGATCAAGAGATCCATACAGCAGGCTCCTATCAGTCTATCTGACGCCAGTTG  120

Query  121  CCATTGGACGGGATGTCGAGGGTTTGCGGTGGGGAACGACCATACTTACTGTCATTACGA  180
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  121  CCATTGGACGGGATGTCGAGGGTTTGCGGTGGGGAACGACCATACTTACTGTCATTACGA  180

Query  181  CGTGCGGGGAAATTGAGGTTAAGTTGTTTGCCACCCTACAATAACGAAGAATTTAGCCAC  240
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  181  CGTGCGGGGAAATTGAGGTTAAGTTGTTTGCCACCCTACAATAACGAAGAATTTAGCCAC  240

Query  241  CGGTTGGCG-TAGAGTTGTCAAGACGTTGGCGTGATGGGATGAACGTCGCTTAAACGTTG  299
            | ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  241  CAGTTGGCGTTAGAGTTGTCAAGACGTTGGCGTGATGGGATGAACGTCGCTTAAACGTTG  300

Query  300  GTTCAGGGCTCCATATATACATCTGCCGTGCCCCCCTTAATCTCCATACAGACCCCCCAG  359
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  301  GTTCAGGGCTCCATATATACATCTGCCGTGCCCCCCTTAATCTCCATACAGACCCCCCAG  360

Query  360  GCGGAATGATAAGTCGATACCAGGACAATGACGGCTTCAACGTTTTCACTTTCCGCAGGT  419
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  361  GCGGAATGATAAGTCGATACCAGGACAATGACGGCTTCAACGTTTTCACTTTCCGCAGGT  420

Query  420  GGCGACCCTCTAGTTGCACGCTGGTACATCAGACACGTACACACGCGCAGTGGGGTGTAA  479
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  421  GGCGACCCTCTAGTTGCACGCTGGTACATCAGACACGTACACACGCGCAGTGGGGTGTAA  480

Query  480  TCAAGCAGGACCATAACTGATAGTTCACCA  509
            ||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  481  TCAAGCAGGACCATAACTGATAGTTCACCA  510

Query=  ERCC-00083_genbank |103488727|gb|DQ516780.1| Methanocaldococcus
jannaschii spike-in control MJ-1000-63 genomic sequence
Length=1000

Subject=  ERCC-00083
Length=1022

Score = 1840 bits (996),  Expect = 0.0
Identities = 999/1000 (99%), Gaps = 1/1000 (0%)
Strand=Plus/Plus

Query  1    GAGTTTATAGTCtttttttGATTGCCTCAACTAATGCCTCCTTTGTAGGAGCTCCAATAA  60
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  1    GAGTTTATAGTCTTTTTTTGATTGCCTCAACTAATGCCTCCTTTGTAGGAGCTCCAATAA  60

Query  61   ACTCAACATCCCCATTTATTACAATTGTTGGAACTGCCATTATCCCATATTCCATTGCCT  120
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  61   ACTCAACATCCCCATTTATTACAATTGTTGGAACTGCCATTATCCCATATTCCATTGCCT  120

Query  121  TTTGAGGATTCTCCATAACGTTTATGTATTCTACTTCAACAGCATCCGGCATTTCATTTG  180
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  121  TTTGAGGATTCTCCATAACGTTTATGTATTCTACTTCAACAGCATCCGGCATTTCATTTG  180

Query  181  CTACCTCTTCAACAACTCTTTTAGCTGCAGGACAGTGAGGACACATTGGTGATGTAAAAA  240
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  181  CTACCTCTTCAACAACTCTTTTAGCTGCAGGACAGTGAGGACACATTGGTGATGTAAAAA  240

Query  241  GCTCTATCTTTACCTTTGACATACTAACACCttaaaaacctcttaagtttataataaaaa  300
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  241  GCTCTATCTTTACCTTTGACATACTAACACCTTAAAAACCTCTTAAGTTTATAATAAAAA  300

Query  301  ttttatccaaatttttataaatagttttccaaaaatagaatattaaattataGGCTAAAA  360
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  301  TTTTATCCAAATTTTTATAAATAGTTTTCCAAAAATAGAATATTAAATTATAGGCTAAAA  360

Query  361  ATTAATGACCACATGTCCAAACTTGTCTGAAGTGTTCAATTGCTTCAACAATATCCTTCA  420
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  361  ATTAATGACCACATGTCCAAACTTGTCTGAAGTGTTCAATTGCTTCAACAATATCCTTCA  420

Query  421  ATTTCTCTGGTGGGAAAGCTACAACAACTTCTTCTGGCTTAATTCCAGCGTATTTTCTTG  480
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  421  ATTTCTCTGGTGGGAAAGCTACAACAACTTCTTCTGGCTTAATTCCAGCGTATTTTCTTG  480

Query  481  AACCGTTACAACCTAAAGTCATGTTAGGAGCTTTTCTTGTATAAACTGCCGCTACAGCAT  540
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  481  AACCGTTACAACCTAAAGTCATGTTAGGAGCTTTTCTTGTATAAACTGCCGCTACAGCAT  540

Query  541  CAGCACACAATGACTGAATTCCTGAGAAATCTGCCTGGAATCTTCCACCTTTATGGTAGA  600
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  541  CAGCACACAATGACTGAATTCCTGAGAAATCTGCCTGGAATCTTCCACCTTTATGGTAGA  600

Query  601  GTATTGCTTGAACTAACCTCAACGCATATAATGGCTCTCCAATAAATACAATTGAGTCTG  660
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  601  GTATTGCTTGAACTAACCTCAACGCATATAATGGCTCTCCAATAAATACAATTGAGTCTG  660

Query  661  GAATGAAGTCGGTTTCATCTAATGGAGCATAGACTGTTGCATAAATTTCCTCTTCAACTT  720
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  661  GAATGAAGTCGGTTTCATCTAATGGAGCATAGACTGTTGCATAAATTTCCTCTTCAACTT  720

Query  721  TTGGTATTGCATCAACTGtttttttAGCTGCCTCTTCATCTTTAAAGTTTCCTAATTTGA  780
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  721  TTGGTATTGCATCAACTGTTTTTTTAGCTGCCTCTTCATCTTTAAAGTTTCCTAATTTGA  780

Query  781  CATATAATTTTCCTGTTGCTAATGGTTCTGGTGGGTTTCTAAAGACCCCCATTGCATAAG  840
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  781  CATATAATTTTCCTGTTGCTAATGGTTCTGGTGGGTTTCTAAAGACCCCCATTGCATAAG  840

Query  841  CTCCTCCCTTACAGAGGTGTTTATCAACTGTTGCATATAAtttttttCTTTCTAATCTTG  900
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  841  CTCCTCCCTTACAGAGGTGTTTATCAACTGTTGCATATAATTTTTTTCTTTCTAATCTTG  900

Query  901  CCATTTGAATCATTTCACAGTGTCTTTTTTCTTCGTCTAATGTTTCATAGCCTTCTGGAA  960
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  901  CCATTTGAATCATTTCACAGTGTCTTTTTTCTTCGTCTAATGTTTCATAGCCTTCTGGAA  960

Query  961  TTTCTTCCTTTGATTTTGCCAATTTTACAGCGACAAATGG  1000
            ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||
Sbjct  961  TTTCTTCCTTTGATTTTGCCA-TTTTACAGCGACAAATGG  999

Query=  ERCC-00084_genbank |114976998|gb|DQ883682.2| Synthetic construct
clone NISTag41 external RNA control sequence
Length=1000

Subject=  ERCC-00084
Length=994

Score = 1836 bits (994),  Expect = 0.0
Identities = 994/994 (100%), Gaps = 0/994 (0%)
Strand=Plus/Plus

Query  1    GCGAATTGTCTGGGGCCTCGTTGTGACTATCCTATTACGGGGATCTCAGGTGTGGTATCC  60
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  1    GCGAATTGTCTGGGGCCTCGTTGTGACTATCCTATTACGGGGATCTCAGGTGTGGTATCC  60

Query  61   CTGGTTGAGACATTGGACTAGTGTAATTGACAGTCATCGTATGCGGGATACCTCAAGTTG  120
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  61   CTGGTTGAGACATTGGACTAGTGTAATTGACAGTCATCGTATGCGGGATACCTCAAGTTG  120

Query  121  TATTCGAGGGCTTATCGGTGATACTGTGTAATCCCTTCGGCGAAAGATGTATGCGTGAGC  180
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  121  TATTCGAGGGCTTATCGGTGATACTGTGTAATCCCTTCGGCGAAAGATGTATGCGTGAGC  180

Query  181  ATTAAATTTACGTGTTTCCTATATCGGACGCCTAATCTTTACCCGAGAAAGATATCTCTG  240
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  181  ATTAAATTTACGTGTTTCCTATATCGGACGCCTAATCTTTACCCGAGAAAGATATCTCTG  240

Query  241  TAAGTTTTCAAGCAACCGCGTCCTAATGTATATAACTTGGATCATCAGATAGGCCCATTA  300
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  241  TAAGTTTTCAAGCAACCGCGTCCTAATGTATATAACTTGGATCATCAGATAGGCCCATTA  300

Query  301  CACTCTTCGGTGCTGCCGATATCCGACGAGCGGGCTTTTCGACTTGATCAGCGCTGTGGG  360
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  301  CACTCTTCGGTGCTGCCGATATCCGACGAGCGGGCTTTTCGACTTGATCAGCGCTGTGGG  360

Query  361  TAGAGCTTGGATAAGCGAGGTCAGTCAAGCGATTCGTTGCCTCCGGGTCCCACGTAGATC  420
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  361  TAGAGCTTGGATAAGCGAGGTCAGTCAAGCGATTCGTTGCCTCCGGGTCCCACGTAGATC  420

Query  421  GTTTGCCTGCATTTTATAGGTAGTGGCCTGCGTTCGCACTCCGAGGCACTGGGAACGATC  480
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  421  GTTTGCCTGCATTTTATAGGTAGTGGCCTGCGTTCGCACTCCGAGGCACTGGGAACGATC  480

Query  481  CTACCAACATAACGGTCGAACTCGGTGTCGGATGACCCGGACGGGACGCCCGCGCTCACA  540
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  481  CTACCAACATAACGGTCGAACTCGGTGTCGGATGACCCGGACGGGACGCCCGCGCTCACA  540

Query  541  CAGGTATCTGGCGTGTACACCCGAATCGGCGGGGCTCGGCGACACAAAATGCTTCTAACT  600
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  541  CAGGTATCTGGCGTGTACACCCGAATCGGCGGGGCTCGGCGACACAAAATGCTTCTAACT  600

Query  601  CGCTGTGAATCTACTGCAGAACTATGGGTTTGCTAGCGCGCCGGTATCTACCAGCAAAAC  660
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  601  CGCTGTGAATCTACTGCAGAACTATGGGTTTGCTAGCGCGCCGGTATCTACCAGCAAAAC  660

Query  661  ATAGGAGCGTGGCCGAAACTGGGTCACTGAGTGGAATATATCCGAGTGCAGCTGCCATTA  720
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  661  ATAGGAGCGTGGCCGAAACTGGGTCACTGAGTGGAATATATCCGAGTGCAGCTGCCATTA  720

Query  721  GTGGGGCGGTATCGGGCGTGATTGAAGGTAGGCTAACATTAGTCATCTGGTAGGGCATAT  780
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  721  GTGGGGCGGTATCGGGCGTGATTGAAGGTAGGCTAACATTAGTCATCTGGTAGGGCATAT  780

Query  781  TTTACAAACGGTCTAGGCTGCGGTTCAGATAGGGACTGATATACTTGATGTGCCCCCGTT  840
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  781  TTTACAAACGGTCTAGGCTGCGGTTCAGATAGGGACTGATATACTTGATGTGCCCCCGTT  840

Query  841  CTTCAGCGTGCAGCTATGCAGCGACAGACGTTTGGAGCCTTAATCAAGTACGCATCGGAG  900
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  841  CTTCAGCGTGCAGCTATGCAGCGACAGACGTTTGGAGCCTTAATCAAGTACGCATCGGAG  900

Query  901  CATACGGTCACTGGGGCATTTGCAGTGAAATTAACCATCCCCGTTCCCGCTTCTCAGTTG  960
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  901  CATACGGTCACTGGGGCATTTGCAGTGAAATTAACCATCCCCGTTCCCGCTTCTCAGTTG  960

Query  961  CAGGGTGGGGaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaa  994
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  961  CAGGGTGGGGAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAA  994

Query=  ERCC-00085_genbank |114976949|gb|DQ883669.2| Synthetic construct
clone NISTag28 external RNA control sequence
Length=850

Subject=  ERCC-00085
Length=844

Score = 1559 bits (844),  Expect = 0.0
Identities = 844/844 (100%), Gaps = 0/844 (0%)
Strand=Plus/Plus

Query  1    GATTCAGCCTGACGTACATAGACGAGATAGGGTAAGCCTATTGCAAACCTCCGCTTTGCT  60
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  1    GATTCAGCCTGACGTACATAGACGAGATAGGGTAAGCCTATTGCAAACCTCCGCTTTGCT  60

Query  61   ACTACAAGGACCTCGGAAGTGTGGAGAATCGAACCTACAATTTTGCCAGGATCACGCCGG  120
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  61   ACTACAAGGACCTCGGAAGTGTGGAGAATCGAACCTACAATTTTGCCAGGATCACGCCGG  120

Query  121  TTATCTCTTGCAATTCCTAAGATGGAGGATAGTTTTGGAACCCAATATCCCCAGCCTACG  180
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  121  TTATCTCTTGCAATTCCTAAGATGGAGGATAGTTTTGGAACCCAATATCCCCAGCCTACG  180

Query  181  GTTTAGGTGCAAGAATAGAGCGTACCAGGCGTCGCCCGCGGCCTTATGTAGTCTGTATTG  240
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  181  GTTTAGGTGCAAGAATAGAGCGTACCAGGCGTCGCCCGCGGCCTTATGTAGTCTGTATTG  240

Query  241  TTGAATTAGCCTTCTTCAGAGGGCCTAACGCCAGCACAACATGCTTACCTGGCTAATTGA  300
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  241  TTGAATTAGCCTTCTTCAGAGGGCCTAACGCCAGCACAACATGCTTACCTGGCTAATTGA  300

Query  301  CTAAGTGCTACGGTACACAACGACTACGTACGTAGCACACAGTTGAGGTTATCTCTGAGC  360
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  301  CTAAGTGCTACGGTACACAACGACTACGTACGTAGCACACAGTTGAGGTTATCTCTGAGC  360

Query  361  GCCCCGTTAGAACTGAGGGCTCAATTATAGTACCTTAACTGCGTTGCGCTGTCATGGGAA  420
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  361  GCCCCGTTAGAACTGAGGGCTCAATTATAGTACCTTAACTGCGTTGCGCTGTCATGGGAA  420

Query  421  GGTATTTTAATACGGATTCATTACCGCTCCACCGGCAGCGTTCCGTTACATCCAACTAGG  480
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  421  GGTATTTTAATACGGATTCATTACCGCTCCACCGGCAGCGTTCCGTTACATCCAACTAGG  480

Query  481  TGGACAAACCTGCTCATTCAAGGGCGCCTCCATCGCAGGGTTGCAATTTATTTTCTAGCT  540
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  481  TGGACAAACCTGCTCATTCAAGGGCGCCTCCATCGCAGGGTTGCAATTTATTTTCTAGCT  540

Query  541  AGAGGTGTAACCATGCCGGCAGCGAACGTCCGCACTAGCAGGTACACAATCAGGCATCGA  600
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  541  AGAGGTGTAACCATGCCGGCAGCGAACGTCCGCACTAGCAGGTACACAATCAGGCATCGA  600

Query  601  ACATGTACTCATTAGTTCCGAATTATAAGTCGGATACTTGCCTTAAGTCGCATCTGAATC  660
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  601  ACATGTACTCATTAGTTCCGAATTATAAGTCGGATACTTGCCTTAAGTCGCATCTGAATC  660

Query  661  ATAGCCGCTCCATTGCCGAGTAGACGGGATCTGCTGTAGAATGGTAATCAGTCTTACCCG  720
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  661  ATAGCCGCTCCATTGCCGAGTAGACGGGATCTGCTGTAGAATGGTAATCAGTCTTACCCG  720

Query  721  TGGGGTCGTTCTGCCCGAGTGCTGCATTCCGCCTACGCGCGGTATTCAACAAGGGTAATC  780
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  721  TGGGGTCGTTCTGCCCGAGTGCTGCATTCCGCCTACGCGCGGTATTCAACAAGGGTAATC  780

Query  781  CCTCCGACAACCCTCAGTGTTATCATCCGCGTCAAGGGGGaaaaaaaaaaaaaaaaaaaa  840
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  781  CCTCCGACAACCCTCAGTGTTATCATCCGCGTCAAGGGGGAAAAAAAAAAAAAAAAAAAA  840

Query  841  aaaa  844
            ||||
Sbjct  841  AAAA  844

Query=  ERCC-00086_genbank |103488738|gb|DQ516791.1| Methanocaldococcus
jannaschii spike-in control MJ-1000-74 genomic sequence
Length=1000

Subject=  ERCC-00086
Length=1020

Score = 1825 bits (988),  Expect = 0.0
Identities = 996/1000 (99%), Gaps = 1/1000 (0%)
Strand=Plus/Plus

Query  1    TTTCTCTTGACTTTTTCCATAACTTCCCTAATTGTTCTATAATTCYCTTTCAAAGAGTCC  60
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||
Sbjct  1    TTTCTCTTGACTTTTTCCATAACTTCCCTAATTGTTCTATAATTCTCTTTCAAAGAGTCC  60

Query  61   TTATCATAACCAAATACATAAACTCTAACTCTATTTCCTTTTGATTCTATTGTGCAATCA  120
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  61   TTATCATAACCAAATACATAAACTCTAACTCTATTTCCTTTTGATTCTATTGTGCAATCA  120

Query  121  ATGTCCATCCTTGATAATCTCTCACAAAGCTCCAAAAGCTCTTCATCACAACTCACTTTT  180
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  121  ATGTCCATCCTTGATAATCTCTCACAAAGCTCCAAAAGCTCTTCATCACAACTCACTTTT  180

Query  181  GATGAAATAATCTTTCTCATAGTATCACCAAAATAATAAAGTAAATTTATAAATTACCAT  240
            |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||
Sbjct  181  GATGAAATAATCTTTCTCATAGTATCGCCAAAATAATAAAGTAAATTTACAAATTACCAT  240

Query  241  AGCTTATATAATAAAGTTTTGCATGAACAAAAATGTTGTGGTGATATATCATGGACGAAT  300
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  241  AGCTTATATAATAAAGTTTTGCATGAACAAAAATGTTGTGGTGATATATCATGGACGAAT  300

Query  301  TTGAAATGATAAAGAGAAACACATCTGAAATTATCAGCGAGGAAGAGTTAAGAGAGGTTT  360
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  301  TTGAAATGATAAAGAGAAACACATCTGAAATTATCAGCGAGGAAGAGTTAAGAGAGGTTT  360

Query  361  TaaaaaaaGATGAAAAATCTGCTTACATAGGTTTTGAACCAAGTGGTAAAATACATTTAG  420
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  361  TAAAAAAAGATGAAAAATCTGCTTACATAGGTTTTGAACCAAGTGGTAAAATACATTTAG  420

Query  421  GGCATTATCTCCAAATAAAAAAGATGATTGATTTACAAAATGCTGGATTTGATATAATTA  480
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  421  GGCATTATCTCCAAATAAAAAAGATGATTGATTTACAAAATGCTGGATTTGATATAATTA  480

Query  481  TATTGTTGGCTGATTTACACGCCTATTTAAACCAGAAAGGAGAGTTGGATGAGATTAGAA  540
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  481  TATTGTTGGCTGATTTACACGCCTATTTAAACCAGAAAGGAGAGTTGGATGAGATTAGAA  540

Query  541  AAATAGGAGATTATAACAAAAAAGTTTTTGAAGCAATGGGGTTAAAGGCAAAATATGTTT  600
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  541  AAATAGGAGATTATAACAAAAAAGTTTTTGAAGCAATGGGGTTAAAGGCAAAATATGTTT  600

Query  601  ATGGAAGTGAATTCCAGCTTGATAAGGATTATACACTGAATGTCTATAGATTGGCTTTAA  660
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  601  ATGGAAGTGAATTCCAGCTTGATAAGGATTATACACTGAATGTCTATAGATTGGCTTTAA  660

Query  661  AAACTACCTTAAAAAGAGCAAGAAGGAGTATGGAACTTATAGCAAGAGAGGATGAAAATC  720
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  661  AAACTACCTTAAAAAGAGCAAGAAGGAGTATGGAACTTATAGCAAGAGAGGATGAAAATC  720

Query  721  CAAAGGTTGCTGAAGTTATCTATCCAATAATGCAGGTTAATGATATTCATTATTTAGGCG  780
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  721  CAAAGGTTGCTGAAGTTATCTATCCAATAATGCAGGTTAATGATATTCATTATTTAGGCG  780

Query  781  TTGATGTTGCAGTTGGAGGGATGGAGCAGAGAAAAATACACATGTTAGCAAGGGAGCTTT  840
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  781  TTGATGTTGCAGTTGGAGGGATGGAGCAGAGAAAAATACACATGTTAGCAAGGGAGCTTT  840

Query  841  TACCAAAAAAGGTTGTTTGTATTCACAACCCTGTCTTAACGGGTTTGGATGGAGAAGGAA  900
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  841  TACCAAAAAAGGTTGTTTGTATTCACAACCCTGTCTTAACGGGTTTGGATGGAGAAGGAA  900

Query  901  AGATGAGTTCTTCAAAAGGGAATTTTATAGCTGTTGATGACTCTCCAGAAGAGATTAGGG  960
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  901  AGATGAGTTCTTCAAAAGGGAATTTTATAGCTGTTGATGACTCTCCAGAAGAGATTAGGG  960

Query  961  CTAAGATAAAGAAAGCATACTGCCCAGCTGGAGTTGTTGA  1000
            |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||
Sbjct  961  CTAAGATAAAGAAAGCATAC-GCCCAGCTGGAGTTGTTGA  999

Query=  ERCC-00092_genbank |92111303|gb|DQ459425.1| Synthetic construct
microarray control MC20 mRNA, complete sequence
Length=1131

Subject=  ERCC-00092
Length=1124

Score = 2023 bits (1095),  Expect = 0.0
Identities = 1117/1126 (99%), Gaps = 7/1126 (0%)
Strand=Plus/Plus

Query  4     AGATGTATATATGATGTCCTTGGACGGGGTGGCGCAGTCTTACTGCAAGAGAGCGGACAG  63
             |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||
Sbjct  1     AGATGTATATATGATGTCCTTGGACGGGGTGGCGCAGTATTACTGCAAGAGAGCGGACAG  60

Query  64    ATTAGTGTGTTGG-GCCGACACATCAAAGGTTCGTCCGGGGACCGATCTGCAGCCTACGG  122
             ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  61    ATTAGTGTGTTGGAGCCGACACATCAAAGGTTCGTCCGGGGACCGATCTGCAGCCTACGG  120

Query  123   GACATTTATCCGTAAAAGCATGGCGCTGTTTCGTACTTATCGGAGGCCAGGTATCGTCGC  182
             ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  121   GACATTTATCCGTAAAAGCATGGCGCTGTTTCGTACTTATCGGAGGCCAGGTATCGTCGC  180

Query  183   GGCGAGTCTCCCCGACGACGGAGATGGGCGTTACTATCTGGGCCGTCTCGTACTCTGTTA  242
             ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  181   GGCGAGTCTCCCCGACGACGGAGATGGGCGTTACTATCTGGGCCGTCTCGTACTCTGTTA  240

Query  243   CTTGGCACAGATGCGAGCCCTCGTAATGTGCATCAGCTAAGGGCGATATTATAATGCGAC  302
             ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  241   CTTGGCACAGATGCGAGCCCTCGTAATGTGCATCAGCTAAGGGCGATATTATAATGCGAC  300

Query  303   GTTTGTACGGACTCGTTACTAACGTGTTGGACGCTAGTGGAATATGTGTCGTTGGTTAGC  362
             ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  301   GTTTGTACGGATTCGTTACTAACGTGTTGGACGCTAGTGGAATATGTGTCGTTGGTTAGC  360

Query  363   CTACCCATGGCTTTCGCGGCGAC-CATGCTTAGACTCTTTCAAAACTTCGGTGAAGTTCA  421
             ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  361   CTACCCATGGCTTTCGCGGCGACACATGCTTAGACTCTTTCAAAACTTCGGTGAAGTTCA  420

Query  422   CTCAAGCCGCGGAGCGCCGTCGTAATTCACTAGGGATGGCGG-ACCCG-GCCCGTCCGAT  479
             |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||
Sbjct  421   CTCAAGCCGCGGAGCGCCGTCGTAATTCACTAGGGATGGCGGTACCCGTGCCCGTCCGAT  480

Query  480   TCGTAGCAACCTGCATCACGATTTTGTCTTCGGGCGACTTATCAGATACGGTAATGTAAA  539
             ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  481   TCGTAGCAACCTGCATCACGATTTTGTCTTCGGGCGACTTATCAGATACGGTAATGTAAA  540

Query  540   TACCTGGCATTTGGGCACTTCTGTGC-TTTAAGCGGGAAAGATCGCGAGGGCCCGCTATT  598
             |||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  541   TACCTGGCATTTGGGCACTTCT-TGCGTTTAAGCGGGAAAGATCGCGAGGGCCCGCTATT  599

Query  599   TGCGATACTTCCCATGTCGGTGCCGTCGCCTCTATGTACTCGGAGACGTTAATGCAGAGG  658
             ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  600   TGCGATACTTCCCATGTCGGTGCCGTCGCCTCTATGTACTCGGAGACGTTAATGCAGAGG  659

Query  659   CTAAGGACAATTTACCATGACTCGGTAATCCGTTCGTCAAGCAGGTAGCTCGAGTCTCCC  718
             ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  660   CTAAGGACAATTTACCATGACTCGGTAATCCGTTCGTCAAGCAGGTAGCTCGAGTCTCCC  719

Query  719   CACGGACACGTAGTGGGTTTGTAACGATCGATACCGAGTCTTTTTGTCTAGTAGAACCAA  778
             ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  720   CACGGACACGTAGTGGGTTTGTAACGATCGATACCGAGTCTTTTTGTCTAGTAGAACCAA  779

Query  779   CCAACGCATTAAGGAGTTCACTAGCACATCTTTGCGACCCGATCGTCCGTGTGTCGCGTA  838
             ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  780   CCAAC-CATTAAGGAGTTCACTAGCACATCTTTGCGACCCGATCGTCCGTGTGTCGCGTA  838

Query  839   ATACTTTTGTTATGACGAGACATACGCTCAAGCCCTGGGTAGCTAGTCGCGGAGGCACGT  898
             ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  839   ATACTTTTGTTATGACGAGACATACGCTCAAGCCCTGGGTAGCTAGTCGCGGAGGCACGT  898

Query  899   TACCGCGCACAACCCCTATTCGTTTACATGTACATCGCATCTGAGGTAGTACACTTCCGG  958
             ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  899   TACCGCGCACAACCCCTATTCGTTTACATGTACATCGCATCTGAGGTAGTACACTTCCGG  958

Query  959   CGTACGTGAGTATTTGCGCGTAATAAGCGCGTGTTTAGCTGATCCCCTCTCGTATCGAGG  1018
             ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  959   CGTACGTGAGTATTTGCGCGTAATAAGCGCGTGTTTAGCTGATCCCCTCTCGTATCGAGG  1018

Query  1019  TTAAGGCAGATTAGTGCCCAGTAATTGCGtttttttGTCGTTGTCGCAGAACGCGATTTG  1078
             ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  1019  TTAAGGCAGATTAGTGCCCAGTAATTGCGTTTTTTTGTCGTTGTCGCAGAACGCGATTTG  1078

Query  1079  CTCCGAAAGCTTTAAGCCGTGGaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaa  1124
             ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  1079  CTCCGAAAGCTTTAAGCCGTGGAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAA  1124

Query=  ERCC-00095_genbank |103488706|gb|DQ516759.1| Methanocaldococcus
jannaschii spike-in control MJ-500-42 genomic sequence
Length=500

Subject=  ERCC-00095
Length=521

Score =  911 bits (493),  Expect = 0.0
Identities = 498/500 (99%), Gaps = 1/500 (0%)
Strand=Plus/Plus

Query  1    TTGATGATGATACTTAACCAAACCTACCACTAATGTAGTCATCTGTCTCCTTCTTCTGTG  60
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  1    TTGATGATGATACTTAACCAAACCTACCACTAATGTAGTCATCTGTCTCCTTCTTCTGTG  60

Query  61   GATTTAGGAATATCTGCTCTGTCTCTCCAAACTCAATTAATTTCCCCATTAAGAAAAAGG  120
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  61   GATTTAGGAATATCTGCTCTGTCTCTCCAAACTCAATTAATTTCCCCATTAAGAAAAAGG  120

Query  121  CAGTGTAATCAGAAACCCTACTTGCCTGCTGCATGTTGTGGGTAACAACAACAATCGTAT  180
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  121  CAGTGTAATCAGAAACCCTACTTGCCTGCTGCATGTTGTGGGTAACAACAACAATCGTAT  180

Query  181  AATCTTTAGCTAACTCAACCATTAACTCCTCTATCTTTAATGTGGAGATAGGGTCTAAGG  240
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  181  AATCTTTAGCTAACTCAACCATTAACTCCTCTATCTTTAATGTGGAGATAGGGTCTAAGG  240

Query  241  CAGATGTTGGTTCATCCATCAATAAAACCTCTGGCTTAACTGCTATCGCTCTCGCTATAC  300
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  241  CAGATGTTGGTTCATCCATCAATAAAACCTCTGGCTTAACTGCTATCGCTCTCGCTATAC  300

Query  301  ATAACCTCTGCTGTTGTCCTCCAGAGAGAGATAAAGCGTTTTTATGCAGTTCATCTTTAA  360
            ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  301  ATAACCTCTGCTGTTGTCCTCCAGAGAGAGATAGAGCGTTTTTATGCAGTTCATCTTTAA  360

Query  361  CCTCATCCCACAAAGCCGCTTTCTTTAAAGCCCACTCAACAATCTTATCCAATTCTTTTT  420
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  361  CCTCATCCCACAAAGCCGCTTTCTTTAAAGCCCACTCAACAATCTTATCCAATTCTTTTT  420

Query  421  TATCCTTAATTCCATGAATTCTTGGGCCAAATGCAACATTATCATAGATGCTCATAGCAA  480
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  421  TATCCTTAATTCCATGAATTCTTGGGCCAAATGCAACATTATCATAGATGCTCATAGCAA  480

Query  481  AAGGATTTGGCTTTTGAAAT  500
            |||||||||| |||||||||
Sbjct  481  AAGGATTTGG-TTTTGAAAT  499

Query=  ERCC-00096_genbank |92111307|gb|DQ459429.1| Synthetic construct
microarray control MC27 mRNA, complete sequence
Length=1119

Subject=  ERCC-00096
Length=1107

Score = 2036 bits (1102),  Expect = 0.0
Identities = 1107/1109 (99%), Gaps = 2/1109 (0%)
Strand=Plus/Plus

Query  4     AGATAAAACGAATAGCTCGTAACCAAACATGCACAGCGGTCAAACAGTATGTCCCAAGGG  63
             ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  1     AGATAAAACGAATAGCTCGTAACCAAACATGCACAGCGGTCAAACAGTATGTCCCAAGGG  60

Query  64    GACTTAAGCGCGGTGGCCTCCCCTATCCCCTACGAGGCTACCCGGATCGATGACGCGCAA  123
             ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||
Sbjct  61    GACTTAAGCGCGGTGGCCTCCCCTATCCCCTACGAGGCTACCCGGATCGATGACGCG-AA  119

Query  124   TTGGGGACATTCAAATGAGCATCCTAGTCACCGCGTTTAAAATGAACCTGCCGGCTGATC  183
             ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  120   TTGGGGACATTCAAATGAGCATCCTAGTCACCGCGTTTAAAATGAACCTGCCGGCTGATC  179

Query  184   GTTTTTAGGATATTGTGAGTAATATAGATTGGCGCTAGTAGATCACAGAACAACCGCCGC  243
             ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  180   GTTTTTAGGATATTGTGAGTAATATAGATTGGCGCTAGTAGATCACAGAACAACCGCCGC  239

Query  244   ATACGGCCGATTGTCGCAGCCCGGGTCGATTATAACAACGGTGCAATCTCAGCTAAACCG  303
             ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  240   ATACGGCCGATTGTCGCAGCCCGGGTCGATTATAACAACGGTGCAATCTCAGCTAAACCG  299

Query  304   ACGCAGTTTTGCTCCTTGGATTCTGAGCCCGGGCATCGCCCCTCGTTTATGAACTAGCCT  363
             ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  300   ACGCAGTTTTGCTCCTTGGATTCTGAGCCCGGGCATCGCCCCTCGTTTATGAACTAGCCT  359

Query  364   ATCGCAGACGGTATCAACAGGAACATCCTCGTGTTAGATATTGAGGCTGCTTCGTGTCGG  423
             ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  360   ATCGCAGACGGTATCAACAGGAACATCCTCGTGTTAGATATTGAGGCTGCTTCGTGTCGG  419

Query  424   CACGAAGTGTCTTCCGATGCAGTGTCCAGTCATGACCTCGATCCATCGCGTATAGGGACG  483
             ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  420   CACGAAGTGTCTTCCGATGCAGTGTCCAGTCATGACCTCGATCCATCGCGTATAGGGACG  479

Query  484   CCCCCTGCTCGCGTTACTGCCAAGCGAGCGTGGTGTGGTGCCCCCGACCTACAACTTGCG  543
             ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  480   CCCCCTGCTCGCGTTACTGCCAAGCGAGCGTGGTGTGGTGCCCCCGACCTACAACTTGCG  539

Query  544   CCAATTATCCGAGCTGGTAGACGACCAGCGCTGACGAGCTGGCGCAATGATGACCTAATT  603
             |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  540   CCAATTAT-CGAGCTGGTAGACGACCAGCGCTGACGAGCTGGCGCAATGATGACCTAATT  598

Query  604   GGCGCACAGTACTAGGCATCGTCATCCAATGCGACGAGTCCTACACTATCTTGGATATGA  663
             ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  599   GGCGCACAGTACTAGGCATCGTCATCCAATGCGACGAGTCCTACACTATCTTGGATATGA  658

Query  664   TATGGCGCACTACACATGCTAGCCGCTGGGGAGATTAGCTCGAGTTGCCCCTTTGCCCGA  723
             ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  659   TATGGCGCACTACACATGCTAGCCGCTGGGGAGATTAGCTCGAGTTGCCCCTTTGCCCGA  718

Query  724   TCCCGGAAGATACGCTCTAAGCTCGGCAATCGCTCTTGCCGTGCGAGATGCTAGCAAAAA  783
             ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  719   TCCCGGAAGATACGCTCTAAGCTCGGCAATCGCTCTTGCCGTGCGAGATGCTAGCAAAAA  778

Query  784   GGTGTACTTCTCAGCGGAGCAGAAAGATCATGTTTATTGGAAGCATCAACCTGTGCCGTC  843
             ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  779   GGTGTACTTCTCAGCGGAGCAGAAAGATCATGTTTATTGGAAGCATCAACCTGTGCCGTC  838

Query  844   TTGTTAACTTGTCATATCGCGCACGTAGTAGCCTAGAGCGCCAGGGGCGGAAATTCGCCT  903
             ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  839   TTGTTAACTTGTCATATCGCGCACGTAGTAGCCTAGAGCGCCAGGGGCGGAAATTCGCCT  898

Query  904   GAAAAGTTTTGCCGGCGCACAAGCACGATCGGCTCCTAATAGGAGGTGAATTAGATAGGG  963
             ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  899   GAAAAGTTTTGCCGGCGCACAAGCACGATCGGCTCCTAATAGGAGGTGAATTAGATAGGG  958

Query  964   AAAAGATCGGGATGCTACTAGTTTACTGCGTCACGCTGAGGGACTCATCCTGGGCTACAA  1023
             ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  959   AAAAGATCGGGATGCTACTAGTTTACTGCGTCACGCTGAGGGACTCATCCTGGGCTACAA  1018

Query  1024  TCCTATTGCCGAGATAGTATTTCTTAGCTTCCTGAGGGAGGTCAATTTGAATGTGGTTAT  1083
             ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  1019  TCCTATTGCCGAGATAGTATTTCTTAGCTTCCTGAGGGAGGTCAATTTGAATGTGGTTAT  1078

Query  1084  ATGCGaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaa  1112
             |||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  1079  ATGCGAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAA  1107

Query=  ERCC-00097_genbank |103488705|gb|DQ516758.1| Methanocaldococcus
jannaschii spike-in control MJ-500-41 genomic sequence
Length=500

Subject=  ERCC-00097
Length=523

Score =  911 bits (493),  Expect = 0.0
Identities = 498/500 (99%), Gaps = 1/500 (0%)
Strand=Plus/Plus

Query  1    CCTTCATAATACCACCAAAATACCAATTCGAAAGTTTTAGCATATTCAAACAATATAAAA  60
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  1    CCTTCATAATACCACCAAAATACCAATTCGAAAGTTTTAGCATATTCAAACAATATAAAA  60

Query  61   TCTTCAGATTGGACATTAATTGGGACTGAAAGTCCCAACTTAATGGACGTGTGGTATCCA  120
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  61   TCTTCAGATTGGACATTAATTGGGACTGAAAGTCCCAACTTAATGGACGTGTGGTATCCA  120

Query  121  CACCATAAAGGGGCTACGCCCCTCTTGGGATACTCCCCTAATATTGCTAATTTACACCTC  180
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  121  CACCATAAAGGGGCTACGCCCCTCTTGGGATACTCCCCTAATATTGCTAATTTACACCTC  180

Query  181  CGAGCATAAGCGAGGAGGTGTTAGGTTTTGATGAACCTTTTACTAAAAGGTTCATACCAA  240
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  181  CGAGCATAAGCGAGGAGGTGTTAGGTTTTGATGAACCTTTTACTAAAAGGTTCATACCAA  240

Query  241  TAGGAGGTTTCCTCCTATGGTAGTTAAATGTACATTGGATATTCCTTTCTACTCTTTGAC  300
            |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  241  TAGGAGGTTTCCCCCTATGGTAGTTAAATGTACATTGGATATTCCTTTCTACTCTTTGAC  300

Query  301  ATCATCTTTAAATGTTGCTCTGCCAGTTCTTTAAGTTTGTTTTCAATAGCTTCAGCCTCT  360
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  301  ATCATCTTTAAATGTTGCTCTGCCAGTTCTTTAAGTTTGTTTTCAATAGCTTCAGCCTCT  360

Query  361  TTGATGAGATTTTCAATATTTACATTTAGATTGAACATTTTATTCAAAACCTCTAATAGA  420
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  361  TTGATGAGATTTTCAATATTTACATTTAGATTGAACATTTTATTCAAAACCTCTAATAGA  420

Query  421  TTAGcccccccTCTTGGGTCTGGTCTAATTCCAACAGTTTCAGCCAACAAACCAATAGCA  480
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  421  TTAGCCCCCCCTCTTGGGTCTGGTCTAATTCCAACAGTTTCAGCCAACAAACCAATAGCA  480

Query  481  TCAAACCCATTGTCATGGCA  500
            |||||||||| |||||||||
Sbjct  481  TCAAACCCAT-GTCATGGCA  499

Query=  ERCC-00098_genbank |92111293|gb|DQ459415.1| Synthetic construct
microarray control MC04 mRNA, complete sequence
Length=1146

Subject=  ERCC-00098
Length=1143

Score = 2065 bits (1118),  Expect = 0.0
Identities = 1137/1145 (99%), Gaps = 6/1145 (0%)
Strand=Plus/Plus

Query  1     GGAGAGTCGCAATTACATCGGTTCCTGTCCCGTAGAGGCTGGAAGGGGCATAAGAAGCAG  60
             |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  1     GGAG-GTCGCAATTACATCGGTTCCTGTCCCGTAGAGGCTGGAAGGGGCATAAGAAGCAG  59

Query  61    TGATACCAACGCTCTCCCCCGCGCGTCTCGTGAGAGCAGACCATGAACATCGCAGAGGAG  120
             ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  60    TGATACCAACGCTCTCCCCCGCGCGTCTCGTGAGAGCAGACCATGAACATCGCAGAGGAG  119

Query  121   AATCCTGCATGACTGAATGCGCAGAGCAACTGTCACCACGTGGTTAATGAGAAGGCAGAA  180
             ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  120   AATCCTGCATGACTGAATGCGCAGAGCAACTGTCACCACGTGGTTAATGAGAAGGCAGAA  179

Query  181   CTCAACAGACAGCTCTGGATCTGCTGCATCCCAGGGCAAGAATCAGGAAAGCAGATGCAG  240
             ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  180   CTCAACAGACAGCTCTGGATCTGCTGCATCCCAGGGCAAGAATCAGGAAAGCAGATGCAG  239

Query  241   TAACCATAGGCACGTGAAAATGCTCCCGGCCACACTTTGGAGCTATTACCATGGTCGGGC  300
             ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  240   TAACCATAGGCACGTGAAAATGCTCCCGGCCACACTTTGGAGCTATTACCATGGTCGGGC  299

Query  301   CCAAACATAAGTGGACAGCTAGAACGATTTCTCAAGCCTGGCAACGTGGGTTAGAACTCC  360
             ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  300   CCAAACATAAGTGGACAGCTAGAACGATTTCTCAAGCCTGGCAACGTGGGTTAGAACTCC  359

Query  361   AACCCCTCGCACGTAGTATGGCGCTGGAGTAAAGAGCGCTCTGTTAGCAAGCGACCAGTC  420
             ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  360   AACCCCTCGCACGTAGTATGGCGCTGGAGTAAAGAGCGCTCTGTTAGCAAGCGACCAGTC  419

Query  421   TCCCGAAAGTACAGGATGTGCATGTTCTAACCAAAGGGTCGCAGGGACGATGATT-CTAG  479
             ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||
Sbjct  420   TCCCGAAAGTACAGGATGTGCATGTTCTAACCAAAGGGTCGCAGGGACGATGATTGCTAG  479

Query  480   TAGCTTGACAAGGCTATCCTAGTCATCCTGAATCCGGCCTATCAAAGGAATGCGTGGCAG  539
             ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  480   TAGCTTGACAAGGCTATCCTAGTCATCCTGAATCCGGCCTATCAAAGGAATGCGTGGCAG  539

Query  540   GTCAAGTGACGAGAGTGGAAGAGCTTCCCGTTGACAAGCGGCAAGTAGACTGTGCCTACC  599
             ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  540   GTCAAGTGACGAGAGTGGAAGAGCTTCCCGTTGACAAGCGGCAAGTAGACTGTGCCTACC  599

Query  600   CGGGCTTTCCAGACCTAAGATATCTGCACTCAGCAGAGTGTTGTGTTCGGGGCAGCAGTG  659
             |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  600   CGGGCTTTCCAGACCTAAGATATCTGCATTCAGCAGAGTGTTGTGTTCGGGGCAGCAGTG  659

Query  660   TGCCTTCATTCGTCAACTGGAGCCTAAGGCCCCAAACTCGATCATTGATGACTACTCGAC  719
             ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  660   TGCCTTCATTCGTCAACTGGAGCCTAAGGCCCCAAACTCGATCATTGATGACTACTCGAC  719

Query  720   AAAAGAGGGTGGTATACAGAAAGAGGCTTGTGTCGCCGGAAACGCTTATCCGCACAGTAA  779
             ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  720   AAAAGAGGGTGGTATACAGAAAGAGGCTTGTGTCGCCGGAAACGCTTATCCGCACAGTAA  779

Query  780   AACCTCCCCAGATGACCTTCTCCCTCATAATCACTTAATCTG-GC--AGGAGGCAGGCTG  836
             |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||  |||||||||||||
Sbjct  780   AACCTCCCCAGATGACCTTCTCCCTCATAATCACTTAATCTGAGCGCAGGAGGCAGGCTG  839

Query  837   TATTAATTCCGGCCTCCAACCGGACCGTGGAACGACGCGACCAAGTGGTCGACGGGACAT  896
             ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  840   TATTAATTCCGGCCTCCAACCGGACCGTGGAACGACGCGACCAAGTGGTCGACGGGACAT  899

Query  897   GCCCCAGTATTTGGCCGTTCTGCCGATTCTCAGCTAGCAAACCAAGATCGTACTACGTAC  956
             |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  900   GCCC-AGTATTTGGCCGTTCTGCCGATTCTCAGCTAGCAAACCAAGATCGTACTACGTAC  958

Query  957   GCGCCTGGATAGATCGACGGCTGTTTAATAAGAGTCACTCCAGGCCTGTGCTAGGATCAG  1016
             ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  959   GCGCCTGGATAGATCGACGGCTGTTTAATAAGAGTCACTCCAGGCCTGTGCTAGGATCAG  1018

Query  1017  GGCGACCATGCCAAATATCAACTCAAGGACAAGTTGACGCCTGCCTTCTGGGGTATGGAT  1076
             ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  1019  GGCGACCATGCCAAATATCAACTCAAGGACAAGTTGACGCCTGCCTTCTGGGGTATGGAT  1078

Query  1077  CAAAAGCCCACGTTACCATGTAAGACCGTGTGGATCTTCGaaaaaaaaaaaaaaaaaaaa  1136
             ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||
Sbjct  1079  CAAAAGCCCACGTTACCATGTAAGACCGTGTGGATTTTCGAAAAAAAAAAAAAAAAAAAA  1138

Query  1137  aaaaa  1141
             |||||
Sbjct  1139  AAAAA  1143

Query=  ERCC-00099_genbank |112819962|gb|DQ875387.1| Synthetic construct
microarray control PHE gene, complete sequence
Length=1330

Subject=  ERCC-00099
Length=1350

Score = 2444 bits (1323),  Expect = 0.0
Identities = 1328/1330 (99%), Gaps = 2/1330 (0%)
Strand=Plus/Minus

Query  1     GGGGATGCAAATGAAAGAGGAGACATTTTATCTTGTCCGTGAAGATGTATTGCCCGATGC  60
             ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  1350  GGGGATGCAAATGAAAGAGGAGACATTTTATCTTGTCCGTGAAGATGTATTGCCCGATGC  1291

Query  61    AATGAGAAAAACATTAGAAGTCAAAAAGCTGCTTGATCGaaaaaaaGCAGATTCAGTAGC  120
             ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  1290  AATGAGAAAAACATTAGAAGTCAAAAAGCTGCTTGATCGAAAAAAAGCAGATTCAGTAGC  1231

Query  121   AGATGCCGTTCAAAAGGTCGATTTAAGTAGAAGTGCGTTTTATAAATACAGGGATGCTGT  180
             ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  1230  AGATGCCGTTCAAAAGGTCGATTTAAGTAGAAGTGCGTTTTATAAATACAGGGATGCTGT  1171

Query  181   TTTTCCATTCTACACCATGGTAAAAGAACAAATTATCACACTTTTCTTTCATTTGGAGGA  240
             ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  1170  TTTTCCATTCTACACCATGGTAAAAGAACAAATTATCACACTTTTCTTTCATTTGGAGGA  1111

Query  241   TAGGTCAGGTGCGTTATCTCAGCTTCTTCAGGCGGTAGCTGATTCTGGAAGCAACGTTCT  300
             ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  1110  TAGGTCAGGTGCGTTATCTCAGCTTCTTCAGGCGGTAGCTGATTCTGGAAGCAACGTTCT  1051

Query  301   TTCCATTCACCAGACCATTCCGCTTCAAGGCAGAGCAAATGTGACACTGTCTATCAGTAC  360
             ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  1050  TTCCATTCACCAGACCATTCCGCTTCAAGGCAGAGCAAATGTGACACTGTCTATCAGTAC  991

Query  361   GTCGGCAATGGAAGAAGACATTCATACATTAATGAATAAGCTCAGGAAGTTTGATTTTGT  420
             |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  990   GTCGGC-ATGGAAGAAGACATTCATACATTAATGAATAAGCTCAGGAAGTTTGATTTTGT  932

Query  421   AGAAAAGGTTGAAATATTAGGTTCAGGTGCATAAGGGAGAGAAAATCGTCATGAAAGTCG  480
             ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  931   AGAAAAGGTTGAAATATTAGGTTCAGGTGCATAAGGGAGAGAAAATCGTCATGAAAGTCG  872

Query  481   GTTATTTAGGTCCAGCAGCTACATTTACACATCTAGCAGTCAGTTCTTGTTTTCAAAACG  540
             ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  871   GTTATTTAGGTCCAGCAGCTACATTTACACATCTAGCAGTCAGTTCTTGTTTTCAAAACG  812

Query  541   GCGCCGAACATGTTGCTTACCGCACCATTCCGGAGTGTATAGATGCAGCCGTTGCAGGCG  600
             ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  811   GCGCCGAACATGTTGCTTACCGCACCATTCCGGAGTGTATAGATGCAGCCGTTGCAGGCG  752

Query  601   AAGTTGATTTTGCTTTTGTTCCTTTGGAAAATGCTTTAGAAGGATCTGTTAATCTAACAA  660
             ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  751   AAGTTGATTTTGCTTTTGTTCCTTTGGAAAATGCTTTAGAAGGATCTGTTAATCTAACAA  692

Query  661   TAGACTATTTAATACATGAACAGCCTTTGCCAATCGTGGGTGAAATGACGTTGCCGATTC  720
             ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  691   TAGACTATTTAATACATGAACAGCCTTTGCCAATCGTGGGTGAAATGACGTTGCCGATTC  632

Query  721   ACCAGCACTTGCTCGTCCATCCCTCAAGAGAGAATGCATGGAAAGAGCTCGACAAAATTT  780
             ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  631   ACCAGCACTTGCTCGTCCATCCCTCAAGAGAGAATGCATGGAAAGAGCTCGACAAAATTT  572

Query  781   ACTCACATTCACACGCGATTGCGCAATGCCATAAATTTCTTCATCGACACTTTCCTTCCG  840
             ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  571   ACTCACATTCACACGCGATTGCGCAATGCCATAAATTTCTTCATCGACACTTTCCTTCCG  512

Query  841   TTCCATATGAATACGCCAATTCTACCGGGGCGGCAGCAAAGTTTGTCAGTGACCATCCCG  900
             ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  511   TTCCATATGAATACGCCAATTCTACCGGGGCGGCAGCAAAGTTTGTCAGTGACCATCCCG  452

Query  901   AGCTGAATATCGGGGTCATTGCCAATGATATGGCAGCTTCTACATACGAATTAAAAATCG  960
             ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  451   AGCTGAATATCGGGGTCATTGCCAATGATATGGCAGCTTCTACATACGAATTAAAAATCG  392

Query  961   TGAAACGGGATATACAGGATTATAGGGACAATCATACAAGATTTGTTATCCTGTCTCCCG  1020
             ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  391   TGAAACGGGATATACAGGATTATAGGGACAATCATACAAGATTTGTTATCCTGTCTCCCG  332

Query  1021  ATGAAAACATATCTTTTGAAGTGAATTCAAAATTGAGCTCTAGGCCCAAAACGACCTTAA  1080
             ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  331   ATGAAAACATATCTTTTGAAGTGAATTCAAAATTGAGCTCTAGGCCCAAAACGACCTTAA  272

Query  1081  TGGTCATGCTGCCGCAGGATGATCAGTCCGGGGCGCTGCATAGAGTGCTGTCTGCATTTT  1140
             ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  271   TGGTCATGCTGCCGCAGGATGATCAGTCCGGGGCGCTGCATAGAGTGCTGTCTGCATTTT  212

Query  1141  CTTGGAGAAATTTAAACCTGTCAAAAATTGAGTCACGTCCGACTAAAACCGGATTAGGCC  1200
             ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  211   CTTGGAGAAATTTAAACCTGTCAAAAATTGAGTCACGTCCGACTAAAACCGGATTAGGCC  152

Query  1201  ATTATTTCTTTATTATTGATATTGAGAAAGCGTTTGATGATGTATTGATTCCAGGGGCCA  1260
             ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  151   ATTATTTCTTTATTATTGATATTGAGAAAGCGTTTGATGATGTATTGATTCCAGGGGCCA  92

Query  1261  TGCAGGAGCTTGAAGCACTCGGCTGCAAAGTGAGGCTTCTGGGTGCATACCAGTCTTACC  1320
             |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||
Sbjct  91    TGCAGGAGCTTGAAGCACTCGGCTGCAAAGTGAGGCTTCTGGGTGCATAC-AGTCTTACC  33

Query  1321  AATTATAAAA  1330
             ||||||||||
Sbjct  32    AATTATAAAA  23

Query=  ERCC-00104_genbank |103488762|gb|DQ516815.1| Methanocaldococcus
jannaschii spike-in control MJ-2000-98 genomic sequence
Length=2000

Subject=  ERCC-00104
Length=2022

Score = 3677 bits (1991),  Expect = 0.0
Identities = 1997/2000 (99%), Gaps = 0/2000 (0%)
Strand=Plus/Plus

Query  1     TGCAATCTCTTCAACAGCCTCTGCTAAGTATTCTGCAGCTGCTCTGCTAACTCTCTCAGC  60
             ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  1     TGCAATCTCTTCAACAGCCTCTGCTAAGTATTCTGCAGCTGCTCTGCTAACTCTCTCAGC  60

Query  61    ACCAGCCTTTTTCAATATTCTCTCAAATGGTGCAACTGGAAGCTCAGCCATAATACCACC  120
             ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  61    ACCAGCCTTTTTCAATATTCTCTCAAATGGTGCAACTGGAAGCTCAGCCATAATACCACC  120

Query  121   TCACAATAGATTTCCAATAAATACTGTTATAAAATCCTTTATTTAAACTTTTCGGTCATT  180
             ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  121   TCACAATAGATTTCCAATAAATACTGTTATAAAATCCTTTATTTAAACTTTTCGGTCATT  180

Query  181   TTCATTTTTTGTGAAAGTCTTTGGAAAATTTTCCCACACATAAAGAAGGTATTAAAAAGT  240
             ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  181   TTCATTTTTTGTGAAAGTCTTTGGAAAATTTTCCCACACATAAAGAAGGTATTAAAAAGT  240

Query  241   GTGACACTAAAATTATAAAAAACACTATTTATAATGTATGTCACAAATTTAAAATATAAT  300
             ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  241   GTGACACTAAAATTATAAAAAACACTATTTATAATGTATGTCACAAATTTAAAATATAAT  300

Query  301   TTTATGAAAGATAGATAAACATAAATTAATAGAGTTTAATTGTGATATTTATGATAATTA  360
             |||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  301   TTTATGAAAGATAGATAAACATAAATTGGTAGAGTTTAATTGTGATATTTATGATAATTA  360

Query  361   CTATAGCTTCGGGTAAAGGAGGGGTTGGAAAAACTACAACATCAGCATCTTTAGCAGTAG  420
             ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  361   CTATAGCTTCGGGTAAAGGAGGGGTTGGAAAAACTACAACATCAGCATCTTTAGCAGTAG  420

Query  421   CACTTGCTAAATTGGGAAAAAAGGTTTTAGCTATTGATGGAGACATATCAATGGCTAATT  480
             ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  421   CACTTGCTAAATTGGGAAAAAAGGTTTTAGCTATTGATGGAGACATATCAATGGCTAATT  480

Query  481   TAGGGATTCTATTCAATATGGAAAAGAAAAAACCCTCTTTACATGAAGTTTTGAGTGAAG  540
             ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  481   TAGGGATTCTATTCAATATGGAAAAGAAAAAACCCTCTTTACATGAAGTTTTGAGTGAAG  540

Query  541   AGGCAGATGTTAGGGATGCAATTTACAAACATAAAACTGGAGTTTATGTATTGCCAACGA  600
             ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  541   AGGCAGATGTTAGGGATGCAATTTACAAACATAAAACTGGAGTTTATGTATTGCCAACGA  600

Query  601   GTTTGTCTTTAGAAGGTTATAAGAAATCAGATATTGATTTACTTCCAGATGTGGTTAATG  660
             ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  601   GTTTGTCTTTAGAAGGTTATAAGAAATCAGATATTGATTTACTTCCAGATGTGGTTAATG  660

Query  661   AGGTAGCTGATGATTTTGATTATGTAATTATAGATGCTCCAGCTGGGTTAAATAGAGAAA  720
             ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  661   AGGTAGCTGATGATTTTGATTATGTAATTATAGATGCTCCAGCTGGGTTAAATAGAGAAA  720

Query  721   TGGCTACTCATTTAGCTATTGCTGATAAACTTTTACTTGTTGTCACCCCAGAGATGTTCT  780
             ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  721   TGGCTACTCATTTAGCTATTGCTGATAAACTTTTACTTGTTGTCACCCCAGAGATGTTCT  780

Query  781   CAATTATTGACGCTGTTAGATTAAAAGAAAGTGCTGAAATGGCTGGAACACCTTTAATGG  840
             ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  781   CAATTATTGACGCTGTTAGATTAAAAGAAAGTGCTGAAATGGCTGGAACACCTTTAATGG  840

Query  841   GTGTTGTGTTAAATAGGGTTGGTAGAGATTTTGGTGAAATGGGTAGAGATGAGATTGAAA  900
             ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  841   GTGTTGTGTTAAATAGGGTTGGTAGAGATTTTGGTGAAATGGGTAGAGATGAGATTGAAA  900

Query  901   TGTTAATAAAAGGTAAAGTTTTAGTTGAAGTCCCTGAAGATGAAAATGTTAGGTCAGCAG  960
             ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  901   TGTTAATAAAAGGTAAAGTTTTAGTTGAAGTCCCTGAAGATGAAAATGTTAGGTCAGCAG  960

Query  961   CTTTAAAAAAGATGAGTGTTATTGAATATAGAAAGAATTCTCCAGCTTCTCAAGCTTATA  1020
             ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  961   CTTTAAAAAAGATGAGTGTTATTGAATATAGAAAGAATTCTCCAGCTTCTCAAGCTTATA  1020

Query  1021  TGAAGTTAGCTTCAATAATAGCAGGAGTTCCTATTTACATTGAAGATGAAATTAAAATAA  1080
             ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  1021  TGAAGTTAGCTTCAATAATAGCAGGAGTTCCTATTTACATTGAAGATGAAATTAAAATAA  1080

Query  1081  TAAGGAAAGAAAGCTTTATAGATAAAATTAAGAGATTATTTAGGATGTATTAATTATCTT  1140
             ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  1081  TAAGGAAAGAAAGCTTTATAGATAAAATTAAGAGATTATTTAGGATGTATTAATTATCTT  1140

Query  1141  GATTTAAAAATTTTAATTATCATCCTTTTCCAAATAAACCGTATATGTTGGGAACGCCCT  1200
             ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  1141  GATTTAAAAATTTTAATTATCATCCTTTTCCAAATAAACCGTATATGTTGGGAACGCCCT  1200

Query  1201  CTCAATGAACCTTTCAGTAAAAGCTTCACCAAAAATGGATGCATCATCTCGCTTTGCTCG  1260
             ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  1201  CTCAATGAACCTTTCAGTAAAAGCTTCACCAAAAATGGATGCATCATCTCGCTTTGCTCG  1260

Query  1261  ATGATGCCTCTTAGTTATCTTTCTCCAAATAAACAGTATATGTTGGGAATGCCATCTCTA  1320
             ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  1261  ATGATGCCTCTTAGTTATCTTTCTCCAAATAAACAGTATATGTTGGGAATGCCATCTCTA  1320

Query  1321  TCCCTTCTTTTTCAAATTCCTCTTTTATCTTCAAATTTATTTCATCAACGGCATTTAAAT  1380
             ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  1321  TCCCTTCTTTTTCAAATTCCTCTTTTATCTTCAAATTTATTTCATCAACGGCATTTAAAT  1380

Query  1381  AGTAATCAAATCCCATGTTTCTAACAAAGTATTCTACCCTCAAATTTAAACTCCAATCTC  1440
             ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  1381  AGTAATCAAATCCCATGTTTCTAACAAAGTATTCTACCCTCAAATTTAAACTCCAATCTC  1440

Query  1441  CATATTCCCTAAAATGCACTCTATATGGAGGGAGAGTAGCTGGATGATTTTCAACAATCT  1500
             ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  1441  CATATTCCCTAAAATGCACTCTATATGGAGGGAGAGTAGCTGGATGATTTTCAACAATCT  1500

Query  1501  CTTTTATTATCTCCTTAGCCCTCTTAATTTTCTCTACCGGTGTGTTATAAGTTAAACCGA  1560
             ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  1501  CTTTTATTATCTCCTTAGCCCTCTTAATTTTCTCTACCGGTGTGTTATAAGTTAAACCGA  1560

Query  1561  TAGTCATTAAAACCCTTCTTCTATCTCTAACTGTTAAGTTTTCAATGGCTGAATCCAACA  1620
             ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  1561  TAGTCATTAAAACCCTTCTTCTATCTCTAACTGTTAAGTTTTCAATGGCTGAATCCAACA  1620

Query  1621  ATTCTGAGTTTGGGATAGTTATTAAAGTGTAATCAAAAGTTCTAATTCGTGTGCTTCTTA  1680
             ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  1621  ATTCTGAGTTTGGGATAGTTATTAAAGTGTAATCAAAAGTTCTAATTCGTGTGCTTCTTA  1680

Query  1681  TTCCAATCTCCTCTACAATCCCTTCAGCCCCTTTAACTTTAACCCAATGGCCTAAACTAA  1740
             ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  1681  TTCCAATCTCCTCTACAATCCCTTCAGCCCCTTTAACTTTAACCCAATGGCCTAAACTAA  1740

Query  1741  AGGGTTTGTCAATCAATATTAAAATCCCAGCAATGAAGTTTTTTATGGTGTCTTGCATAG  1800
             ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  1741  AGGGTTTGTCAATCAATATTAAAATCCCAGCAATGAAGTTTTTTATGGTGTCTTGCATAG  1800

Query  1801  CCAAAGCTAAAGCTAAACCCCCTACTCCTAAACCAGCCAATAAAGCAGTGATATCATAAC  1860
             ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  1801  CCAAAGCTAAAGCTAAACCCCCTACTCCTAAACCAGCCAATAAAGCAGTGATATCATAAC  1860

Query  1861  CAACAGAGCTTAAAGCCGTTAATATACCAAGAAGTATTGTTAATATCTTTACAACTTTTT  1920
             ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  1861  CAACAGAGCTTAAAGCCGTTAATATACCAAGAAGTATTGTTAATATCTTTACAACTTTTT  1920

Query  1921  TCAATGGCTTTATTATGTGTTCGTCCAACTCTGTTTCTGTCTTTTCGGTTAATGGAATTA  1980
             ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||
Sbjct  1921  TCAATGGCTTTATTATGTGTTCGTCCAACTCTGTTTCTGTCTTTTCGGTCAATGGAATTA  1980

Query  1981  GGTAGTGTTCAAATATCCCA  2000
             ||||||||||||||||||||
Sbjct  1981  GGTAGTGTTCAAATATCCCA  2000

Query=  ERCC-00108_genbank |110339338|gb|DQ668365.1| Synthetic construct
clone TagO microarray control
Length=998

Subject=  ERCC-00108
Length=1022

Score = 1844 bits (998),  Expect = 0.0
Identities = 998/998 (100%), Gaps = 0/998 (0%)
Strand=Plus/Plus

Query  1    CTCTGTGTCATGATCGTGAGTTGTCGCAGTGTCTGTACCAATACTCTGGTGGAGCTATAT  60
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  1    CTCTGTGTCATGATCGTGAGTTGTCGCAGTGTCTGTACCAATACTCTGGTGGAGCTATAT  60

Query  61   AAGCCGCTGTTGCGTAAATCAACGGCATGATCCCTATGACCGCGTCATGCTAACTGATAC  120
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  61   AAGCCGCTGTTGCGTAAATCAACGGCATGATCCCTATGACCGCGTCATGCTAACTGATAC  120

Query  121  ACGCTGCTCGAACAGTGATACGCACACTGATAACTATGCGCAGACGCTTGAAACGATGTG  180
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  121  ACGCTGCTCGAACAGTGATACGCACACTGATAACTATGCGCAGACGCTTGAAACGATGTG  180

Query  181  ACATCGCTTCTAGAGTATGAGCCGCAATGCACGACTGATACTCGATATGAGCAGCAGTCG  240
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  181  ACATCGCTTCTAGAGTATGAGCCGCAATGCACGACTGATACTCGATATGAGCAGCAGTCG  240

Query  241  GCTATGATTTGCAATGCTTGCAGTATGTATCCTGATCGTGCGTGCGATGTCTGATAATAC  300
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  241  GCTATGATTTGCAATGCTTGCAGTATGTATCCTGATCGTGCGTGCGATGTCTGATAATAC  300

Query  301  GCTCGCATGATATGTATTGCGCTCAGATGCTGGAGATATGCCATGCGTGCTGTCAGTATG  360
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  301  GCTCGCATGATATGTATTGCGCTCAGATGCTGGAGATATGCCATGCGTGCTGTCAGTATG  360

Query  361  CCATGTATGCTGATATGTCGCGATCTATGTGGTGACTATGAGATCCATGTGATGACGTTG  420
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  361  CCATGTATGCTGATATGTCGCGATCTATGTGGTGACTATGAGATCCATGTGATGACGTTG  420

Query  421  CAGTCTCTGTGACCTTATCGACGCGCATGTGAGCCTATAGACAGCGATGTGAGCACTCTC  480
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  421  CAGTCTCTGTGACCTTATCGACGCGCATGTGAGCCTATAGACAGCGATGTGAGCACTCTC  480

Query  481  ATCTGCGGATCAGTCTATCCTCGCTGATGCTCAGTGATACACGCTGATGCACGTAGTGAG  540
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  481  ATCTGCGGATCAGTCTATCCTCGCTGATGCTCAGTGATACACGCTGATGCACGTAGTGAG  540

Query  541  CATCCTGTGCTCGCATATACCGCTGCTGCACTGATATGAGCCAGTGCTGCTGCTCTCTAC  600
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  541  CATCCTGTGCTCGCATATACCGCTGCTGCACTGATATGAGCCAGTGCTGCTGCTCTCTAC  600

Query  601  GGAGTGTGCTCGGCTATAACAGCGAGTGCTACGCCTAAACTGGCTGTCTAGCACTGTAGC  660
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  601  GGAGTGTGCTCGGCTATAACAGCGAGTGCTACGCCTAAACTGGCTGTCTAGCACTGTAGC  660

Query  661  TGGTGCATGTACTCGACTGCCGCTGCATCTACTATAAGACTCTGACATTAGCGTATAGGC  720
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  661  TGGTGCATGTACTCGACTGCCGCTGCATCTACTATAAGACTCTGACATTAGCGTATAGGC  720

Query  721  TGATACATTAGCTCGGATGCTATCAGCTTGCGCCTATTATATGCCTGACGCGGGATCTAT  780
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  721  TGATACATTAGCTCGGATGCTATCAGCTTGCGCCTATTATATGCCTGACGCGGGATCTAT  780

Query  781  CAGAACGACTCGGTAGCTCATATACTGGATCACGGTGCCACAACATGCTACACGAGGTCT  840
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  781  CAGAACGACTCGGTAGCTCATATACTGGATCACGGTGCCACAACATGCTACACGAGGTCT  840

Query  841  CAGACTCTATCCCGTGGACTCAACGTGCATCTGCTATGCTGAGCGCGTATCTGTGTACCT  900
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  841  CAGACTCTATCCCGTGGACTCAACGTGCATCTGCTATGCTGAGCGCGTATCTGTGTACCT  900

Query  901  GTCCGATGCTCTGATCTACACTGCCGTGATCGTTATATGACGAGACTGTGCGCTCATAGC  960
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  901  GTCCGATGCTCTGATCTACACTGCCGTGATCGTTATATGACGAGACTGTGCGCTCATAGC  960

Query  961  CGACACTGTGCTCGATAAGACCACGCTGTGCGGATATA  998
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  961  CGACACTGTGCTCGATAAGACCACGCTGTGCGGATATA  998

Query=  ERCC-00109_genbank |110586144|gb|DQ854998.1| Synthetic construct
clone AG009.1100 external RNA control sequence
Length=511

Subject=  ERCC-00109
Length=536

Score =  939 bits (508),  Expect = 0.0
Identities = 511/512 (99%), Gaps = 1/512 (0%)
Strand=Plus/Plus

Query  1    TAGCGGAGTGTCAAATTTCGGAAGGGGGCCATAATGTTTCTTTACAATCGCACCAGTTAG  60
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  1    TAGCGGAGTGTCAAATTTCGGAAGGGGGCCATAATGTTTCTTTACAATCGCACCAGTTAG  60

Query  61   CGTGGCGTATACCATGTTGTTAACAGCGCCATAAGTGCCTGATCCGCGGGCAAAACTACG  120
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  61   CGTGGCGTATACCATGTTGTTAACAGCGCCATAAGTGCCTGATCCGCGGGCAAAACTACG  120

Query  121  CAACACTGTGACTGGGTGCTAGGTCGACGAACAACTGACGCAACTAGATCATGGGAGTGC  180
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  121  CAACACTGTGACTGGGTGCTAGGTCGACGAACAACTGACGCAACTAGATCATGGGAGTGC  180

Query  181  CCCAAGTAAAAATTGTGTGTCAGGGCAACAAGTGACGATAGCGCGCGTAAATGGTATCAT  240
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  181  CCCAAGTAAAAATTGTGTGTCAGGGCAACAAGTGACGATAGCGCGCGTAAATGGTATCAT  240

Query  241  GATTGTGACCTCGGTATCTCTTGTACAGTTTACGTCGACGCGAAGTCTGATCACGTTTAA  300
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  241  GATTGTGACCTCGGTATCTCTTGTACAGTTTACGTCGACGCGAAGTCTGATCACGTTTAA  300

Query  301  CTAGCTCAGGGGTATTAAATAACCGAAAGGTTCATGTGGATGTGTGAACTTGCAGACAGA  360
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  301  CTAGCTCAGGGGTATTAAATAACCGAAAGGTTCATGTGGATGTGTGAACTTGCAGACAGA  360

Query  361  ATGACCCATAGTCCTTTACCCAGGTAGCTGAGGGCGACGCACTTGACCATCCGAATCAAA  420
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  361  ATGACCCATAGTCCTTTACCCAGGTAGCTGAGGGCGACGCACTTGACCATCCGAATCAAA  420

Query  421  CTGAGAGATCGAAATAGCCTCACCCTTGAACCTACAAAGCTCACTTTAGCCCGTTAAGTT  480
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  421  CTGAGAGATCGAAATAGCCTCACCCTTGAACCTACAAAGCTCACTTTAGCCCGTTAAGTT  480

Query  481  GTCGAAATCACTAGATCAGAAGTCTCC-ACTC  511
            ||||||||||||||||||||||||||| ||||
Sbjct  481  GTCGAAATCACTAGATCAGAAGTCTCCCACTC  512

Query=  ERCC-00111_genbank |114977037|gb|DQ883685.2| Synthetic construct
clone NISTag44 external RNA control sequence
Length=1000

Subject=  ERCC-00111
Length=994

Score = 1836 bits (994),  Expect = 0.0
Identities = 994/994 (100%), Gaps = 0/994 (0%)
Strand=Plus/Plus

Query  1    GCCCTAAGTTCCGGTCCGCAATTTCGTTTCGTTGGGACGCTTGAAGCGCAAGTAGAAAAC  60
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  1    GCCCTAAGTTCCGGTCCGCAATTTCGTTTCGTTGGGACGCTTGAAGCGCAAGTAGAAAAC  60

Query  61   GAGATAGGGTGTCCCATCTAAACCGCCGTGCCAATAGCTTTAAAGGCCAGGAAACATTTA  120
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  61   GAGATAGGGTGTCCCATCTAAACCGCCGTGCCAATAGCTTTAAAGGCCAGGAAACATTTA  120

Query  121  ATATCCCTAACAAGCACGGTCCACCAACGGCATTACGACTTTACGAGTTCGCAGAACAAA  180
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  121  ATATCCCTAACAAGCACGGTCCACCAACGGCATTACGACTTTACGAGTTCGCAGAACAAA  180

Query  181  GACTTTGCAACTGCAGGGGAGCCCTTCGATGCATCCGAATGAGGGCGAGCGTCGCAGATT  240
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  181  GACTTTGCAACTGCAGGGGAGCCCTTCGATGCATCCGAATGAGGGCGAGCGTCGCAGATT  240

Query  241  AACTTCGAGCAGTTAACCAGGCAAGGATATTTCCGGCATCAAGCGTTTCTCCCTACTAAT  300
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  241  AACTTCGAGCAGTTAACCAGGCAAGGATATTTCCGGCATCAAGCGTTTCTCCCTACTAAT  300

Query  301  ATCCTTCCTTATGTCCCGCATTAAACAGCACTCAGCATCTCAAACAATCACAAAACAACC  360
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  301  ATCCTTCCTTATGTCCCGCATTAAACAGCACTCAGCATCTCAAACAATCACAAAACAACC  360

Query  361  CACCTCATCGTTGACCAGATGATAACGTGGGACATTATCTTTGGGCAATACCACCAAAAT  420
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  361  CACCTCATCGTTGACCAGATGATAACGTGGGACATTATCTTTGGGCAATACCACCAAAAT  420

Query  421  CGTTCTTTATGGGGTATCGCTCTTAAGCAGCGCACTTCTGCATAACTATGCCATACAGTT  480
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  421  CGTTCTTTATGGGGTATCGCTCTTAAGCAGCGCACTTCTGCATAACTATGCCATACAGTT  480

Query  481  AGGTGCTACCATGAACATCCCGAGCTGCGTTGCATGTATCGGGTATGCCCAAGACCATAC  540
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  481  AGGTGCTACCATGAACATCCCGAGCTGCGTTGCATGTATCGGGTATGCCCAAGACCATAC  540

Query  541  CTCCAATGCTGCAGGGGTTAAATTCTCCGTTCTCGTCTAATCTAAGAGAATTGTATAGCT  600
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  541  CTCCAATGCTGCAGGGGTTAAATTCTCCGTTCTCGTCTAATCTAAGAGAATTGTATAGCT  600

Query  601  TGCAGGCTAACATCCTGGGTCCAACCCCACATTGTAACTTCGCTGATTCCCACCACTAAT  660
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  601  TGCAGGCTAACATCCTGGGTCCAACCCCACATTGTAACTTCGCTGATTCCCACCACTAAT  660

Query  661  TTCTAGGGTTAGTGAAGGTTCGATACATCGCGCATTGGGGGTCTCGGTCAAGAGGAGCGC  720
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  661  TTCTAGGGTTAGTGAAGGTTCGATACATCGCGCATTGGGGGTCTCGGTCAAGAGGAGCGC  720

Query  721  GTAAGTAAAGACGCCTATCTTCCAGTTTGATCGGGAAACTACCCGAGGGGGATGGTGCTC  780
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  721  GTAAGTAAAGACGCCTATCTTCCAGTTTGATCGGGAAACTACCCGAGGGGGATGGTGCTC  780

Query  781  AATTGGGCCTCGTCTGAACACAAGAGAGATCGCACGCGGAAACCGTTAACGCAAGAATAT  840
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  781  AATTGGGCCTCGTCTGAACACAAGAGAGATCGCACGCGGAAACCGTTAACGCAAGAATAT  840

Query  841  ACAGCATATGGCATGTAAGCGAAATAACATCCTCCCACTGGGTGCACAGCGAATTAGTAT  900
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  841  ACAGCATATGGCATGTAAGCGAAATAACATCCTCCCACTGGGTGCACAGCGAATTAGTAT  900

Query  901  CATAGTAGAATTAAGCGAGATCCATGACGTCACCGCTACTCAATCATCATCCACGTCTCG  960
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  901  CATAGTAGAATTAAGCGAGATCCATGACGTCACCGCTACTCAATCATCATCCACGTCTCG  960

Query  961  CGTCATACCCaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaa  994
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  961  CGTCATACCCAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAA  994

Query=  ERCC-00112_genbank |92111300|gb|DQ459422.1| Synthetic construct
microarray control MC14 mRNA, complete sequence
Length=1137

Subject=  ERCC-00112
Length=1136

Score = 2002 bits (1084),  Expect = 0.0
Identities = 1123/1139 (98%), Gaps = 14/1139 (1%)
Strand=Plus/Plus

Query  4     AGATGCCTGGATAGGTTCAAGTTACGTTTACACCGTTCCCACCCCACTAACCACGACCTT  63
             ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  1     AGATGCCTGGATAGGTTCAAGTTACGTTTACACCGTTCCCACCCCACTAACCACGACCTT  60

Query  64    TCTCGCCTTTGTTTTACCAACGCCGGCTAACAGCGTCGGGCCCAGCTAATATTGTTAAGG  123
             ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  61    TCTCGCCTTTGTTTTACCAACGCCGGCTAACAG-GTCGGGCCCAGCTAATATTGTTAAGG  119

Query  124   CAGGCGTTCTGTACTTACTCGATCGTTCATAGCCCC-CGACATAGTTTTTAGTCATTACG  182
             |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||
Sbjct  120   CAGGCGTTCTGTACTTACTCGATCGTTCATAGCCCCACGACATAGTTTTTAGTCATTACG  179

Query  183   TAGCCGTTATAGAAACTCACCTGTTGTAGGAGGTTACAACCAGATCGTCTTAGCTTATGG  242
             ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||
Sbjct  180   TAGCCGTTATAGAAACTCACCTGTTGTAGAAGGTTACAACCAGATCGTCTTA-CTTATGG  238

Query  243   CATGCTGGCGTAGACAGGT-CCAATTTGCGGCCAGTACTCGGATGTTCGTGGACTGATCT  301
             ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  239   CATGCTGGCGTAGACAGGTGCCAATTTGCGGCCAGTACTCGGATGTTCGTGGACTGATCT  298

Query  302   GGTCCTCTGTTCCCCTGGTGAAAACGTCGCTTCACTCCGGTAAGGGCGAATGTAATGACC  361
             ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  299   GGTCCTCTGTTCCCCTGGTGAAAACGTCGCTTCACTCCGGTAAGGGCGAATGTAATGACC  358

Query  362   GTATTCTAAGGTACAGATCTACACTATGTGCGGGCGAATAGA-TCGGGCCCGTAGCGGGG  420
             |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||
Sbjct  359   GTATTCTAAGGTACGGATCTACACTATGTGCGGGCGAATAGACTCGGGCCCGTAGCGGGG  418

Query  421   AGCAAATACTTGATCGCAATCTCTGACGTCAACTGATGTCGC-GAGA---CTG-GCACCC  475
             |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||   ||| ||||||
Sbjct  419   AGCAAATACTTGATCGCAATCTCTGACGTCAACTGATGTCGCGGAGACTGCTGCGCACCC  478

Query  476   AATAGGTACCACTAACGTCCGTGTGATTTT-ACCGGTAGGAATAAACACCGTCTTATACA  534
             |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  479   AATAGGTACCACTAACGTCCGTGTGATTTTAACCGGTAGGAATAAACACCGTCTTATACA  538

Query  535   GCTACGTTTTTCGATTTACTACCGAGCCGTTTGCGAGAACATATGGATTGGGAAATAGGC  594
             ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  539   GCTACGTTTTTCGATTTACTACCGAGCCGTTTGCGAGAACATATGGATTGGGAAATAGGC  598

Query  595   TCGAGTCCACATACAGCCTACGGTAAGTTGCT-GGCTCGCAATTCTATCCGGGTTTGTGA  653
             |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  599   TCGAGTCCACATACAGCCTACGGTAAGTTGCTAGGCTCGCAATTCTATCCGGGTTTGTGA  658

Query  654   GTCTTAGTTGTGCTCCGGCTTTTGAATGAGCATACTCATGAAAGCGCTGCTTACTATGAT  713
             |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||
Sbjct  659   GTCTTAGTTGTGCTCCGGCTTTTGAATGAGCATACTCATGAAAGCGCTGC-TACTATGAT  717

Query  714   AAGAGTACACGTACAGGTCTCGCCCGATTGGATTATGGCGAGCTGCCGCATTGACGGACA  773
             ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  718   AAGAGTACACGTACAGGTCTCGCCCGATTGGATTATGGCGAGCTGCCGCATTGACGGACA  777

Query  774   TACCTTTGAACGTAATCGCGCACGAGTGCGGATTAAGATTCTCCGCTTCAATCATGCAAT  833
             ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  778   TACCTTTGAACGTAATCGCGCACGAGTGCGGATTAAGATTCTCCGCTTCAATCATGCAAT  837

Query  834   GTGGTACAGCTGACTATCATTGACACCAAGCCGCTTGCAGGTATCGCCTGTCGGATAAGT  893
             ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  838   GTGGTACAGCTGACTATCATTGACACCAAGCCGCTTGCAGGTATCGCCTGTCGGATAAGT  897

Query  894   TAAGAGTGAGACGAAGAGTATTCATCGAGCGCCAGGTAAGATAGTGCCACTCTAAGCATC  953
             ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  898   TAAGAGTGAGACGAAGAGTATTCATCGAGCGCCAGGTAAGATAGTGCCACTCTAAGCATC  957

Query  954   GGTATCTAGCTTTAGTAACCTTCTCGATGGGGAATACACCTCTGCTTAACGGTCTTAATA  1013
             ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  958   GGTATCTAGCTTTAGTAACCTTCTCGATGGGGAATACACCTCTGCTTAACGGTCTTAATA  1017

Query  1014  ATTGACGCG-CTTGGACGTAGTACTCTGCAGTGCCTAAACTCATAGTAAACGATCTGGTA  1072
             ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  1018  ATTGACGCGTCTTGGACGTAGTACTCTGCAGTGCCTAAACTCATAGTAAACGATCTGGTA  1077

Query  1073  GGTCCTTTTACACACGGTTTTTATCGCTTAGTGCTaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaa  1131
             |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  1078  GGTCCTTTTACACACGGTTTTTATCGCTTAGTGCTAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAA  1136

Query=  ERCC-00113_genbank |114976925|gb|DQ883663.2| Synthetic construct
clone NISTag22 external RNA control sequence
Length=850

Subject=  ERCC-00113
Length=840

Score = 1537 bits (832),  Expect = 0.0
Identities = 840/843 (99%), Gaps = 3/843 (0%)
Strand=Plus/Plus

Query  1    ACACCGGCGCACGCCACAGGCGTCATACTTCCCAAGAAGCGGCCATAGCCCAGATGCGAG  60
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  1    ACACCGGCGCACGCCACAGGCGTCATACTTCCCAAGAAGCGGCCATAGCCCAGATGCGAG  60

Query  61   GTGGAAAAGTCACACTAGAGCGACACCAACATCGTTACGCTTACACACCGGACGCTTGGA  120
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  61   GTGGAAAAGTCACACTAGAGCGACACCAACATCGTTACGCTTACACACCGGACGCTTGGA  120

Query  121  TCAGTGGGAAGTGCTCACGCGCGGAGCCCACTGGGCGAACAGCAACGTTATAACGGCCAC  180
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  121  TCAGTGGGAAGTGCTCACGCGCGGAGCCCACTGGGCGAACAGCAACGTTATAACGGCCAC  180

Query  181  TCAGTGGTTCGTCACGCGCAGCCCCGGGTTCGTCCCCTATAAGGGCCTAGTACCTTTCGA  240
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  181  TCAGTGGTTCGTCACGCGCAGCCCCGGGTTCGTCCCCTATAAGGGCCTAGTACCTTTCGA  240

Query  241  GCCCCGCGCGTACTAGGCAGATAAGAACCCTCCAGCTCGGGGCCTCAAACCGATATTCCA  300
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  241  GCCCCGCGCGTACTAGGCAGATAAGAACCCTCCAGCTCGGGGCCTCAAACCGATATTCCA  300

Query  301  TGTGGGCCAACTGCCATGTTGTGTCCAGTCGCTATCGGAGTAGCCGCGCTGGTGCCACAC  360
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  301  TGTGGGCCAACTGCCATGTTGTGTCCAGTCGCTATCGGAGTAGCCGCGCTGGTGCCACAC  360

Query  361  GACTACAACCCTCGTAATAGGGCTGCGTGCGTCCTAAATACACTCGCTGTTGAGATACTA  420
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  361  GACTACAACCCTCGTAATAGGGCTGCGTGCGTCCTAAATACACTCGCTGTTGAGATACTA  420

Query  421  AAATTATCTGTGGATTGCCGGCATTGAGCCCACGGTAAACCCCAAATACATAAGTGTATA  480
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  421  AAATTATCTGTGGATTGCCGGCATTGAGCCCACGGTAAACCCCAAATACATAAGTGTATA  480

Query  481  ATGTCTCGGACCCGTCGCAACGGTTGTTAATATGACAGGCCGCTAAAGACGTTCTACTCC  540
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  481  ATGTCTCGGACCCGTCGCAACGGTTGTTAATATGACAGGCCGCTAAAGACGTTCTACTCC  540

Query  541  GCCATATGAGATAATATCCTTATCTTGAGACGCATAGCAAATGTAGGAGAGAGAGGTTAA  600
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  541  GCCATATGAGATAATATCCTTATCTTGAGACGCATAGCAAATGTAGGAGAGAGAGGTTAA  600

Query  601  TAAGGCCTAGCCTAAAGGTTCTTGCAGAGCAACATCATATACCCTGTAGAACCCGACTTT  660
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  601  TAAGGCCTAGCCTAAAGGTTCTTGCAGAGCAACATCATATACCCTGTAGAACCCGACTTT  660

Query  661  TGGGTTTAGGGGCCTGCCGTCAGCTACAATTCATGCTTGAAGGTTTCACTAGATCGTGTT  720
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  661  TGGGTTTAGGGGCCTGCCGTCAGCTACAATTCATGCTTGAAGGTTTCACTAGATCGTGTT  720

Query  721  ATGGACGATGACTATAGTGTAACAGGTGCAGAGCTTAACTTTGGACACATGACACTCAGT  780
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  721  ATGGACGATGACTATAGTGTAACAGGTGCAGAGCTTAACTTTGGACACATGACACTCAGT  780

Query  781  TCTGTACCAACTAGGAAGAGCGCCGGGGTAGAAGAATGGGaaaaaaaaaaaaaaaaaaaa  840
            |||||||||||||||||||||||||||||||||||||   ||||||||||||||||||||
Sbjct  781  TCTGTACCAACTAGGAAGAGCGCCGGGGTAGAAGAAT---AAAAAAAAAAAAAAAAAAAA  837

Query  841  aaa  843
            |||
Sbjct  838  AAA  840

Query=  ERCC-00116_genbank |110339340|gb|DQ668367.1| Synthetic construct
clone TagIN microarray control
Length=1969

Subject=  ERCC-00116
Length=1991

Score = 3637 bits (1969),  Expect = 0.0
Identities = 1969/1969 (100%), Gaps = 0/1969 (0%)
Strand=Plus/Minus

Query  1     AAGCGTTCACAGCTCGGCAATACCTGTGACGAGCTGCTCGCAAGATTTACGCAGTGTGGC  60
             ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  1991  AAGCGTTCACAGCTCGGCAATACCTGTGACGAGCTGCTCGCAAGATTTACGCAGTGTGGC  1932

Query  61    TATACTTGACAGTGATGGCGCTTACTTCAGATGTATGGGTGATACTTCGCTATATGGGTG  120
             ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  1931  TATACTTGACAGTGATGGCGCTTACTTCAGATGTATGGGTGATACTTCGCTATATGGGTG  1872

Query  121   GTCACTTCTCTATGGCGCGTGACAATGTACTATGGAGCGGTCAATGTCAGTACGGATCGC  180
             ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  1871  GTCACTTCTCTATGGCGCGTGACAATGTACTATGGAGCGGTCAATGTCAGTACGGATCGC  1812

Query  181   GTCGATCTAGGTGACTACGCACGCCTCTGGAGTAAATCGAGTGCTCCGTGCGAAATACGC  240
             ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  1811  GTCGATCTAGGTGACTACGCACGCCTCTGGAGTAAATCGAGTGCTCCGTGCGAAATACGC  1752

Query  241   GGTCATCGTGCGAATAACCGAGTCATCGTGAGTAGTATGAACGTGTCGTGTTATGCAGCG  300
             ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  1751  GGTCATCGTGCGAATAACCGAGTCATCGTGAGTAGTATGAACGTGTCGTGTTATGCAGCG  1692

Query  301   GTATGTCGTGCTATAATGGCGTCTGTCGTGCTCATAAGGTTCCTCTGATGTGCTAGACGT  360
             ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  1691  GTATGTCGTGCTATAATGGCGTCTGTCGTGCTCATAAGGTTCCTCTGATGTGCTAGACGT  1632

Query  361   GTCCATCGAGCTGCATAGCTATACTTCGAGTCACTTGGGATACTTCGATAGCGTTGTGAA  420
             ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  1631  GTCCATCGAGCTGCATAGCTATACTTCGAGTCACTTGGGATACTTCGATAGCGTTGTGAA  1572

Query  421   TAGTGTCGTAGGCTCTCGGGCACGTTGTTAAACTGTTGCCGCCAATTCAAGATTAGTCCA  480
             ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  1571  TAGTGTCGTAGGCTCTCGGGCACGTTGTTAAACTGTTGCCGCCAATTCAAGATTAGTCCA  1512

Query  481   GCTCGTACTATCGAATACACCATCGTCGTATCGAATAATCGCACCTCGTAGGAGTCAGTT  540
             ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  1511  GCTCGTACTATCGAATACACCATCGTCGTATCGAATAATCGCACCTCGTAGGAGTCAGTT  1452

Query  541   GCCACTCGTTGATAGTCAACCAAGCTCGTTAGATAGTAGCCCAGATCCTACGAGATGAGC  600
             ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  1451  GCCACTCGTTGATAGTCAACCAAGCTCGTTAGATAGTAGCCCAGATCCTACGAGATGAGC  1392

Query  601   TACGTAACTACAGTGATAGCATATAGGGTACGCTAGAATGCCAGGTCGTAGTCGAATTAG  660
             ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  1391  TACGTAACTACAGTGATAGCATATAGGGTACGCTAGAATGCCAGGTCGTAGTCGAATTAG  1332

Query  661   TCAGGTTGGATGTCTACTAGTTGACTTGGAGTATGCCATGAAGACTCGTCCCTCGATATC  720
             ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  1331  TCAGGTTGGATGTCTACTAGTTGACTTGGAGTATGCCATGAAGACTCGTCCCTCGATATC  1272

Query  721   AATACTCGTCCGCAGGTGAACACTGTAGTCGGTGCTAGTGCCCACTTCTCGGTATGTGTC  780
             ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  1271  AATACTCGTCCGCAGGTGAACACTGTAGTCGGTGCTAGTGCCCACTTCTCGGTATGTGTC  1212

Query  781   CTCAATTATCGAGTAGGATTCTAATCAATCGTCGCGGCTCACTAATTGTCTGCGGTGGCT  840
             ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  1211  CTCAATTATCGAGTAGGATTCTAATCAATCGTCGCGGCTCACTAATTGTCTGCGGTGGCT  1152

Query  841   ACTAATGGTTACGGTGCCTGACTAATCGTGTAGGTGTCTAATACATCGTGATACGGGCGA  900
             ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  1151  ACTAATGGTTACGGTGCCTGACTAATCGTGTAGGTGTCTAATACATCGTGATACGGGCGA  1092

Query  901   TATAATGCTCGATACGGCAAATATAGCTCCGTCCGGTGGATCCAGATCGCAGGGTATCGC  960
             ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  1091  TATAATGCTCGATACGGCAAATATAGCTCCGTCCGGTGGATCCAGATCGCAGGGTATCGC  1032

Query  961   ATCGACAGACCTGGTATCGTCGTGACGAACGTGCTACTCGCTTATCGGGCCTGCTACATC  1020
             ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  1031  ATCGACAGACCTGGTATCGTCGTGACGAACGTGCTACTCGCTTATCGGGCCTGCTACATC  972

Query  1021  AGTGGCGATGTTCGTAACCCTTAGCCGATCTTCTTACTTACGAGGCTACTATTCGATCAA  1080
             ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  971   AGTGGCGATGTTCGTAACCCTTAGCCGATCTTCTTACTTACGAGGCTACTATTCGATCAA  912

Query  1081  ACTCGCCTATCTGGTAATAACTGCGGTGATCTGGTAGCCACTACGTGCGCCTGGTAGCAA  1140
             ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  911   ACTCGCCTATCTGGTAATAACTGCGGTGATCTGGTAGCCACTACGTGCGCCTGGTAGCAA  852

Query  1141  ATACGGCGAGCTGGTATCACTATCGGCTCAGTGGTCCGACATAGTGCCCAGTGGTTCGCA  1200
             ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  851   ATACGGCGAGCTGGTATCACTATCGGCTCAGTGGTCCGACATAGTGCCCAGTGGTTCGCA  792

Query  1201  TAACTGCCGCTGGGTCCAATATAACACGCAGTCGTCAATCATACGAGCCGATGGTCAGCA  1260
             ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  791   TAACTGCCGCTGGGTCCAATATAACACGCAGTCGTCAATCATACGAGCCGATGGTCAGCA  732

Query  1261  ATAGCGCCTGTGGTGACACTATGCCACCTCTGGTCTAATATAGCGCCCTGTGGTCGTATA  1320
             ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  731   ATAGCGCCTGTGGTGACACTATGCCACCTCTGGTCTAATATAGCGCCCTGTGGTCGTATA  672

Query  1321  ATCGAGCGCGTAATCGTATATCCGACTGTAGGTGCGTAACTCGCGACTAGGTGGCTCTAA  1380
             ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  671   ATCGAGCGCGTAATCGTATATCCGACTGTAGGTGCGTAACTCGCGACTAGGTGGCTCTAA  612

Query  1381  TCTGCGTTGGTTGTCGCTCACAGTGTCTGGTGTTCGATACCCGGATCGGGTTCCGTAATC  1440
             ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  611   TCTGCGTTGGTTGTCGCTCACAGTGTCTGGTGTTCGATACCCGGATCGGGTTCCGTAATC  552

Query  1441  TTGGCATCGAGGTTTCGTACATGTCACGCGGTCTCGTTCATTCTCGGTGGTGCTCAGTAC  1500
             ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  551   TTGGCATCGAGGTTTCGTACATGTCACGCGGTCTCGTTCATTCTCGGTGGTGCTCAGTAC  492

Query  1501  ATCCAGTGGTGAGTCGCTACATCACACGGTGATCCGGCTAAACCTCTGGGCATCCGTATT  1560
             ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  491   ATCCAGTGGTGAGTCGCTACATCACACGGTGATCCGGCTAAACCTCTGGGCATCCGTATT  432

Query  1561  AAGCGACATTCCTACGACTTATCAGCACGTCCTACGGTATAACAAGGCGTGCTACGGTCT  1620
             ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  431   AAGCGACATTCCTACGACTTATCAGCACGTCCTACGGTATAACAAGGCGTGCTACGGTCT  372

Query  1621  AACGACGCTGGTAGCAGTCTATCAGATCGCTAGTACGAGTTAGAGATGCTTAGTACGCCT  1680
             ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  371   AACGACGCTGGTAGCAGTCTATCAGATCGCTAGTACGAGTTAGAGATGCTTAGTACGCCT  312

Query  1681  TCGAATCTATGATGCTCGTGCTCACGCGATGCACTCGGATTATGGCACATGCACTCGCGT  1740
             ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  311   TCGAATCTATGATGCTCGTGCTCACGCGATGCACTCGGATTATGGCACATGCACTCGCGT  252

Query  1741  AATGACGCTGCATCGCTCAGTATGATCCATGAGCGCCGTGAATGACGCATGAGCCTCGTA  1800
             ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  251   AATGACGCTGCATCGCTCAGTATGATCCATGAGCGCCGTGAATGACGCATGAGCCTCGTA  192

Query  1801  TCGAGTGCATGAGCTGTCTTTCACATGATACATCGCTCTAAATCATCATGCGACAGTCTC  1860
             ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  191   TCGAGTGCATGAGCTGTCTTTCACATGATACATCGCTCTAAATCATCATGCGACAGTCTC  132

Query  1861  GACAGCAGCTCAGCATCTATGCATCATGTGCCTCACTAGGACATCATGCTCGACTCTGAG  1920
             ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  131   GACAGCAGCTCAGCATCTATGCATCATGTGCCTCACTAGGACATCATGCTCGACTCTGAG  72

Query  1921  ACACTGATCGAGCATTAAGACTCTAGAGCGGCCGCCGACTAGTGAGCTC  1969
             |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  71    ACACTGATCGAGCATTAAGACTCTAGAGCGGCCGCCGACTAGTGAGCTC  23

Query=  ERCC-00117_genbank |92111290|gb|DQ459412.1| Synthetic construct
microarray control MC01 mRNA, complete sequence
Length=1143

Subject=  ERCC-00117
Length=1136

Score = 2036 bits (1102),  Expect = 0.0
Identities = 1129/1140 (99%), Gaps = 10/1140 (0%)
Strand=Plus/Plus

Query  4     AGATACTATCAGGCGCCTATGGGCAAATCTGGCCTCCAAACTCCGAGTGTCACCGAACCG  63
             ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  1     AGATACTATCAGGCGCCTATGGGCAAATCTGGCCTCCAAACTCCGAGTGTCACCGAACCG  60

Query  64    TAGGAAATTCCTT-CCCAAGCGTGTGCAATACTCGTAGCACACCGGGATAAATAGGAAGG  122
             ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  61    TAGGAAATTCCTTCCCCAAGCGTGTGCAATACTCGTAGCACACCGGGATAAATAGGAAGG  120

Query  123   AAACATCCGCGGGTCTTACGGTGAAGCTGTGGGACCGCTTCTGTACACGGCGTCCAATCA  182
             ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  121   AAACATCCGCGGGTCTTACGGTGAAGCTGTGGGACCGCTTCTGTACACGGCGTCCAATCA  180

Query  183   AGGGGCTTGGCATTTGGCCCCAGATC-AAAGTGTTGAACCACAAACGACTCTATCGGTGA  241
             ||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  181   AGGGGCTTGGCATTTGG-CCCAGATCGAAAGTGTTGAACCACAAACGACTCTATCGGTGA  239

Query  242   CGCCTCCAAGCGCGAAACTCCAGGCATTGGGGAACCGCAGAAAGATGTTCCGCTAGACCG  301
             |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  240   CGCCTCCAAGCGCGAAACTCCAGGCAATGGGGAACCGCAGAAAGATGTTCCGCTAGACCG  299

Query  302   CATTAATACCACATCTGGGCTTAGAAGCCCCTCGGTGCTCCAGGGAGGACGGATCGGAAT  361
             ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  300   CATTAATACCACATCTGGGCTTAGAAGCCCCTCGGTGCTCCAGGGAGGACGGATCGGAAT  359

Query  362   TAAACGTGATATGGAACTTTAACTGAT-AGGCCTTGCCCTTACTAATGGCGCGTTGTAAC  420
             ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  360   TAAACGTGATATGGAACTTTAACTGATCAGGCCTTGCCCTTACTAATGGCGCGTTGTAAC  419

Query  421   GGGCCTTGAGGGCAATGTCACTATTGAGGCACCCGTTCGACCCTCAGAGATATACCATTC  480
             |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  420   GGGCCTTGAGGG-AATGTCACTATTGAGGCACCCGTTCGACCCTCAGAGATATACCATTC  478

Query  481   CGCCTATTGTAGCTCTCCTCGTACCACAGTCTTGCAAATACTGTCATAGCTATGGAACCG  540
             ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  479   CGCCTATTGTAGCTCTCCTCGTACCACAGTCTTGCAAATACTGTCATAGCTATGGAACCG  538

Query  541   CCCCGACGCCGGGATTATGGCCTCTCATGGACTCAGTGTGATCAGAACCTGCTCG-GTGG  599
             ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||
Sbjct  539   CCCCGACGCCGGGATTATGGCCTCTCATGGACTCAGTGTGATCAGAACCTGCTCGAGTGG  598

Query  600   GGACTGGATGCAGAGCTGATCTCTGTAGTGTGTTGTGTCGCGGGAGCACCACCGG-TGAC  658
             ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||
Sbjct  599   GGACTGGATGCAGAGCTGATCTCTGTAGTGTGTTGTGTCGCGGGAGCACCACCGGATGAC  658

Query  659   AACCGCCATATTCCAGTGCCCAAATACTCACTGGTAACGGCTTGAACTCATGCTAATTCC  718
             ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  659   AACCGCCATATTCCAGTGCCCAAATACTCACTGGTAACGGCTTGAACTCATGCTAATTCC  718

Query  719   ATTATAGTTCTTTAAACATAAGCTTTGCCCTCGGGGCCCATCCCCTGAACCATGCGGTGA  778
             ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  719   ATTATAGTTCTTTAAACATAAGCTTTGCCCTCGGGGCCCATCCCCTGAACCATGCGGTGA  778

Query  779   GTCACGTACGCAGACCTGAAAATTAAAGATCCGGACAGGCCCGACCTTAGCCAAGGGTAA  838
             ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  779   GTCACGTACGCAGACCTGAAAATTAAAGATCCGGACAGGCCCGACCTTAGCCAAGGGTAA  838

Query  839   GAACCGCTGTCACTTAGTGAACATCCTATCCAGTGCCGTGCAGCATCGTCTACGGTCCGG  898
             |||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||
Sbjct  839   GAACCGCT-TCACTTAGTGAACATCCTATCCAGT-CCGTGCAGCATCGTCTACGGTCCGG  896

Query  899   GCTTCTGCCGAAAGGTCCATTAAACAGACAGAAGGATAAATGGCTCCAGCGGATACGCGC  958
             ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  897   GCTTCTGCCGAAAGGTCCATTAAACAGACAGAAGGATAAATGGCTCCAGCGGATACGCGC  956

Query  959   ATATTCGGTTATCGCAGTTACCGTGCAAAACTGCATCCCCGCTGGGATAAGCACATGAGA  1018
             ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  957   ATATTCGGTTATCGCAGTTACCGTGCAAAACTGCATCCCCGCTGGGATAAGCACATGAGA  1016

Query  1019  TGGACAAGGCTTCCTATGA-TGATTCCAAAGAACATTGCCCGACGACCGAGCCTTCAGGT  1077
             ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  1017  TGGACAAGGCTTCCTATGAGTGATTCCAAAGAACATTGCCCGACGACCGAGCCTTCAGGT  1076

Query  1078  AATCCACGAGACATATGCTAACCAGTGGTGCCATGGaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaa  1137
             ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  1077  AATCCACGAGACATATGCTAACCAGTGGTGCCATGGAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAA  1136

Query=  ERCC-00120_genbank |110586090|gb|DQ854992.1| Synthetic construct
clone AG003.0011 external RNA control sequence
Length=512

Subject=  ERCC-00120
Length=536

Score =  941 bits (509),  Expect = 0.0
Identities = 511/512 (99%), Gaps = 0/512 (0%)
Strand=Plus/Plus

Query  1    GGCGTCTCACCTGGCTTGATTCAGTTAATGGAGCACTTGTGGGAGTGCCGCGACACAACA  60
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  1    GGCGTCTCACCTGGCTTGATTCAGTTAATGGAGCACTTGTGGGAGTGCCGCGACACAACA  60

Query  61   TCCGCTAGCCTCAGTCGAATGACAAGTTAGAACAAGAGTGGGGCCGATCTCTGCAAACTC  120
            |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||
Sbjct  61   TCCGCTAGCCTCAGTCGAATGACAAGTTAGAACAGGAGTGGGGCCGATCTCTGCAAACTC  120

Query  121  CTATTGTCAGGGGTGGTGGACGGTATAGGGTTTTGCGCCTACCTGAATGCAAGGGCTTAC  180
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  121  CTATTGTCAGGGGTGGTGGACGGTATAGGGTTTTGCGCCTACCTGAATGCAAGGGCTTAC  180

Query  181  CTCCAACGGCTTAGATGTGCCTAGAAGGTACGCCCTTCAGTCAAGACCGGCCCGGCGTTA  240
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  181  CTCCAACGGCTTAGATGTGCCTAGAAGGTACGCCCTTCAGTCAAGACCGGCCCGGCGTTA  240

Query  241  GTTAAAGCAGGCTTGTCACACATCACGTAGTTCCTGCTGCGTTTTAAGTCATTAGCTCCC  300
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  241  GTTAAAGCAGGCTTGTCACACATCACGTAGTTCCTGCTGCGTTTTAAGTCATTAGCTCCC  300

Query  301  AGTAACCCATCAACCATTACCGTATAGACTTATCCGAGTGTGATCAAATAACGCTGAGCC  360
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  301  AGTAACCCATCAACCATTACCGTATAGACTTATCCGAGTGTGATCAAATAACGCTGAGCC  360

Query  361  TTATGATCCTCGTCGACCCAACAACCGCCGGATATACGTTGGGATATAAACGAAACACGT  420
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  361  TTATGATCCTCGTCGACCCAACAACCGCCGGATATACGTTGGGATATAAACGAAACACGT  420

Query  421  ACCGCGCGAGTGACACGCGTTGACGTTACATGGTAAACTCGTAGCCAACCTTAACATTCC  480
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  421  ACCGCGCGAGTGACACGCGTTGACGTTACATGGTAAACTCGTAGCCAACCTTAACATTCC  480

Query  481  CTGCACTATGTTAGTGCGTACAACATTAAGGG  512
            ||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  481  CTGCACTATGTTAGTGCGTACAACATTAAGGG  512

Query=  ERCC-00123_genbank |103488729|gb|DQ516782.1| Methanocaldococcus
jannaschii spike-in control MJ-1000-65 genomic sequence
Length=1000

Subject=  ERCC-00123
Length=1022

Score = 1807 bits (978),  Expect = 0.0
Identities = 993/1000 (99%), Gaps = 2/1000 (0%)
Strand=Plus/Plus

Query  1    TTAAGAGAGGAATAATTActtttttcatcttacccaccaagttttagttttcttattctt  60
            ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  1    TTAAGAGAGGAATAATTAC-TTTTTCATCTTACCCACCAAGTTTTAGTTTTCTTATTCTT  59

Query  61   tcatttaatttttcGACCTCCTCCTTTGTTAATCTTGTAGCTTTTTTAACCTCCTCCAAT  120
            ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  60   TCACTTAATTTTTCGACCTCCTCCTTTGTTAATCTTGTAGCTTTTTTAACCTCCTCCAAT  119

Query  121  TCTTTTTGTAACATTATTACTTTAATCCCCAGTATTATGTTGAGGAGTATGCTAATAGCC  180
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  120  TCTTTTTGTAACATTATTACTTTAATCCCCAGTATTATGTTGAGGAGTATGCTAATAGCC  179

Query  181  ACAATTATATACAAAATCATCCTTATCTCCTCCCGAACAATCCTTTAATAAACTTAGATA  240
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  180  ACAATTATATACAAAATCATCCTTATCTCCTCCCGAACAATCCTTTAATAAACTTAGATA  239

Query  241  TGAATGATTCTTTCTTCTTCTTAAGTTGTGCTTCATATTTAGCTCCAATTAACTTAGCTG  300
            ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  240  TGAATGATTCTTTCTTCTTCTCAAGTTGTGCTTCATATTTAGCTCCAATTAACTTAGCTG  299

Query  301  CTATCTCCATGATTGCTTGAGCGGCTGGAGAATCTGGATACATAATAACGAGAGGTGTTC  360
            |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  300  CTATCTCCATGACTGCTTGAGCGGCTGGAGAATCTGGATACATAATAACGAGAGGTGTTC  359

Query  361  CAAATGCAGCTGCCTTCCTAACATGAGGGTCCTCTGGAACAACACCTATAACAGGAACTT  420
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  360  CAAATGCAGCTGCCTTCCTAACATGAGGGTCCTCTGGAACAACACCTATAACAGGAACTT  419

Query  421  CTAAAATTGTCTCTATAGCTTTAACCCCCAACTCTGTACTCTCATTTGAAACCCTATTAA  480
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  420  CTAAAATTGTCTCTATAGCTTTAACCCCCAACTCTGTACTCTCATTTGAAACCCTATTAA  479

Query  481  CAATAGCCCCAATGATGTCAGTTCCCAATCTTTTTGTTATAGCGATAATTTTTAATGCAT  540
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  480  CAATAGCCCCAATGATGTCAGTTCCCAATCTTTTTGTTATAGCGATAATTTTTAATGCAT  539

Query  541  CTGATATTGAGGATATCTCTGGATTTACAACGACAATTAAACCATCTGCTGATGATATTG  600
            ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  540  CTGATATTGGGGATATCTCTGGATTTACAACGACAATTAAACCATCTGCTGATGATATTG  599

Query  601  CTATTAAAGTCTCTTTTCCAATACCTGCTGGACAGTCAATAATTAAAATCTCAACTAAAT  660
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  600  CTATTAAAGTCTCTTTTCCAATACCTGCTGGACAGTCAATAATTAAAATCTCAACTAAAT  659

Query  661  CATGTATTGCCTTTAAAACTTCCTCAAGTTTTTCTGGTTTAGCTCTTCTGAACTTTTCTA  720
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  660  CATGTATTGCCTTTAAAACTTCCTCAAGTTTTTCTGGTTTAGCTCTTCTGAACTTTTCTA  719

Query  721  ATGAAACACCTGCTGGAATAACTAAAACTCCTTCAGGACCTTCATAAATTGCGTCCTTTA  780
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  720  ATGAAACACCTGCTGGAATAACTAAAACTCCTTCAGGACCTTCATAAATTGCGTCCTTTA  779

Query  781  TATCTGCTTTACCAGCCAACACATCGTTTAAGGTTACTGGCTTTCCTTCTAACCCCATGA  840
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  780  TATCTGCTTTACCAGCCAACACATCGTTTAAGGTTACTGGCTTTCCTTCTAACCCCATGA  839

Query  841  TAAGCTCTAAGTTTGCCATTGCTATATCAGCGTCCAAAACAGCCACtttttttCCAAATT  900
            || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  840  TAGGCTCTAAGTTTGCCATTGCTATATCAGCGTCCAAAACAGCCACTTTTTTTCCAAATT  899

Query  901  TTGCAAGAGCCACAGCAAGATTTGCAGATATCGTTGTCTTTCCAGTACCTCCTTTTCCAG  960
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  900  TTGCAAGAGCCACAGCAAGATTTGCAGATATCGTTGTCTTTCCAGTACCTCCTTTTCCAG  959

Query  961  ATGCTATCGCGATAGCTATTGCCATTAATGTCACCATTCT  1000
            |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||
Sbjct  960  ATGCTATCGCGATAGCTATT-CCATTAATGTCACCATTCT  998

Query=  ERCC-00126_genbank |92111305|gb|DQ459427.1| Synthetic construct
microarray control MC25 mRNA, complete sequence
Length=1124

Subject=  ERCC-00126
Length=1118

Score = 1962 bits (1062),  Expect = 0.0
Identities = 1107/1125 (98%), Gaps = 17/1125 (1%)
Strand=Plus/Plus

Query  1     GGAGA-CGACCGCGCATTAGTCAATCATATAGTTCGATAAATGAGACGTCACGGATTTGA  59
             ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  1     GGAGACCGACCGCGCATTAGTCAATCATATAGTTCGATAAATGAGACGTCACGGATTTGA  60

Query  60    GTATCATTTGCTAGAACTGCTTACCTATCTAAACGCTCAGGTATGCCTGCGCTGAGACTC  119
             ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  61    GTATCATTTGCTAGAACTGCTTACCTATCTAAACGCTCAGGTATGCCTGCGCTGAGACTC  120

Query  120   AGCATCTCAATGTGACCGAGCTTGTGACTCCGCA---TCC--C--TATACCCATCGGCCC  172
             ||||||||||||||||||||||||||||||||||   |||  |  |||||||||||||||
Sbjct  121   AGCATCTCAATGTGACCGAGCTTGTGACTCCGCATCCTCCTGCAATATACCCATCGGCCC  180

Query  173   TCACGGGGTAACGTAGCTCTTCTGCGTACACCTGGCTAGAGGGTCCTTACCGGCTGTAAG  232
             ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  181   TCACGGGGTAACGTAGCTCTTCTGCGTACACCTGGCTAGAGGGTCCTTACCGGCTGTAAG  240

Query  233   CTCACTACAATCCAGGTACAGAGTGCGTTAACCGGCCATTAGAGGGCCGCTACACCCGTC  292
             ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  241   CTCACTACAATCCAGGTACAGAGTGCGTTAACCGGCCATTAGAGGGCCGCTACACCCGTC  300

Query  293   AGAATTTAAACGTATGGGCGGCGAAGCGCGATAATGGTTAGACGCTTCTTGCAGGGGTCA  352
             ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||
Sbjct  301   AGAATTTAAACGTATGGGCGGCGAAGCGCGATAATGGTTAGAC-CTTCTTGCAGGGG-CA  358

Query  353   AATAACGATTTTGCGACTGCCCCTTTAAGATGGAGAATGGACAAACGCTCATTCCTAGTG  412
             ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  359   AATAACGATTTTGCGACTGCCCCTTTAAGATGGAGAATGGACAAACGCTCATTCCTAGTG  418

Query  413   AGGACATCGACATCGTTACGATGCAACGTCGAGTGGCGGCATAACACTTGGCTCGGTCCT  472
             ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  419   AGGACATCGACATCGTTACGATGCAACGTCGAGTGGCGGCATAACACTTGGCTCGGTCCT  478

Query  473   ACCCGCGACAGTGCAACAAAAACAGTTGCTCTACATTCGCTATGCATTTTAACGGATATG  532
             ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  479   ACCCGCGACAGTGCAACAAAAACAGTTGCTCTACATTCGCTATGCATTTTAACGGATATG  538

Query  533   CCTTTGCCCCCCGTCCGTCATG-ACGAAAAGTTTGGCTATGCGCGGAACATTATGCCGGA  591
             |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  539   CCTTTGCCCCCCGTCCGTCATGGACGAAAAGTTTGGCTATGCGCGGAACATTATGCCGGA  598

Query  592   TTACTCGTTATCGCTGGGTAATCGTCCGTTGGGCCCGCTCTTACGCGATCAGTGCCGTTA  651
             ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  599   TTACTCGTTATCGCTGGGTAATCGTCCGTTGGGCCCGCTCTTACGCGATCAGTGCCGTTA  658

Query  652   GCACATGCGCGAATAGGGCGGATTCCGAAAGCATGTGCCAAATTCCCCATGACCCTGTTC  711
             ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  659   GCACATGCGCGAATAGGGCGGATTCCGAAAGCATGTGCCAAATTCCCCATGACCCTGTTC  718

Query  712   CAGGTGAG-TGACACTATCAGTCGAAGTTGTTTGCTTAACCAGGAAAAACGCTGTTTCTC  770
             |||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  719   CAGGTGAGCTGACACTATCAGTCGAAGTTGTTTCCTTAACCAGGAAAAACGCTGTTTCTC  778

Query  771   CGTTTGCTTGTACCATGGGGGCAGGGAATTCTTCGAGCGCGCGAATGTATACACTATTAT  830
             ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  779   CGTTTGCTTGTACCATGGGGGCAGGGAATTCTTCGAGCGCGCGAATGTATACACTATTAT  838

Query  831   CTCATGTGCATGTCCAGAGCGGGCTAACCTAATATACCTGGTCGCATCCGTCCGAGATCA  890
             |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||
Sbjct  839   CTCATGTGCATGTCCAGAGCGGGCTAACCTAATATACCTGGTCGCATC-GTCCGAGATCA  897

Query  891   GTTGGGAATAGCGGAGCGGATACGCCTGGAACGCTGGGGCGTGCCAGTAAACTTACTGTT  950
             ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  898   GTTGGGAATAGCGGAGCGGATACGCCTGGAACGCTGGGGCGTGCCAGTAAACTTACTGTT  957

Query  951   CTCCAGTTCCTCCATCATGTTCCGTCTAATCCGGAGATGTGTAGCTGCATTGTGCTCCGT  1010
             ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  958   CTCCAGTTCCTCCATCATGTTCCGTCTAATCCGGAGATGTGTAGCTGCATTGTGCTCCGT  1017

Query  1011  TGCGGTACTCCTCGACTTGCCAGGTGCCATATGGGCTACTGGCGAGAGGAAATTTGCTTT  1070
             ||||||||||||||||| |   ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  1018  TGCGGTACTCCTCGACT-G---GGTGCCATATGGGCTACTGGCGAGAGGAAATTTGCTTT  1073

Query  1071  TGTGTATTTAGGCCCGTGGCACCTaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaa  1115
             |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  1074  TGTGTATTTAGGCCCGTGGCACCTAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAA  1118

Query=  ERCC-00128_genbank |92111306|gb|DQ459428.1| Synthetic construct
microarray control MC26 mRNA, complete sequence
Length=1134

Subject=  ERCC-00128
Length=1133

Score = 2021 bits (1094),  Expect = 0.0
Identities = 1123/1135 (98%), Gaps = 10/1135 (0%)
Strand=Plus/Plus

Query  1     GGGAGAACCTAAAAGCCATGAATCAAGCGCTTATGGATTCGTTTGCAGCGAAGTGAGGCC  60
             ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  1     GGGAGAACCTAAAAGCCATGAATCAAGCGCTTATGGATTCGTTTGCAGCGAAGTGAGGCC  60

Query  61    ATTCCCGCTTACATTAAAGACGTCCTATGAGGTTCGGAGGTGCCTGGCACCCTTGGCCGC  120
             |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  61    ATTCCCGCTTACATTAAAGACGTCCTATGA-GTTCGGAGGTGCCTGGCACCCTTGGCCGC  119

Query  121   GGTTGTATACTAACTGCTGACGCAAGCATAAGGAGTCAGGTTGATGGTACATCTTCACTT  180
             ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  120   GGTTGTATACTAACTGCTGACGCAAGCATAAGGAGTCAGGTTGATGGTACATCTTCACTT  179

Query  181   GCACACCCATAGCGCCAAGAAGAACCACTGTTAGCTTGACAGGGGATAAGTCCATGGTTC  240
             ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  180   GCACACCCATAGCGCCAAGAAGAACCACTGTTAGCTTGACAGGGGATAAGTCCATGGTTC  239

Query  241   GTCCGGGTTAGATTAGATGTTGCCTAGGCGACTTTAAGTGAACCAGATTATGTATGGACG  300
             ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  240   GTCCGGGTTAGATTAGATGTTGCCTAGGCGACTTTAAGTGAACCAGATTATGTATGGACG  299

Query  301   CGCAATAGATATGACACTTATTAATACCCGTACTGGTTTGGACACGGTATGGATCATAAC  360
             ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  300   CGCAATAGATATGACACTTATTAATACCCGTACTGGTTTGGACACGGTATGGATCATAAC  359

Query  361   TAGTCTTGCCTACATCAAGAGACCTGCACTCTCCTGTTGCGACGGTAGCAGACTCTACAT  420
             |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  360   TAGTATTGCCTACATCAAGAGACCTGCACTCTCCTGTTGCGACGGTAGCAGACTCTACAT  419

Query  421   TGGCCAATCATGTCCTCTGTTAATCCAGCCAGAATATGCCAATTGAGGCGAGGGAACTGG  480
             ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  420   TGGCCAATCATGTCCTCTGTTAATCCAGCCAGAATATGCCAATTGAGGCGAGGGAACTGG  479

Query  481   GATTGTCCCGTAGAACCTATACCATGTAATGGTTGTTAAGCTTCGATTCATCGGGAGTTG  540
             ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  480   GATTGTCCCGTAGAACCTATACCATGTAATGGTTGTTAAGCTTCGATTCATCGGGAGTTG  539

Query  541   CGCGTGCTGATGTCTCAGATATAGCACGCAGCTGCGCACGTCTCTATCGTAAGTCCGAGT  600
             ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  540   CGCGTGCTGATGTCTCAGATATAGCACGCAGCTGCGCACGTCTCTATCGTAAGTCCGAGT  599

Query  601   ATGCTTGCACTTGGTCAATTACAAGTTCGAACAGAGAGCGGGTGGAGGGCTATAGCTTTG  660
             ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  600   ATGCTTGCACTTGGTCAATTACAAGTTCGAACAGAGAGCGGGTGGAGGGCTATAGCTTTG  659

Query  661   CTGTAGCGATCCAATCGAGGCCAGTCTCTGCGGCCAAGTTACGCCTGAAAATTCCGATAG  720
             ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  660   CTGTAGCGATCCAATCGAGGCCAGTCTCTGCGGCCAAGTTACGCCTGAAAATTCCGATAG  719

Query  721   GTGGCTCTCGTACCGCGATGCGGGTACCCCGCCGGCTTTTCTATCACTATGCTTCGCAGA  780
             ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  720   GTGGCTCTCGTACCGCGATGCGGGTACCCCGCCGGCTTTTCTATCACTATGCTTCGCAGA  779

Query  781   TCAAACTTCTCCTGCGCGCCACGAGTGCAGGTAATCGCACTTAGAAGTAACTATGCCTAT  840
             ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  780   TCAAACTTCTCCTGCGCGCCACGAGTGCAGGTAATCGCACTTAGAAGTAACTATGCCTAT  839

Query  841   CATAACCCTGTACGCGGAGTAATTCCATGAACCGGCTTTGAAACGGATTACCGATCCTAT  900
             ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  840   CATAACCCTGTACGCGGAGTAATTCCATGAACCGGCTTTGAAACGGATTACCGATCCTAT  899

Query  901   CTGTTTGCTGTTTGGAGTGTGTATCCATGGTGATTGCAGGCACACTAAAATTGGCCTGAG  960
             ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  900   CTGTTTGCTGTTTGGAGTGTGTATCCATGGTGATTGCAGGCACACTAAAATTGGCCTGAG  959

Query  961   GA--TC-T-----GGCATGGACCGCGTCCGTTGAATAATGCATAATATCGCATTGAGCGA  1012
             ||  || |     |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  960   GAACTCCTTTTCTGGCATGGACCGCGTCCGTTGAATAATGCATAATATCGCATTGAGCGA  1019

Query  1013  TCACTGCGTCTTCTGTACGGTCGGACCCCTTGTTGATCAACGAACTAACTACGCGTTTAA  1072
             ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  1020  TCACTGCGTCTTCTGTACGGTCGGACCCCTTGTTGATCAACGAACTAACTACGCGTTTAA  1079

Query  1073  GATAGCGGACAGCCTATTCAATTCTCACTCTaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaa  1127
             | |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||
Sbjct  1080  GGTAGCGGACAGCCTATTCAATTCTCACTC-AAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAA  1133

Query=  ERCC-00130_genbank |116733912|gb|EF011072.1| Synthetic construct
spike-in microarray control hypothetical protein (ynbA) gene,
partial cds
Length=1046

Subject=  ERCC-00130
Length=1059

Score = 1916 bits (1037),  Expect = 0.0
Identities = 1037/1037 (100%), Gaps = 0/1037 (0%)
Strand=Plus/Plus

Query  10    GCATTTTGAAAATTCTATGGAAGAGCTAGCATCTCTGACGAAAACAGCAGACGGAAAAGT  69
             ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  1     GCATTTTGAAAATTCTATGGAAGAGCTAGCATCTCTGACGAAAACAGCAGACGGAAAAGT  60

Query  70    ACTGACCAGCGTCACACAAAAACGGAACAGGGCTGACGCCGCTACATATATAGGAAAAGG  129
             ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  61    ACTGACCAGCGTCACACAAAAACGGAACAGGGCTGACGCCGCTACATATATAGGAAAAGG  120

Query  130   GAAGGTAGAAGAGCTGAAGGCACTCGTGGAAGAGCTTGAAGCTGATCTCCTCATCTTTAA  189
             ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  121   GAAGGTAGAAGAGCTGAAGGCACTCGTGGAAGAGCTTGAAGCTGATCTCCTCATCTTTAA  180

Query  190   TGATGAACTGTCGCCAAGTCAGCTGAAGTCATTGGCAACAGCAATTGAAGTGAAGATGAT  249
             ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  181   TGATGAACTGTCGCCAAGTCAGCTGAAGTCATTGGCAACAGCAATTGAAGTGAAGATGAT  240

Query  250   TGACCGCACGCAATTGATATTAGATATTTTTGCAAAGCGGGCGAGAACGAGAGAAGGCAA  309
             ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  241   TGACCGCACGCAATTGATATTAGATATTTTTGCAAAGCGGGCGAGAACGAGAGAAGGCAA  300

Query  310   ACTTCAAATTGAGCTGGCTCAGCTGCAATATGCACTGCCGCGTCTGACGGGACAAGGGAT  369
             ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  301   ACTTCAAATTGAGCTGGCTCAGCTGCAATATGCACTGCCGCGTCTGACGGGACAAGGGAT  360

Query  370   CAACCTTTCCCGGCAAGGCGGAGGAATTGGGGCAAGAGGTCCCGGGGAAACGAAACTGGA  429
             ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  361   CAACCTTTCCCGGCAAGGCGGAGGAATTGGGGCAAGAGGTCCCGGGGAAACGAAACTGGA  420

Query  430   AACCGACCGCCGCCATATCAGAAATCGCATTCATGAAATCAACACACAGCTTTCCACTGT  489
             ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  421   AACCGACCGCCGCCATATCAGAAATCGCATTCATGAAATCAACACACAGCTTTCCACTGT  480

Query  490   CATTCGCCATAGAAGCCGATACCGTGAAAGAAGAAAGAAAAACGGTGTGCTTCAAATTGC  549
             ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  481   CATTCGCCATAGAAGCCGATACCGTGAAAGAAGAAAGAAAAACGGTGTGCTTCAAATTGC  540

Query  550   GCTTGTCGGCTATACAAACGCAGGGAAATCAACATGGTTCAACCGCCTGACGAGTGCTGA  609
             ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  541   GCTTGTCGGCTATACAAACGCAGGGAAATCAACATGGTTCAACCGCCTGACGAGTGCTGA  600

Query  610   CAGCTATGAAGAAGACCTCCTGTTTGCCACGCTGGACCCGATGACCAGAAAAATGGTCCT  669
             ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  601   CAGCTATGAAGAAGACCTCCTGTTTGCCACGCTGGACCCGATGACCAGAAAAATGGTCCT  660

Query  670   GCCAAGCGGCTACAGTGTTCTTCTTTCAGATACAGTAGGATTTATTCAGGATCTTCCGAC  729
             ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  661   GCCAAGCGGCTACAGTGTTCTTCTTTCAGATACAGTAGGATTTATTCAGGATCTTCCGAC  720

Query  730   GACATTGATTGCTGCATTCCGCTCAACGCTTGAGGAAGTAAAAGAAGCGGATTTAATTCT  789
             ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  721   GACATTGATTGCTGCATTCCGCTCAACGCTTGAGGAAGTAAAAGAAGCGGATTTAATTCT  780

Query  790   GCATTTAATTGATTCTTCAAATGAGGATTATGCGGGACATGAAAAAACAGTGCTTCGGCT  849
             ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  781   GCATTTAATTGATTCTTCAAATGAGGATTATGCGGGACATGAAAAAACAGTGCTTCGGCT  840

Query  850   GCTTGAGGAGCTTGAAGCAGATGATATCCCGATGCTGACGGCTTACAATAAACGTGATCA  909
             ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  841   GCTTGAGGAGCTTGAAGCAGATGATATCCCGATGCTGACGGCTTACAATAAACGTGATCA  900

Query  910   AAAACTGCCTGATTTTATACCGACCGCCGGAAGGGATCACATTATGGTCAGTGCGAAATT  969
             ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  901   AAAACTGCCTGATTTTATACCGACCGCCGGAAGGGATCACATTATGGTCAGTGCGAAATT  960

Query  970   TGAGGACGACGCTGCAGCCTTTAAAGAAGCGATTCAGCGCTATTTGCGCCAAGAACTGTT  1029
             ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  961   TGAGGACGACGCTGCAGCCTTTAAAGAAGCGATTCAGCGCTATTTGCGCCAAGAACTGTT  1020

Query  1030  AACGTCTTGAATTCTGG  1046
             |||||||||||||||||
Sbjct  1021  AACGTCTTGAATTCTGG  1037

Query=  ERCC-00131_genbank |116662508|gb|DQ855003.2| Synthetic construct
clone AG016.1110 external RNA control sequence
Length=747

Subject=  ERCC-00131
Length=771

Score = 1369 bits (741),  Expect = 0.0
Identities = 745/747 (99%), Gaps = 0/747 (0%)
Strand=Plus/Plus

Query  1    CGCCGGATAAAGGCTTCTTCGGTACTATACAAGTTGTCTACGCACATTTGCCTTGGGTAT  60
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  1    CGCCGGATAAAGGCTTCTTCGGTACTATACAAGTTGTCTACGCACATTTGCCTTGGGTAT  60

Query  61   TAAACTCTAGTAGGAGCGAAACTTGACATATCAAACCTCTCTGGAGAGGCATCTCCCAGA  120
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  61   TAAACTCTAGTAGGAGCGAAACTTGACATATCAAACCTCTCTGGAGAGGCATCTCCCAGA  120

Query  121  CATTACGGATGATCAGGTCTCAGCGAATCTTAGCTGTGCGGATAATTTGTGGCCCGCACA  180
            ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  121  CATTACGGATGATCAGGTCTCAGCGAATCCTAGCTGTGCGGATAATTTGTGGCCCGCACA  180

Query  181  ACCGCAAGACACCGCCGTGTCTATTCCACAAACTTCGACATATCAATAACGCAGTAACAA  240
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  181  ACCGCAAGACACCGCCGTGTCTATTCCACAAACTTCGACATATCAATAACGCAGTAACAA  240

Query  241  CGTTAAGTAGGGGGACAGGCAGTGCGTCCTAAGGGGCTTGAGGTCGCCCGATTCGCGATC  300
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  241  CGTTAAGTAGGGGGACAGGCAGTGCGTCCTAAGGGGCTTGAGGTCGCCCGATTCGCGATC  300

Query  301  TAATCTTAACAGACGAGGTGGCGTAAGATGTACCTCGTTCAATCTAAGTATGAATTTGTC  360
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  301  TAATCTTAACAGACGAGGTGGCGTAAGATGTACCTCGTTCAATCTAAGTATGAATTTGTC  360

Query  361  CGCTGGGTAATGGTGGAATTAAAGAACATGCGTAAAACGACCTCGTTGTAATTTGGGTCG  420
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  361  CGCTGGGTAATGGTGGAATTAAAGAACATGCGTAAAACGACCTCGTTGTAATTTGGGTCG  420

Query  421  GCCCGTCTCGGCAAATTTGCCCTTGCAGTGAAGCTCGGATTGGATGTCTCGTAAGGAATA  480
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  421  GCCCGTCTCGGCAAATTTGCCCTTGCAGTGAAGCTCGGATTGGATGTCTCGTAAGGAATA  480

Query  481  CTTATTGCGGGTGGTACGCAAATTCGCAACCATGTGAAGTAATGTGAGCGTACTTCACCT  540
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  481  CTTATTGCGGGTGGTACGCAAATTCGCAACCATGTGAAGTAATGTGAGCGTACTTCACCT  540

Query  541  GCTCCGGTACAAGCCGCCATGTGCTCATGTTGGGAACCTCCTGCGTAACAACCGGACGCT  600
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  541  GCTCCGGTACAAGCCGCCATGTGCTCATGTTGGGAACCTCCTGCGTAACAACCGGACGCT  600

Query  601  TGCGAAAGTCATTCCCCTATCGGTACACTATTGGAAAACATGACAAACGTATAATGCGTG  660
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  601  TGCGAAAGTCATTCCCCTATCGGTACACTATTGGAAAACATGACAAACGTATAATGCGTG  660

Query  661  ATGACCGCAACAGATGTAAGTGCACCAACTAGTATTGGCTCCTGTCCACATGGTCGGGTT  720
            ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  661  ATGACCGCAACAGGTGTAAGTGCACCAACTAGTATTGGCTCCTGTCCACATGGTCGGGTT  720

Query  721  TTCCGCCCCCAAACATGCAAACATCCG  747
            |||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  721  TTCCGCCCCCAAACATGCAAACATCCG  747

Query=  ERCC-00134_genbank |103488686|gb|DQ516739.1| Methanocaldococcus
jannaschii spike-in control MJ-250-22 genomic sequence
Length=250

Subject=  ERCC-00134
Length=274

Score =  457 bits (247),  Expect = 1e-133
Identities = 249/250 (99%), Gaps = 0/250 (0%)
Strand=Plus/Plus

Query  1    AGGCTTTGTTATTGGTATTGACTTACAACCAGTTAAGCCATTTGAATATGATAATGTAGT  60
            |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  1    AGGCTTTGTTATTGGTATTGACTTACAAACAGTTAAGCCATTTGAATATGATAATGTAGT  60

Query  61   TGCAATAAAAGGAGATTTCACCTTAGAAGAAAATTTGAACAAAATTAGAGAGCTAATTCC  120
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  61   TGCAATAAAAGGAGATTTCACCTTAGAAGAAAATTTGAACAAAATTAGAGAGCTAATTCC  120

Query  121  AAATGATGaaaaaaaGGTGGATGTGGTTATAAGTGACGCCTCCCCTAATATAAGCGGTTA  180
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  121  AAATGATGAAAAAAAGGTGGATGTGGTTATAAGTGACGCCTCCCCTAATATAAGCGGTTA  180

Query  181  TTGGGATATAGACCACGCTCGTTCAATAGATTTAGTAACTACTGCCTTACAAATAGCTAC  240
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  181  TTGGGATATAGACCACGCTCGTTCAATAGATTTAGTAACTACTGCCTTACAAATAGCTAC  240

Query  241  TGAGATGCTA  250
            ||||||||||
Sbjct  241  TGAGATGCTA  250

Query=  ERCC-00136_genbank |116733895|gb|EF011063.1| Synthetic construct
spike-in microarray control DNA-directed RNA polymerase alpha
subunit (rpoA) gene, complete cds
Length=1020

Subject=  ERCC-00136
Length=1033

Score = 1834 bits (993),  Expect = 0.0
Identities = 1005/1011 (99%), Gaps = 0/1011 (0%)
Strand=Plus/Plus

Query  10    TTTCGACGTTTTGAAGGAGGGTTTTAAGTAATGATCGAGATTGAAAAACCAAAAATCGAA  69
             ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  1     TTTCGACGTTTTGAAGGAGGGTTTTAAGTAATGATCGAGATTGAAAAACCAAAAATCGAA  60

Query  70    ACGGTTGAAATCAGCGACGATGCCAAATTTGGTAAGTTTGTCGTAGAGCCACTTGAGCGT  129
             |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  61    ACGGTTGAAATCAGCGACGATGCCGAATTTGGTAAGTTTGTCGTAGAGCCACTTGAGCGT  120

Query  130   GGATATGGTACAACTCTGGGTAACTCCTTACGTCGTATCCTCTTATCCTCACTCCCTGGT  189
             ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  121   GGATATGGTACAACTCTGGGTAACTCCTTACGTCGTATCCTCTTATCCTCACTCCCTGGT  180

Query  190   GCCGCTGTAACATCAATCCAGATAGATGGTGTACTGCACGAATTCTCGACAATTGAAGGC  249
             ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  181   GCCGCTGTAACATCAATCCAGATAGATGGTGTACTGCACGAATTCTCGACAATTGAAGGC  240

Query  250   GTTGTGGAAGATGTTACAACGATTATCTTACACATTAAAAAGCTTGCATTGAAAATCTAC  309
             ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  241   GTTGTGGAAGATGTTACAACGATTATCTTACACATTAAAAAGCTTGCATTGAAAATCTAC  300

Query  310   TCTGATGAAGAGAAGACGCTAGAAATTGATGTACAGGGTGAAGGAACTGTAACGGCAGCT  369
             ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  301   TCTGATGAAGAGAAGACGCTAGAAATTGATGTACAGGGTGAAGGAACTGTAACGGCAGCT  360

Query  370   GATATTACACACGATAGTGATGTAGAGATCTTAAATCCTGATCTTCATATCGCGACTCTT  429
             ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  361   GATATTACACACGATAGTGATGTAGAGATCTTAAATCCTGATCTTCATATCGCGACTCTT  420

Query  430   GGTGAGAATGCGAGTTTCCGAGTTCGCCTTACTGCTCAAAGAGGACGTGGGTATACGCCT  489
             ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  421   GGTGAGAATGCGAGTTTCCGAGTTCGCCTTACTGCTCAAAGAGGACGTGGGTATACGCCT  480

Query  490   GCTGACGCAAACAAGAGAGACGATCAGCCAATCGGCGTGATTCCGATCGATTCTATCTAT  549
             ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  481   GCTGACGCAAACAAGAGAGGCGATCAGCCAATCGGCGTGATTCCGATCGATTCTATCTAT  540

Query  550   ACGCCAGTTTCTCGTGTATCTTATCAGGTAGAGAACACTCGTGTAGGCCAAGTTGCAAAC  609
             ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  541   ACGCCAGTTTCCCGTGTATCTTATCAGGTAGAGAACACTCGTGTAGGCCAAGTTGCAAAC  600

Query  610   TATGATAAACTTACACTTGATGTTTGGACTGATGGAAGCACTGGACCGAAAGAAGCAATT  669
             ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  601   TATGATAAACTTACACTTGATGTTTGGACTGATGGAAGCACTGGACCGAAAGAAGCAATT  660

Query  670   GCGCTTGGTTCAAAGATTTTAACTGAACACCTTAATATATTCGTTGGTTTAACTGACGAA  729
             ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||
Sbjct  661   GCGCTTGGTTCAAAGATTTTAACTGAACACCTTAATATATTCGCTGGTTTAACTGACGAA  720

Query  730   GCTCAACATGCTGAAATCATGGTTGAAAAAGAAGAAGATCAAAAAGAGAAAGTTCTTGAA  789
             ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  721   GCTCAACATGCTGAAATCATGGTTGAAGAAGAAGAAGATCAAAAAGAGAAAGTTCTTGAA  780

Query  790   ATGACAATTGAAGAATTGGATCTTTCTGTTCGTTCTTACAACTGCTTAAAGCGTGCGGGT  849
             ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  781   ATGACAATTGAAGAATTGGATCTTTCTGTTCGTTCTTACAACTGCTTAAAGCGTGCGGGT  840

Query  850   ATTAACACGGTTCAAGAGCTTGCGAACAAGACGGAAGAAGATATGATGAAAGTTCGAAAT  909
             ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  841   ATTAACACGGTTCAAGAGCTTGCGAACAAGACGGAAGAAGATATGATGAAAGTTCGAAAT  900

Query  910   CTAGGACGCAAATCACTTGAAGAAGTGAAAGCGAAACTAGAAGAACTTGGACTCGGACTT  969
             |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||
Sbjct  901   CTAGGACGCAAATCACTTGAAGAAGTGAAAGCGAGACTAGAAGAACTTGGACTCGGACTT  960

Query  970   CGCAAAGACGATTGACTAGTTTCCCTTGTGAACTAGGATTTTCCCGGGTAC  1020
             |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  961   CGCAAAGACGATTGACTAGTTTCCCTTGTGAACTAGGATTTTCCCGGGTAC  1011

Query=  ERCC-00137_genbank |116662507|gb|DQ855000.2| Synthetic construct
clone AG011.0011 external RNA control sequence
Length=513

Subject=  ERCC-00137
Length=537

Score =  942 bits (510),  Expect = 0.0
Identities = 512/513 (99%), Gaps = 0/513 (0%)
Strand=Plus/Plus

Query  1    CAAAGCAAACCTAATGAAGCCAGACACGAGATCACAGAAAATCGCTGACTATCCCGAGTG  60
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  1    CAAAGCAAACCTAATGAAGCCAGACACGAGATCACAGAAAATCGCTGACTATCCCGAGTG  60

Query  61   CGCGGCGAGCTACAATCCAAGATGATTATTTTTTCACGACCGGGCGCTGGTCAGGTATAT  120
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  61   CGCGGCGAGCTACAATCCAAGATGATTATTTTTTCACGACCGGGCGCTGGTCAGGTATAT  120

Query  121  CGCTGGTACAGATGGCGGCAAGCATCGTTGTCACCACTTCCTTCACGATTTCCGTTAGAG  180
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  121  CGCTGGTACAGATGGCGGCAAGCATCGTTGTCACCACTTCCTTCACGATTTCCGTTAGAG  180

Query  181  CCGAGTGGTACAGCACGTACGTTATATATGGGAGTACGGACATGCTTCCCACCTCGTCAG  240
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  181  CCGAGTGGTACAGCACGTACGTTATATATGGGAGTACGGACATGCTTCCCACCTCGTCAG  240

Query  241  CCAAGATGATAGATACCCGTAGCGTGATGGTCTTATAGCTGCTCTGATGGACTTCGAAAG  300
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  241  CCAAGATGATAGATACCCGTAGCGTGATGGTCTTATAGCTGCTCTGATGGACTTCGAAAG  300

Query  301  ATCACCGTGCAGCTATTCAAAAAAGCAGCCGGGGAAAAGGTGGTCTCGCCCGAAAGCCAT  360
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  301  ATCACCGTGCAGCTATTCAAAAAAGCAGCCGGGGAAAAGGTGGTCTCGCCCGAAAGCCAT  360

Query  361  GACCTCCGATCACTCCTGGCCGGTAGTCGGTTTATTGCATATTGTACAATTGCGCGCGCG  420
            |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||
Sbjct  361  GACCTCCGATCACTCCTGGCCGGTAGTCGGTTTATTGCATATTGTACAGTTGCGCGCGCG  420

Query  421  GCAGGTCACATCCCCCTGGTTAAATAGAGGCACGAGCGCTCGTTTTTGGGTGATCAATAT  480
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  421  GCAGGTCACATCCCCCTGGTTAAATAGAGGCACGAGCGCTCGTTTTTGGGTGATCAATAT  480

Query  481  GGCTTACCCCCGAGAGAGTTGTGAGCTTGCACG  513
            |||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  481  GGCTTACCCCCGAGAGAGTTGTGAGCTTGCACG  513

Query=  ERCC-00138_genbank |103488724|gb|DQ516777.1| Methanocaldococcus
jannaschii spike-in control MJ-1000-60 genomic sequence
Length=1000

Subject=  ERCC-00138
Length=1024

Score = 1836 bits (994),  Expect = 0.0
Identities = 998/1000 (99%), Gaps = 1/1000 (0%)
Strand=Plus/Plus

Query  1    CCTGCTAAAAGAGGTTGGTTGTATAAGATTTGGAGAATTTATCTTAGCCTCTGGTaaaaa  60
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  2    CCTGCTAAAAGAGGTTGGTTGTATAAGATTTGGAGAATTTATCTTAGCCTCTGGTAAAAA  61

Query  61   aaGTAACTACTACATAGACATaaaaaaaGCCACCACAAACCCAGAAATTTTAAAGTTAGT  120
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  62   AAGTAACTACTACATAGACATAAAAAAAGCCACCACAAACCCAGAAATTTTAAAGTTAGT  121

Query  121  TGGAGAAATTATTGCTGAGCAAATAAAGGATGAAGATGTAAAAGTTGCTGGAGTAGAGCT  180
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  122  TGGAGAAATTATTGCTGAGCAAATAAAGGATGAAGATGTAAAAGTTGCTGGAGTAGAGCT  181

Query  181  TGGTTCTGTCCCTATAGCTACAGCTGTCTCAATTATTGCTCAAAAACCACTATTAATTGT  240
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  182  TGGTTCTGTCCCTATAGCTACAGCTGTCTCAATTATTGCTCAAAAACCACTATTAATTGT  241

Query  241  TAGAAAGAAACCTAAGGATTACGGAACTAAAAATAAGATAGAAGGAGAGCTAAAAGAAGG  300
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  242  TAGAAAGAAACCTAAGGATTACGGAACTAAAAATAAGATAGAAGGAGAGCTAAAAGAAGG  301

Query  301  AGATAAGGTTGTTATTGTGGAGGATGTTACTACAACTGGAGGAAGTGTGCTAAAGGCAGT  360
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  302  AGATAAGGTTGTTATTGTGGAGGATGTTACTACAACTGGAGGAAGTGTGCTAAAGGCAGT  361

Query  361  TAAAGAGATTAGGGAAAATGGTGGAATTGTTGATAAAGTTTTTGTTGTTGTTGATAGGTT  420
            |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||
Sbjct  362  TAAAGAGATTAGGGAAAATGGTGGAATTGTTGATAAAGTTTTYGTTGTTGTTGATAGGTT  421

Query  421  AGAAGGAGCTAAAGAAAACCTACAAAAAGAGAATGTTGAATTAATCCCATTAGTTACTGT  480
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  422  AGAAGGAGCTAAAGAAAACCTACAAAAAGAGAATGTTGAATTAATCCCATTAGTTACTGT  481

Query  481  TAAGGAGCTACAATCCACTCAATAAATCTAAAAACCTCTTAGTCCATAGGGGAAACCCCT  540
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  482  TAAGGAGCTACAATCCACTCAATAAATCTAAAAACCTCTTAGTCCATAGGGGAAACCCCT  541

Query  541  ATTGGGATACTCCCCGTCCATTAAGTTGCTCCTTTCAGGAGCAATTAATGTCCATTTTAA  600
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  542  ATTGGGATACTCCCCGTCCATTAAGTTGCTCCTTTCAGGAGCAATTAATGTCCATTTTAA  601

Query  601  GCTTATAATCCACTCAATAAATCTAAAAACTTCTTAGTTTTCTCTTTTTTAACCTTACCA  660
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  602  GCTTATAATCCACTCAATAAATCTAAAAACTTCTTAGTTTTCTCTTTTTTAACCTTACCA  661

Query  661  AATTTCTCTAATTTGCTAACATCTACATTTTTATCCTTTAAAATTTCTTTTATTGGTTCT  720
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  662  AATTTCTCTAATTTGCTAACATCTACATTTTTATCCTTTAAAATTTCTTTTATTGGTTCT  721

Query  721  ATGAGTGCAAtttttttAAGTAAGTCTTCAATATCCTTCTTTTTGAAGTTAAATCTTTCC  780
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  722  ATGAGTGCAATTTTTTTAAGTAAGTCTTCAATATCCTTCTTTTTGAAGTTAAATCTTTCC  781

Query  781  ACAGCATCCCAGTCGTGAATTAAGTATAAAGCAACTCCACCAATGTTCTTTAAAGGAATC  840
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  782  ACAGCATCCCAGTCGTGAATTAAGTATAAAGCAACTCCACCAATGTTCTTTAAAGGAATC  841

Query  841  TGATATTTTGGCAACTCCTCCTCCAATTTAAATTTTAAATCTAAAACATCCACACAATTA  900
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  842  TGATATTTTGGCAACTCCTCCTCCAATTTAAATTTTAAATCTAAAACATCCACACAATTA  901

Query  901  ATCCCATCAACACTCATCCAAGATAAAAATCCTCTCTGTGGAGTAATCATAATAGATGGG  960
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  902  ATCCCATCAACACTCATCCAAGATAAAAATCCTCTCTGTGGAGTAATCATAATAGATGGG  961

Query  961  AACAAATTACTCCTTGCCCTCTCATCTGGTGTTTTGTAGA  1000
            |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||
Sbjct  962  AACAAATTACTCCTTGCCCT-TCATCTGGTGTTTTGTAGA  1000

Query=  ERCC-00142_genbank |114975604|gb|DQ883646.2| Synthetic construct
clone NISTag5 external RNA control sequence
Length=500

Subject=  ERCC-00142
Length=493

Score =  905 bits (490),  Expect = 0.0
Identities = 492/493 (99%), Gaps = 0/493 (0%)
Strand=Plus/Plus

Query  1    CACCTGTCACATTTCCAATCGGCTCCAGGAAGAGAGAAGTGACGGCTTGATCCTGTAGTA  60
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  1    CACCTGTCACATTTCCAATCGGCTCCAGGAAGAGAGAAGTGACGGCTTGATCCTGTAGTA  60

Query  61   ATCCGGGATCGACTTAAGGGGTGCAGCGACCACGGCGGATCGGGCGTCGCAATAGTCCTC  120
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  61   ATCCGGGATCGACTTAAGGGGTGCAGCGACCACGGCGGATCGGGCGTCGCAATAGTCCTC  120

Query  121  CTGTTAGGAGGGTCCTTCTAATGTTAACGCCCGAATATTAGTCATATTTTGCTAGCGCCT  180
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  121  CTGTTAGGAGGGTCCTTCTAATGTTAACGCCCGAATATTAGTCATATTTTGCTAGCGCCT  180

Query  181  ATCAGCGTAAGATATGATTTAAGTTACACCAGGAGAGTAGCGAGATAGAACCACTCGTTG  240
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  181  ATCAGCGTAAGATATGATTTAAGTTACACCAGGAGAGTAGCGAGATAGAACCACTCGTTG  240

Query  241  GATCGGTCTTTCTTAATTGACTACTATCAGATCCGGCGCATGGCGCTGAGGTCAAACTAC  300
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  241  GATCGGTCTTTCTTAATTGACTACTATCAGATCCGGCGCATGGCGCTGAGGTCAAACTAC  300

Query  301  ATTACAGGCCCTGGTTTCCGTGGGTCAGCGCAAGTACAGGCGAGCAGATACAACCTTCCG  360
            ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  301  ATTACAGGCCCTGGTTTCCATGGGTCAGCGCAAGTACAGGCGAGCAGATACAACCTTCCG  360

Query  361  GAGACTTCGCCTCCACACACCGGAGACCCTAACCGTACCCAAATGTAACTAGCGCCTCTG  420
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  361  GAGACTTCGCCTCCACACACCGGAGACCCTAACCGTACCCAAATGTAACTAGCGCCTCTG  420

Query  421  GTGTGAGCTTACTAGAAAGTAGGCCGGGCCGGTCGACAGGAGGTTGCGCCaaaaaaaaaa  480
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  421  GTGTGAGCTTACTAGAAAGTAGGCCGGGCCGGTCGACAGGAGGTTGCGCCAAAAAAAAAA  480

Query  481  aaaaaaaaaaaaa  493
            |||||||||||||
Sbjct  481  AAAAAAAAAAAAA  493

Query=  ERCC-00143_genbank |110339335|gb|DQ668362.1| Synthetic construct
clone TagG microarray control
Length=760

Subject=  ERCC-00143
Length=784

Score = 1404 bits (760),  Expect = 0.0
Identities = 760/760 (100%), Gaps = 0/760 (0%)
Strand=Plus/Plus

Query  1    ATGCAGCGTAGGTATCGACTCTCACTGTGGAGTCGTCTATGATGTCGTGGAGTCCTCTCA  60
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  1    ATGCAGCGTAGGTATCGACTCTCACTGTGGAGTCGTCTATGATGTCGTGGAGTCCTCTCA  60

Query  61   GAGTGCTGTAGGTCCTCATAGGTCGTGCTGTCTCTCTACACGCGTGCGTGAGTCTACATT  120
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  61   GAGTGCTGTAGGTCCTCATAGGTCGTGCTGTCTCTCTACACGCGTGCGTGAGTCTACATT  120

Query  121  TCTGCGAGTTGGTGCTCTCACTGCGGTGTCAGTGATCTCTCCGCGTGTGACATGAGTCTA  180
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  121  TCTGCGAGTTGGTGCTCTCACTGCGGTGTCAGTGATCTCTCCGCGTGTGACATGAGTCTA  180

Query  181  GCTTCGCGGTCATGGTCTATCCCAGCGATGGATGAGACTACTCTGTACTAGATGGTCATG  240
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  181  GCTTCGCGGTCATGGTCTATCCCAGCGATGGATGAGACTACTCTGTACTAGATGGTCATG  240

Query  241  CCTGCGAATGAGTCGTCAGTGCCCACAATGTCTCGATAGTGCGCCGAATGTGTCTGTAAT  300
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  241  CCTGCGAATGAGTCGTCAGTGCCCACAATGTCTCGATAGTGCGCCGAATGTGTCTGTAAT  300

Query  301  GCCTCGAATGTGTAATCGTCAACTCGTATGTGAAGTGCTAGGCTAGTATTGACATCTACG  360
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  301  GCCTCGAATGTGTAATCGTCAACTCGTATGTGAAGTGCTAGGCTAGTATTGACATCTACG  360

Query  361  GGCGGCTATTGACGAACTCTCCGGTATATGCTCTACATCTGCAGGGAATTGCCGACCATA  420
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  361  GGCGGCTATTGACGAACTCTCCGGTATATGCTCTACATCTGCAGGGAATTGCCGACCATA  420

Query  421  TATGGGTCTTGCTGATACGCTAGGGTGCTTGCTACTTAGATAGGCGTCTTGGCCGCTATT  480
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  421  TATGGGTCTTGCTGATACGCTAGGGTGCTTGCTACTTAGATAGGCGTCTTGGCCGCTATT  480

Query  481  CGCGGCGTGTCTCAGAATATGCGCGACGTGTCTGGTATATGGCGACTGTGTCCGTCTATA  540
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  481  CGCGGCGTGTCTCAGAATATGCGCGACGTGTCTGGTATATGGCGACTGTGTCCGTCTATA  540

Query  541  CGCATACTGGTCCACATATAGACATACTTCCACGACATGACAAAGCGTGCTCCTACATAG  600
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  541  CGCATACTGGTCCACATATAGACATACTTCCACGACATGACAAAGCGTGCTCCTACATAG  600

Query  601  CACGAGCGTCTCCTAAATAGATCCGGTCTTATCGCTGAATGTCTAGGATTCTCGTCAATG  660
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  601  CACGAGCGTCTCCTAAATAGATCCGGTCTTATCGCTGAATGTCTAGGATTCTCGTCAATG  660

Query  661  ATCTACGATCCTCGCTAAGTATTCAGCCACCTCGTATAGTATTCGCGCACCTGAGGATTT  720
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  661  ATCTACGATCCTCGCTAAGTATTCAGCCACCTCGTATAGTATTCGCGCACCTGAGGATTT  720

Query  721  ATTCACCTGACTCGCGTATAATATGCCGTCACCTAGTCTA  760
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  721  ATTCACCTGACTCGCGTATAATATGCCGTCACCTAGTCTA  760

Query=  ERCC-00144_genbank |116662504|gb|DQ854995.2| Synthetic construct
clone AG006.1100 external RNA control sequence
Length=514

Subject=  ERCC-00144
Length=538

Score =  950 bits (514),  Expect = 0.0
Identities = 514/514 (100%), Gaps = 0/514 (0%)
Strand=Plus/Plus

Query  1    AGCTAGGATAAATTGACCCGTATGAACTGTTGCCGGCTCGGAAATGTTAAGGCTCTGCGC  60
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  1    AGCTAGGATAAATTGACCCGTATGAACTGTTGCCGGCTCGGAAATGTTAAGGCTCTGCGC  60

Query  61   ACGCACTTTATCATTCGCAGCCTGTTCTGTCAGCGGGTCAGCCTAGGTTACGGTGGAACC  120
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  61   ACGCACTTTATCATTCGCAGCCTGTTCTGTCAGCGGGTCAGCCTAGGTTACGGTGGAACC  120

Query  121  ACTCGGTATCGTGCAGACAGGGATCGTAAGGCGATCCAGCCGGTATACCTTAGTCACATA  180
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  121  ACTCGGTATCGTGCAGACAGGGATCGTAAGGCGATCCAGCCGGTATACCTTAGTCACATA  180

Query  181  TACTATCGTAATATTGGCGGTTGCTGACAAGTAAATACGGCTAAACCGGTCGTTGACCAA  240
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  181  TACTATCGTAATATTGGCGGTTGCTGACAAGTAAATACGGCTAAACCGGTCGTTGACCAA  240

Query  241  CCACTCTCGCGGGGGTCATAAATATCACTGAGCCCGGGAAGTACCCCGTGACAGACATAC  300
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  241  CCACTCTCGCGGGGGTCATAAATATCACTGAGCCCGGGAAGTACCCCGTGACAGACATAC  300

Query  301  GAAAAGCGTGATAACGTATTCGTAGGTATTATTTCCGTTAGCTGGAGGTAAAGGGGTTCT  360
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  301  GAAAAGCGTGATAACGTATTCGTAGGTATTATTTCCGTTAGCTGGAGGTAAAGGGGTTCT  360

Query  361  GGTCCTAGCCGTGTTATGTCTATTTATGAGATGGTAAGCTCGTCACCAACTCGTCACGCG  420
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  361  GGTCCTAGCCGTGTTATGTCTATTTATGAGATGGTAAGCTCGTCACCAACTCGTCACGCG  420

Query  421  ATCGAAATAGCTTGGACTAATGTCCGGCACATAATCAAGTCTACATCAATCATGAATGGT  480
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  421  ATCGAAATAGCTTGGACTAATGTCCGGCACATAATCAAGTCTACATCAATCATGAATGGT  480

Query  481  TTCTGATTTGCTACCATCAGATATCATGTGAGCA  514
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  481  TTCTGATTTGCTACCATCAGATATCATGTGAGCA  514

Query=  ERCC-00145_genbank |112819961|gb|DQ875386.1| Synthetic construct
microarray control LYS gene, complete sequence
Length=1018

Subject=  ERCC-00145
Length=1042

Score = 1881 bits (1018),  Expect = 0.0
Identities = 1018/1018 (100%), Gaps = 0/1018 (0%)
Strand=Plus/Plus

Query  1     ACTGTCCTTTCATCCATAAGCGGAGAAAGAGGGAATGACATTGTTCTTACACGGCACAAG  60
             ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  1     ACTGTCCTTTCATCCATAAGCGGAGAAAGAGGGAATGACATTGTTCTTACACGGCACAAG  60

Query  61    CAGACAAAATCAACATGGTCATTTAGAAATCGGAGGTGTGGATGCTCTCTATTTAGCGGA  120
             ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  61    CAGACAAAATCAACATGGTCATTTAGAAATCGGAGGTGTGGATGCTCTCTATTTAGCGGA  120

Query  121   GAAATATGGTACACCTCTTTACGTATATGATGTGGCTTTAATACGTGAGCGTGCTAAAAG  180
             ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  121   GAAATATGGTACACCTCTTTACGTATATGATGTGGCTTTAATACGTGAGCGTGCTAAAAG  180

Query  181   CTTTAAGCAGGCGTTTATTTCTGCAGGGCTGAAAGCACAGGTGGCATATGCGAGCAAAGC  240
             ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  181   CTTTAAGCAGGCGTTTATTTCTGCAGGGCTGAAAGCACAGGTGGCATATGCGAGCAAAGC  240

Query  241   ATTCTCATCAGTCGCAATGATTCAGCTCGCTGAGGAAGAGGGACTTTCTTTAGATGTCGT  300
             ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  241   ATTCTCATCAGTCGCAATGATTCAGCTCGCTGAGGAAGAGGGACTTTCTTTAGATGTCGT  300

Query  301   ATCCGGAGGAGAGCTATATACGGCTGTTGCAGCAGGCTTTCCGGCAGAACGCATCCACTT  360
             ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  301   ATCCGGAGGAGAGCTATATACGGCTGTTGCAGCAGGCTTTCCGGCAGAACGCATCCACTT  360

Query  361   TCATGGAAACAATAAGAGCAGGGAAGAACTGCGGATGGCGCTTGAGCACCGCATCGGCTG  420
             ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  361   TCATGGAAACAATAAGAGCAGGGAAGAACTGCGGATGGCGCTTGAGCACCGCATCGGCTG  420

Query  421   CATTGTGGTGGATAATTTCTATGAAATCGCGCTTCTTGAAGACCTATGTAAAGAAACGGG  480
             ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  421   CATTGTGGTGGATAATTTCTATGAAATCGCGCTTCTTGAAGACCTATGTAAAGAAACGGG  480

Query  481   TCACTCCATCGATGTTCTTCTTCGGATCACGCCCGGAGTAGAAGCGCATACGCATGACTA  540
             ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  481   TCACTCCATCGATGTTCTTCTTCGGATCACGCCCGGAGTAGAAGCGCATACGCATGACTA  540

Query  541   CATTACAACGGGCCAGGAAGATTCAAAGTTTGGTTTCGATCTTCATAACGGACAAACTGA  600
             ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  541   CATTACAACGGGCCAGGAAGATTCAAAGTTTGGTTTCGATCTTCATAACGGACAAACTGA  600

Query  601   ACGGGCCATTGAACAAGTATTACAATCGGAACACATTCAGCTGCTGGGTGTCCATTGCCA  660
             ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  601   ACGGGCCATTGAACAAGTATTACAATCGGAACACATTCAGCTGCTGGGTGTCCATTGCCA  660

Query  661   TATCGGCTCGCAAATCTTTGATACGGCCGGTTTTGTGTTAGCAGCGGAAAAAATCTTCAA  720
             ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  661   TATCGGCTCGCAAATCTTTGATACGGCCGGTTTTGTGTTAGCAGCGGAAAAAATCTTCAA  720

Query  721   AAAACTAGACGAATGGAGAGATTCATATTCATTTGTATCCAAGGTGCTGAATCTTGGAGG  780
             ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  721   AAAACTAGACGAATGGAGAGATTCATATTCATTTGTATCCAAGGTGCTGAATCTTGGAGG  780

Query  781   AGGTTTCGGCATTCGTTATACGGAAGATGATGAACCGCTTCATGCCACTGAATACGTTGA  840
             ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  781   AGGTTTCGGCATTCGTTATACGGAAGATGATGAACCGCTTCATGCCACTGAATACGTTGA  840

Query  841   AAAAATTATCGAAGCTGTGAAAGAAAATGCTTCCCGTTACGGTTTTGACATTCCGGAAAT  900
             ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  841   AAAAATTATCGAAGCTGTGAAAGAAAATGCTTCCCGTTACGGTTTTGACATTCCGGAAAT  900

Query  901   TTGGATCGAACCGGGCCGTTCTCTCGTGGGAGACGCAGGCACAACTCTTTATACGGTTGG  960
             ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  901   TTGGATCGAACCGGGCCGTTCTCTCGTGGGAGACGCAGGCACAACTCTTTATACGGTTGG  960

Query  961   CTCTCAAAAAGAAGTGGATAAGCTGTACAATCGTTTCATCATTCGGCGTGCGAATTAA  1018
             ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  961   CTCTCAAAAAGAAGTGGATAAGCTGTACAATCGTTTCATCATTCGGCGTGCGAATTAA  1018

Query=  ERCC-00147_genbank |103488737|gb|DQ516790.1| Methanocaldococcus
jannaschii spike-in control MJ-1000-73 genomic sequence
Length=1000

Subject=  ERCC-00147
Length=1023

Score = 1834 bits (993),  Expect = 0.0
Identities = 998/1000 (99%), Gaps = 1/1000 (0%)
Strand=Plus/Plus

Query  1    CCTTGCTTAACCTTAATCTTGCCTTATTACAATATTTTTAGaaaaataaaaagtaaaaat  60
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  1    CCTTGCTTAACCTTAATCTTGCCTTATTACAATATTTTTAGAAAAATAAAAAGTAAAAAT  60

Query  61   aaaaGCAAATCCTTAATCTTTGGTGATATTGATGGAGAGGTATGAAATCCCTAAAGAGAT  120
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  61   AAAAGCAAATCCTTAATCTTTGGTGATATTGATGGAGAGGTATGAAATCCCTAAAGAGAT  120

Query  121  TGGAGAAATAATGTTTGGCTTGTTGTCTCCAGATTACATAAGACAGATGTCAGTTGCTAA  180
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  121  TGGAGAAATAATGTTTGGCTTGTTGTCTCCAGATTACATAAGACAGATGTCAGTTGCTAA  180

Query  181  GATAGTTACACCAGACACTTATGATGAAGATGGTTATCCAATAGATGGAGGTTTAATGGA  240
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  181  GATAGTTACACCAGACACTTATGATGAAGATGGTTATCCAATAGATGGAGGTTTAATGGA  240

Query  241  CACAAGATTGGGAGTTATAGACCCAGGTTTAGTTTGCAAAACATGTGGAGGAAGGATTGG  300
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  241  CACAAGATTGGGAGTTATAGACCCAGGTTTAGTTTGCAAAACATGTGGAGGAAGGATTGG  300

Query  301  AGAGTGTCCAGGGCATTTTGGGCATATAGAGTTGGCTAAACCAGTAATTCATATAGGATT  360
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  301  AGAGTGTCCAGGGCATTTTGGGCATATAGAGTTGGCTAAACCAGTAATTCATATAGGATT  360

Query  361  TGCCAAAACAATATACAAGATATTGAAGGCAGTTTGCCCACACTGTGGAAGAGTAGCAAT  420
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  361  TGCCAAAACAATATACAAGATATTGAAGGCAGTTTGCCCACACTGTGGAAGAGTAGCAAT  420

Query  421  AAGTGAAACTAAGAGGAAAGAAATTTTGGAAAAGATGGAAAAATTAGAGAGAGATGGAGG  480
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  421  AAGTGAAACTAAGAGGAAAGAAATTTTGGAAAAGATGGAAAAATTAGAGAGAGATGGAGG  480

Query  481  AAACAAGTGGGAGGTTTGTGAAGAGGTTTATAAAGAAGCTTCAAAAGTTACAATCTGCCC  540
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  481  AAACAAGTGGGAGGTTTGTGAAGAGGTTTATAAAGAAGCTTCAAAAGTTACAATCTGCCC  540

Query  541  ACACTGTGGAGAGATAAAGTATGATATAAAGTTTGAGAAACCAACAACCTACTACAGAAT  600
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  541  ACACTGTGGAGAGATAAAGTATGATATAAAGTTTGAGAAACCAACAACCTACTACAGAAT  600

Query  601  TGATGGAAATGAGGAAAAAACATTAACTCCATCAGATGTTAGAGAGATTTTAGAGAAGAT  660
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  601  TGATGGAAATGAGGAAAAAACATTAACTCCATCAGATGTTAGAGAGATTTTAGAGAAGAT  660

Query  661  TCCAGATGAAGATTGTATCTTACTCGGCTTAAACCCAGAGGTTGCAAGGCCAGAGTGGAT  720
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  661  TCCAGATGAAGATTGTATCTTACTCGGCTTAAACCCAGAGGTTGCAAGGCCAGAGTGGAT  720

Query  721  GGTTCTCACCGTTTTGCCAGTTCCACCAGTAACTGTAAGGCCATCAATTACCTTGGAAAC  780
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  721  GGTTCTCACCGTTTTGCCAGTTCCACCAGTAACTGTAAGGCCATCAATTACCTTGGAAAC  780

Query  781  TGGAGAGAGAAGTGAAGACGATTTAACTCACAAGTTAGTTGATATCATCAGAATCAACAA  840
            ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  781  TGGAGAGAGAAGTGAAGACGATTTAACCCACAAGTTAGTTGATATCATCAGAATCAACAA  840

Query  841  TAGATTAGAGGAGAATATAGAAGGAGGAGCACCAAACTTAATTATTGAGGATTTATGGAA  900
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  841  TAGATTAGAGGAGAATATAGAAGGAGGAGCACCAAACTTAATTATTGAGGATTTATGGAA  900

Query  901  TCTGTTGCAGTATCACGTAAATACCTACTTCGATAACGAAGCTCCAGGTATTCCACCAGC  960
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  901  TCTGTTGCAGTATCACGTAAATACCTACTTCGATAACGAAGCTCCAGGTATTCCACCAGC  960

Query  961  TAAGCACAGAAGTGGAAGACCATTAAAAACCTTAGCTCAG  1000
            |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||
Sbjct  961  TAAGCACAGAAGTGGAAGAC-ATTAAAAACCTTAGCTCAG  999

Query=  ERCC-00148_genbank |114975574|gb|DQ883642.2| Synthetic construct
clone NISTag1 external RNA control sequence
Length=500

Subject=  ERCC-00148
Length=494

Score =  913 bits (494),  Expect = 0.0
Identities = 494/494 (100%), Gaps = 0/494 (0%)
Strand=Plus/Plus

Query  1    CATCTCCATTTGGTCACGTTTACAACCGGAGTAGACGGCCATAGCAGGAGGGGTGTGCGA  60
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  1    CATCTCCATTTGGTCACGTTTACAACCGGAGTAGACGGCCATAGCAGGAGGGGTGTGCGA  60

Query  61   CAGGCAGGAAGCTCTCGCGGGGTCCAAGCATTGCTGCAATGGGCGTCCTTGCTCGATGTT  120
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  61   CAGGCAGGAAGCTCTCGCGGGGTCCAAGCATTGCTGCAATGGGCGTCCTTGCTCGATGTT  120

Query  121  GACCCGAAGCTCTAACTGCATTTCAAGTCCGAATCTCTAGATATCTCGAGAGCCAATGGT  180
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  121  GACCCGAAGCTCTAACTGCATTTCAAGTCCGAATCTCTAGATATCTCGAGAGCCAATGGT  180

Query  181  TAAGGAAGGGGCGTCAATTTTGCGCGGACACGCTGCAGGATGTAATGATTAAGCCGTAGT  240
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  181  TAAGGAAGGGGCGTCAATTTTGCGCGGACACGCTGCAGGATGTAATGATTAAGCCGTAGT  240

Query  241  TGAATTTATGGAGCGGTGCCCCGGGAAAGGTATAAATCGGAGGCAGGGGTTTACGGCGTC  300
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  241  TGAATTTATGGAGCGGTGCCCCGGGAAAGGTATAAATCGGAGGCAGGGGTTTACGGCGTC  300

Query  301  AGGATAGTTCATAGCGTACGCAGAACGAGAACAAGTGAGACGTGTATAGTTGCCATGCTG  360
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  301  AGGATAGTTCATAGCGTACGCAGAACGAGAACAAGTGAGACGTGTATAGTTGCCATGCTG  360

Query  361  AGTAGACCTGGCGTCTACCCCTCCAAACGCATTCTTATTGGCAAATGGAAGTAGCTTCCA  420
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  361  AGTAGACCTGGCGTCTACCCCTCCAAACGCATTCTTATTGGCAAATGGAAGTAGCTTCCA  420

Query  421  CAGTTTGTAACAAGCCGTGCCTGCGCATGTTATTTACCAATGGAGAATCGaaaaaaaaaa  480
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  421  CAGTTTGTAACAAGCCGTGCCTGCGCATGTTATTTACCAATGGAGAATCGAAAAAAAAAA  480

Query  481  aaaaaaaaaaaaaa  494
            ||||||||||||||
Sbjct  481  AAAAAAAAAAAAAA  494

Query=  ERCC-00150_genbank |114976669|gb|DQ883659.2| Synthetic construct
clone NISTag18 external RNA control sequence
Length=750

Subject=  ERCC-00150
Length=743

Score = 1373 bits (743),  Expect = 0.0
Identities = 743/743 (100%), Gaps = 0/743 (0%)
Strand=Plus/Plus

Query  1    AGCTTGATGTGACATCACGTCCCAATCAATTTGGTTTTACTCCCCTCGATTATGCGGAGT  60
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  1    AGCTTGATGTGACATCACGTCCCAATCAATTTGGTTTTACTCCCCTCGATTATGCGGAGT  60

Query  61   TATCAGTAAGAGCGGGTACCGTTCTGCTGAATGCACTATGAGGGCGACCCTTGATCTTCA  120
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  61   TATCAGTAAGAGCGGGTACCGTTCTGCTGAATGCACTATGAGGGCGACCCTTGATCTTCA  120

Query  121  TTCGTTCCATAGATGCAAATACCCGGGTACTAGTTGGCGAAGTTTGGCTAAAGATTGCCC  180
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  121  TTCGTTCCATAGATGCAAATACCCGGGTACTAGTTGGCGAAGTTTGGCTAAAGATTGCCC  180

Query  181  ACTTACTAGGTGACTGTTAACTAGAAAGTTGCATGAGGCTGGTAAGTGAGGGGCTCAGTG  240
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  181  ACTTACTAGGTGACTGTTAACTAGAAAGTTGCATGAGGCTGGTAAGTGAGGGGCTCAGTG  240

Query  241  AAACAGGATACACCGTACCGTGACGATTCCCGTGTGGGCTTGACATTCAGCCAGCCTCCC  300
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  241  AAACAGGATACACCGTACCGTGACGATTCCCGTGTGGGCTTGACATTCAGCCAGCCTCCC  300

Query  301  GCTTGTACAGAGGCAGACTGTCCGATGCCTAGTATGTTCACTATACGATTTCTTGGGCTA  360
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  301  GCTTGTACAGAGGCAGACTGTCCGATGCCTAGTATGTTCACTATACGATTTCTTGGGCTA  360

Query  361  GCTAGGTGTCTTGACCCCATATTCCAAAGATCCGAACCTGCTTGTACTTATCAGTACGAG  420
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  361  GCTAGGTGTCTTGACCCCATATTCCAAAGATCCGAACCTGCTTGTACTTATCAGTACGAG  420

Query  421  TTGATGCTCTTGGGGTACCTATTTTTTGATCCGATAGTATTGGTTCTGGCGTGTTCTCGT  480
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  421  TTGATGCTCTTGGGGTACCTATTTTTTGATCCGATAGTATTGGTTCTGGCGTGTTCTCGT  480

Query  481  AACCCCGGGCACTAGATTATGGTGAATGGTGTGTACACACTACTTGACGGGGCGTTACCA  540
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  481  AACCCCGGGCACTAGATTATGGTGAATGGTGTGTACACACTACTTGACGGGGCGTTACCA  540

Query  541  TTTTCAGGTGGGCACAAATAGCTAAAGCCTCGTCCGCATTACGCCCCATGGCTCACGTCT  600
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  541  TTTTCAGGTGGGCACAAATAGCTAAAGCCTCGTCCGCATTACGCCCCATGGCTCACGTCT  600

Query  601  CAGAGGAGGCTAGCTCGAGGTCACCCATAAGGGATTACGGAGTTACACCCATAGTAACAG  660
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  601  CAGAGGAGGCTAGCTCGAGGTCACCCATAAGGGATTACGGAGTTACACCCATAGTAACAG  660

Query  661  ACGGAAATTGTTGATAACAGATAGTTAATACGCCTTGGCTGAGGAGACCAACGGACTTCa  720
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  661  ACGGAAATTGTTGATAACAGATAGTTAATACGCCTTGGCTGAGGAGACCAACGGACTTCA  720

Query  721  aaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaa  743
            |||||||||||||||||||||||
Sbjct  721  AAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAA  743

Query=  ERCC-00154_genbank |110586143|gb|DQ854997.1| Synthetic construct
clone AG009.0011 external RNA control sequence
Length=512

Subject=  ERCC-00154
Length=537

Score =  931 bits (504),  Expect = 0.0
Identities = 508/510 (99%), Gaps = 0/510 (0%)
Strand=Plus/Plus

Query  3    CTAGATCAGAAGTCTCCCACTCGAGACTAATCTTGGACTATCTATGAGCACCTATTGCGC  62
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  4    CTAGATCAGAAGTCTCCCACTCGAGACTAATCTTGGACTATCTATGAGCACCTATTGCGC  63

Query  63   TGTGGAAGATTGCCCCTAGGTCTCTGGCGGCTCCGATTGCGGGATGAACTGGTTGGTCCG  122
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  64   TGTGGAAGATTGCCCCTAGGTCTCTGGCGGCTCCGATTGCGGGATGAACTGGTTGGTCCG  123

Query  123  AGGAGGCATATAGGAAACGATGGGCACGCGCTATTCAGACGTTATTTGGTATGGAGTAAG  182
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  124  AGGAGGCATATAGGAAACGATGGGCACGCGCTATTCAGACGTTATTTGGTATGGAGTAAG  183

Query  183  AGGCCGGAAACTGGGCTCGATTGATGGATACTGATCAGTCAACTCAAGCGAGGATATCCA  242
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  184  AGGCCGGAAACTGGGCTCGATTGATGGATACTGATCAGTCAACTCAAGCGAGGATATCCA  243

Query  243  TACCCACCGACGGTATGGTCATTAATACCCAGTATTGACTAGTCGGAGGTCTAATTTGGA  302
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  244  TACCCACCGACGGTATGGTCATTAATACCCAGTATTGACTAGTCGGAGGTCTAATTTGGA  303

Query  303  ACGTATTCCGCCGCACACACGAGATTCACTTACATGGACGTGAAGATTGATCGCCGGGCG  362
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  304  ACGTATTCCGCCGCACACACGAGATTCACTTACATGGACGTGAAGATTGATCGCCGGGCG  363

Query  363  ACTATTATTGCACGACCTTCGCCTGCCCTCAGCTGCGCCCTTTTTGTCCACGGCGCGGGC  422
            |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||
Sbjct  364  ACTATTATTGCACGACCTTCGCCTGCCCTCAGCTGCGCCCTTTTTGTCCACGACGCAGGC  423

Query  423  TGGACCAAGCAGCCGAGGCTGCGCTCCGGCATCAAAGTCCACGAGTTACAGCCAGCGGGT  482
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  424  TGGACCAAGCAGCCGAGGCTGCGCTCCGGCATCAAAGTCCACGAGTTACAGCCAGCGGGT  483

Query  483  TTTAAGGGGGTATTAGCATCTCGAGTGAGT  512
            ||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  484  TTTAAGGGGGTATTAGCATCTCGAGTGAGT  513
Query=  ERCC-00156_genbank |114975588|gb|DQ883643.2| Synthetic construct
clone NISTag2 external RNA control sequence
Length=500

Subject=  ERCC-00156
Length=494

Score =  913 bits (494),  Expect = 0.0
Identities = 494/494 (100%), Gaps = 0/494 (0%)
Strand=Plus/Plus

Query  1    CACAAGAATCCCTGCTAGCTGAAGGAGGGTCAAACTATAACACCTTTAGCATTCGTACAG  60
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  1    CACAAGAATCCCTGCTAGCTGAAGGAGGGTCAAACTATAACACCTTTAGCATTCGTACAG  60

Query  61   GCAGGCTAAGTGAATACTAACCCACCGGCAGCCCGTTGTAGTAACGTTGACCCCTGGCTC  120
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  61   GCAGGCTAAGTGAATACTAACCCACCGGCAGCCCGTTGTAGTAACGTTGACCCCTGGCTC  120

Query  121  GGAGACATTTGGTGTTGCCTAGTACTAGGTGACTGGTACCGATTCATAGGTTCGCCATTC  180
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  121  GGAGACATTTGGTGTTGCCTAGTACTAGGTGACTGGTACCGATTCATAGGTTCGCCATTC  180

Query  181  TCTTATCGAGAGCCCGAGGTAGACTATCTTCCAGATGATGCCATACGTTCACTCAATCGC  240
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  181  TCTTATCGAGAGCCCGAGGTAGACTATCTTCCAGATGATGCCATACGTTCACTCAATCGC  240

Query  241  GCGGCATGCACGGTGGGGCTACGAACTTGCTATCCATAGGCTCTAGATGTGGTAGAAATA  300
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  241  GCGGCATGCACGGTGGGGCTACGAACTTGCTATCCATAGGCTCTAGATGTGGTAGAAATA  300

Query  301  TGCTGCAGGGGTTCTGTCGAATTTGCTCGGCAACCGTGGCCGTGTATGCTTTCATATCCC  360
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  301  TGCTGCAGGGGTTCTGTCGAATTTGCTCGGCAACCGTGGCCGTGTATGCTTTCATATCCC  360

Query  361  GGCGGTGTGATCTAGCCTTCTCGCCATATGAGGGCGCTGAGCATAGACCCAAACCCGACT  420
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  361  GGCGGTGTGATCTAGCCTTCTCGCCATATGAGGGCGCTGAGCATAGACCCAAACCCGACT  420

Query  421  AGTCGAATCTTAGGGTTGTATGCTAGAACGGCATGGTATAAGCCGTGCTCaaaaaaaaaa  480
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  421  AGTCGAATCTTAGGGTTGTATGCTAGAACGGCATGGTATAAGCCGTGCTCAAAAAAAAAA  480

Query  481  aaaaaaaaaaaaaa  494
            ||||||||||||||
Sbjct  481  AAAAAAAAAAAAAA  494

Query=  ERCC-00157_genbank |110586151|gb|DQ839618.1| Synthetic construct
clone AG090.1111 external RNA control sequence
Length=995

Subject=  ERCC-00157
Length=1019

Score = 1821 bits (986),  Expect = 0.0
Identities = 992/995 (99%), Gaps = 0/995 (0%)
Strand=Plus/Plus

Query  1    GGTCTTTGTCACCTCCGTCAATTTGTATTAGAACCCGTGAAGGCCCAAGTAACAGGCCCA  60
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  1    GGTCTTTGTCACCTCCGTCAATTTGTATTAGAACCCGTGAAGGCCCAAGTAACAGGCCCA  60

Query  61   GGGTTAACATGTACGGAACATACTCCTTCCACGGAAGATTGGGGATGAAAGTTGATACCC  120
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  61   GGGTTAACATGTACGGAACATACTCCTTCCACGGAAGATTGGGGATGAAAGTTGATACCC  120

Query  121  AAACTTCATTAACACAAAGGCGATGTGGGCCGAGTACTGTGCTTACACCAACAGGGCGGC  180
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  121  AAACTTCATTAACACAAAGGCGATGTGGGCCGAGTACTGTGCTTACACCAACAGGGCGGC  180

Query  181  TCAACTGGGTTGGTAGCCAGCACTAGCTTATTCACAATTAAGGCCGTATGCATTCTACTG  240
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  181  TCAACTGGGTTGGTAGCCAGCACTAGCTTATTCACAATTAAGGCCGTATGCATTCTACTG  240

Query  241  CTTATCCGGTGGTGATTGCAGCCAGGGCGGAAGTGAACACGCTTGTACGATGTGTTTGCA  300
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  241  CTTATCCGGTGGTGATTGCAGCCAGGGCGGAAGTGAACACGCTTGTACGATGTGTTTGCA  300

Query  301  TAAGCGGTTACCACAGGCGCTACTCTCGTCGATAGCCGACTACTAATATTCAGCCGGCGC  360
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  301  TAAGCGGTTACCACAGGCGCTACTCTCGTCGATAGCCGACTACTAATATTCAGCCGGCGC  360

Query  361  CGGTAGATAGCGAGGCTTTGGGGGTAGCTTTAAGTGCGGTCTAGGCTCAGTTGACGATAC  420
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  361  CGGTAGATAGCGAGGCTTTGGGGGTAGCTTTAAGTGCGGTCTAGGCTCAGTTGACGATAC  420

Query  421  TTACTTAGGCAGGGTTACAACCCTTATGATGGGGTATGAGGCACGTGGCCATTCATCCGG  480
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  421  TTACTTAGGCAGGGTTACAACCCTTATGATGGGGTATGAGGCACGTGGCCATTCATCCGG  480

Query  481  ACCCGATGCTGTCGTGCTTCTCGTTGGCAATAGCGCGGATTAGTACAGGTGACTAGTTCA  540
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  481  ACCCGATGCTGTCGTGCTTCTCGTTGGCAATAGCGCGGATTAGTACAGGTGACTAGTTCA  540

Query  541  GCTGTTGTTCGGATTCCAAGTAAGCTCGCATAGAGCTGGACTTCTCGGAACGGTCCTGAC  600
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  541  GCTGTTGTTCGGATTCCAAGTAAGCTCGCATAGAGCTGGACTTCTCGGAACGGTCCTGAC  600

Query  601  GCATTCCTGCATCAATACGCGGCACCGGGGGTCCGATAGCATCTCGCCTTAGATCCGGCG  660
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  601  GCATTCCTGCATCAATACGCGGCACCGGGGGTCCGATAGCATCTCGCCTTAGATCCGGCG  660

Query  661  GGGGATACTTGGTCAAAGCTCACTACGGGACTAGAGTGGCTAGTGCAGATGCGCAGCGCA  720
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  661  GGGGATACTTGGTCAAAGCTCACTACGGGACTAGAGTGGCTAGTGCAGATGCGCAGCGCA  720

Query  721  GATATGCTATACGAGATGAGCTTCAAATTCATGGAGTTATGACGATATAACGCTAGGATC  780
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  721  GATATGCTATACGAGATGAGCTTCAAATTCATGGAGTTATGACGATATAACGCTAGGATC  780

Query  781  TGACGCGGTGACACCGGTCGTGTGACAACTGGGCTTTAAGTGAGGCATCAGAAGTATACT  840
            |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  781  TGACGCAGTGACACCGGTCGTGTGACAACTGGGCTTTAAGTGAGGCATCAGAAGTATACT  840

Query  841  TTTAATGGTGCCGCTCCCAAATCCCCGATCTTGCCACGATTGCCTAAGCCGTCATGTTAG  900
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  841  TTTAATGGTGCCGCTCCCAAATCCCCGATCTTGCCACGATTGCCTAAGCCGTCATGTTAG  900

Query  901  AGGCGGTCACAGCAAACCCCCACTTTACCGGTTCGATGATTATACGATGCCGGAGCGAAC  960
            ||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  901  AGGCGGTCACAGCAAACCCTCAGTTTACCGGTTCGATGATTATACGATGCCGGAGCGAAC  960

Query  961  GACTACGCTCGAAGTTTGGTTATCTAGAGCACGTC  995
            |||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  961  GACTACGCTCGAAGTTTGGTTATCTAGAGCACGTC  995

Query=  ERCC-00158_genbank |103488742|gb|DQ516795.1| Methanocaldococcus
jannaschii spike-in control MJ-1000-78 genomic sequence
Length=1000

Subject=  ERCC-00158
Length=1027

Score = 1840 bits (996),  Expect = 0.0
Identities = 999/1000 (99%), Gaps = 1/1000 (0%)
Strand=Plus/Plus

Query  1     TTTCAACAGATCATGGAACTACGGGAGAAATAAACATTTGGATAGAAAATGTAACATTTA  60
             ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  7     TTTCAACAGATCATGGAACTACGGGAGAAATAAACATTTGGATAGAAAATGTAACATTTA  66

Query  61    AAAATGATGCAAAATCATATTCCTTTAATTTAACGAATCTTAATATATGGGCAGTAAATA  120
             ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  67    AAAATGATGCAAAATCATATTCCTTTAATTTAACGAATCTTAATATATGGGCAGTAAATA  126

Query  121   AATCTGCTTATGAGTTGTATTGGAATCCATTTAACAAATCTATCTGGATAGATGGGAGTA  180
             ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  127   AATCTGCTTATGAGTTGTATTGGAATCCATTTAACAAATCTATCTGGATAGATGGGAGTA  186

Query  181   ATTACACTATAACTCCAAATATTGACATACCTCCAGGAGAAGTATGGAACTCTAAAACCT  240
             ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  187   ATTACACTATAACTCCAAATATTGACATACCTCCAGGAGAAGTATGGAACTCTAAAACCT  246

Query  241   ACAACTTCACATTTAGTGGAGTTCCAATCGTTTGGGCAAACTGCTCATTTACACTGTCaa  300
             ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  247   ACAACTTCACATTTAGTGGAGTTCCAATCGTTTGGGCAAACTGCTCATTTACACTGTCAA  306

Query  301   aaaaaGATTATATCCTTTTAAATGAAGTAAGTCAAATAGGAAGTTCCTATGTTGTTGTTG  360
             ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  307   AAAAAGATTATATCCTTTTAAATGAAGTAAGTCAAATAGGAAGTTCCTATGTTGTTGTTG  366

Query  361   AGGAGATTTATGTTGTGGGTAGTTATTTGATTAAGGTGACTAAGCATATTGTTCCGGATG  420
             ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  367   AGGAGATTTATGTTGTGGGTAGTTATTTGATTAAGGTGACTAAGCATATTGTTCCGGATG  426

Query  421   CGGATGGGACTTATGATATTTATATAGTTGTGGAGAATATTGGTAGTGTGAAGACTCCTG  480
             ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  427   CGGATGGGACTTATGATATTTATATAGTTGTGGAGAATATTGGTAGTGTGAAGACTCCTG  486

Query  481   AGTATGTGTATGTTTATGATTTGATTCCTAAGAACTTCACCGTCTCAGATGAGTGGGTTA  540
             ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  487   AGTATGTGTATGTTTATGATTTGATTCCTAAGAACTTCACCGTCTCAGATGAGTGGGTTA  546

Query  541   ATCAATCAAGTATGTTGATTGCTGAAGGAAATCACACCATTACAACAAATCCAAGGTATA  600
             ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  547   ATCAATCAAGTATGTTGATTGCTGAAGGAAATCACACCATTACAACAAATCCAAGGTATA  606

Query  601   ATTTAAGCATGTGGTGGGCGTTACATGCAATATATCCAGGAGCAGATGGGGACGGTAACT  660
             ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  607   ATTTAAGCATGTGGTGGGCGTTACATGCAATATATCCAGGAGCAGATGGGGACGGTAACT  666

Query  661   GGAACGACACTGCTGAAATACTTGCAAATAAAACAGTAGTCATACACTACAAACTAAACG  720
             ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  667   GGAACGACACTGCTGAAATACTTGCAAATAAAACAGTAGTCATACACTACAAACTAAACG  726

Query  721   GAACTGGCGAATTCTACCCAAGCGACGCATTTATCGTTGGTATCGACCCTACAAACTCAC  780
             ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  727   GAACTGGCGAATTCTACCCAAGCGACGCATTTATCGTTGGTATCGACCCTACAAACTCAC  786

Query  781   TACTACCAACAACCTCACCAAAAATAACAACAGTAGCCGGAACAGTAGAAAACAACTTTG  840
             ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  787   TACTACCAACAACCTCACCAAAAATAACAACAGTAGCCGGAACAGTAGAAAACAACTTTG  846

Query  841   AGATATTTTTAATACTGATAAACGTTATCTTTGGATTAGGTATATTAACAAAGAGGAATA  900
             ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  847   AGATATTTTTAATACTGATAAACGTTATCTTTGGATTAGGTATATTAACAAAGAGGAATA  906

Query  901   TAAGGAATAATAAATAAAGTTGGGGGATGATGATGAAGAGATTTGCATTACTCTTTATTT  960
             ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  907   TAAGGAATAATAAATAAAGTTGGGGGATGATGATGAAGAGATTTGCATTACTCTTTATTT  966

Query  961   TCCTTGCATTTATAACACCAACTTTTGCAGATGTTGAGGA  1000
             |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||
Sbjct  967   TCCTTGCATTTATAACACCA-CTTTTGCAGATGTTGAGGA  1005

Query=  ERCC-00160_genbank |114976664|gb|DQ883658.2| Synthetic construct
clone NISTag17 external RNA control sequence
Length=750

Subject=  ERCC-00160
Length=743

Score = 1367 bits (740),  Expect = 0.0
Identities = 743/744 (99%), Gaps = 1/744 (0%)
Strand=Plus/Plus

Query  1    TCCTTGGTTTGAAATCAAATTACTATAGATTGCATGCAGAAGTAGGGCTTTACAAGTTTG  60
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  1    TCCTTGGTTTGAAATCAAATTACTATAGATTGCATGCAGAAGTAGGGCTTTACAAGTTTG  60

Query  61   TTCCTAATTCCGTTGAACAATAGCGAATGTATGATGGTCGGTCATTGCCGCAACCCTGAA  120
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  61   TTCCTAATTCCGTTGAACAATAGCGAATGTATGATGGTCGGTCATTGCCGCAACCCTGAA  120

Query  121  GCAGTGAGCGTGGTTGAGTAACCACGTACTAGAAGTCCAAGGATGGTTGCAGTAGCTAGC  180
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  121  GCAGTGAGCGTGGTTGAGTAACCACGTACTAGAAGTCCAAGGATGGTTGCAGTAGCTAGC  180

Query  181  TCAATTGCCATTGCTGGAATAGTGTCGGTAAACCACGCACCGGGGAGCCGCGTTTCGTTG  240
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  181  TCAATTGCCATTGCTGGAATAGTGTCGGTAAACCACGCACCGGGGAGCCGCGTTTCGTTG  240

Query  241  CGATAACCTCATATAGTCCCAGTCTCGGACGCGAGCACCTGCAGCGTAATTAATAAGGTC  300
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  241  CGATAACCTCATATAGTCCCAGTCTCGGACGCGAGCACCTGCAGCGTAATTAATAAGGTC  300

Query  301  AGGCTATGATTCACCACCGTGTAGGAGTTATGCGCCTTATCGCGAAGGTAGTTACTCTTG  360
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  301  AGGCTATGATTCACCACCGTGTAGGAGTTATGCGCCTTATCGCGAAGGTAGTTACTCTTG  360

Query  361  CCAGTGGGCATGAAATTGCGAGCTTGCCCTAGTAGCGTTAGTACCGTCATAAGCCACTCT  420
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  361  CCAGTGGGCATGAAATTGCGAGCTTGCCCTAGTAGCGTTAGTACCGTCATAAGCCACTCT  420

Query  421  AAGAGATCGAAATTTTATACAGTAGTACTAACCAGCAGACCTGCAATATCAAAGTTATAA  480
            |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  421  AAGAGATCGAAATTTTATACAGTAGTACTAAC-AGCAGACCTGCAATATCAAAGTTATAA  479

Query  481  GCGCGTCGACACGCCTCGTCTAAGAAAAACTACTTCCATTAAAGTTCGAGGACAAATGCG  540
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  480  GCGCGTCGACACGCCTCGTCTAAGAAAAACTACTTCCATTAAAGTTCGAGGACAAATGCG  539

Query  541  GTCTGATTCAGTCCTATAGCGAGGCCATTGCAGTGTGGTCTGCCGTGGTCGGCTCGATAA  600
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  540  GTCTGATTCAGTCCTATAGCGAGGCCATTGCAGTGTGGTCTGCCGTGGTCGGCTCGATAA  599

Query  601  TACCATGATAACTACTGACTGCGCAGTTGTAGCGACCGCAATGGGGAGTGTGTGTTCTTT  660
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  600  TACCATGATAACTACTGACTGCGCAGTTGTAGCGACCGCAATGGGGAGTGTGTGTTCTTT  659

Query  661  ATTTCAACTGCGTGGCTTATCCTACTTAGGAGTTGTGGATACCAGATTATCTCGCGGTGG  720
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  660  ATTTCAACTGCGTGGCTTATCCTACTTAGGAGTTGTGGATACCAGATTATCTCGCGGTGG  719

Query  721  aaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaa  744
            ||||||||||||||||||||||||
Sbjct  720  AAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAA  743

Query=  ERCC-00162_genbank |103488697|gb|DQ516750.1| Methanocaldococcus
jannaschii spike-in control MJ-500-33 genomic sequence
Length=500

Subject=  ERCC-00162
Length=523

Score =  917 bits (496),  Expect = 0.0
Identities = 499/500 (99%), Gaps = 1/500 (0%)
Strand=Plus/Plus

Query  1    CTCCACAGATTCCCATGTGTCCAATTCTGAATATCTTTCCAGCTAAGTGCTTCTGCCCAC  60
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  1    CTCCACAGATTCCCATGTGTCCAATTCTGAATATCTTTCCAGCTAAGTGCTTCTGCCCAC  60

Query  61   CAGCAACAACTATGTTGTATTTGTTGCTTAATATACCTCTAAATTTGCTATCTTCAATGC  120
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  61   CAGCAACAACTATGTTGTATTTGTTGCTTAATATACCTCTAAATTTGCTATCTTCAATGC  120

Query  121  CTTCTGGATATTTTGCTGATGTAACTGTTACTGACCTTGCCCTCTCCTTGGCAAACAACT  180
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  121  CTTCTGGATATTTTGCTGATGTAACTGTTACTGACCTTGCCCTCTCCTTGGCAAACAACT  180

Query  181  CTATTCCCATTGCCTCCAAACCAGCCCTTGTTGCTTTTGCTAATCTCTCATGTCTTTTAA  240
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  181  CTATTCCCATTGCCTCCAAACCAGCCCTTGTTGCTTTTGCTAATCTCTCATGTCTTTTAA  240

Query  241  CCCTATTCTCGATTCCTTCCTCTAAAACTAAATCTAATGCAACATTTAAGGCATAGGTTA  300
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  241  CCCTATTCTCGATTCCTTCCTCTAAAACTAAATCTAATGCAACATTTAAGGCATAGGTTA  300

Query  301  AATTAACTGATGGTGTGTATGGGGTTTGTTTTTTCTCTTCATAGTATTTTTTATAAGCCA  360
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  301  AATTAACTGATGGTGTGTATGGGGTTTGTTTTTTCTCTTCATAGTATTTTTTATAAGCCA  360

Query  361  ATAAATCTAAGTAGAAACCAACTTTGTCATCATTCTTCTTAATAACTTCCCATGCCTTTT  420
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  361  ATAAATCTAAGTAGAAACCAACTTTGTCATCATTCTTCTTAATAACTTCCCATGCCTTTT  420

Query  421  CACTGACTGTTATTGCAGCCAATCCTGGTGGAGCTGCCAAACATTTTTGAGAACCAGTAA  480
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  421  CACTGACTGTTATTGCAGCCAATCCTGGTGGAGCTGCCAAACATTTTTGAGAACCAGTAA  480

Query  481  CACAGATATCTATGTGGAAT  500
            |||||||||| |||||||||
Sbjct  481  CACAGATATC-ATGTGGAAT  499

 

Query=  ERCC-00163_genbank |110339332|gb|DQ668359.1| Synthetic construct
clone TagD microarray control
Length=519

Subject=  ERCC-00163
Length=543

Score =  942 bits (510),  Expect = 0.0
Identities = 516/519 (99%), Gaps = 0/519 (0%)
Strand=Plus/Plus

Query  1    ATAGACTAGCCTGCCGGTCAATAACTGATGACGCGGAGTCAACCTGATAACCCATAGCGG  60
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  1    ATAGACTAGCCTGCCGGTCAATAACTGATGACGCGGAGTCAACCTGATAACCCATAGCGG  60

Query  61   AACAGTCTAACCTACGCGAGATACGTCTTACCGCACATAGGTAACCTATTCGTGACTAGC  120
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  61   AACAGTCTAACCTACGCGAGATACGTCTTACCGCACATAGGTAACCTATTCGTGACTAGC  120

Query  121  AGGCCTTATTCCGGTGCTATGAGTATCTTACCTGGTCTAGGTATCTAATTCGTGAGTCGG  180
            |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||
Sbjct  121  AGGCCTTATTCCGGTGCTATGAGTATCTTACCTGGTCTAGGTATCTAATTCGTGGGTCGG  180

Query  181  GTACTACATTCGTGCGATGGGTCCTCGCTTCGTCTATGAGGTCTCGTCTTCGTGAGTGCA  240
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  181  GTACTACATTCGTGCGATGGGTCCTCGCTTCGTCTATGAGGTCTCGTCTTCGTGAGTGCA  240

Query  241  ATGTATCCGAAGTCGTAGTGATAATATGGAACTAGGCGCGATTTGACGAACGTATGCCGC  300
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  241  ATGTATCCGAAGTCGTAGTGATAATATGGAACTAGGCGCGATTTGACGAACGTATGCCGC  300

Query  301  ATATTCGGAACGTCGCCTGGAAATTCGCCACCTAGATCGAAATTATCGGAACTCGTCGCT  360
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  301  ATATTCGGAACGTCGCCTGGAAATTCGCCACCTAGATCGAAATTATCGGAACTCGTCGCT  360

Query  361  TATTTACGAACCTTGGGAGCCGTTCCTAAAGCTGAGTCTGGTTTCTTATTAGCGAGGAGC  420
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  361  TATTTACGAACCTTGGGAGCCGTTCCTAAAGCTGAGTCTGGTTTCTTATTAGCGAGGAGC  420

Query  421  ATTTCGTGAATACTGAGCCGAATATCGTAAGACATCCGCGAGCGACTGTAAACTAATCGG  480
            |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||
Sbjct  421  ATTTCGTGAATACTGAGCCGAATATCGTAAGACACCCGCGAGCGACTGTAAACTAATCGG  480

Query  481  GGAACTTATTATAGAGCCGGTCCAGGTCTTGAACGACGT  519
            |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||
Sbjct  481  GGAACTTATTATAGGGCCGGTCCAGGTCTTGAACGACGT  519

Query=  ERCC-00164_genbank |103488726|gb|DQ516779.1| Methanocaldococcus
jannaschii spike-in control MJ-1000-62 genomic sequence
Length=1000

Subject=  ERCC-00164
Length=1022

Score = 1812 bits (981),  Expect = 0.0
Identities = 994/1000 (99%), Gaps = 1/1000 (0%)
Strand=Plus/Plus

Query  1    AGGAGCTCCAGTAGTTTTCCCCTCAAAAATTCCTGATAAGATTTCAACTTTATCCTCTTC  60
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  1    AGGAGCTCCAGTAGTTTTCCCCTCAAAAATTCCTGATAAGATTTCAACTTTATCCTCTTC  60

Query  61   TTTTCTTGGTGTTGAGAAGATGCTCTGCCCTGGTCTTCTCCTGTCAAGCTCTTTTTGGAT  120
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  61   TTTTCTTGGTGTTGAGAAGATGCTCTGCCCTGGTCTTCTCCTGTCAAGCTCTTTTTGGAT  120

Query  121  ATCCTCTTCAGATAAAGGCAGATTAGCTGGACATCCATCAACAACTGCTCCAACAGCCTT  180
            |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  121  ATCCTCTTCAGATAAAGGCAGATTAGTTGGACATCCATCAACAACTGCTCCAACAGCCTT  180

Query  181  TCCATGACTTTCTCCAAAAACTGTAACTCTAAACATATCCCCATAGGTGTTCATTAATGT  240
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  181  TCCATGACTTTCTCCAAAAACTGTAACTCTAAACATATCCCCATAGGTGTTCATTAATGT  240

Query  241  CACCaaaaatttttaattgcttagttttacatttaaaataaaaattaaaatagtcaaaaa  300
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  241  CACCAAAAATTTTTAATTGCTTAGTTTTACATTTAAAATAAAAATTAAAATAGTCAAAAA  300

Query  301  ataaaaaaGGTTTATCTGTAGAGAACATCCAAGTGTGCTGGTTCCTTAACTTTAACTTTC  360
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  301  ATAAAAAAGGTTTATCTGTAGAGAACATCCAAGTGTGCTGGTTCCTTAACTTTAACTTTC  360

Query  361  TTTTTCTCCATAATCTTCTCAACTGCCTTTCTAAAGTCATCCATTGTTACATAGTCCCTT  420
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  361  TTTTTCTCCATAATCTTCTCAACTGCCTTTCTAAAGTCATCCATTGTTACATAGTCCCTT  420

Query  421  AACTCCCTAATTGCATTCATCCCTGCCTCTGTGCAGATTGCCTTTAACTCAGCCCCTACA  480
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  421  AACTCCCTAATTGCATTCATCCCTGCCTCTGTGCAGATTGCCTTTAACTCAGCCCCTACA  480

Query  481  CATCCTTCAGTCATCTTAGCTATTTCTTCTAAATTGACATCTTCCGCTAAATTCATCTTT  540
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  481  CATCCTTCAGTCATCTTAGCTATTTCTTCTAAATTGACATCTTCCGCTAAATTCATCTTT  540

Query  541  CTTGTATGAATCTTCAATATCTCCAATCTACCCTTCTCATCAGGAGCTGGGACTTCTATG  600
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  541  CTTGTATGAATCTTCAATATCTCCAATCTACCCTTCTCATCAGGAGCTGGGACTTCTATG  600

Query  601  ATTCTATCAAATCTTCCAGGTCTTAATATTGCAGGGTCTAAAATGTCAGGTCTGTTTGTG  660
            |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |
Sbjct  601  ATTCTATCAAATCTTCCAGGTCTTAATATTGCAGGGTCTAAAATGTCAGGCCTGTTTGCG  660

Query  661  GCCCCAATTATCTTAACATCTCCCCTTGCATCGAATCCATCCATCTCTGCCAACAACTGC  720
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  661  GCCCCAATTATCTTAACATCTCCCCTTGCATCGAATCCATCCATCTCTGCCAACAACTGC  720

Query  721  ATTAATGTTCTCTGAACTTCCCTATCTCCACCAGTTAAAGCGTCTGTTCTCTTTGCTGCA  780
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  721  ATTAATGTTCTCTGAACTTCCCTATCTCCACCAGTTAAAGCGTCTGTTCTCTTTGCTGCA  780

Query  781  ATAGCATCAATCTCATCTATGAATATGATTGAAGGAGCTTTTTCTTTAGCCAATTTGAAT  840
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  781  ATAGCATCAATCTCATCTATGAATATGATTGAAGGAGCTTTTTCTTTAGCCAATTTGAAT  840

Query  841  ATATCTTTAACTAACGAAGCCCCCTCTCCAATAAACTTCTTAACCAATTCAGAACCAACA  900
            |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  841  ATATCTTTAACTAACGGAGCCCCCTCTCCAATAAACTTCTTAACCAATTCAGAACCAACA  900

Query  901  ACTCTTATAAAGGTAGCATTTGTTTCTGTAGCAACAGCTTTAGCTAATAATGTCTTTCCA  960
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  901  ACTCTTATAAAGGTAGCATTTGTTTCTGTAGCAACAGCTTTAGCTAATAATGTCTTTCCA  960

Query  961  GTTCCTGGTGGTCCGTAAAGCAGAATACCTTTTGGTGGTT  1000
            ||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||
Sbjct  961  GTTCCTGGTGGCCCGTAAAG-AGAATACCTTTTGGTGGTT  999

Query=  ERCC-00165_genbank |110339336|gb|DQ668363.1| Synthetic construct
clone TagH microarray control
Length=848

Subject=  ERCC-00165
Length=872

Score = 1567 bits (848),  Expect = 0.0
Identities = 848/848 (100%), Gaps = 0/848 (0%)
Strand=Plus/Plus

Query  1    GATATGCGTTACGTGAGTCTGATAGCAGTTCACTACCTGGATATCTGATCCACTAGCTCG  60
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  1    GATATGCGTTACGTGAGTCTGATAGCAGTTCACTACCTGGATATCTGATCCACTAGCTCG  60

Query  61   ATCATGCTCACCCATAGTTTATCTGCATCACTCGTACTGAAATGCTCACATCGCAGGTAG  120
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  61   ATCATGCTCACCCATAGTTTATCTGCATCACTCGTACTGAAATGCTCACATCGCAGGTAG  120

Query  121  AGCAGCATCGTAGAGCGTCAAGCTGCATCCTAGCGTCATGAGTCATAGTACCTCATGCTC  180
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  121  AGCAGCATCGTAGAGCGTCAAGCTGCATCCTAGCGTCATGAGTCATAGTACCTCATGCTC  180

Query  181  ACGTGATCTACCCTAGCTGACCGCTAATGACGGCAGTGCAACCTGAGATACCGACGGCAT  240
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  181  ACGTGATCTACCCTAGCTGACCGCTAATGACGGCAGTGCAACCTGAGATACCGACGGCAT  240

Query  241  ACTGTCGTCAACGTCAGGCAATGTGTCCGAACGGCGAGCTACGTCGCCTCACGGAGTAAT  300
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  241  ACTGTCGTCAACGTCAGGCAATGTGTCCGAACGGCGAGCTACGTCGCCTCACGGAGTAAT  300

Query  301  CGCGTCCCTCTAGGTATAGTGCCGTCGGTTCAGGTCATATGTCGCGGGTTCTGCACATAT  360
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  301  CGCGTCCCTCTAGGTATAGTGCCGTCGGTTCAGGTCATATGTCGCGGGTTCTGCACATAT  360

Query  361  CACGGACGTATCGCTATCAGACGGACGCTCTCGGACCTAAACCGTAGCTCTCGGCAAGAT  420
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  361  CACGGACGTATCGCTATCAGACGGACGCTCTCGGACCTAAACCGTAGCTCTCGGCAAGAT  420

Query  421  CGTCCTCGTCTCGAATATAGCGCCCTAGTGCTGCAAATGTCACCGCTATCTCGTAAGGGG  480
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  421  CGTCCTCGTCTCGAATATAGCGCCCTAGTGCTGCAAATGTCACCGCTATCTCGTAAGGGG  480

Query  481  TCCGTCTGTTGAGTTAGGCCTCCTCTCGTTGGATGTGAGCTCGGTTGCTTGGATGGTGCA  540
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  481  TCCGTCTGTTGAGTTAGGCCTCCTCTCGTTGGATGTGAGCTCGGTTGCTTGGATGGTGCA  540

Query  541  GCTTACTTCGCGTACCTGCTGTTTGCATCAGTCCTCTGCATCTATAATCGCGTATCTCTC  600
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  541  GCTTACTTCGCGTACCTGCTGTTTGCATCAGTCCTCTGCATCTATAATCGCGTATCTCTC  600

Query  601  TCTAGTAGACCATATAGCCATCTAAGCGCTCGATATTCCACCTAAGTGGCGCCTATTGAA  660
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  601  TCTAGTAGACCATATAGCCATCTAAGCGCTCGATATTCCACCTAAGTGGCGCCTATTGAA  660

Query  661  CTAAGTGGCAGCCGAATGGACTATCGCTCCTCGATATGTACGGATAGGCCACGGCATGTA  720
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  661  CTAAGTGGCAGCCGAATGGACTATCGCTCCTCGATATGTACGGATAGGCCACGGCATGTA  720

Query  721  CGAGCATAAGCCGAACTGCACGAGCATACCCGACACTGATCTGAGAGTCGCTTAAATCAT  780
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  721  CGAGCATAAGCCGAACTGCACGAGCATACCCGACACTGATCTGAGAGTCGCTTAAATCAT  780

Query  781  CTGCGTGTCTTAGAGCTTATCGCCATGTCTGTCAACTGTACTGTCATCCTGTAACTGTAG  840
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  781  CTGCGTGTCTTAGAGCTTATCGCCATGTCTGTCAACTGTACTGTCATCCTGTAACTGTAG  840

Query  841  CGTATGTG  848
            ||||||||
Sbjct  841  CGTATGTG  848

Query=  ERCC-00168_genbank |103488723|gb|DQ516776.1| Methanocaldococcus
jannaschii spike-in control MJ-1000-59 genomic sequence
Length=1000

Subject=  ERCC-00168
Length=1024

Score = 1825 bits (988),  Expect = 0.0
Identities = 997/1001 (99%), Gaps = 2/1001 (0%)
Strand=Plus/Plus

Query  1    CCAATGAACTCAGCTATTCTTCTTAACAAATAACTTTCTCCAGAAAATTCAAATGTATCA  60
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  1    CCAATGAACTCAGCTATTCTTCTTAACAAATAACTTTCTCCAGAAAATTCAAATGTATCA  60

Query  61   TCTTCAGGATTCCACCTAAAAACATCATGTAATATAATATCATCAATTTTTGGGTCGTAT  120
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  61   TCTTCAGGATTCCACCTAAAAACATCATGTAATATAATATCATCAATTTTTGGGTCGTAT  120

Query  121  TCAACAATCTCAGTTATACTCTTAGTTCTTCTAACAAATCTTCCTTTATAAATCAATCTA  180
            |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  121  TCAACAATCTCAGTTATACTCTCAGTTCTTCTAACAAATCTTCCTTTATAAATCAATCTA  180

Query  181  ACCTGCATACATATGGCATTTAGTTGTTCAAGCATAATCTTTGGAATGTTCATTGGTTCA  240
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  181  ACCTGCATACATATGGCATTTAGTTGTTCAAGCATAATCTTTGGAATGTTCATTGGTTCA  240

Query  241  GCATTCAACCTCCTTATAACTGCCTCTGGGGATTTTGCGTGTATCGTTGATAACGCCAAA  300
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  241  GCATTCAACCTCCTTATAACTGCCTCTGGGGATTTTGCGTGTATCGTTGATAACGCCAAA  300

Query  301  TGTCCTGTAGTTATTGCTTGAAATAATATCTTCGCCTCCTCACCTCTAACCTCTCCAACA  360
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  301  TGTCCTGTAGTTATTGCTTGAAATAATATCTTCGCCTCCTCACCTCTAACCTCTCCAACA  360

Query  361  ATTAAATAATCTGGTCTTTGCCTTAAAGCCGCTTTTAATAAATCCATCATAGTTATTTCA  420
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  361  ATTAAATAATCTGGTCTTTGCCTTAAAGCCGCTTTTAATAAATCCATCATAGTTATTTCA  420

Query  421  TATTCTTCTCCACCGAATCCACTTCTTGTAGTTCCAGCAATCCAGTTTTCATGATACAAC  480
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  421  TATTCTTCTCCACCGAATCCACTTCTTGTAGTTCCAGCAATCCAGTTTTCATGATACAAC  480

Query  481  CTAATTTCTGGAGTATCCTCAATAGATACGATTTTCATTTGAGGAGGGATGAAAAGAGAG  540
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||
Sbjct  481  CTAATTTCTGGAGTATCCTCAATAGATACGATTTTCATTTGAGGAAGGATGAAAAGAGAG  540

Query  541  AATGCATTTAAAAGGGTGGTTTTTCCAGTAGCTACCTCTCCAGCAACCATAATAGAATTT  600
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  541  AATGCATTTAAAAGGGTGGTTTTTCCAGTAGCTACCTCTCCAGCAACCATAATAGAATTT  600

Query  601  TTATATTCAATGAGTAACCAAAGATATGCAAGCATCTCTGGAGAAATACTCCCATATCTT  660
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  601  TTATATTCAATGAGTAACCAAAGATATGCAAGCATCTCTGGAGAAATACTCCCATATCTT  660

Query  661  ATTAAATCTGTTGGCAATATAGGAGTGTGTGTGAATTTTCTTATTGTAAATGTTGAACCA  720
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  661  ATTAAATCTGTTGGCAATATAGGAGTGTGTGTGAATTTTCTTATTGTAAATGTTGAACCA  720

Query  721  TATCT-GAGATATCCCTTCCAAGGGTTACATTTAGCCTGCTACCATCTGGGAGAGAACCA  779
            ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  721  TATCTTGAGATATCCCTTCCAAGGGTTACATTTAGCCTGCTACCATCTGGGAGAGAACCA  780

Query  780  TCCACTATTGGATTAGCCAATGTTAAAGATTTTCCACACCTTTGGGCTAAGGATATACAA  839
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  781  TCCACTATTGGATTAGCCAATGTTAAAGATTTTCCACACCTTTGGGCTAAGGATATACAA  840

Query  840  AACGAGTCTAATTCTTCATCAGTTTCAAATTTTATATTTGTCTTTAAATGTTCGTATTTT  899
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  841  AACGAGTCTAATTCTTCATCAGTTTCAAATTTTATATTTGTCTTTAAATGTTCGTATTTT  900

Query  900  CTATGAAACACATACACTGGCTTTCCAACACCTGTGCAACTGATATCCTCCAAATTCTCA  959
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  901  CTATGAAACACATACACTGGCTTTCCAACACCTGTGCAACTGATATCCTCCAAATTCTCA  960

Query  960  TCTTTCATAAGAGCATCTATTTTCCCATATCCAATGAGGTA  1000
            |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||
Sbjct  961  TCTTTCATAAGAGCATCTATTT-CCCATATCCAATGAGGTA  1000

Query=  ERCC-00170_genbank |103488720|gb|DQ516773.1| Methanocaldococcus
jannaschii spike-in control MJ-1000-56 genomic sequence
Length=1000

Subject=  ERCC-00170
Length=1023

Score = 1840 bits (996),  Expect = 0.0
Identities = 999/1000 (99%), Gaps = 1/1000 (0%)
Strand=Plus/Plus

Query  1    TATTGGTGGAGGGGCACAAGTTGCTGAAGTTGCGAGAGGGGCGATAAGTGAGGCAGACAG  60
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  1    TATTGGTGGAGGGGCACAAGTTGCTGAAGTTGCGAGAGGGGCGATAAGTGAGGCAGACAG  60

Query  61   GCATAATATAAGAGGGGAGAGAATTAGCGTAGATACTCTTCCAATAGTTGGTGAAGAAAA  120
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  61   GCATAATATAAGAGGGGAGAGAATTAGCGTAGATACTCTTCCAATAGTTGGTGAAGAAAA  120

Query  121  TTTATATGAGGCTGTTAAAGCTGTAGCAACTCTTCCACGAGTAGGAATTTTAGTTTTAGC  180
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  121  TTTATATGAGGCTGTTAAAGCTGTAGCAACTCTTCCACGAGTAGGAATTTTAGTTTTAGC  180

Query  181  TGGCTCTTTAATGGGAGGGAAGATAACTGAAGCAGTTAAAGAATTAAAGGAAAAGACTGG  240
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  181  TGGCTCTTTAATGGGAGGGAAGATAACTGAAGCAGTTAAAGAATTAAAGGAAAAGACTGG  240

Query  241  CATTCCCGTGATAAGCTTAAAGATGTTTGGCTCTGTTCCTAAGGTTGCTGATTTGGTTGT  300
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  241  CATTCCCGTGATAAGCTTAAAGATGTTTGGCTCTGTTCCTAAGGTTGCTGATTTGGTTGT  300

Query  301  TGGAGACCCATTGCAGGCAGGGGTTTTAGCTGTTATGGCTATTGCTGAAACAGCAAAATT  360
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  301  TGGAGACCCATTGCAGGCAGGGGTTTTAGCTGTTATGGCTATTGCTGAAACAGCAAAATT  360

Query  361  TGATATAAATAAGGTTAAAGGTAGGGTGCTATAAAGATAATTTAATAATTTTTGATGAAA  420
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  361  TGATATAAATAAGGTTAAAGGTAGGGTGCTATAAAGATAATTTAATAATTTTTGATGAAA  420

Query  421  CCGAAGCGTTAGCTTTGGGTTATGAAACTCCATGATTTTCATTTAATTTTTTCCTATTAA  480
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  421  CCGAAGCGTTAGCTTTGGGTTATGAAACTCCATGATTTTCATTTAATTTTTTCCTATTAA  480

Query  481  TTTTCTCCTAAAAAGTTTCTTTAACATAAATAAGGTTAAAGGGAGAGCTCTATGATTGTC  540
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  481  TTTTCTCCTAAAAAGTTTCTTTAACATAAATAAGGTTAAAGGGAGAGCTCTATGATTGTC  540

Query  541  TTCAAAAATACAAAGATTATTGATGTATATACTGGAGAGGTTGTTAAAGGAAATGTTGCA  600
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  541  TTCAAAAATACAAAGATTATTGATGTATATACTGGAGAGGTTGTTAAAGGAAATGTTGCA  600

Query  601  GTTGAGAGGGATAAAATATCCTTTGTGGATTTAAATGATGAAATTGATAAGATAATTGAA  660
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  601  GTTGAGAGGGATAAAATATCCTTTGTGGATTTAAATGATGAAATTGATAAGATAATTGAA  660

Query  661  AAAATAAAGGAGGATGTTAAAGTTATTGACTTAAAAGGAAAATATTTATCTCCAACATTT  720
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  661  AAAATAAAGGAGGATGTTAAAGTTATTGACTTAAAAGGAAAATATTTATCTCCAACATTT  720

Query  721  ATAGATGGGCATATACATATAGAATCTTCCCATCTCATCCCATCAGAGTTTGAGAAATTT  780
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  721  ATAGATGGGCATATACATATAGAATCTTCCCATCTCATCCCATCAGAGTTTGAGAAATTT  780

Query  781  GTATTAAAAAGCGGAGTTAGCAAAGTAGTTATAGACCCGCATGAAATAGCAAATATTGCT  840
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  781  GTATTAAAAAGCGGAGTTAGCAAAGTAGTTATAGACCCGCATGAAATAGCAAATATTGCT  840

Query  841  GGAAAAGAAGGAATTTTGTTTATGTTGAATGATGCCAAAATTTTAGATGTCTATGTTATG  900
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  841  GGAAAAGAAGGAATTTTGTTTATGTTGAATGATGCCAAAATTTTAGATGTCTATGTTATG  900

Query  901  CTTCCTTCCTGTGTTCCAGCTACAAACTTAGAAACAAGTGGAGCTGAGATTACAGCAGAG  960
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  901  CTTCCTTCCTGTGTTCCAGCTACAAACTTAGAAACAAGTGGAGCTGAGATTACAGCAGAG  960

Query  961  AATATTGAAGAACTCATTCTTTTAGATAATGTCTTAGGTT  1000
            ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||
Sbjct  961  AATATTGAAGAACTCATTCTTTT-GATAATGTCTTAGGTT  999

Query=  ERCC-00171_genbank |110586107|gb|DQ854994.1| Synthetic construct
clone AG006.0011 external RNA control sequence
Length=506

Subject=  ERCC-00171
Length=505

Score =  889 bits (481),  Expect = 0.0
Identities = 481/481 (100%), Gaps = 0/481 (0%)
Strand=Plus/Plus

Query  26   CTGGAGATTGTCTCGTACGGTTAAGAGCCTCCGCCCGTCTCTGGGACTATGGACGGGCAC  85
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  1    CTGGAGATTGTCTCGTACGGTTAAGAGCCTCCGCCCGTCTCTGGGACTATGGACGGGCAC  60

Query  86   GCTCATATCAGGCTATATTTGGTCCGGGTTATTATCGTCGCGGTTACCGTAATACTTCAG  145
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  61   GCTCATATCAGGCTATATTTGGTCCGGGTTATTATCGTCGCGGTTACCGTAATACTTCAG  120

Query  146  ATCAGTTAAGTAGGGCCATATGCCTCGGGAATAAGCTGACGGTGACAAGGTTTCCCCCTA  205
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  121  ATCAGTTAAGTAGGGCCATATGCCTCGGGAATAAGCTGACGGTGACAAGGTTTCCCCCTA  180

Query  206  ATCGAGACGCTGCAATAACACAGGGGCATACAGTAACCAGGCAAGAGTTCAATCGCTTAG  265
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  181  ATCGAGACGCTGCAATAACACAGGGGCATACAGTAACCAGGCAAGAGTTCAATCGCTTAG  240

Query  266  TTTCGTGGCGGGATTTGAGGAAAACTGCGACTGTTCTTTAACCAAACATCCGTGCGATTC  325
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  241  TTTCGTGGCGGGATTTGAGGAAAACTGCGACTGTTCTTTAACCAAACATCCGTGCGATTC  300

Query  326  GTGCCACTCGTAGACGGCATCTCACAGTCACTGAAGGCTATTAAAGAGTTAGCACCCACC  385
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  301  GTGCCACTCGTAGACGGCATCTCACAGTCACTGAAGGCTATTAAAGAGTTAGCACCCACC  360

Query  386  ATTGGATGAAGCCCAGGATAAGTGAcccccccGGACCTTGGAGTTTCATGCTAATCAAAG  445
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  361  ATTGGATGAAGCCCAGGATAAGTGACCCCCCCGGACCTTGGAGTTTCATGCTAATCAAAG  420

Query  446  AAGAGCTAATCCGACGTAAAGTTGCGGCGTTGATTACGCAGGATTGCGACCAAAGAACGA  505
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  421  AAGAGCTAATCCGACGTAAAGTTGCGGCGTTGATTACGCAGGATTGCGACCAAAGAACGA  480

Query  506  G  506
            |
Sbjct  481  G  481